File: test_query_position.sam

package info (click to toggle)
python-pysam 0.10.0%2Bds-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 14,196 kB
  • ctags: 10,087
  • sloc: ansic: 79,627; python: 8,569; sh: 282; makefile: 215; perl: 41
file content (9 lines) | stat: -rw-r--r-- 559 bytes parent folder | download | duplicates (7)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
@HD	VN:1.0
@SQ	SN:chr1	LN:100
@SQ	SN:chr2	LN:100
@SQ	SN:chr3	LN:100
@SQ	SN:chr4	LN:100
read1	0	chr1	21	20	10M1D25M	=	200	167	AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<	NM:i:1
read2	0	chr2	21	30	10M2D25M	=	500	412	ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA	<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<	MF:i:18
read1	16	chr3	21	20	10M1D25M	=	200	167	AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<<	NM:i:1
read2	16	chr4	21	30	10M2D25M	=	500	412	ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA	<<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<	MF:i:18