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python-pysam 0.23.0%2Bds-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid, trixie
  • size: 18,468 kB
  • sloc: ansic: 158,936; python: 8,604; sh: 338; makefile: 264; perl: 41

Folder: pysam

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 32 include
- - rw-r--r-- 8,955 Pileup.py
- - rw-r--r-- 47,638 VCF.py.obsolete
- - rw-r--r-- 3,431 __init__.py
- - rw-r--r-- 3,095 alternatives.py.obsolete
- - rw-r--r-- 1,528 bcftools.py
- - rw-r--r-- 102 cbcftools_util.h
- - rw-r--r-- 102 csamtools_util.h
- - rw-r--r-- 3,294 htslib_util.c
- - rw-r--r-- 2,565 htslib_util.h
- - rw-r--r-- 2,942 libcalignedsegment.pxd
- - rw-r--r-- 6,658 libcalignedsegment.pyi
- - rw-r--r-- 116,812 libcalignedsegment.pyx
- - rw-r--r-- 3,558 libcalignmentfile.pxd
- - rw-r--r-- 7,840 libcalignmentfile.pyi
- - rw-r--r-- 104,627 libcalignmentfile.pyx
- - rw-r--r-- 4,116 libcbcf.pxd
- - rw-r--r-- 11,827 libcbcf.pyi
- - rw-r--r-- 145,793 libcbcf.pyx
- - rw-r--r-- 301 libcbcftools.pxd
- - rw-r--r-- 31 libcbcftools.pyi
- - rw-r--r-- 28 libcbcftools.pyx
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- - rw-r--r-- 7,437 libcbgzf.pyx
- - rw-r--r-- 2,213 libcfaidx.pxd
- - rw-r--r-- 2,580 libcfaidx.pyi
- - rw-r--r-- 21,164 libcfaidx.pyx
- - rw-r--r-- 109,435 libchtslib.pxd
- - rw-r--r-- 3,700 libchtslib.pyi
- - rw-r--r-- 22,848 libchtslib.pyx
- - rw-r--r-- 1,538 libcsamfile.pxd
- - rw-r--r-- 176 libcsamfile.pyi
- - rw-r--r-- 822 libcsamfile.pyx
- - rw-r--r-- 301 libcsamtools.pxd
- - rw-r--r-- 31 libcsamtools.pyi
- - rw-r--r-- 28 libcsamtools.pyx
- - rw-r--r-- 2,679 libctabix.pxd
- - rw-r--r-- 3,153 libctabix.pyi
- - rw-r--r-- 42,424 libctabix.pyx
- - rw-r--r-- 1,322 libctabixproxies.pxd
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- - rw-r--r-- 25,100 libctabixproxies.pyx
- - rw-r--r-- 1,596 libcutils.pxd
- - rw-r--r-- 973 libcutils.pyi
- - rw-r--r-- 14,172 libcutils.pyx
- - rw-r--r-- 28 libcvcf.pxd
- - rw-r--r-- 0 libcvcf.pyi
- - rw-r--r-- 52,226 libcvcf.pyx
- - rw-r--r-- 0 py.typed
- - rw-r--r-- 255 pysam_stream.h
- - rw-r--r-- 704 pysam_util.c
- - rw-r--r-- 51 pysam_util.h
- - rw-r--r-- 3,193 samtools.py
- - rw-r--r-- 3,772 utils.py
- - rw-r--r-- 196 version.h
- - rw-r--r-- 143 version.py
- - rw-r--r-- 93 version.pyi