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python-pysam 0.15.4+ds-3
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye, sid
  • size: 27,992 kB
  • sloc: ansic: 140,738; python: 7,881; sh: 265; makefile: 223; perl: 41

Folder: pysam

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 32 include
- - rw-r--r-- 8,975 Pileup.py
- - rw-r--r-- 47,638 VCF.py.obsolete
- - rw-r--r-- 3,235 __init__.py
- - rw-r--r-- 3,048 alternatives.py.obsolete
- - rw-r--r-- 434 bcftools.py
- - rw-r--r-- 102 cbcftools_util.h
- - rw-r--r-- 102 csamtools_util.h
- - rw-r--r-- 3,294 htslib_util.c
- - rw-r--r-- 2,565 htslib_util.h
- - rw-r--r-- 2,964 libcalignedsegment.pxd
- - rw-r--r-- 110,029 libcalignedsegment.pyx
- - rw-r--r-- 3,734 libcalignmentfile.pxd
- - rw-r--r-- 100,088 libcalignmentfile.pyx
- - rw-r--r-- 4,031 libcbcf.pxd
- - rw-r--r-- 142,883 libcbcf.pyx
- - rw-r--r-- 304 libcbcftools.pxd
- - rw-r--r-- 28 libcbcftools.pyx
- - rw-r--r-- 7,438 libcbgzf.pyx
- - rw-r--r-- 2,186 libcfaidx.pxd
- - rw-r--r-- 21,141 libcfaidx.pyx
- - rw-r--r-- 104,939 libchtslib.pxd
- - rw-r--r-- 22,533 libchtslib.pyx
- - rw-r--r-- 1,511 libcsamfile.pxd
- - rw-r--r-- 869 libcsamfile.pyx
- - rw-r--r-- 304 libcsamtools.pxd
- - rw-r--r-- 28 libcsamtools.pyx
- - rw-r--r-- 2,652 libctabix.pxd
- - rw-r--r-- 43,372 libctabix.pyx
- - rw-r--r-- 1,291 libctabixproxies.pxd
- - rw-r--r-- 25,033 libctabixproxies.pyx
- - rw-r--r-- 1,308 libcutils.pxd
- - rw-r--r-- 13,470 libcutils.pyx
- - rw-r--r-- 2 libcvcf.pxd
- - rw-r--r-- 52,226 libcvcf.pyx
- - rw-r--r-- 255 pysam_stream.h
- - rw-r--r-- 704 pysam_util.c
- - rw-r--r-- 51 pysam_util.h
- - rw-r--r-- 1,422 samtools.py
- - rw-r--r-- 3,210 utils.py
- - rw-r--r-- 197 version.py