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#NEXUS
[Modified from example data distributed with PAUP* 4.01b.
Original Data from:
Hayasaka, K., T. Gojobori, and S. Horai. 1988. Molecular phylogeny
and evolution of primate mitochondrial DNA. Mol. Biol. Evol.
5:626-644.
]
BEGIN DATA;
DIMENSIONS NTAX=12 NCHAR=898;
FORMAT DATATYPE=DNA GAP=-;
MATRIX
Lemur_catta AAGCTTCATAGGAGCAACCATTCTAATAATCGCACATGGCCTTACATCATCCATATTATTCTGTCTAGCCAACTCTAACTACGAACGAATCCATAGCCGTACAATACTACTAGCACGAGGGATCCAAACCATTCTCCCTCTTATAGCCACCTGATGACTACTCGCCAGCCTAACTAACCTAGCCCTACCCACCTCTATCAATTTAATTGGCGAACTATTCGTCACTATAGCATCCTTCTCATGATCAAACATTACAATTATCTTAATAGGCTTAAATATGCTCATCACCGCTCTCTATTCCCTCTATATATTAACTACTACACAACGAGGAAAACTCACATATCATTCGCACAACCTAAACCCATCCTTTACACGAGAAAACACCCTTATATCCATACACATACTCCCCCTTCTCCTATTTACCTTAAACCCCAAAATTATTCTAGGACCCACGTACTGTAAATATAGTTTAAA-AAAACACTAGATTGTGAATCCAGAAATAGAAGCTCAAAC-CTTCTTATTTACCGAGAAAGTAATGTATGAACTGCTAACTCTGCACTCCGTATATAAAAATACGGCTATCTCAACTTTTAAAGGATAGAAGTAATCCATTGGCCTTAGGAGCCAAAAA-ATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAAATCTATTATCCTCTTTCACCCTTGTCACACTGATTATCCTAACTTTACCTATCATTATAAACGTTACAAACATATACAAAAACTACCCCTATGCACCATACGTAAAATCTTCTATTGCATGTGCCTTCATCACTAGCCTCATCCCAACTATATTATTTATCTCCTCAGGACAAGAAACAATCATTTCCAACTGACATTGAATAACAATCCAAACCCTAAAACTATCTATTAGCTT
Homo_sapiens AAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATAATCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCTGCCTAGCAAACTCAAACTACGAACGCACTCACAGTCGCATCATAATCCTCTCTCAAGGACTTCAAACTCTACTCCCACTAATAGCTTTTTGATGACTTCTAGCAAGCCTCGCTAACCTCGCCTTACCCCCCACTATTAACCTACTGGGAGAACTCTCTGTGCTAGTAACCACGTTCTCCTGATCAAATATCACTCTCCTACTTACAGGACTCAACATACTAGTCACAGCCCTATACTCCCTCTACATATTTACCACAACACAATGGGGCTCACTCACCCACCACATTAACAACATAAAACCCTCATTCACACGAGAAAACACCCTCATGTTCATACACCTATCCCCCATTCTCCTCCTATCCCTCAACCCCGACATCATTACCGGGTTTTCCTCTTGTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTA-CGACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CACAAGAACTGCTAACTCATGCCCCCATGTCTAACAACATGGCTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAACCATGCACACTACTATAACCACCCTAACCCTGACTTCCCTAATTCCCCCCATCCTTACCACCCTCGTTAACCCTAACAAAAAAAACTCATACCCCCATTATGTAAAATCCATTGTCGCATCCACCTTTATTATCAGTCTCTTCCCCACAACAATATTCATGTGCCTAGACCAAGAAGTTATTATCTCGAACTGACACTGAGCCACAACCCAAACAACCCAGCTCTCCCTAAGCTT
Pan AAGCTTCACCGGCGCAATTATCCTCATAATCGCCCACGGACTTACATCCTCATTATTATTCTGCCTAGCAAACTCAAATTATGAACGCACCCACAGTCGCATCATAATTCTCTCCCAAGGACTTCAAACTCTACTCCCACTAATAGCCTTTTGATGACTCCTAGCAAGCCTCGCTAACCTCGCCCTACCCCCTACCATTAATCTCCTAGGGGAACTCTCCGTGCTAGTAACCTCATTCTCCTGATCAAATACCACTCTCCTACTCACAGGATTCAACATACTAATCACAGCCCTGTACTCCCTCTACATGTTTACCACAACACAATGAGGCTCACTCACCCACCACATTAATAACATAAAGCCCTCATTCACACGAGAAAATACTCTCATATTTTTACACCTATCCCCCATCCTCCTTCTATCCCTCAATCCTGATATCATCACTGGATTCACCTCCTGTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTCA-CGACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-TATAAGAACTGCTAATTCATATCCCCATGCCTGACAACATGGCTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCCATCCGTTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAACCATGTATACTACCATAACCACCTTAACCCTAACTCCCTTAATTCTCCCCATCCTCACCACCCTCATTAACCCTAACAAAAAAAACTCATATCCCCATTATGTGAAATCCATTATCGCGTCCACCTTTATCATTAGCCTTTTCCCCACAACAATATTCATATGCCTAGACCAAGAAGCTATTATCTCAAACTGGCACTGAGCAACAACCCAAACAACCCAGCTCTCCCTAAGCTT
Gorilla AAGCTTCACCGGCGCAGTTGTTCTTATAATTGCCCACGGACTTACATCATCATTATTATTCTGCCTAGCAAACTCAAACTACGAACGAACCCACAGCCGCATCATAATTCTCTCTCAAGGACTCCAAACCCTACTCCCACTAATAGCCCTTTGATGACTTCTGGCAAGCCTCGCCAACCTCGCCTTACCCCCCACCATTAACCTACTAGGAGAGCTCTCCGTACTAGTAACCACATTCTCCTGATCAAACACCACCCTTTTACTTACAGGATCTAACATACTAATTACAGCCCTGTACTCCCTTTATATATTTACCACAACACAATGAGGCCCACTCACACACCACATCACCAACATAAAACCCTCATTTACACGAGAAAACATCCTCATATTCATGCACCTATCCCCCATCCTCCTCCTATCCCTCAACCCCGATATTATCACCGGGTTCACCTCCTGTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGATAACAGAGGCTCA-CAACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CGTAAGAGCTGCTAACTCATACCCCCGTGCTTGACAACATGGCTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGACCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAACTATGTACGCTACCATAACCACCTTAGCCCTAACTTCCTTAATTCCCCCTATCCTTACCACCTTCATCAATCCTAACAAAAAAAGCTCATACCCCCATTACGTAAAATCTATCGTCGCATCCACCTTTATCATCAGCCTCTTCCCCACAACAATATTTCTATGCCTAGACCAAGAAGCTATTATCTCAAGCTGACACTGAGCAACAACCCAAACAATTCAACTCTCCCTAAGCTT
Pongo AAGCTTCACCGGCGCAACCACCCTCATGATTGCCCATGGACTCACATCCTCCCTACTGTTCTGCCTAGCAAACTCAAACTACGAACGAACCCACAGCCGCATCATAATCCTCTCTCAAGGCCTTCAAACTCTACTCCCCCTAATAGCCCTCTGATGACTTCTAGCAAGCCTCACTAACCTTGCCCTACCACCCACCATCAACCTTCTAGGAGAACTCTCCGTACTAATAGCCATATTCTCTTGATCTAACATCACCATCCTACTAACAGGACTCAACATACTAATCACAACCCTATACTCTCTCTATATATTCACCACAACACAACGAGGTACACCCACACACCACATCAACAACATAAAACCTTCTTTCACACGCGAAAATACCCTCATGCTCATACACCTATCCCCCATCCTCCTCTTATCCCTCAACCCCAGCATCATCGCTGGGTTCGCCTACTGTAAATATAGTTTAACCAAAACATTAGATTGTGAATCTAATAATAGGGCCCCA-CAACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CACAAGAACTGCTAACTCTCACT-CCATGTGTGACAACATGGCTTTCTCAGCTTTTAAAGGATAACAGCTATCCCTTGGTCTTAGGATCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAACAGCCATGTTTACCACCATAACTGCCCTCACCTTAACTTCCCTAATCCCCCCCATTACCGCTACCCTCATTAACCCCAACAAAAAAAACCCATACCCCCACTATGTAAAAACGGCCATCGCATCCGCCTTTACTATCAGCCTTATCCCAACAACAATATTTATCTGCCTAGGACAAGAAACCATCGTCACAAACTGATGCTGAACAACCACCCAGACACTACAACTCTCACTAAGCTT
Hylobates AAGCTTTACAGGTGCAACCGTCCTCATAATCGCCCACGGACTAACCTCTTCCCTGCTATTCTGCCTTGCAAACTCAAACTACGAACGAACTCACAGCCGCATCATAATCCTATCTCGAGGGCTCCAAGCCTTACTCCCACTGATAGCCTTCTGATGACTCGCAGCAAGCCTCGCTAACCTCGCCCTACCCCCCACTATTAACCTCCTAGGTGAACTCTTCGTACTAATGGCCTCCTTCTCCTGGGCAAACACTACTATTACACTCACCGGGCTCAACGTACTAATCACGGCCCTATACTCCCTTTACATATTTATCATAACACAACGAGGCACACTTACACACCACATTAAAAACATAAAACCCTCACTCACACGAGAAAACATATTAATACTTATGCACCTCTTCCCCCTCCTCCTCCTAACCCTCAACCCTAACATCATTACTGGCTTTACTCCCTGTAAACATAGTTTAATCAAAACATTAGATTGTGAATCTAACAATAGAGGCTCG-AAACCTCTTGCTTACCGAGAAAGCC-CACAAGAACTGCTAACTCACTATCCCATGTATGACAACATGGCTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGACCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAGCAATGTACACCACCATAGCCATTCTAACGCTAACCTCCCTAATTCCCCCCATTACAGCCACCCTTATTAACCCCAATAAAAAGAACTTATACCCGCACTACGTAAAAATGACCATTGCCTCTACCTTTATAATCAGCCTATTTCCCACAATAATATTCATGTGCACAGACCAAGAAACCATTATTTCAAACTGACACTGAACTGCAACCCAAACGCTAGAACTCTCCCTAAGCTT
Macaca_fuscata AAGCTTTTCCGGCGCAACCATCCTTATGATCGCTCACGGACTCACCTCTTCCATATATTTCTGCCTAGCCAATTCAAACTATGAACGCACTCACAACCGTACCATACTACTGTCCCGAGGACTTCAAATCCTACTTCCACTAACAGCCTTTTGATGATTAACAGCAAGCCTTACTAACCTTGCCCTACCCCCCACTATCAATCTACTAGGTGAACTCTTTGTAATCGCAACCTCATTCTCCTGATCCCATATCACCATTATGCTAACAGGACTTAACATATTAATTACGGCCCTCTACTCTCTCCACATATTCACTACAACACAACGAGGAACACTCACACATCACATAATCAACATAAAGCCCCCCTTCACACGAGAAAACACATTAATATTCATACACCTCGCTCCAATTATCCTTCTATCCCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACCTCCTGTAGATATAGTTTAACTAAAACACTAGATTGTGAATCTAACCATAGAGACTCA-CCACCTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCAAGGACTGCTAACCCATGTACCCGTACCTAAAATTACGGTTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGACCTTAGGAGTCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAATCATGCACACCCCCATCATTATAACAACCCTTATCTCCCTAACTCTCCCAATTTTTGCCACCCTCATCAACCCTTACAAAAAACGTCCATACCCAGATTACGTAAAAACAACCGTAATATATGCTTTCATCATCAGCCTCCCCTCAACAACTTTATTCATCTTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGGAGCTGACATTGAATAATGACCCAAACACTAGACCTAACGCTAAGCTT
Macaca_mulatta AAGCTTTTCTGGCGCAACCATCCTCATGATTGCTCACGGACTCACCTCTTCCATATATTTCTGCCTAGCCAATTCAAACTATGAACGCACTCACAACCGTACCATACTACTGTCCCGGGGACTTCAAATCCTACTTCCACTAACAGCTTTCTGATGATTAACAGCAAGCCTTACTAACCTTGCCCTACCCCCCACTATCAACCTACTAGGTGAACTCTTTGTAATCGCGACCTCATTCTCCTGGTCCCATATCACCATTATATTAACAGGATTTAACATACTAATTACGGCCCTCTACTCCCTCCACATATTCACCACAACACAACGAGGAGCACTCACACATCACATAATCAACATAAAACCCCCCTTCACACGAGAAAACATATTAATATTCATACACCTCGCTCCAATCATCCTCCTATCTCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACTTCCTGTAGATATAGTTTAACTAAAACATTAGATTGTGAATCTAACCATAGAGACTTA-CCACCTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCGAGGACTGCTAACCCATGTATCCGTACCTAAAATTACGGTTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGACCTTAGGAGTCAAAAATATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAATCATGCACACCCCTATCATAATAACAACCCTTATCTCCCTAACTCTCCCAATTTTTGCCACCCTCATCAACCCTTACAAAAAACGTCCATACCCAGATTACGTAAAAACAACCGTAATATATGCTTTCATCATCAGCCTCCCCTCAACAACTTTATTCATCTTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGAAGCTGACATTGAATAATAACCCAAACACTAGACCTAACACTAAGCTT
Macaca_fascicularis AAGCTTCTCCGGCGCAACCACCCTTATAATCGCCCACGGGCTCACCTCTTCCATGTATTTCTGCTTGGCCAATTCAAACTATGAGCGCACTCATAACCGTACCATACTACTATCCCGAGGACTTCAAATTCTACTTCCATTGACAGCCTTCTGATGACTCACAGCAAGCCTTACTAACCTTGCCCTACCCCCCACTATTAATCTACTAGGCGAACTCTTTGTAATCACAACTTCATTTTCCTGATCCCATATCACCATTGTGTTAACGGGCCTTAATATACTAATCACAGCCCTCTACTCTCTCCACATGTTCATTACAGTACAACGAGGAACACTCACACACCACATAATCAATATAAAACCCCCCTTCACACGAGAAAACATATTAATATTCATACACCTCGCTCCAATTATCCTTCTATCTCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACCTCCTGTAAATATAGTTTAACTAAAACATTAGATTGTGAATCTAACTATAGAGGCCTA-CCACTTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCAAGGACTGCTAATCCATGCCTCCGTACTTAAAACTACGGTTTCCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGACCTTAGGAGTCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAATCATGCACACCCCCATCATAATAACAACCCTCATCTCCCTGACCCTTCCAATTTTTGCCACCCTCACCAACCCCTATAAAAAACGTTCATACCCAGACTACGTAAAAACAACCGTAATATATGCTTTTATTACCAGTCTCCCCTCAACAACCCTATTCATCCTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGGAGTTGACATTGAATAACAACCCAAACATTAGACCTAACACTAAGCTT
Macaca_sylvanus AAGCTTCTCCGGTGCAACTATCCTTATAGTTGCCCATGGACTCACCTCTTCCATATACTTCTGCTTGGCCAACTCAAACTACGAACGCACCCACAGCCGCATCATACTACTATCCCGAGGACTCCAAATCCTACTCCCACTAACAGCCTTCTGATGATTCACAGCAAGCCTTACTAATCTTGCTCTACCCTCCACTATTAATCTACTGGGCGAACTCTTCGTAATCGCAACCTCATTTTCCTGATCCCACATCACCATCATACTAACAGGACTGAACATACTAATTACAGCCCTCTACTCTCTTCACATATTCACCACAACACAACGAGGAGCGCTCACACACCACATAATTAACATAAAACCACCTTTCACACGAGAAAACATATTAATACTCATACACCTCGCTCCAATTATTCTTCTATCTCTTAACCCCAACATCATTCTAGGATTTACTTCCTGTAAATATAGTTTAATTAAAACATTAGACTGTGAATCTAACTATAGAAGCTTA-CCACTTCTTATTTACCGAGAAAACT-TGCAAGGACCGCTAATCCACACCTCCGTACTTAAAACTACGGTTTTCTCAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGCCTTAGGAGTCAAAAATATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAATCATGTATACCCCCATCATAATAACAACTCTCATCTCCCTAACTCTTCCAATTTTCGCTACCCTTATCAACCCCAACAAAAAACACCTATATCCAAACTACGTAAAAACAGCCGTAATATATGCTTTCATTACCAGCCTCTCTTCAACAACTTTATATATATTCTTAAACCAAGAAACAATCATCTGAAGCTGGCACTGAATAATAACCCAAACACTAAGCCTAACATTAAGCTT
Saimiri_sciureus AAGCTTCACCGGCGCAATGATCCTAATAATCGCTCACGGGTTTACTTCGTCTATGCTATTCTGCCTAGCAAACTCAAATTACGAACGAATTCACAGCCGAACAATAACATTTACTCGAGGGCTCCAAACACTATTCCCGCTTATAGGCCTCTGATGACTCCTAGCAAATCTCGCTAACCTCGCCCTACCCACAGCTATTAATCTAGTAGGAGAATTACTCACAATCGTATCTTCCTTCTCTTGATCCAACTTTACTATTATATTCACAGGACTTAATATACTAATTACAGCACTCTACTCACTTCATATGTATGCCTCTACACAGCGAGGTCCACTTACATACAGCACCAGCAATATAAAACCAATATTTACACGAGAAAATACGCTAATATTTATACATATAACACCAATCCTCCTCCTTACCTTGAGCCCCAAGGTAATTATAGGACCCTCACCTTGTAATTATAGTTTAGCTAAAACATTAGATTGTGAATCTAATAATAGAAGAATA-TAACTTCTTAATTACCGAGAAAGTG-CGCAAGAACTGCTAATTCATGCTCCCAAGACTAACAACTTGGCTTCCTCAACTTTTAAAGGATAGTAGTTATCCATTGGTCTTAGGAGCCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATA---ATACACTTCTCCATCACTCTAATAACACTAATTAGCCTACTAGCGCCAATCCTAGCTACCCTCATTAACCCTAACAAAAGCACACTATACCCGTACTACGTAAAACTAGCCATCATCTACGCCCTCATTACCAGTACCTTATCTATAATATTCTTTATCCTTACAGGCCAAGAATCAATAATTTCAAACTGACACTGAATAACTATCCAAACCATCAAACTATCCCTAAGCTT
Tarsius_syrichta AAGTTTCATTGGAGCCACCACTCTTATAATTGCCCATGGCCTCACCTCCTCCCTATTATTTTGCCTAGCAAATACAAACTACGAACGAGTCCACAGTCGAACAATAGCACTAGCCCGTGGCCTTCAAACCCTATTACCTCTTGCAGCAACATGATGACTCCTCGCCAGCTTAACCAACCTGGCCCTTCCCCCAACAATTAATTTAATCGGTGAACTGTCCGTAATAATAGCAGCATTTTCATGGTCACACCTAACTATTATCTTAGTAGGCCTTAACACCCTTATCACCGCCCTATATTCCCTATATATACTAATCATAACTCAACGAGGAAAATACACATATCATATCAACAATATCATGCCCCCTTTCACCCGAGAAAATACATTAATAATCATACACCTATTTCCCTTAATCCTACTATCTACCAACCCCAAAGTAATTATAGGAACCATGTACTGTAAATATAGTTTAAACAAAACATTAGATTGTGAGTCTAATAATAGAAGCCCAAAGATTTCTTATTTACCAAGAAAGTA-TGCAAGAACTGCTAACTCATGCCTCCATATATAACAATGTGGCTTTCTT-ACTTTTAAAGGATAGAAGTAATCCATCGGTCTTAGGAACCGAAAA-ATTGGTGCAACTCCAAATAAAAGTAATAAATTTATTTTCATCCTCCATTTTACTATCACTTACACTCTTAATTACCCCATTTATTATTACAACAACTAAAAAATATGAAACACATGCATACCCTTACTACGTAAAAAACTCTATCGCCTGCGCATTTATAACAAGCCTAGTCCCAATGCTCATATTTCTATACACAAATCAAGAAATAATCATTTCCAACTGACATTGAATAACGATTCATACTATCAAATTATGCCTAAGCTT
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END;
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