File: 12.vcf

package info (click to toggle)
python-pysam 0.7.7-1~bpo70%2B1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: wheezy-backports
  • size: 11,096 kB
  • sloc: ansic: 25,638; python: 3,882; makefile: 157; sh: 12
file content (1000 lines) | stat: -rw-r--r-- 95,454 bytes parent folder | download | duplicates (30)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
##fileformat=VCFv4.0
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	DNA_pool_A
chr1	1281168	.	A	G	14	.	DP=37;AF1=0.6243;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=15;PV4=1,0.027,1,1	PL:GT:GQ	43,0,4:0/1:6
chr1	1281205	.	T	C	26	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41	PL:GT:GQ	58,9,0:1/1:63
chr1	1281206	.	G	C	25	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41	PL:GT:GQ	57,9,0:1/1:63
chr1	1922737	.	G	C	13.2	.	DP=21;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,21;MQ=22	PL:GT:GQ	46,63,0:1/1:99
chr1	21197513	.	A	G	55.1	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=41	PL:GT:GQ	88,21,0:1/1:84
chr1	21343209	.	T	C	5.45	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=14	PL:GT:GQ	37,51,0:1/1:99
chr1	22097362	.	T	C	4.75	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30	PL:GT:GQ	35,9,0:1/1:63
chr1	22254012	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	22650927	.	G	A	48.1	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=24	PL:GT:GQ	81,21,0:1/1:84
chr1	23535401	.	C	T	40.4	.	DP=25;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,16,0,5;MQ=19;PV4=1,0.2,1,1	PL:GT:GQ	73,13,0:1/1:65
chr1	23543855	.	T	C	49.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44	PL:GT:GQ	82,18,0:1/1:90
chr1	24245107	.	C	G	32	.	DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,0,35:0/1:38
chr1	24274412	.	G	C	39.5	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=32	PL:GT:GQ	72,12,0:1/1:72
chr1	36529832	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr1	37788090	.	A	G	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr1	43120440	.	C	T	34	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=49;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	64,0,31:0/1:34
chr1	43980466	.	C	T	43	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=19	PL:GT:GQ	76,45,0:1/1:99
chr1	46047795	.	T	C	29.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=31	PL:GT:GQ	62,18,0:1/1:90
chr1	48860309	.	C	T	99	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=46	PL:GT:GQ	141,18,0:1/1:90
chr1	49415599	.	T	C	4.61	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr1	51601816	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	51955459	.	G	C	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr1	68479569	.	T	G	12	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	43,6,0:1/1:49
chr1	69032455	.	A	G	15.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29	PL:GT:GQ	47,9,0:1/1:63
chr1	71888225	.	G	T	9.31	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	72381528	.	T	C	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr1	82004013	.	A	G	37.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50	PL:GT:GQ	70,12,0:1/1:72
chr1	86289622	.	C	T	18	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42	PL:GT:GQ	50,9,0:1/1:63
chr1	90267663	.	A	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr1	92699542	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	94867317	.	G	A	26.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	58,6,0:1/1:49
chr1	96428713	.	C	G	3.98	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=27	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr1	100466329	.	G	C	4.85	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22	PL:GT:GQ	36,18,0:1/1:90
chr1	101909281	.	G	A	70	.	DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=46;PV4=1,1,0.096,1	PL:GT:GQ	100,0,88:0/1:91
chr1	106216572	.	T	A	22	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=21	PL:GT:GQ	55,48,0:1/1:99
chr1	107901770	.	T	C	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	108431179	.	A	G	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=41	PL:GT:GQ	155,24,0:1/1:96
chr1	112005344	.	C	T	99	.	DP=52;AF1=1;CI95=1,1;DP4=7,0,27,0;MQ=44;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	196,25,0:1/1:99
chr1	116625452	.	C	T	36	.	DP=44;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,20;MQ=49;PV4=1,2.3e-69,0.42,1	PL:GT:GQ	66,0,179:0/1:69
chr1	118060710	.	G	T	6.98	.	DP=8;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=47;PV4=1,0.0071,1,1	PL:GT:GQ	36,0,73:0/1:39
chr1	118198177	.	A	G	15.9	.	DP=23;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43	PL:GT:GQ	47,6,0:1/1:49
chr1	118586346	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	120809555	.	G	A	20	.	DP=8;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	50,0,106:0/1:53
chr1	130723110	.	C	A	20.7	.	DP=8;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,2;MQ=26;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	50,0,5:0/1:7
chr1	133979895	.	T	C	14.9	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr1	134977940	.	C	T	30	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,1,0.26,1	PL:GT:GQ	60,0,31:0/1:34
chr1	141768589	.	G	A	18.1	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,4,0;MQ=51;PV4=1,2.7e-05,1,1	PL:GT:GQ	48,0,100:0/1:51
chr1	141768590	.	G	A	22	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=50;PV4=1,0.0033,1,1	PL:GT:GQ	52,0,40:0/1:43
chr1	146506051	.	T	C	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr1	150997009	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	162915612	.	G	C	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr1	168455400	.	A	G	4.12	.	DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,27;MQ=10	PL:GT:GQ	35,81,0:1/1:99
chr1	172784744	.	T	C	17.8	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	49,6,0:1/1:49
chr1	183627307	.	G	A	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr1	185789457	.	T	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr1	187081827	.	T	C	4.77	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=17	PL:GT:GQ	36,30,0:1/1:99
chr1	188468339	.	C	T	33	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=24	PL:GT:GQ	66,39,0:1/1:99
chr1	188595435	.	C	T	41.8	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr1	188670561	.	G	C	3.55	.	DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=18	PL:GT:GQ	34,27,0:1/1:99
chr1	188924877	.	G	A	6.2	.	DP=10;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=21;PV4=1,1,1,0.3	PL:GT:GQ	35,3,0:1/1:41
chr1	190536295	.	G	A	68	.	DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,36,0;MQ=18	PL:GT:GQ	101,108,0:1/1:99
chr1	191129408	.	T	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	195937816	.	T	C	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr1	198857619	.	T	C	89	.	DP=61;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,38,0,17;MQ=30;PV4=1,0.032,1,1	PL:GT:GQ	119,0,139:0/1:99
chr1	199057483	.	T	C	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr1	200133619	.	G	C	5.83	.	DP=49;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=2,0,8,0;MQ=17;PV4=1,0.059,1,0.2	PL:GT:GQ	37,12,0:1/1:72
chr1	200729661	.	A	T	36	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=27	PL:GT:GQ	69,42,0:1/1:99
chr1	201374519	.	T	C	69.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39	PL:GT:GQ	102,12,0:1/1:72
chr1	202811668	.	G	A	20.2	.	DP=4;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,3;MQ=24;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	50,0,12:0/1:15
chr1	202960650	.	C	T	16.6	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27	PL:GT:GQ	49,12,0:1/1:72
chr1	205686638	.	C	T	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr1	205949857	.	A	G	3.14	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=21	PL:GT:GQ	33,15,0:1/1:75
chr1	209806643	.	A	G	13.2	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=21	PL:GT:GQ	46,24,0:1/1:96
chr1	209871501	.	C	T	25	.	DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,4,0;MQ=41;PV4=1,7.7e-06,1,1	PL:GT:GQ	55,0,84:0/1:58
chr1	211051323	.	G	A	99	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=49	PL:GT:GQ	176,24,0:1/1:96
chr1	211389716	.	C	T	12	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32	PL:GT:GQ	43,6,0:1/1:49
chr1	211868415	.	G	A	3.54	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=14	PL:GT:GQ	34,33,0:1/1:99
chr1	211914531	.	C	T	84.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	116,7,0:1/1:57
chr1	214691313	.	A	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr1	215184650	.	C	T	40.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46	PL:GT:GQ	72,6,0:1/1:49
chr1	215995258	.	A	G	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr1	217031394	.	G	C	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr1	217986960	.	T	C	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr1	218086681	.	A	G	99	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34	PL:GT:GQ	142,27,0:1/1:99
chr1	218546019	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	218632417	.	G	T	17.1	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=26	PL:GT:GQ	50,21,0:1/1:84
chr1	218833355	.	C	G	23	.	DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,2,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	53,0,63:0/1:56
chr1	219303186	.	T	C	7.79	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=12	PL:GT:GQ	40,75,0:1/1:99
chr1	219517634	.	G	A	26.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42	PL:GT:GQ	59,12,0:1/1:72
chr1	219590158	.	T	C	3.27	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	33,12,0:1/1:72
chr1	219709853	.	A	T	99	.	DP=124;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=80,0,41,0;MQ=44;PV4=1,0.26,1,1	PL:GT:GQ	143,0,156:0/1:99
chr1	222457988	.	A	G	11.1	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23	PL:GT:GQ	42,6,0:1/1:49
chr1	222477914	.	A	G	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr1	223010233	.	A	G	18.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr1	223796360	.	G	A	6.79	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=21	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr1	224273784	.	A	T	14.2	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=15	PL:GT:GQ	47,30,0:1/1:99
chr1	224454685	.	C	T	46.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32	PL:GT:GQ	79,15,0:1/1:75
chr1	224514706	.	G	C	21	.	DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=19	PL:GT:GQ	54,114,0:1/1:99
chr1	224515793	.	C	T	99	.	DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=45	PL:GT:GQ	211,78,0:1/1:99
chr1	224692969	.	C	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr1	225607249	.	A	G	34	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,1,0,1	PL:GT:GQ	64,0,31:0/1:34
chr1	226923918	.	C	A	29.1	.	DP=52;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,10;MQ=27;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,18,0:1/1:90
chr1	227125189	.	T	C	56.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=41	PL:GT:GQ	89,12,0:1/1:72
chr1	227133712	.	A	T	20.1	.	DP=26;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,10,0;MQ=23;PV4=1,1,0.48,1	PL:GT:GQ	50,0,39:0/1:42
chr1	227943954	.	G	C	47	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37	PL:GT:GQ	79,9,0:1/1:63
chr1	227943974	.	G	A	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr1	228067480	.	A	G	42.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45	PL:GT:GQ	75,15,0:1/1:75
chr1	228067510	.	A	G	99	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=45	PL:GT:GQ	140,15,0:1/1:75
chr1	228088778	.	C	T	6.79	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr1	228117888	.	A	C	13.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr1	228139641	.	T	C	44.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	77,12,0:1/1:72
chr1	228577146	.	T	C	26	.	DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027	PL:GT:GQ	56,0,77:0/1:59
chr1	229001369	.	C	A	45	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41	PL:GT:GQ	77,9,0:1/1:63
chr1	229001386	.	C	T	8.44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	39,6,0:1/1:49
chr1	229348080	.	T	C	18.1	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33	PL:GT:GQ	48,0,31:0/1:34
chr1	229439710	.	C	T	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr1	229655149	.	T	C	30	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30	PL:GT:GQ	63,24,0:1/1:96
chr1	229660873	.	C	G	81	.	DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	111,0,120:0/1:99
chr2a	3661005	.	C	G	24	.	DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1	PL:GT:GQ	54,0,34:0/1:37
chr2a	4140063	.	G	A	81	.	DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1	PL:GT:GQ	110,0,3:0/1:5
chr2a	4248440	.	T	C	20	.	DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1	PL:GT:GQ	50,0,92:0/1:53
chr2a	4707656	.	A	G	63	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	95,9,0:1/1:63
chr2a	5194801	.	G	A	7.59	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24	PL:GT:GQ	38,6,0:1/1:49
chr2a	14111103	.	A	G	7.84	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20	PL:GT:GQ	40,21,0:1/1:84
chr2a	17799746	.	A	G	11.3	.	DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	41,0,35:0/1:37
chr2a	24728910	.	G	A	45.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28	PL:GT:GQ	78,15,0:1/1:75
chr2a	29627939	.	G	T	5.44	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27	PL:GT:GQ	36,9,0:1/1:63
chr2a	31373164	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr2a	33935228	.	T	C	41.8	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr2a	36311856	.	G	A	99	.	DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44	PL:GT:GQ	213,87,0:1/1:99
chr2a	39281204	.	T	C	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr2a	41087565	.	C	T	74.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=38	PL:GT:GQ	107,12,0:1/1:72
chr2a	45574768	.	C	A	11.3	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr2a	55464464	.	T	C	26.1	.	DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	55,1,0:1/1:23
chr2a	63107673	.	T	A	70.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34	PL:GT:GQ	103,12,0:1/1:72
chr2a	63141732	.	A	T	22.8	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	54,6,0:1/1:49
chr2a	63141910	.	G	A	3.41	.	DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32	PL:GT:GQ	32,6,0:1/1:49
chr2a	63141911	.	C	T	9.55	.	DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1	PL:GT:GQ	39,0,19:0/1:22
chr2a	63143543	.	C	T	28	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	61,42,0:1/1:99
chr2a	66419805	.	G	A	3.69	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	34,15,0:1/1:75
chr2a	66563922	.	C	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr2a	67719136	.	C	T	39.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	71,6,0:1/1:49
chr2a	72781453	.	A	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr2a	76733211	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr2a	78190502	.	A	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr2a	85021209	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr2a	88554861	.	A	T	39	.	DP=74;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=46;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	69,0,92:0/1:72
chr2a	88554877	.	A	G	92	.	DP=90;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,23,0,13;MQ=41;PV4=1,0.3,1,1	PL:GT:GQ	122,0,128:0/1:99
chr2a	88824857	.	G	A	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr2a	93546675	.	C	T	26	.	DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	56,0,87:0/1:59
chr2a	94788853	.	A	G	34.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43	PL:GT:GQ	67,15,0:1/1:75
chr2a	96738146	.	T	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr2a	102737384	.	A	G	12.3	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,18,0;MQ=11	PL:GT:GQ	45,54,0:1/1:99
chr2a	103407172	.	A	G	35	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=19	PL:GT:GQ	68,24,0:1/1:96
chr2a	105774580	.	T	G	99	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=30	PL:GT:GQ	135,39,0:1/1:99
chr2a	106376301	.	C	G	24.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19	PL:GT:GQ	57,18,0:1/1:90
chr2a	106376315	.	C	T	8.75	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=19	PL:GT:GQ	41,18,0:1/1:90
chr2a	112422267	.	C	T	30	.	DP=20;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,5,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	60,0,131:0/1:63
chr2b	3049384	.	A	C	14.9	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr2b	3049385	.	G	C	14.9	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr2b	3049406	.	C	G	99	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=36	PL:GT:GQ	135,18,0:1/1:90
chr2b	4213802	.	T	C	89.5	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr2b	5022895	.	G	A	66	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=49	PL:GT:GQ	99,30,0:1/1:99
chr2b	6037666	.	G	T	56	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=17	PL:GT:GQ	89,39,0:1/1:99
chr2b	13656952	.	G	A	19.2	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=21	PL:GT:GQ	52,18,0:1/1:90
chr2b	15026944	.	A	G	6.79	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr2b	23362613	.	A	G	5.64	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22	PL:GT:GQ	37,15,0:1/1:75
chr2b	45947861	.	C	G	68	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=50	PL:GT:GQ	101,33,0:1/1:99
chr2b	46597824	.	T	C	65.6	.	DP=39;AF1=0.5939;CI95=0.5,1;DP4=23,0,10,0;MQ=22;PV4=1,0.014,1,1	PL:GT:GQ	95,0,5:0/1:7
chr2b	49665191	.	G	T	34.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37	PL:GT:GQ	67,21,0:1/1:84
chr2b	61001546	.	A	G	48	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=26	PL:GT:GQ	81,24,0:1/1:96
chr2b	88502851	.	T	C	4.77	.	DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=37;PV4=1,1,0.46,1	PL:GT:GQ	33,0,34:0/1:33
chr2b	91675431	.	C	T	30	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=27	PL:GT:GQ	63,24,0:1/1:96
chr2b	91870148	.	T	G	67	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=47;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	100,31,0:1/1:99
chr2b	97066826	.	G	A	20.1	.	DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,2;MQ=31;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	50,0,35:0/1:38
chr2b	97670822	.	G	A	4.85	.	DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=18	PL:GT:GQ	36,18,0:1/1:90
chr2b	102773175	.	A	G	17.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38	PL:GT:GQ	49,9,0:1/1:63
chr2b	109805532	.	T	C	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=45	PL:GT:GQ	176,24,0:1/1:96
chr2b	110841448	.	A	G	11.1	.	DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	42,6,0:1/1:49
chr2b	123217025	.	T	C	31.5	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=37	PL:GT:GQ	64,12,0:1/1:72
chr2b	123263214	.	A	G	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr2b	127747292	.	C	T	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=52	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr2b	130121958	.	A	G	89.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43	PL:GT:GQ	122,15,0:1/1:75
chr2b	130253633	.	A	G	14.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr2b	130692761	.	C	T	49.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=51	PL:GT:GQ	82,18,0:1/1:90
chr2b	130743365	.	A	G	99	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42	PL:GT:GQ	140,15,0:1/1:75
chr2b	131553874	.	A	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=37	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr2b	131716894	.	A	G	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40	PL:GT:GQ	137,24,0:1/1:96
chr2b	131716936	.	G	A	99	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=36	PL:GT:GQ	173,36,0:1/1:99
chr2b	131716952	.	A	G	99	.	DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,14;MQ=36;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	152,0,43:0/1:46
chr2b	133360184	.	C	T	99	.	DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,20;MQ=32	PL:GT:GQ	163,60,0:1/1:99
chr2b	133644741	.	T	A	16.4	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=27	PL:GT:GQ	49,15,0:1/1:75
chr2b	133720595	.	T	C	41	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=29	PL:GT:GQ	74,36,0:1/1:99
chr2b	133727192	.	C	T	19.3	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	52,15,0:1/1:75
chr2b	133727260	.	G	A	3.56	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18	PL:GT:GQ	34,24,0:1/1:95
chr2b	133800294	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=23	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr2b	134582754	.	A	C	56.1	.	DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=36	PL:GT:GQ	89,21,0:1/1:84
chr2b	134582763	.	G	C	78	.	DP=37;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,36;MQ=34	PL:GT:GQ	111,108,0:1/1:99
chr2b	134809668	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr3	527814	.	C	G	46	.	DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,3,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	76,0,106:0/1:79
chr3	559510	.	G	A	38	.	DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,17,0;MQ=28;PV4=1,1,0.014,1	PL:GT:GQ	68,0,111:0/1:71
chr3	879433	.	T	G	32	.	DP=4;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,0,34:0/1:37
chr3	1809645	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr3	3235812	.	C	T	7.59	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	38,6,0:1/1:49
chr3	3250176	.	A	G	83	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=32	PL:GT:GQ	116,24,0:1/1:96
chr3	5049073	.	T	A	99	.	DP=25;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,9,0;MQ=39;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	136,0,129:0/1:99
chr3	5142874	.	G	A	99	.	DP=38;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,38,0;MQ=28	PL:GT:GQ	179,114,0:1/1:99
chr3	5554864	.	T	C	3.54	.	DP=7;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=27;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	31,0,35:0/1:33
chr3	5749648	.	G	A	21.2	.	DP=26;AF1=0.7303;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,7;MQ=26;PV4=1,0.16,1,0.17	PL:GT:GQ	50,0,2:0/1:3
chr3	16451708	.	A	T	71.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38	PL:GT:GQ	104,15,0:1/1:75
chr3	23410276	.	G	A	99	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45	PL:GT:GQ	140,15,0:1/1:75
chr3	51368824	.	A	G	28	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48	PL:GT:GQ	60,9,0:1/1:63
chr3	53000453	.	A	G	54	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19	PL:GT:GQ	87,30,0:1/1:99
chr3	53000463	.	A	G	54	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19	PL:GT:GQ	87,30,0:1/1:99
chr3	59077423	.	C	T	77.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=33	PL:GT:GQ	110,15,0:1/1:75
chr3	60040501	.	T	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr3	64203481	.	A	G	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr3	67947441	.	C	T	17.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25	PL:GT:GQ	50,12,0:1/1:72
chr3	76372631	.	A	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr3	80611316	.	C	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr3	81554381	.	G	T	17.6	.	DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26	PL:GT:GQ	50,12,0:1/1:72
chr3	87614647	.	A	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr3	93900455	.	A	T	11.6	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13	PL:GT:GQ	44,15,0:1/1:75
chr3	96174457	.	A	G	4.11	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr3	96215569	.	A	C	3.41	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32	PL:GT:GQ	32,6,0:1/1:49
chr3	96587998	.	A	C	7.08	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17	PL:GT:GQ	39,18,0:1/1:90
chr3	99711220	.	A	C	12.8	.	DP=11;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	42,2,0:1/1:37
chr3	99789741	.	C	G	99	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47	PL:GT:GQ	210,51,0:1/1:99
chr3	103667651	.	A	C	3.98	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr3	104604896	.	G	C	55	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50	PL:GT:GQ	87,9,0:1/1:63
chr3	104997217	.	G	A	33.1	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36	PL:GT:GQ	66,19,0:1/1:76
chr3	106097816	.	A	G	28	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=26	PL:GT:GQ	61,45,0:1/1:99
chr3	106822259	.	G	C	99	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=50	PL:GT:GQ	140,15,0:1/1:75
chr3	109946413	.	G	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr3	121238963	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr3	126248567	.	A	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr3	129733836	.	A	G	6.2	.	DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1	PL:GT:GQ	35,0,28:0/1:30
chr3	131372785	.	C	T	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr3	132290987	.	C	T	22	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr3	136054421	.	C	T	73	.	DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28	PL:GT:GQ	106,235,0:1/1:99
chr3	141075246	.	G	A	30.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41	PL:GT:GQ	62,6,0:1/1:49
chr3	141075262	.	T	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr3	141430649	.	G	T	81.8	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25	PL:GT:GQ	113,6,0:1/1:49
chr3	143617747	.	G	T	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr3	163576128	.	C	T	5.6	.	DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	33,0,2:0/1:3
chr3	163839828	.	A	G	4.45	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26	PL:GT:GQ	35,12,0:1/1:72
chr3	175839340	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr3	190193258	.	G	T	3.98	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr3	190777007	.	G	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr3	190970350	.	A	G	61	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37	PL:GT:GQ	94,30,0:1/1:99
chr3	198686408	.	G	A	36.6	.	DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1	PL:GT:GQ	69,11,0:1/1:66
chr3	199277478	.	T	C	3.61	.	DP=6;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21	PL:GT:GQ	34,18,0:1/1:90
chr3	199780181	.	G	T	77	.	DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	107,0,114:0/1:99
chr3	199889335	.	A	C	9.54	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=18	PL:GT:GQ	42,24,0:1/1:96
chr3	200018161	.	A	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr4	195475	.	A	G	13	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr4	639141	.	C	A	14.9	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr4	639152	.	C	T	15.2	.	DP=17;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=33;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	45,0,22:0/1:25
chr4	986497	.	G	T	99	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=33	PL:GT:GQ	163,30,0:1/1:99
chr4	986516	.	C	T	55.1	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=37	PL:GT:GQ	88,21,0:1/1:84
chr4	1207485	.	A	C	14.9	.	DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr4	1323502	.	G	A	13.2	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=22	PL:GT:GQ	46,33,0:1/1:99
chr4	1613521	.	G	A	89	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,16,0;MQ=32	PL:GT:GQ	122,48,0:1/1:99
chr4	1748790	.	C	T	38	.	DP=21;AF1=0.5005;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,8,0;MQ=40;PV4=1,0.09,1,1	PL:GT:GQ	68,0,27:0/1:30
chr4	2255732	.	T	C	99	.	DP=29;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,28,0;MQ=31	PL:GT:GQ	186,84,0:1/1:99
chr4	3010159	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr4	3545023	.	A	G	99	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=38	PL:GT:GQ	145,27,0:1/1:99
chr4	3586344	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr4	3879337	.	A	G	16.6	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	49,12,0:1/1:72
chr4	3940733	.	A	G	47.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31	PL:GT:GQ	80,15,0:1/1:75
chr4	4410338	.	T	C	13.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31	PL:GT:GQ	46,15,0:1/1:75
chr4	4796408	.	T	C	41	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=17	PL:GT:GQ	74,48,0:1/1:99
chr4	4796414	.	A	G	11.3	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,15;MQ=17	PL:GT:GQ	44,45,0:1/1:99
chr4	6436959	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr4	9494256	.	T	C	3.41	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37	PL:GT:GQ	32,6,0:1/1:49
chr4	24881479	.	G	A	14.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42	PL:GT:GQ	46,9,0:1/1:63
chr4	26128644	.	A	G	23	.	DP=18;AF1=0.5006;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,10,0;MQ=22;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	53,0,26:0/1:29
chr4	42109100	.	G	A	17.1	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48	PL:GT:GQ	49,9,0:1/1:63
chr4	42309652	.	C	T	68	.	DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=50	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr4	46913966	.	C	T	9.08	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=16	PL:GT:GQ	41,12,0:1/1:72
chr4	50335142	.	A	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr4	51658550	.	C	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr4	58258023	.	T	C	26	.	DP=5;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=34;PV4=1,1,1,0.05	PL:GT:GQ	56,0,32:0/1:35
chr4	59219112	.	C	A	42.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50	PL:GT:GQ	75,12,0:1/1:72
chr4	62746067	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr4	67404338	.	G	T	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=39	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr4	73353380	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr4	73946294	.	G	C	4.77	.	DP=51;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,3;MQ=40;PV4=1,0.19,0.37,0.11	PL:GT:GQ	33,0,64:0/1:36
chr4	79607484	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr4	82337365	.	G	C	90	.	DP=54;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=28	PL:GT:GQ	123,48,0:1/1:99
chr4	82653801	.	A	G	4.11	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr4	87130164	.	C	T	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr4	87130176	.	G	A	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr4	91459729	.	C	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr4	96130778	.	G	C	99	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45	PL:GT:GQ	211,57,0:1/1:99
chr4	100709417	.	A	G	45.1	.	DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	75,0,17:0/1:20
chr4	107276770	.	C	T	70	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	100,0,97:0/1:98
chr4	115327550	.	G	C	42	.	DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1	PL:GT:GQ	75,162,0:1/1:99
chr4	136558502	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr4	159572459	.	G	A	15.1	.	DP=126;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,69,0,57;MQ=39;PV4=1,4.1e-96,0.077,1	PL:GT:GQ	45,0,175:0/1:48
chr4	174968484	.	G	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr4	175030633	.	T	C	14.3	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=29	PL:GT:GQ	47,18,0:1/1:90
chr4	183410027	.	G	T	6.2	.	DP=31;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.035,1,0.21	PL:GT:GQ	35,0,28:0/1:30
chr4	190907368	.	T	C	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=50	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr4	192175690	.	A	G	76.8	.	DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	105,0,0:1/1:10
chr4	192673268	.	G	A	14.2	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22	PL:GT:GQ	47,27,0:1/1:99
chr4	192943966	.	T	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr4	195460104	.	C	G	23.1	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19	PL:GT:GQ	56,24,0:1/1:96
chr4	198277830	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr5	170098	.	A	G	13	.	DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr5	395814	.	T	C	4.77	.	DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1	PL:GT:GQ	33,0,33:0/1:33
chr5	414024	.	T	A	10.4	.	DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20	PL:GT:GQ	42,9,0:1/1:63
chr5	496767	.	T	C	13.9	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr5	805676	.	C	G	45	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32	PL:GT:GQ	78,51,0:1/1:99
chr5	1252896	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr5	1418370	.	G	A	3.65	.	DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	30,0,2:0/1:3
chr5	1494911	.	G	C	62	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46	PL:GT:GQ	95,24,0:1/1:96
chr5	1494932	.	C	T	6.98	.	DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1	PL:GT:GQ	36,0,31:0/1:33
chr5	1506037	.	T	C	24.1	.	DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	55,5,0:1/1:46
chr5	1509406	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr5	1733649	.	A	G	99	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47	PL:GT:GQ	212,75,0:1/1:99
chr5	1747304	.	A	G	12.3	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19	PL:GT:GQ	45,36,0:1/1:99
chr5	1747308	.	C	A	44	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19	PL:GT:GQ	77,36,0:1/1:99
chr5	3519783	.	C	T	21.1	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18	PL:GT:GQ	54,24,0:1/1:96
chr5	4101593	.	A	G	69.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43	PL:GT:GQ	102,12,0:1/1:72
chr5	7204332	.	T	A	4.61	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr5	11510398	.	A	C	34	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1	PL:GT:GQ	64,0,31:0/1:34
chr5	15406720	.	T	C	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr5	25152417	.	C	A	10.9	.	DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1	PL:GT:GQ	40,0,6:0/1:8
chr5	39072637	.	A	G	35.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50	PL:GT:GQ	68,15,0:1/1:75
chr5	46022699	.	G	A	44	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr5	55664181	.	C	G	10.4	.	DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	40,3,0:1/1:41
chr5	56253386	.	T	C	50.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36	PL:GT:GQ	83,21,0:1/1:84
chr5	56253447	.	C	T	42.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45	PL:GT:GQ	75,12,0:1/1:72
chr5	71950166	.	G	T	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr5	72703090	.	C	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr5	73570280	.	G	T	5.45	.	DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15	PL:GT:GQ	37,123,0:1/1:99
chr5	73701762	.	G	T	40.8	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43	PL:GT:GQ	72,6,0:1/1:49
chr5	76956867	.	T	C	10.2	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46	PL:GT:GQ	41,6,0:1/1:49
chr5	79097961	.	C	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr5	87026167	.	T	C	22	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr5	97680525	.	T	C	3.27	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23	PL:GT:GQ	33,12,0:1/1:72
chr5	100674737	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr5	105389966	.	T	C	3.52	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15	PL:GT:GQ	33,9,0:1/1:63
chr5	109998341	.	A	C	12.7	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	45,12,0:1/1:72
chr5	120629105	.	C	T	6.79	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr5	128383954	.	C	T	23	.	DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1	PL:GT:GQ	53,0,98:0/1:56
chr5	133925142	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr5	135375404	.	T	C	11.8	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1	PL:GT:GQ	42,4,0:1/1:45
chr5	136498281	.	T	G	13.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr5	136717285	.	A	G	82.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48	PL:GT:GQ	115,12,0:1/1:72
chr5	136910734	.	G	A	62	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	95,31,0:1/1:99
chr5	141208149	.	C	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr5	148056348	.	C	A	37.1	.	DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	66,1,0:1/1:23
chr5	151941534	.	G	T	46.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34	PL:GT:GQ	79,12,0:1/1:72
chr5	159967229	.	G	C	22.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35	PL:GT:GQ	55,12,0:1/1:72
chr5	174024541	.	T	G	29.5	.	DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	59,2,0:1/1:37
chr5	175525290	.	A	G	3.27	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20	PL:GT:GQ	33,12,0:1/1:72
chr5	175988954	.	A	C	14.2	.	DP=23;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,6,0,4;MQ=47;PV4=1,1,0.2,1	PL:GT:GQ	44,0,76:0/1:47
chr5	176782226	.	T	C	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr5	179132834	.	C	G	99	.	DP=28;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,28;MQ=41	PL:GT:GQ	207,84,0:1/1:99
chr5	180155809	.	G	C	3.01	.	DP=36;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=35;PV4=1,1e-15,1,1	PL:GT:GQ	30,0,121:0/1:33
chr5	181282819	.	T	G	38.3	.	DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,9;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	71,14,0:1/1:70
chr5	182426125	.	G	C	29	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26	PL:GT:GQ	61,9,0:1/1:63
chr5	182443682	.	G	A	3.69	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=21	PL:GT:GQ	34,15,0:1/1:75
chr5	183008993	.	C	T	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr5	183312016	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr6_cox_hap1	519146	.	G	A	17.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30	PL:GT:GQ	49,9,0:1/1:63
chr6_cox_hap1	687497	.	A	G	33	.	DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1	PL:GT:GQ	63,3,0:1/1:41
chr6_qbl_hap2	120066	.	T	C	99	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37	PL:GT:GQ	139,27,0:1/1:99
chr6	277954	.	C	T	53	.	DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=4,0,37,0;MQ=19;PV4=1,1,0.3,1	PL:GT:GQ	86,49,0:1/1:99
chr6	593158	.	A	G	4.61	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr6	2865562	.	T	G	25	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=23	PL:GT:GQ	58,27,0:1/1:99
chr6	3751403	.	G	A	42.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=32	PL:GT:GQ	75,15,0:1/1:75
chr6	3884989	.	A	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr6	4127278	.	A	T	13.9	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr6	5887783	.	C	G	99	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34	PL:GT:GQ	142,21,0:1/1:84
chr6	5887811	.	C	T	55.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=34	PL:GT:GQ	88,21,0:1/1:84
chr6	6937170	.	G	C	99	.	DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,47;MQ=28	PL:GT:GQ	157,141,0:1/1:99
chr6	7262317	.	C	T	13.2	.	DP=50;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,9,0;MQ=36;PV4=1,4e-05,0.17,0.26	PL:GT:GQ	43,0,158:0/1:46
chr6	7533214	.	A	G	10.4	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26	PL:GT:GQ	42,9,0:1/1:63
chr6	20979907	.	A	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=38	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr6	22321632	.	A	G	41	.	DP=5;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=46;PV4=1,0.24,0.19,0.33	PL:GT:GQ	71,0,28:0/1:31
chr6	25352296	.	G	A	7.8	.	DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=38;PV4=1,1,0.16,1	PL:GT:GQ	37,0,28:0/1:30
chr6	26298040	.	T	A	34	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=48;PV4=1,1,0.21,0.33	PL:GT:GQ	64,0,31:0/1:34
chr6	33428755	.	G	A	70	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=32	PL:GT:GQ	103,27,0:1/1:99
chr6	39512099	.	G	A	55.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=50	PL:GT:GQ	88,21,0:1/1:84
chr6	39961094	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr6	40452120	.	A	G	40.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	72,6,0:1/1:49
chr6	43204766	.	A	G	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=51	PL:GT:GQ	176,24,0:1/1:96
chr6	52696512	.	C	T	70	.	DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1	PL:GT:GQ	100,0,51:0/1:54
chr6	53785550	.	A	G	99	.	DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=46	PL:GT:GQ	190,30,0:1/1:99
chr6	53897484	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr6	57038290	.	C	T	10.2	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	41,6,0:1/1:49
chr6	62925087	.	G	C	35	.	DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1	PL:GT:GQ	65,0,25:0/1:28
chr6	62925094	.	T	C	25.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36	PL:GT:GQ	58,15,0:1/1:75
chr6	70834405	.	G	A	72.1	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29	PL:GT:GQ	105,21,0:1/1:84
chr6	71026058	.	C	T	48.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42	PL:GT:GQ	81,18,0:1/1:90
chr6	74420752	.	T	C	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr6	77498624	.	T	C	16.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33	PL:GT:GQ	48,6,0:1/1:49
chr6	80416836	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr6	113611590	.	A	G	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr6	119308431	.	T	C	38.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40	PL:GT:GQ	71,12,0:1/1:72
chr6	151758592	.	T	C	3.07	.	DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	29,1,0:1/1:23
chr6	151759358	.	A	G	99	.	DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19	PL:GT:GQ	171,0,128:0/1:99
chr6	154741755	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr6	161061053	.	C	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr6	161474189	.	C	T	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr6	164304657	.	C	T	10.4	.	DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049	PL:GT:GQ	40,0,37:0/1:38
chr6	164703105	.	T	C	99	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40	PL:GT:GQ	165,30,0:1/1:99
chr6	167518328	.	A	G	78	.	DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056	PL:GT:GQ	108,0,149:0/1:99
chr6	169906323	.	G	A	41.8	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr6	171893912	.	G	A	69.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33	PL:GT:GQ	102,15,0:1/1:75
chr6	173631604	.	A	G	6.98	.	DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1	PL:GT:GQ	36,0,34:0/1:35
chr7	835856	.	C	T	27.5	.	DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1	PL:GT:GQ	57,2,0:1/1:37
chr7	1046005	.	C	T	11.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr7	1564339	.	C	T	71	.	DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1	PL:GT:GQ	101,0,134:0/1:99
chr7	1806266	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr7	1936013	.	G	T	7.77	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17	PL:GT:GQ	39,9,0:1/1:63
chr7	2319532	.	C	A	4.11	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr7	2682121	.	C	T	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr7	3248116	.	T	C	36.5	.	DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	66,2,0:1/1:37
chr7	3624766	.	C	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	5291140	.	G	C	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr7	5314457	.	C	A	3.56	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18	PL:GT:GQ	34,24,0:1/1:95
chr7	5595072	.	T	A	79	.	DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	109,0,57:0/1:60
chr7	5646060	.	G	C	7.79	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10	PL:GT:GQ	40,30,0:1/1:99
chr7	6056816	.	C	G	7.08	.	DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	35,1,0:1/1:23
chr7	6412641	.	C	T	40	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33	PL:GT:GQ	73,33,0:1/1:99
chr7	6766874	.	A	G	34.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43	PL:GT:GQ	67,15,0:1/1:75
chr7	8482729	.	C	T	5.08	.	DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19	PL:GT:GQ	32,0,1:1/1:5
chr7	9238362	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	9687781	.	G	A	33	.	DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1	PL:GT:GQ	63,0,170:0/1:66
chr7	9752803	.	A	T	14.2	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18	PL:GT:GQ	47,27,0:1/1:99
chr7	10240910	.	T	C	45.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35	PL:GT:GQ	78,12,0:1/1:72
chr7	11046187	.	C	T	86.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47	PL:GT:GQ	119,12,0:1/1:72
chr7	11548207	.	C	G	14.6	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1	PL:GT:GQ	46,7,0:1/1:57
chr7	11580317	.	C	T	42	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	75,23,0:1/1:92
chr7	11585384	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr7	13498356	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr7	13500887	.	G	A	15.1	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22	PL:GT:GQ	48,30,0:1/1:99
chr7	13827079	.	C	T	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr7	14403976	.	T	G	59	.	DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39	PL:GT:GQ	92,24,0:1/1:96
chr7	14756588	.	A	G	44	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1	PL:GT:GQ	74,0,70:0/1:72
chr7	14756619	.	T	G	44	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1	PL:GT:GQ	74,0,70:0/1:72
chr7	36734598	.	A	C	11.1	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40	PL:GT:GQ	42,6,0:1/1:49
chr7	36734599	.	A	T	11.1	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40	PL:GT:GQ	42,6,0:1/1:49
chr7	36734603	.	G	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	40634921	.	A	C	55	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39	PL:GT:GQ	88,39,0:1/1:99
chr7	48271285	.	A	T	73	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25	PL:GT:GQ	106,30,0:1/1:99
chr7	56264700	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	62326003	.	C	A	26.1	.	DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28	PL:GT:GQ	59,18,0:1/1:90
chr7	109468934	.	T	G	5.13	.	DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1	PL:GT:GQ	33,2,0:1/1:37
chr7	110208327	.	C	G	16.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	48,6,0:1/1:49
chr7	125654934	.	A	G	4.11	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=27	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr7	125770209	.	A	C	32	.	DP=31;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,13,0;MQ=34;PV4=1,0.00017,0.16,0.22	PL:GT:GQ	62,0,105:0/1:65
chr7	125770265	.	G	C	36	.	DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,0.0047,0.016,0.035	PL:GT:GQ	66,0,110:0/1:69
chr7	126687042	.	A	G	21.1	.	DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=22	PL:GT:GQ	54,21,0:1/1:84
chr7	132292897	.	G	T	99	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=43	PL:GT:GQ	167,21,0:1/1:84
chr7	132334562	.	A	C	23	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=23	PL:GT:GQ	56,30,0:1/1:99
chr7	132431838	.	C	T	13.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,4,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	44,5,0:1/1:46
chr7	136324945	.	T	C	13.7	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	46,12,0:1/1:72
chr7	136957634	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	141746871	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr7	146831870	.	C	T	4.77	.	DP=14;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.0029,0.28,1	PL:GT:GQ	33,0,28:0/1:30
chr7	147142770	.	T	C	45	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=31	PL:GT:GQ	77,9,0:1/1:63
chr7	147713906	.	C	T	4.77	.	DP=8;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,8.9e-06,0.48,0.27	PL:GT:GQ	33,0,29:0/1:31
chr7	148742642	.	G	A	68	.	DP=14;AF1=0.5032;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,10,0;MQ=28;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	98,0,19:0/1:22
chr7	148879148	.	C	T	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr7	149484407	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr7	152444478	.	A	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr7	154106613	.	C	T	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=51	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr7	154776891	.	G	T	14.4	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31	PL:GT:GQ	47,15,0:1/1:75
chr7	155882061	.	A	C	29	.	DP=24;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,4;MQ=46;PV4=1,0.018,0.15,0.29	PL:GT:GQ	59,0,21:0/1:24
chr7	155956844	.	G	C	23	.	DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,4;MQ=38;PV4=1,1,0.38,1	PL:GT:GQ	53,0,103:0/1:56
chr7	156277694	.	G	A	62	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=46	PL:GT:GQ	95,24,0:1/1:96
chr7	156720588	.	T	C	16.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29	PL:GT:GQ	48,9,0:1/1:63
chr7	156807649	.	T	C	3.01	.	DP=30;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,3;MQ=43;PV4=1,0.16,0.15,1	PL:GT:GQ	30,0,72:0/1:33
chr7	157331292	.	G	T	43.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34	PL:GT:GQ	76,21,0:1/1:84
chr7	157382957	.	T	C	33.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr8	556382	.	A	G	37.1	.	DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	66,1,0:1/1:23
chr8	1661673	.	T	C	9.31	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr8	7379751	.	C	A	6.24	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19	PL:GT:GQ	38,21,0:1/1:84
chr8	8160505	.	A	T	68.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	101,12,0:1/1:72
chr8	8160508	.	C	T	24.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	57,12,0:1/1:72
chr8	16781011	.	A	G	55.5	.	DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34	PL:GT:GQ	88,12,0:1/1:72
chr8	18716499	.	A	T	20	.	DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	50,0,52:0/1:51
chr8	23326483	.	A	G	60	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47	PL:GT:GQ	92,9,0:1/1:63
chr8	25842819	.	T	A	12	.	DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47	PL:GT:GQ	43,6,0:1/1:49
chr8	26300279	.	T	C	34	.	DP=44;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=21	PL:GT:GQ	67,123,0:1/1:99
chr8	29673470	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr8	29673473	.	C	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr8	31685466	.	C	T	34	.	DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36	PL:GT:GQ	64,0,50:0/1:53
chr8	37378739	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr8	51325952	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr8	59221963	.	G	A	16.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29	PL:GT:GQ	48,9,0:1/1:63
chr8	62764995	.	T	G	20	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32	PL:GT:GQ	52,9,0:1/1:63
chr8	63157426	.	C	G	41.6	.	DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25	PL:GT:GQ	74,11,0:1/1:66
chr8	68710444	.	G	A	30	.	DP=5;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=3,0,2,0;MQ=32;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	59,0,3:0/1:5
chr8	76416560	.	G	A	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=46	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr8	81425275	.	T	G	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=50	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr8	89842286	.	G	C	4.61	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr8	100926281	.	G	A	38	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41	PL:GT:GQ	70,9,0:1/1:63
chr8	102746002	.	G	C	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr8	107850176	.	C	T	43.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=45	PL:GT:GQ	76,18,0:1/1:90
chr8	109966441	.	T	C	27.3	.	DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38	PL:GT:GQ	60,15,0:1/1:75
chr8	118811716	.	G	T	99	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50	PL:GT:GQ	155,18,0:1/1:90
chr8	119440254	.	A	T	58.5	.	DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14	PL:GT:GQ	87,0,1:1/1:5
chr8	121236024	.	G	A	39.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	71,6,0:1/1:49
chr8	125489079	.	C	T	13	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr8	128502549	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr8	128502551	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr8	130951113	.	G	A	4.61	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr8	135307123	.	G	A	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr8	138814155	.	C	T	57.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46	PL:GT:GQ	90,18,0:1/1:90
chr8	140566111	.	A	G	18.1	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15	PL:GT:GQ	51,36,0:1/1:99
chr8	141586480	.	T	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr8	143376712	.	A	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr8	150662729	.	T	C	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr8	150741294	.	A	G	25.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34	PL:GT:GQ	58,18,0:1/1:90
chr8	150975618	.	A	G	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr8	151580103	.	T	C	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr8	151634410	.	G	T	48	.	DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1	PL:GT:GQ	78,0,125:0/1:81
chr8	151709267	.	G	A	91.1	.	DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37	PL:GT:GQ	121,0,16:0/1:19
chr8	152636420	.	G	A	8.75	.	DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	37,1,0:1/1:23
chr8	152706967	.	G	A	3.01	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16	PL:GT:GQ	33,30,0:1/1:99
chr8	152786522	.	T	C	80.1	.	DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1	PL:GT:GQ	110,0,14:0/1:17
chr8	152863132	.	T	G	5.44	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30	PL:GT:GQ	36,9,0:1/1:63
chr9	23235268	.	C	T	12	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32	PL:GT:GQ	43,6,0:1/1:49
chr9	26391176	.	T	C	15.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	47,6,0:1/1:49
chr9	26868232	.	C	G	63	.	DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44	PL:GT:GQ	93,0,20:0/1:23
chr9	34223668	.	C	T	22	.	DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1	PL:GT:GQ	52,0,79:0/1:55
chr9	39696645	.	G	A	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr9	40654130	.	T	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr9	41145321	.	T	G	46.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33	PL:GT:GQ	79,12,0:1/1:72
chr9	42273483	.	G	A	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr9	55633192	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr9	58705807	.	T	C	70	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24	PL:GT:GQ	103,30,0:1/1:99
chr9	61697149	.	C	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr9	63152790	.	A	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr9	63703913	.	C	G	90.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38	PL:GT:GQ	123,21,0:1/1:84
chr9	65116068	.	T	C	70	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49	PL:GT:GQ	103,39,0:1/1:99
chr9	71266598	.	C	A	3.98	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr9	73188677	.	G	T	52	.	DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1	PL:GT:GQ	85,147,0:1/1:99
chr9	78854179	.	G	T	22	.	DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033	PL:GT:GQ	52,0,158:0/1:55
chr9	82964679	.	A	C	13.2	.	DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36	PL:GT:GQ	45,9,0:1/1:63
chr9	84124545	.	G	T	57	.	DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1	PL:GT:GQ	87,0,59:0/1:62
chr9	86552862	.	C	T	14.4	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26	PL:GT:GQ	47,15,0:1/1:75
chr9	87548941	.	A	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr9	89021101	.	G	A	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr9	90447825	.	G	A	9.31	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr9	92462035	.	C	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr9	93077294	.	T	G	5.44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31	PL:GT:GQ	36,9,0:1/1:63
chr9	93998137	.	G	A	68	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr9	93998148	.	C	T	21.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36	PL:GT:GQ	54,15,0:1/1:75
chr9	95028964	.	C	A	99	.	DP=83;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,57,0,26;MQ=32;PV4=1,9.3e-08,1,0.092	PL:GT:GQ	134,0,120:0/1:99
chr9	103829155	.	A	G	33	.	DP=96;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,96,0;MQ=16	PL:GT:GQ	66,255,0:1/1:99
chr9	104981331	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr9	111070656	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr9	117395657	.	T	C	16.4	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	49,15,0:1/1:75
chr9	117718907	.	A	G	46.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=29	PL:GT:GQ	79,18,0:1/1:90
chr9	119149161	.	T	C	3.14	.	DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22	PL:GT:GQ	33,15,0:1/1:75
chr9	124528802	.	G	A	78	.	DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=25	PL:GT:GQ	111,39,0:1/1:99
chr9	126707903	.	G	A	26	.	DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,21,0,8;MQ=46;PV4=1,2.6e-07,0.21,0.42	PL:GT:GQ	56,0,175:0/1:59
chr9	128700686	.	C	G	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr9	129084077	.	G	A	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=41	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr9	129116900	.	A	T	20	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30	PL:GT:GQ	52,9,0:1/1:63
chr9	130290720	.	C	G	21.8	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42	PL:GT:GQ	53,6,0:1/1:49
chr9	130306057	.	C	G	71	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=28	PL:GT:GQ	104,42,0:1/1:99
chr9	130528990	.	G	A	99	.	DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,31,0;MQ=27	PL:GT:GQ	174,93,0:1/1:99
chr9	130529002	.	A	T	7.79	.	DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=15	PL:GT:GQ	40,33,0:1/1:99
chr9	130639996	.	A	G	8.44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	39,6,0:1/1:49
chr9	130704890	.	A	G	3.27	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=26	PL:GT:GQ	33,12,0:1/1:72
chr9	130708345	.	G	A	13.3	.	DP=11;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=38;PV4=1,0.096,1,1	PL:GT:GQ	42,1,0:1/1:23
chr9	131001601	.	T	A	3.98	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr9	131058539	.	T	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr9	131808965	.	C	T	42	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37	PL:GT:GQ	75,27,0:1/1:99
chr9	132551867	.	C	T	17.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25	PL:GT:GQ	49,9,0:1/1:63
chr9	132685120	.	A	G	4.75	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25	PL:GT:GQ	35,9,0:1/1:63
chr9	133175050	.	A	G	18.1	.	DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=20	PL:GT:GQ	51,51,0:1/1:99
chr9	133584978	.	A	G	99	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=45	PL:GT:GQ	212,75,0:1/1:99
chr9	133661895	.	A	G	99	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31	PL:GT:GQ	138,42,0:1/1:99
chr9	133670376	.	T	C	68	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,16;MQ=39;PV4=1,1.4e-20,1,1	PL:GT:GQ	101,39,0:1/1:99
chr9	133843777	.	T	C	99	.	DP=9;AF1=0.5129;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,8,0;MQ=43;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	154,0,13:0/1:16
chr9	134017265	.	G	C	3.27	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=13	PL:GT:GQ	33,12,0:1/1:72
chr9	134105563	.	T	C	34.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=39	PL:GT:GQ	67,18,0:1/1:90
chr9	134608906	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr9	134861929	.	T	A	9.49	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30	PL:GT:GQ	41,9,0:1/1:63
chr10	796662	.	A	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr10	1216716	.	T	A	18.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr10	1220781	.	G	A	21	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18	PL:GT:GQ	54,27,0:1/1:99
chr10	1225208	.	T	C	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=47	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr10	1727946	.	T	C	14.2	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27	PL:GT:GQ	47,21,0:1/1:84
chr10	5986542	.	T	C	83	.	DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39	PL:GT:GQ	116,30,0:1/1:99
chr10	6436277	.	G	A	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr10	7704114	.	C	A	35	.	DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,4;MQ=29;PV4=1,0.27,1,0.27	PL:GT:GQ	65,3,0:1/1:41
chr10	10881734	.	A	G	9.52	.	DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1	PL:GT:GQ	39,0,91:0/1:42
chr10	13099383	.	G	A	27.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48	PL:GT:GQ	60,12,0:1/1:72
chr10	15764077	.	G	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr10	18091502	.	T	C	47	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38	PL:GT:GQ	79,9,0:1/1:63
chr10	19645913	.	A	T	15.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43	PL:GT:GQ	47,6,0:1/1:49
chr10	22845062	.	C	T	18.1	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=18	PL:GT:GQ	51,21,0:1/1:84
chr10	28282802	.	T	C	69	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=42	PL:GT:GQ	102,36,0:1/1:99
chr10	28496872	.	T	G	8.44	.	DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	39,6,0:1/1:49
chr10	32746793	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr10	41437604	.	T	G	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr10	43051239	.	C	T	6.98	.	DP=3;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=40;PV4=1,0.33,0.33,1	PL:GT:GQ	36,0,31:0/1:33
chr10	44455192	.	C	T	4.41	.	DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	31,0,1:1/1:5
chr10	48387336	.	A	G	13	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr10	51561705	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr10	51561712	.	C	G	39.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	71,6,0:1/1:49
chr10	55617954	.	G	A	8.44	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31	PL:GT:GQ	39,6,0:1/1:49
chr10	55718281	.	T	A	3.41	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32	PL:GT:GQ	32,6,0:1/1:49
chr10	55888771	.	T	C	23.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43	PL:GT:GQ	56,12,0:1/1:72
chr10	56025569	.	C	G	34.1	.	DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	64,0,16:0/1:19
chr10	57384943	.	G	T	84	.	DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1	PL:GT:GQ	114,0,110:0/1:99
chr10	59873077	.	T	G	49	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42	PL:GT:GQ	82,24,0:1/1:96
chr10	61329572	.	C	T	15.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	47,6,0:1/1:49
chr10	63790636	.	T	G	32.1	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1	PL:GT:GQ	65,22,0:1/1:88
chr10	64466048	.	C	G	18.2	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28	PL:GT:GQ	51,18,0:1/1:90
chr10	65053440	.	G	T	99	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39	PL:GT:GQ	153,30,0:1/1:99
chr10	65407358	.	C	G	84.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45	PL:GT:GQ	117,15,0:1/1:75
chr10	65605291	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr10	66104447	.	T	C	99	.	DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1	PL:GT:GQ	136,0,162:0/1:99
chr10	82160859	.	G	C	99	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36	PL:GT:GQ	153,39,0:1/1:99
chr10	82198579	.	C	T	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr10	87086290	.	A	G	4.13	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17	PL:GT:GQ	35,27,0:1/1:99
chr10	89550621	.	T	G	74	.	DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45	PL:GT:GQ	107,135,0:1/1:99
chr10	92325046	.	G	A	42.3	.	DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45	PL:GT:GQ	75,15,0:1/1:75
chr10	94488050	.	A	G	5.46	.	DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1	PL:GT:GQ	34,0,34:0/1:34
chr10	95024815	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr10	95466306	.	G	A	53	.	DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	82,0,3:0/1:5
chr10	100256777	.	T	G	3.83	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23	PL:GT:GQ	34,12,0:1/1:72
chr10	101510485	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr10	101530760	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr10	101879744	.	T	C	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr10	102147276	.	G	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr10	102642248	.	T	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr10	107666616	.	T	C	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr10	108319945	.	C	G	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr10	109734371	.	G	A	12.7	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,12,0:1/1:72
chr10	112870604	.	C	T	46.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36	PL:GT:GQ	79,12,0:1/1:72
chr10	115304673	.	T	C	11.3	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr10	119380588	.	G	A	14.2	.	DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1	PL:GT:GQ	44,0,21:0/1:24
chr10	123063756	.	C	T	14.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23	PL:GT:GQ	46,9,0:1/1:63
chr10	128424770	.	T	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr10	131229204	.	T	C	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr10	132420570	.	G	C	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr10	132528066	.	C	T	99	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42	PL:GT:GQ	213,57,0:1/1:99
chr10	132644619	.	G	A	19.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23	PL:GT:GQ	52,15,0:1/1:75
chr10	132707581	.	G	C	9.11	.	DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	38,2,0:1/1:37
chr10	133026892	.	T	C	55.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44	PL:GT:GQ	88,18,0:1/1:90
chr11	768033	.	T	C	33.5	.	DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,0,1:1/1:5
chr11	768042	.	T	C	33.5	.	DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,0,1:1/1:5
chr11	874568	.	G	C	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr11	1009210	.	T	C	4	.	DP=70;AF1=0.6241;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,8;MQ=24;PV4=1,1,0.5,1	PL:GT:GQ	31,0,4:0/1:6
chr11	1016692	.	C	T	27	.	DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=22	PL:GT:GQ	60,114,0:1/1:99
chr11	1034477	.	A	G	66	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42	PL:GT:GQ	98,9,0:1/1:63
chr11	1074037	.	G	A	4.13	.	DP=9;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=24;PV4=1,1,0.43,1	PL:GT:GQ	32,0,30:0/1:31
chr11	1556298	.	G	A	11.8	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33	PL:GT:GQ	44,12,0:1/1:72
chr11	1824777	.	T	C	27	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=28	PL:GT:GQ	60,30,0:1/1:99
chr11	3395801	.	C	T	22	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr11	3411901	.	G	A	4.75	.	DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29	PL:GT:GQ	35,9,0:1/1:63
chr11	3731606	.	A	C	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr11	3783855	.	C	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr11	3967636	.	A	G	4.29	.	DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24	PL:GT:GQ	35,15,0:1/1:75
chr11	4385618	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr11	4424365	.	T	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr11	5295586	.	C	T	3.01	.	DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17	PL:GT:GQ	30,0,131:0/1:33
chr11	6157144	.	C	G	45.1	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=35	PL:GT:GQ	78,21,0:1/1:84
chr11	6352044	.	C	T	18	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=31	PL:GT:GQ	50,9,0:1/1:63
chr11	6767356	.	T	C	9.63	.	DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=29;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	38,1,0:1/1:23
chr11	6999404	.	G	C	21	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=37	PL:GT:GQ	53,9,0:1/1:63
chr11	9120930	.	C	G	17.6	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25	PL:GT:GQ	50,12,0:1/1:72
chr11	9373125	.	T	C	19.8	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	51,6,0:1/1:49
chr11	9585101	.	C	T	67	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=45	PL:GT:GQ	100,42,0:1/1:99
chr11	10266192	.	A	C	14.3	.	DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27	PL:GT:GQ	47,18,0:1/1:90
chr11	10303263	.	T	C	8.64	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18	PL:GT:GQ	41,51,0:1/1:99
chr11	10420170	.	T	C	35	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4	PL:GT:GQ	68,36,0:1/1:99
chr11	10912169	.	G	A	99	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=49	PL:GT:GQ	155,18,0:1/1:90
chr11	11315826	.	T	G	6.29	.	DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19	PL:GT:GQ	38,18,0:1/1:90
chr11	11603859	.	A	C	22	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1	PL:GT:GQ	52,0,115:0/1:55
chr11	11700034	.	C	T	33	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=30	PL:GT:GQ	66,27,0:1/1:99
chr11	11822758	.	G	A	15.1	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1	PL:GT:GQ	45,0,88:0/1:48
chr11	11976636	.	C	T	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=24	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr11	14380517	.	C	G	16.1	.	DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1	PL:GT:GQ	46,0,113:0/1:49
chr11	14419212	.	A	G	91.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38	PL:GT:GQ	124,18,0:1/1:90
chr11	14846792	.	A	G	55	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19	PL:GT:GQ	88,33,0:1/1:99
chr11	15494556	.	C	T	99	.	DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1	PL:GT:GQ	146,0,159:0/1:99
chr11	16262879	.	A	C	16.1	.	DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33	PL:GT:GQ	46,0,28:0/1:31
chr11	21514947	.	T	C	24.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41	PL:GT:GQ	57,12,0:1/1:72
chr11	22532576	.	C	G	28	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17	PL:GT:GQ	61,51,0:1/1:99
chr11	23529238	.	G	T	4.29	.	DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21	PL:GT:GQ	32,0,9:0/1:12
chr11	24249554	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr11	24853167	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr11	33353903	.	T	C	24.3	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36	PL:GT:GQ	57,15,0:1/1:75
chr11	35126569	.	T	C	24.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43	PL:GT:GQ	57,12,0:1/1:72
chr11	35132248	.	C	T	18.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr11	35155482	.	T	C	68	.	DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46	PL:GT:GQ	101,66,0:1/1:99
chr11	52494088	.	T	C	99	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37	PL:GT:GQ	140,27,0:1/1:99
chr11	57899943	.	C	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr11	62261460	.	G	T	19.1	.	DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1	PL:GT:GQ	49,0,58:0/1:51
chr11	67456049	.	C	T	39.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19	PL:GT:GQ	72,18,0:1/1:90
chr11	68509708	.	C	G	3.65	.	DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	30,0,2:0/1:3
chr11	70115115	.	T	A	99	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49	PL:GT:GQ	140,15,0:1/1:75
chr11	72643951	.	T	C	70	.	DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39	PL:GT:GQ	103,66,0:1/1:99
chr11	72647930	.	G	A	36	.	DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1	PL:GT:GQ	66,0,28:0/1:31
chr11	73330148	.	C	T	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr11	81720893	.	A	G	5.83	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19	PL:GT:GQ	37,12,0:1/1:72
chr11	83813797	.	A	G	23.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43	PL:GT:GQ	56,12,0:1/1:72
chr11	85949488	.	C	A	54	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37	PL:GT:GQ	87,42,0:1/1:99
chr11	87634829	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr11	90913093	.	A	T	35.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	67,6,0:1/1:49
chr11	93793348	.	G	A	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31	PL:GT:GQ	139,24,0:1/1:96
chr11	100802294	.	T	C	16.6	.	DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35	PL:GT:GQ	49,12,0:1/1:72
chr11	107455449	.	C	T	8.44	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26	PL:GT:GQ	39,6,0:1/1:49
chr11	111344355	.	A	G	69.5	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43	PL:GT:GQ	102,12,0:1/1:72
chr11	111611115	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr11	113050466	.	G	C	6.02	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30	PL:GT:GQ	36,6,0:1/1:49
chr11	114332544	.	T	C	3.54	.	DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1	PL:GT:GQ	31,0,37:0/1:33
chr11	114332549	.	G	A	3.54	.	DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1	PL:GT:GQ	31,0,127:0/1:34
chr11	114843578	.	G	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr11	115580279	.	A	G	99	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48	PL:GT:GQ	190,45,0:1/1:99
chr11	116434328	.	G	A	17.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	50,12,0:1/1:72
chr11	125914161	.	A	G	20.8	.	DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1	PL:GT:GQ	49,0,0:1/1:10
chr11	125917089	.	C	T	12.3	.	DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1	PL:GT:GQ	42,0,167:0/1:45
chr11	127194100	.	A	G	60	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49	PL:GT:GQ	93,24,0:1/1:96
chr12	70856	.	G	A	27.5	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	60,12,0:1/1:72
chr12	153693	.	T	C	52.3	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38	PL:GT:GQ	85,15,0:1/1:75
chr12	924547	.	C	G	37.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	69,6,0:1/1:49
chr12	1555916	.	G	A	7.18	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	39,15,0:1/1:75
chr12	1919860	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr12	2283756	.	G	A	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr12	2805983	.	G	C	12.7	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35	PL:GT:GQ	45,12,0:1/1:72
chr12	6088203	.	T	C	72.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37	PL:GT:GQ	105,15,0:1/1:75
chr12	7099460	.	G	C	10.8	.	DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1	PL:GT:GQ	39,0,1:1/1:5
chr12	7099464	.	G	A	13.3	.	DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1	PL:GT:GQ	42,1,0:1/1:23
chr12	7198516	.	T	G	4.61	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	34,6,0:1/1:49
chr12	23331895	.	C	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr12	28209020	.	T	G	14.4	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31	PL:GT:GQ	47,15,0:1/1:75
chr12	30074073	.	C	T	32.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	64,6,0:1/1:49
chr12	30563452	.	T	C	25	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46	PL:GT:GQ	57,9,0:1/1:63
chr12	30563453	.	A	G	25	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46	PL:GT:GQ	57,9,0:1/1:63
chr12	30563464	.	C	A	78.8	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1	PL:GT:GQ	110,6,0:1/1:49
chr12	31505085	.	G	A	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr12	34041336	.	G	A	5.46	.	DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21	PL:GT:GQ	34,0,34:0/1:34
chr12	49003648	.	C	G	42	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39	PL:GT:GQ	75,24,0:1/1:96
chr12	51280690	.	G	A	69	.	DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1	PL:GT:GQ	99,0,84:0/1:87
chr12	69206633	.	T	C	17.1	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17	PL:GT:GQ	50,33,0:1/1:99
chr12	80417253	.	T	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr12	86633033	.	C	T	34	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=43;PV4=1,1,0.33,1	PL:GT:GQ	64,0,31:0/1:34
chr12	98097274	.	C	T	47.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=31	PL:GT:GQ	80,15,0:1/1:75
chr12	105269319	.	C	T	19	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=26	PL:GT:GQ	51,9,0:1/1:63
chr12	109053425	.	G	A	9.53	.	DP=8;AF1=0.5012;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,6,0;MQ=25;PV4=1,1,0.19,1	PL:GT:GQ	39,0,23:0/1:26
chr12	111904540	.	A	G	3.41	.	DP=65;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31	PL:GT:GQ	32,6,0:1/1:49
chr12	115038686	.	T	C	15.2	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=27	PL:GT:GQ	48,21,0:1/1:84
chr12	115039419	.	A	G	4.11	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=30	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr12	115103890	.	G	A	66	.	DP=39;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,38;MQ=49	PL:GT:GQ	99,114,0:1/1:99
chr12	115833830	.	G	A	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr12	116361873	.	T	G	6.34	.	DP=5;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=23;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	34,0,2:0/1:3
chr12	123583527	.	G	A	14.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25	PL:GT:GQ	46,9,0:1/1:63
chr12	124115330	.	A	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=38	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr12	125062296	.	G	A	41.8	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr12	126718106	.	A	G	8.76	.	DP=50;AF1=0.5163;CI95=0.5,1;DP4=2,0,6,0;MQ=26;PV4=1,0.33,0.37,1	PL:GT:GQ	38,0,12:0/1:15
chr12	133348311	.	G	A	24	.	DP=18;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=14,0,3,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	54,0,118:0/1:57
chr12	134494475	.	C	T	28	.	DP=18;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=8,0,10,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	57,0,3:0/1:5
chr12	134831761	.	C	T	41.3	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=27	PL:GT:GQ	74,15,0:1/1:75
chr12	134992770	.	A	C,T	84	.	DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,26,0;MQ=29	PL:GT:GQ	117,72,114,0,44,114:1/1:99
chr12	135261117	.	G	A	49.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46	PL:GT:GQ	82,18,0:1/1:90
chr12	135261144	.	A	G	99	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46	PL:GT:GQ	155,18,0:1/1:90
chr12	135460302	.	G	A	99	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=40	PL:GT:GQ	198,69,0:1/1:99
chr12	135463758	.	A	G	83	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,16;MQ=26	PL:GT:GQ	116,48,0:1/1:99
chr12	135523325	.	G	A	99	.	DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=26	PL:GT:GQ	136,66,0:1/1:99
chr12	135782401	.	T	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr12	135795472	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr13	18040027	.	G	C	42	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=33	PL:GT:GQ	74,9,0:1/1:63
chr13	19494625	.	G	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr13	20121126	.	A	G	15.1	.	DP=36;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=25,0,9,0;MQ=36;PV4=1,1,0.13,1	PL:GT:GQ	45,0,153:0/1:48
chr13	21536703	.	A	G	9.31	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr13	23160035	.	G	T	3.98	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr13	23476554	.	C	A	6.79	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr13	26632967	.	C	G	32	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=34	PL:GT:GQ	65,27,0:1/1:99
chr13	26790010	.	T	C	89.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35	PL:GT:GQ	122,15,0:1/1:75
chr13	36083571	.	T	C	43	.	DP=84;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,37,0;MQ=16;PV4=1,1,1,0.3	PL:GT:GQ	76,99,0:1/1:99
chr13	44432419	.	C	T	3.58	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=19	PL:GT:GQ	34,21,0:1/1:84
chr13	46592359	.	T	C	16.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	48,6,0:1/1:49
chr13	52764657	.	A	T	3.14	.	DP=32;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=22	PL:GT:GQ	33,15,0:1/1:75
chr13	53084193	.	C	T	9.11	.	DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	38,2,0:1/1:37
chr13	57763228	.	C	T	45	.	DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3	PL:GT:GQ	78,45,0:1/1:99
chr13	73857921	.	G	C	31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49	PL:GT:GQ	63,9,0:1/1:63
chr13	76718001	.	G	A	59	.	DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1	PL:GT:GQ	89,0,28:0/1:31
chr13	100912695	.	A	T	23	.	DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35	PL:GT:GQ	53,0,103:0/1:56
chr13	101332001	.	G	C	21	.	DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21	PL:GT:GQ	54,69,0:1/1:99
chr13	102637334	.	C	T	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr13	102895627	.	C	T	63	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=48	PL:GT:GQ	96,27,0:1/1:99
chr13	103830322	.	T	C	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr13	112842448	.	G	A	39	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=27	PL:GT:GQ	72,27,0:1/1:99
chr13	113310291	.	C	T	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr13	114775162	.	A	G	80	.	DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21	PL:GT:GQ	113,51,0:1/1:99
chr13	115267482	.	A	G	16.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29	PL:GT:GQ	48,9,0:1/1:63
chr13	116068676	.	C	T	3.83	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27	PL:GT:GQ	34,12,0:1/1:72
chr13	116455918	.	A	G	33	.	DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1	PL:GT:GQ	63,0,146:0/1:66
chr13	116765012	.	G	A	30.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	62,6,0:1/1:49
chr13	116779773	.	C	T	17.1	.	DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1	PL:GT:GQ	47,0,106:0/1:50
chr13	116779791	.	C	T	57	.	DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	87,0,103:0/1:90
chr14	20159250	.	C	T	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr14	23510676	.	T	C	52	.	DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32	PL:GT:GQ	85,66,0:1/1:99
chr14	24735256	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr14	29525577	.	G	A	21	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16	PL:GT:GQ	54,27,0:1/1:99
chr14	36186389	.	C	T	6.79	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr14	36186394	.	A	G	6.79	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr14	37440609	.	A	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr14	40432807	.	A	G	18.6	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr14	59466268	.	T	C	15.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25	PL:GT:GQ	47,9,0:1/1:63
chr14	61368162	.	G	T	7.18	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17	PL:GT:GQ	39,15,0:1/1:75
chr14	65152922	.	G	A	92	.	DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1	PL:GT:GQ	122,0,144:0/1:99
chr14	69749148	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr14	74877658	.	C	T	45	.	DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39	PL:GT:GQ	78,28,0:1/1:99
chr14	75546678	.	C	T	19.2	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17	PL:GT:GQ	52,18,0:1/1:90
chr14	76439185	.	T	C	67.1	.	DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29	PL:GT:GQ	97,0,17:0/1:20
chr14	77313295	.	T	A	99	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48	PL:GT:GQ	191,30,0:1/1:99
chr14	77673422	.	G	A	11.5	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24	PL:GT:GQ	44,18,0:1/1:90
chr14	78646125	.	T	C	99	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40	PL:GT:GQ	153,24,0:1/1:96
chr14	91702449	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr14	91769842	.	G	A	63	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47	PL:GT:GQ	95,9,0:1/1:63
chr14	91775899	.	C	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr14	91775924	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr14	93482918	.	A	C	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr14	93665819	.	C	T	75	.	DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	105,0,31:0/1:34
chr14	95422276	.	A	G	55.1	.	DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45	PL:GT:GQ	88,21,0:1/1:84
chr14	95731986	.	C	T	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr14	96045464	.	A	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr14	97172020	.	C	T	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr14	100515480	.	A	G	6.98	.	DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33	PL:GT:GQ	36,0,30:0/1:32
chr14	100770214	.	A	T	8.69	.	DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16	PL:GT:GQ	41,21,0:1/1:84
chr14	101258303	.	G	A	82	.	DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26	PL:GT:GQ	115,45,0:1/1:99
chr14	101701492	.	C	G	66	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49	PL:GT:GQ	99,30,0:1/1:99
chr14	102113772	.	T	C	3.98	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30	PL:GT:GQ	33,6,0:1/1:49
chr14	102751431	.	A	C	36.5	.	DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	66,2,0:1/1:37
chr14	103708033	.	A	G	99	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27	PL:GT:GQ	141,36,0:1/1:99
chr14	104744582	.	G	A	3.52	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25	PL:GT:GQ	33,9,0:1/1:63
chr14	105989100	.	C	T	3.14	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	33,15,0:1/1:75
chr14	105989162	.	C	T	3.65	.	DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	30,0,2:0/1:3
chr14	106234810	.	G	A	25.3	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39	PL:GT:GQ	58,15,0:1/1:75
chr14	106995572	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr14	107283057	.	T	C	5.5	.	DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20	PL:GT:GQ	37,21,0:1/1:84
chr14	107285319	.	T	C	33	.	DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22	PL:GT:GQ	66,105,0:1/1:99
chr14	107640449	.	A	G	11.8	.	DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36	PL:GT:GQ	44,12,0:1/1:72
chr15	20082092	.	T	G	18.3	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24	PL:GT:GQ	51,15,0:1/1:75
chr15	22955884	.	T	C	67	.	DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,12,0;MQ=48	PL:GT:GQ	100,36,0:1/1:99
chr15	22971987	.	A	G	5.29	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=22	PL:GT:GQ	35,6,0:1/1:49
chr15	23233324	.	C	A	47	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31	PL:GT:GQ	80,42,0:1/1:99
chr15	25175286	.	C	T	36.5	.	DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	66,2,0:1/1:37
chr15	25385709	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr15	27372396	.	A	G	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=40	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr15	35998093	.	C	T	9.53	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=17	PL:GT:GQ	42,27,0:1/1:99
chr15	36716538	.	C	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr15	36793360	.	G	T	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr15	53783097	.	A	G	10.5	.	DP=31;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16	PL:GT:GQ	43,21,0:1/1:84
chr15	54180175	.	C	T	10.4	.	DP=7;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=27;PV4=1,1.2e-05,1,1	PL:GT:GQ	40,0,32:0/1:34
chr15	54939306	.	C	T	99	.	DP=34;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,16;MQ=49;PV4=1,1,0.18,1	PL:GT:GQ	172,0,181:0/1:99
chr15	59377916	.	C	T	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr15	59685961	.	G	C	68	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=36	PL:GT:GQ	101,33,0:1/1:99
chr15	60306384	.	A	G	18.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr15	60345642	.	G	C	14.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr15	60367387	.	G	A	13.2	.	DP=6;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,3,0;MQ=34;PV4=1,0.098,0.24,1	PL:GT:GQ	43,0,35:0/1:37
chr15	60367446	.	C	T	44	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41	PL:GT:GQ	76,9,0:1/1:63
chr15	61763755	.	G	A	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=45	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr15	61831362	.	C	G	11.3	.	DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=30;PV4=1,0.00077,0.47,1	PL:GT:GQ	41,0,42:0/1:41
chr15	63978880	.	G	C	60	.	DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	90,3,0:1/1:41
chr15	64342445	.	A	G	12.2	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=18	PL:GT:GQ	44,9,0:1/1:63
chr15	65424859	.	T	C	11.3	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=21	PL:GT:GQ	44,30,0:1/1:99
chr15	65603698	.	C	T	60	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	92,9,0:1/1:63
chr15	67005078	.	G	A	13.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr15	71133512	.	G	C	22.3	.	DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25	PL:GT:GQ	55,15,0:1/1:75
chr15	72619009	.	A	G	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=48	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr15	73272688	.	C	T	70.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=39	PL:GT:GQ	103,15,0:1/1:75
chr15	73699335	.	T	A	99	.	DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=45	PL:GT:GQ	175,27,0:1/1:99
chr15	74513352	.	C	T	99	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=37	PL:GT:GQ	139,30,0:1/1:99
chr15	75540536	.	G	A	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr15	75822537	.	C	A	17.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23	PL:GT:GQ	50,15,0:1/1:75
chr15	78554005	.	T	C	12	.	DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46	PL:GT:GQ	43,6,0:1/1:49
chr15	80089369	.	G	A	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=28	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr15	83089149	.	C	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr15	86839307	.	T	C	90.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=43	PL:GT:GQ	123,15,0:1/1:75
chr15	89836258	.	T	C	99	.	DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39	PL:GT:GQ	141,24,0:1/1:96
chr15	89837706	.	G	A	4.13	.	DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1	PL:GT:GQ	32,0,59:0/1:35
chr15	89857648	.	T	C	99	.	DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1	PL:GT:GQ	133,0,130:0/1:99
chr15	89864228	.	A	C	32	.	DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	62,0,31:0/1:34
chr15	91261235	.	G	A	7.8	.	DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1	PL:GT:GQ	37,0,30:0/1:32
chr16	256990	.	A	C	10.4	.	DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1	PL:GT:GQ	40,0,25:0/1:28
chr16	260794	.	T	C	3.01	.	DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	30,0,32:0/1:31
chr16	419905	.	A	G	7.9	.	DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	36,1,0:1/1:23
chr16	824086	.	T	C	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr16	1085063	.	C	T	52	.	DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1	PL:GT:GQ	82,0,128:0/1:85
chr16	1221305	.	T	C	54	.	DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	84,0,60:0/1:63
chr16	1411728	.	A	G	32.3	.	DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35	PL:GT:GQ	65,15,0:1/1:75
chr16	1443197	.	C	G	64	.	DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36	PL:GT:GQ	97,75,0:1/1:99
chr16	1478746	.	A	T	32	.	DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28	PL:GT:GQ	65,24,0:1/1:96
chr16	1514438	.	A	C	45	.	DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26	PL:GT:GQ	78,144,0:1/1:99
chr16	1601989	.	T	C	99	.	DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29	PL:GT:GQ	133,39,0:1/1:99
chr16	2043883	.	C	T	30	.	DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14	PL:GT:GQ	63,99,0:1/1:99
chr16	2137470	.	A	C	39	.	DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1	PL:GT:GQ	69,0,22:0/1:25
chr16	2537260	.	A	G	99	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40	PL:GT:GQ	177,33,0:1/1:99
chr16	2564737	.	T	C	99	.	DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41	PL:GT:GQ	199,66,0:1/1:99
chr16	2612605	.	A	T	62.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28	PL:GT:GQ	95,15,0:1/1:75
chr16	2704518	.	G	A	41	.	DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034	PL:GT:GQ	71,0,175:0/1:74
chr16	3274307	.	G	T	68	.	DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1	PL:GT:GQ	98,0,138:0/1:99
chr16	5467292	.	G	C	37.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	69,6,0:1/1:49
chr16	10079145	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr16	11483702	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr16	12038227	.	A	T	23	.	DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028	PL:GT:GQ	53,0,135:0/1:56
chr16	21336880	.	G	C	55	.	DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1	PL:GT:GQ	85,0,121:0/1:88
chr16	21980241	.	C	T	16.1	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29	PL:GT:GQ	48,9,0:1/1:63
chr16	23275383	.	C	G	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr16	27546495	.	G	T	25	.	DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43	PL:GT:GQ	57,9,0:1/1:63
chr16	27700399	.	A	T	17.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17	PL:GT:GQ	50,12,0:1/1:72
chr16	28021935	.	A	G	18.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23	PL:GT:GQ	51,15,0:1/1:75
chr16	29070016	.	G	T	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr16	29478618	.	C	T	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr16	29718140	.	C	T	46.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31	PL:GT:GQ	79,15,0:1/1:75
chr16	30700759	.	T	C	17.1	.	DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14	PL:GT:GQ	50,42,0:1/1:99
chr16	35139103	.	A	G	46.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37	PL:GT:GQ	79,12,0:1/1:72
chr16	35473348	.	G	A	3.83	.	DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	34,12,0:1/1:72
chr16	36213667	.	A	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr16	36705528	.	G	A	14.4	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32	PL:GT:GQ	47,15,0:1/1:75
chr16	43831353	.	C	T	69.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42	PL:GT:GQ	102,12,0:1/1:72
chr16	44715166	.	A	C	25	.	DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32	PL:GT:GQ	58,24,0:1/1:96
chr16	44957661	.	T	C	7.03	.	DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18	PL:GT:GQ	39,21,0:1/1:84
chr16	44958698	.	C	T	42.3	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49	PL:GT:GQ	75,15,0:1/1:75
chr16	44959163	.	T	C	33.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48	PL:GT:GQ	66,12,0:1/1:72
chr16	45167959	.	C	T	4.45	.	DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24	PL:GT:GQ	35,12,0:1/1:72
chr16	50254956	.	C	T	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr16	52383122	.	A	C	46.5	.	DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42	PL:GT:GQ	79,12,0:1/1:72
chr16	55978159	.	C	T	10.7	.	DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059	PL:GT:GQ	40,0,9:0/1:12
chr16	61358878	.	T	A	15.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32	PL:GT:GQ	47,6,0:1/1:49
chr16	61392487	.	G	A	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr16	61621603	.	G	T	6.59	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22	PL:GT:GQ	38,12,0:1/1:72
chr16	69120890	.	G	C	51.3	.	DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42	PL:GT:GQ	84,15,0:1/1:75
chr16	70778219	.	A	G	21.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39	PL:GT:GQ	53,6,0:1/1:49
chr16	71899519	.	T	C	40	.	DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33	PL:GT:GQ	73,33,0:1/1:99
chr16	72079251	.	A	G	11.3	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41	PL:GT:GQ	43,9,0:1/1:63
chr16	72093003	.	G	C	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr16	72672428	.	A	G	68	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49	PL:GT:GQ	100,9,0:1/1:63
chr16	72864515	.	A	G	13.9	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr16	72890560	.	G	A	47.1	.	DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1	PL:GT:GQ	77,0,16:0/1:19
chr16	73048929	.	A	G	6.29	.	DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33	PL:GT:GQ	34,1,0:1/1:23
chr16	73177179	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr16	73191468	.	C	T	69.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40	PL:GT:GQ	102,12,0:1/1:72
chr16	73367439	.	A	C	7.41	.	DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1	PL:GT:GQ	37,4,0:1/1:45
chr16	74259316	.	C	T	89.5	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr16	75271450	.	C	G	6.99	.	DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1	PL:GT:GQ	36,0,22:0/1:25
chr16	76199870	.	G	A	26	.	DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1	PL:GT:GQ	56,0,141:0/1:59
chr16	77723692	.	A	G	89.5	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50	PL:GT:GQ	122,12,0:1/1:72
chr17	165875	.	G	A	40.8	.	DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42	PL:GT:GQ	72,6,0:1/1:49
chr17	1443809	.	C	G	9.31	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr17	1618253	.	C	T	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr17	2815309	.	T	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr17	3537486	.	T	G	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr17	3734367	.	C	A	23.5	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36	PL:GT:GQ	56,12,0:1/1:72
chr17	5634764	.	T	C	13	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr17	6408090	.	C	G	3.54	.	DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1	PL:GT:GQ	31,0,66:0/1:34
chr17	7089723	.	A	G	9.31	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr17	8731503	.	G	C	11.1	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	42,6,0:1/1:49
chr17	9282935	.	T	C,G	24.5	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40	PL:GT:GQ	57,12,61,0,3,61:1/1:72
chr17	17284831	.	T	C	29	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25	PL:GT:GQ	61,9,0:1/1:63
chr17	18439515	.	G	A	4.11	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25	PL:GT:GQ	34,9,0:1/1:63
chr17	18602146	.	C	T	4.76	.	DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16	PL:GT:GQ	36,33,0:1/1:99
chr17	19427888	.	C	T	57	.	DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1	PL:GT:GQ	87,0,131:0/1:90
chr17	19604159	.	T	C	9.31	.	DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45	PL:GT:GQ	40,6,0:1/1:49
chr17	19610366	.	C	T	13	.	DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48	PL:GT:GQ	44,6,0:1/1:49
chr17	20484706	.	C	G	51	.	DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1	PL:GT:GQ	81,0,36:0/1:39
chr17	20555720	.	A	G	26.3	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28	PL:GT:GQ	59,15,0:1/1:75
chr17	24328984	.	A	C	15.4	.	DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25	PL:GT:GQ	48,15,0:1/1:75
chr17	26237090	.	G	A	41.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44	PL:GT:GQ	73,6,0:1/1:49
chr17	28394766	.	C	A	13.9	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31	PL:GT:GQ	45,6,0:1/1:49
chr17	31218277	.	A	G	3.62	.	DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1	PL:GT:GQ	31,0,12:0/1:15
chr17	31254021	.	C	T	15.1	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35	PL:GT:GQ	47,9,0:1/1:63
chr17	32516798	.	G	A	37.8	.	DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49	PL:GT:GQ	69,6,0:1/1:49
chr17	32600253	.	A	G	16.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25	PL:GT:GQ	49,12,0:1/1:72
chr17	34255214	.	G	C	19.2	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21	PL:GT:GQ	52,18,0:1/1:90
chr17	34365900	.	T	C	93.1	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38	PL:GT:GQ	126,18,0:1/1:90
chr17	35380386	.	A	T	6.79	.	DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46	PL:GT:GQ	37,6,0:1/1:49
chr17	41993344	.	C	T	64	.	DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16	PL:GT:GQ	97,123,0:1/1:99
chr17	42128201	.	A	G	4.13	.	DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1	PL:GT:GQ	32,0,62:0/1:35
chr17	42984490	.	C	A	56	.	DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1	PL:GT:GQ	86,0,34:0/1:37
chr17	43419457	.	G	A	99	.	DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45	PL:GT:GQ	185,42,0:1/1:99
chr17	43421225	.	A	G	65.1	.	DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1	PL:GT:GQ	98,18,0:1/1:90
chr17	45206897	.	G	A	22	.	DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47	PL:GT:GQ	54,9,0:1/1:63
chr17	45381302	.	T	C	18.6	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr17	45530812	.	C	A	3.54	.	DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1	PL:GT:GQ	31,0,58:0/1:34
chr17	50242633	.	G	A	44	.	DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1	PL:GT:GQ	74,0,154:0/1:77
chr17	51275317	.	G	A	14.9	.	DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31	PL:GT:GQ	46,6,0:1/1:49
chr17	52325530	.	C	T	29	.	DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24	PL:GT:GQ	62,54,0:1/1:99
chr17	52411748	.	T	G	18.6	.	DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25	PL:GT:GQ	51,12,0:1/1:72
chr17	53190746	.	C	G	62.1	.	DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40	PL:GT:GQ	95,18,0:1/1:90
chr17	58289916	.	T	C	18.2	.	DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22	PL:GT:GQ	51,18,0:1/1:90
chr17	59796875	.	C	T	42	.	DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35	PL:GT:GQ	74,9,0:1/1:63