package info (click to toggle)
python-biopython 1.86%2Bdfsg-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 128,424 kB
  • sloc: xml: 1,050,354; python: 360,709; ansic: 18,503; sql: 1,208; makefile: 132; sh: 84

Folder: Align

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 93 substitution_matrices
- - rw-r--r-- 1,715 AlignInfo.py
- - rw-r--r-- 196,542 __init__.py
- - rw-r--r-- 14,084 _aligncore.c
- - rw-r--r-- 70,159 _alignmentcounts.c
- - rw-r--r-- 33,299 _codonaligner.c
- - rw-r--r-- 273,667 _pairwisealigner.c
- - rw-r--r-- 1,917 _pairwisealigner.h
- - rw-r--r-- 4,523 a2m.py
- - rw-r--r-- 46,214 analysis.py
- - rw-r--r-- 9,932 bed.py
- - rw-r--r-- 81,937 bigbed.py
- - rw-r--r-- 13,708 bigmaf.py
- - rw-r--r-- 23,416 bigpsl.py
- - rw-r--r-- 9,338 chain.py
- - rw-r--r-- 9,298 clustal.py
- - rw-r--r-- 10,387 emboss.py
- - rw-r--r-- 26,538 exonerate.py
- - rw-r--r-- 3,141 fasta.py
- - rw-r--r-- 9,503 hhr.py
- - rw-r--r-- 12,461 interfaces.py
- - rw-r--r-- 18,139 maf.py
- - rw-r--r-- 10,056 mauve.py
- - rw-r--r-- 9,481 msf.py
- - rw-r--r-- 7,330 nexus.py
- - rw-r--r-- 6,401 phylip.py
- - rw-r--r-- 22,119 psl.py
- - rw-r--r-- 30,565 sam.py
- - rw-r--r-- 26,134 stockholm.py
- - rw-r--r-- 16,525 tabular.py