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python-pysam 0.10.0+ds-2
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  • area: main
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  • size: 14,196 kB
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  • sloc: ansic: 79,627; python: 8,569; sh: 282; makefile: 215; perl: 41

Folder: pysam

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 32 include
- - rw-r--r-- 8,305 Pileup.py
- - rw-r--r-- 47,638 VCF.py.obsolete
- - rw-r--r-- 3,041 __init__.py
- - rw-r--r-- 3,095 alternatives.py.obsolete
- - rw-r--r-- 428 bcftools.py
- - rw-r--r-- 3,197 htslib_util.c
- - rw-r--r-- 3,697 htslib_util.h
- - rw-r--r-- 2,977 libcalignedsegment.pxd
- - rw-r--r-- 82,896 libcalignedsegment.pyx
- - rw-r--r-- 3,579 libcalignmentfile.pxd
- - rw-r--r-- 84,729 libcalignmentfile.pyx
- - rw-r--r-- 4,033 libcbcf.pxd
- - rw-r--r-- 122,500 libcbcf.pyx
- - rw-r--r-- 6,635 libcbgzf.pyx
- - rw-r--r-- 2,111 libcfaidx.pxd
- - rw-r--r-- 17,433 libcfaidx.pyx
- - rw-r--r-- 81,004 libchtslib.pxd
- - rw-r--r-- 8,447 libchtslib.pyx
- - rw-r--r-- 1,511 libcsamfile.pxd
- - rw-r--r-- 869 libcsamfile.pyx
- - rw-r--r-- 2,614 libctabix.pxd
- - rw-r--r-- 38,981 libctabix.pyx
- - rw-r--r-- 1,320 libctabixproxies.pxd
- - rw-r--r-- 24,944 libctabixproxies.pyx
- - rw-r--r-- 1,612 libcutils.pxd
- - rw-r--r-- 10,718 libcutils.pyx
- - rw-r--r-- 2 libcvcf.pxd
- - rw-r--r-- 52,226 libcvcf.pyx
- - rw-r--r-- 5,056 namedtuple.py
- - rw-r--r-- 255 pysam_stream.h
- - rw-r--r-- 1,362 pysam_util.c
- - rw-r--r-- 791 pysam_util.h
- - rw-r--r-- 6,416 samfile_util.c
- - rw-r--r-- 180 samfile_util.h
- - rw-r--r-- 1,416 samtools.py
- - rw-r--r-- 561 tabix_util.c
- - rw-r--r-- 218 tabix_util.h
- - rw-r--r-- 3,023 utils.py
- - rw-r--r-- 149 version.py