package info (click to toggle)
python-pysam 0.10.0+ds-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 14,196 kB
  • ctags: 10,087
  • sloc: ansic: 79,627; python: 8,569; sh: 282; makefile: 215; perl: 41

Folder: bcftools

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 14,235 HMM.c
- - rw-r--r-- 14,255 HMM.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,180 HMM.h
- - rw-r--r-- 2,387 bcftools.h
- - rw-r--r-- 4,595 call.h
- - rw-r--r-- 13,240 ccall.c
- - rw-r--r-- 13,260 ccall.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 25,427 consensus.c
- - rw-r--r-- 25,585 consensus.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 37,566 convert.c
- - rw-r--r-- 37,610 convert.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,730 convert.h
- - rw-r--r-- 8,856 em.c
- - rw-r--r-- 8,936 em.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 65,603 filter.c
- - rw-r--r-- 65,695 filter.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,982 filter.h
- - rw-r--r-- 8,048 gvcf.c
- - rw-r--r-- 8,068 gvcf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,561 gvcf.h
- - rw-r--r-- 3,163 khash_str2str.h
- - rw-r--r-- 7,269 kmin.c
- - rw-r--r-- 7,289 kmin.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 1,619 kmin.h
- - rw-r--r-- 8,279 main.c
- - rw-r--r-- 8,401 main.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 57,217 mcall.c
- - rw-r--r-- 57,297 mcall.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 8,038 ploidy.c
- - rw-r--r-- 8,058 ploidy.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 4,416 ploidy.h
- - rw-r--r-- 20,291 prob1.c
- - rw-r--r-- 20,335 prob1.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,539 prob1.h
- - rw-r--r-- 151 pysam.h
- - rw-r--r-- 5,851 rbuf.h
- - rw-r--r-- 5,748 tabix.c
- - rw-r--r-- 5,944 tabix.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,603 tsv2vcf.c
- - rw-r--r-- 3,623 tsv2vcf.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 2,621 tsv2vcf.h
- - rw-r--r-- 79,623 vcfannotate.c
- - rw-r--r-- 79,793 vcfannotate.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 33,897 vcfcall.c
- - rw-r--r-- 34,259 vcfcall.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 55,981 vcfcnv.c
- - rw-r--r-- 56,271 vcfcnv.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 35,055 vcfconcat.c
- - rw-r--r-- 35,249 vcfconcat.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 57,855 vcfconvert.c
- - rw-r--r-- 58,433 vcfconvert.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 23,032 vcffilter.c
- - rw-r--r-- 23,184 vcffilter.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 33,888 vcfgtcheck.c
- - rw-r--r-- 34,073 vcfgtcheck.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 8,331 vcfindex.c
- - rw-r--r-- 8,543 vcfindex.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 25,186 vcfisec.c
- - rw-r--r-- 25,434 vcfisec.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 80,865 vcfmerge.c
- - rw-r--r-- 81,182 vcfmerge.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 72,656 vcfnorm.c
- - rw-r--r-- 72,856 vcfnorm.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 20,232 vcfplugin.c
- - rw-r--r-- 20,552 vcfplugin.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 14,664 vcfquery.c
- - rw-r--r-- 14,855 vcfquery.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 28,799 vcfroh.c
- - rw-r--r-- 29,092 vcfroh.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 23,858 vcfsom.c
- - rw-r--r-- 24,082 vcfsom.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 64,628 vcfstats.c
- - rw-r--r-- 66,157 vcfstats.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 34,879 vcfview.c
- - rw-r--r-- 35,193 vcfview.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 3,950 vcmp.c
- - rw-r--r-- 3,970 vcmp.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 2,387 vcmp.h
- - rw-r--r-- 1,918 version.c
- - rw-r--r-- 1,944 version.c.pysam.c
- - rw-r--r-- 33 version.h