1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
|
@HD VN:1.0
@SQ SN:chr1 LN:1575 AH:chr1:5000000-5010000
@SQ SN:chr2 LN:1584 AH:*
@RG ID:L1 PU:SC_1_10 LB:SC_1 SM:NA12891 CN:name:with:colon
@RG ID:L2 PU:SC_2_12 LB:SC_2 SM:NA12891 CN:name:with:colon
@PG ID:P1 VN:1.0
@PG ID:P2 VN:1.1
@CO this is a comment
@CO this is another comment
read_28833_29006_6945 99 chr1 33 20 10M1D25M = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
read_28701_28881_323b 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<< MF:i:18 RG:Z:L2 PG:Z:P2 XT:A:R
read_28701_28881_323c 147 chr2 88 30 35M = 500 412 ACCTATATCTTGGCCTTGGCCGATGCGGCCTTGCA <<<<<;<<<<7;:<<<6;<<<<<<<<<<<<7<<<<
test_clipped1 99 chr2 997 20 4S6M1D20M5S = 200 167 AGCTTAGCTAGCTACCTATATCTTGGTCTTGGCCG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<9/,&,22;;<<< NM:i:1 RG:Z:L1 PG:Z:P1 XT:A:U
|
