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python-pysam 0.15.4+ds-3
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bullseye, sid
  • size: 27,992 kB
  • sloc: ansic: 140,738; python: 7,881; sh: 265; makefile: 223; perl: 41

Folder: pysam_data

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 2,101 Makefile
- - rw-r--r-- 26 ex1.bed
- - rw-r--r-- 3,225 ex1.fa
- - rw-r--r-- 113,194 ex1.sam.gz
- - rw-r--r-- 16,982 ex1.vcf.gz
- - rw-r--r-- 5,636 ex1.vcf.gz.tbi
- - rw-r--r-- 1,784 ex10.sam
- - rw-r--r-- 869 ex3.sam
- - rw-r--r-- 460 ex4.sam
- - rw-r--r-- 277 ex5.sam
- - rw-r--r-- 332 ex6.sam
- - rw-r--r-- 311 ex7.sam.donottest
- - rw-r--r-- 516 ex8.sam
- - rw-r--r-- 26,626 ex9_fail.sam
- - rw-r--r-- 26,601 ex9_nofail.sam
- - rw-r--r-- 26,058 ex_spliced.sam
- - rw-r--r-- 24,130 example_aligned_pairs.sam
- - rw-r--r-- 2,933 example_btag.sam
- - rw-r--r-- 414 example_dash_in_chr.sam
- - rw-r--r-- 90,941 example_empty_header.sam
- - rw-r--r-- 953 example_no_seq_in_header.bam
- - rw-r--r-- 954 example_no_seq_in_header_null_bytes.bam
- - rw-r--r-- 2,902 example_reverse_complement.sam
- - rw-r--r-- 239 example_unmapped_reads_no_sq.sam
- - rw-r--r-- 1,088 faidx_empty_seq.fq
- - rw-r--r-- 195,399 faidx_ex1.fa
- - rw-r--r-- 320,458 faidx_ex1.fq
- - rw-r--r-- 12,364 issue100.sam
- - rw-r--r-- 237 softclip.sam
- - rw-r--r-- 540 tag_bug.sam
- - rw-r--r-- 1,777 test.gtf
- - rw-r--r-- 311 test.gtf.gz
- - rw-r--r-- 3,111 test_mapped_unmapped.sam
- - rw-r--r-- 559 test_query_position.sam
- - rw-r--r-- 1,013 test_unaligned.sam