package info (click to toggle)
python-pysam 0.14+ds-2~bpo9+1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch-backports
  • size: 16,116 kB
  • sloc: ansic: 105,386; python: 8,862; sh: 284; makefile: 218; perl: 41

Folder: pysam

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 24 include
- - rw-r--r-- 8,975 Pileup.py
- - rw-r--r-- 47,638 VCF.py.obsolete
- - rw-r--r-- 3,235 __init__.py
- - rw-r--r-- 3,095 alternatives.py.obsolete
- - rw-r--r-- 428 bcftools.py
- - rw-r--r-- 102 cbcftools_util.h
- - rw-r--r-- 102 csamtools_util.h
- - rw-r--r-- 3,294 htslib_util.c
- - rw-r--r-- 3,070 htslib_util.h
- - rw-r--r-- 2,964 libcalignedsegment.pxd
- - rw-r--r-- 109,015 libcalignedsegment.pyx
- - rw-r--r-- 3,734 libcalignmentfile.pxd
- - rw-r--r-- 97,718 libcalignmentfile.pyx
- - rw-r--r-- 4,031 libcbcf.pxd
- - rw-r--r-- 141,155 libcbcf.pyx
- - rw-r--r-- 304 libcbcftools.pxd
- - rw-r--r-- 28 libcbcftools.pyx
- - rw-r--r-- 7,438 libcbgzf.pyx
- - rw-r--r-- 2,186 libcfaidx.pxd
- - rw-r--r-- 20,840 libcfaidx.pyx
- - rw-r--r-- 104,535 libchtslib.pxd
- - rw-r--r-- 22,095 libchtslib.pyx
- - rw-r--r-- 1,511 libcsamfile.pxd
- - rw-r--r-- 869 libcsamfile.pyx
- - rw-r--r-- 304 libcsamtools.pxd
- - rw-r--r-- 28 libcsamtools.pyx
- - rw-r--r-- 2,652 libctabix.pxd
- - rw-r--r-- 43,105 libctabix.pyx
- - rw-r--r-- 1,291 libctabixproxies.pxd
- - rw-r--r-- 25,033 libctabixproxies.pyx
- - rw-r--r-- 1,290 libcutils.pxd
- - rw-r--r-- 11,875 libcutils.pyx
- - rw-r--r-- 2 libcvcf.pxd
- - rw-r--r-- 52,226 libcvcf.pyx
- - rw-r--r-- 255 pysam_stream.h
- - rw-r--r-- 704 pysam_util.c
- - rw-r--r-- 51 pysam_util.h
- - rw-r--r-- 1,416 samtools.py
- - rw-r--r-- 3,210 utils.py
- - rw-r--r-- 195 version.py