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# Steven Henikoff and Jorja G. Henikoff:
# "Performance evaluation of amino acid substitution matrices."
# Proteins: Structure, Function, and Genetics: 17(1): 49-61 (1993).
# Figure 1, lower triangle.
# PMID 8234244
A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
A 4 -2 -1 0 -3 0 -2 -2 -1 -2 0 -1 -1 0 -1 0 -1 0 -3 -3
C -2 11 -7 -3 -2 -6 -6 -4 -4 -6 -5 -6 -8 -3 -2 -4 -5 -4 -6 -6
D -1 -7 6 2 -5 -1 0 -3 -1 -6 -4 2 -1 0 -2 0 -1 -4 -6 -3
E 0 -3 2 5 -4 -2 -2 -3 1 -4 -2 0 -1 2 0 -1 0 -2 -6 -2
F -3 -2 -5 -4 7 -6 -2 1 -3 2 0 -3 -5 -4 -4 -3 -3 -1 2 3
G 0 -6 -1 -2 -6 5 -3 -5 -3 -5 -4 -1 -2 -2 -2 -1 -3 -4 -4 -3
H -2 -6 0 -2 -2 -3 8 -5 0 -3 -2 2 -3 0 0 -2 -2 -2 -3 0
I -2 -4 -3 -3 1 -5 -5 6 -3 2 1 -3 -4 -5 -3 -3 -2 2 -2 -1
K -1 -4 -1 1 -3 -3 0 -3 5 -2 -1 0 -1 1 2 -1 0 -3 -3 -2
L -2 -6 -6 -4 2 -5 -3 2 -2 5 3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 1 -1 -2
M 0 -5 -4 -2 0 -4 -2 1 -1 3 8 -2 -6 1 -4 -4 -2 0 -2 -1
N -1 -6 2 0 -3 -1 2 -3 0 -3 -2 5 -2 0 -1 0 0 -4 -5 -1
P -1 -8 -1 -1 -5 -2 -3 -4 -1 -3 -6 -2 7 -2 -2 -1 -1 -4 -4 -6
Q 0 -3 0 2 -4 -2 0 -5 1 -3 1 0 -2 6 1 -1 0 -2 -5 -3
R -1 -2 -2 0 -4 -2 0 -3 2 -3 -4 -1 -2 1 7 0 -1 -3 -2 -1
S 0 -4 0 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -4 -4 0 -1 -1 0 4 1 -3 -5 -2
T -1 -5 -1 0 -3 -3 -2 -2 0 -3 -2 0 -1 0 -1 1 5 -1 -5 -2
V 0 -4 -4 -2 -1 -4 -2 2 -3 1 0 -4 -4 -2 -3 -3 -1 5 -4 -1
W -3 -6 -6 -6 2 -4 -3 -2 -3 -1 -2 -5 -4 -5 -2 -5 -5 -4 10 2
Y -3 -6 -3 -2 3 -3 0 -1 -2 -2 -1 -1 -6 -3 -1 -2 -2 -1 2 7
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