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Folder: pysam
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.. (parent) | |||
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d | rwxr-xr-x | 32 | include |
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- | rw-r--r-- | 8,975 | Pileup.py |
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- | rw-r--r-- | 47,638 | VCF.py.obsolete |
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- | rw-r--r-- | 3,235 | __init__.py |
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- | rw-r--r-- | 3,095 | alternatives.py.obsolete |
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- | rw-r--r-- | 428 | bcftools.py |
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- | rw-r--r-- | 102 | cbcftools_util.h |
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- | rw-r--r-- | 102 | csamtools_util.h |
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- | rw-r--r-- | 3,294 | htslib_util.c |
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- | rw-r--r-- | 3,070 | htslib_util.h |
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- | rw-r--r-- | 2,964 | libcalignedsegment.pxd |
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- | rw-r--r-- | 111,798 | libcalignedsegment.pyx |
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- | rw-r--r-- | 3,734 | libcalignmentfile.pxd |
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- | rw-r--r-- | 100,179 | libcalignmentfile.pyx |
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- | rw-r--r-- | 4,031 | libcbcf.pxd |
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- | rw-r--r-- | 142,014 | libcbcf.pyx |
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- | rw-r--r-- | 304 | libcbcftools.pxd |
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- | rw-r--r-- | 28 | libcbcftools.pyx |
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- | rw-r--r-- | 7,438 | libcbgzf.pyx |
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- | rw-r--r-- | 2,186 | libcfaidx.pxd |
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- | rw-r--r-- | 20,866 | libcfaidx.pyx |
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- | rw-r--r-- | 104,604 | libchtslib.pxd |
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- | rw-r--r-- | 22,539 | libchtslib.pyx |
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- | rw-r--r-- | 1,511 | libcsamfile.pxd |
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- | rw-r--r-- | 869 | libcsamfile.pyx |
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- | rw-r--r-- | 304 | libcsamtools.pxd |
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- | rw-r--r-- | 28 | libcsamtools.pyx |
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- | rw-r--r-- | 2,652 | libctabix.pxd |
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- | rw-r--r-- | 43,372 | libctabix.pyx |
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- | rw-r--r-- | 1,291 | libctabixproxies.pxd |
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- | rw-r--r-- | 25,033 | libctabixproxies.pyx |
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- | rw-r--r-- | 1,308 | libcutils.pxd |
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- | rw-r--r-- | 12,744 | libcutils.pyx |
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- | rw-r--r-- | 2 | libcvcf.pxd |
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- | rw-r--r-- | 52,226 | libcvcf.pyx |
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- | rw-r--r-- | 255 | pysam_stream.h |
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- | rw-r--r-- | 704 | pysam_util.c |
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- | rw-r--r-- | 51 | pysam_util.h |
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- | rw-r--r-- | 1,416 | samtools.py |
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- | rw-r--r-- | 3,210 | utils.py |
|
- | rw-r--r-- | 197 | version.py |