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chr1 228088778 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=23 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
chr1 228117888 . A C 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr1 228139641 . T C 44.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 77,12,0:1/1:72
chr1 228577146 . T C 26 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,14;MQ=22;PV4=1,1,1,0.027 PL:GT:GQ 56,0,77:0/1:59
chr1 229001369 . C A 45 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 77,9,0:1/1:63
chr1 229001386 . C T 8.44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
chr1 229348080 . T C 18.1 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=40;PV4=1,0.33,0.17,0.33 PL:GT:GQ 48,0,31:0/1:34
chr1 229439710 . C T 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=32 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
chr1 229655149 . T C 30 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=30 PL:GT:GQ 63,24,0:1/1:96
chr1 229660873 . C G 81 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,20,0,7;MQ=36;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 111,0,120:0/1:99
chr2a 3661005 . C G 24 . DP=13;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,4,0;MQ=27;PV4=1,1.1e-05,1,1 PL:GT:GQ 54,0,34:0/1:37
chr2a 4140063 . G A 81 . DP=26;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=18,0,8,0;MQ=24;PV4=1,8.3e-09,1,1 PL:GT:GQ 110,0,3:0/1:5
chr2a 4248440 . T C 20 . DP=28;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=11,0,7,0;MQ=25;PV4=1,1,0.47,1 PL:GT:GQ 50,0,92:0/1:53
chr2a 4707656 . A G 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
chr2a 5194801 . G A 7.59 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=24 PL:GT:GQ 38,6,0:1/1:49
chr2a 14111103 . A G 7.84 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=20 PL:GT:GQ 40,21,0:1/1:84
chr2a 17799746 . A G 11.3 . DP=5;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 41,0,35:0/1:37
chr2a 24728910 . G A 45.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 78,15,0:1/1:75
chr2a 29627939 . G T 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=27 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
chr2a 31373164 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr2a 33935228 . T C 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr2a 36311856 . G A 99 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,29;MQ=44 PL:GT:GQ 213,87,0:1/1:99
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chr2a 45574768 . C A 11.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=18 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr2a 55464464 . T C 26.1 . DP=7;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=5,0,2,0;MQ=26;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,1,0:1/1:23
chr2a 63107673 . T A 70.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=34 PL:GT:GQ 103,12,0:1/1:72
chr2a 63141732 . A T 22.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=42 PL:GT:GQ 54,6,0:1/1:49
chr2a 63141910 . G A 3.41 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
chr2a 63141911 . C T 9.55 . DP=16;AF1=0.5031;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,3;MQ=33;PV4=1,0.43,1,1 PL:GT:GQ 39,0,19:0/1:22
chr2a 63143543 . C T 28 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,17;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 61,42,0:1/1:99
chr2a 66419805 . G A 3.69 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 34,15,0:1/1:75
chr2a 66563922 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr2a 67719136 . C T 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
chr2a 72781453 . A C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
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chr2a 88824857 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr2a 93546675 . C T 26 . DP=6;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,2,0;MQ=46;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 56,0,87:0/1:59
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chr3 51368824 . A G 28 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 60,9,0:1/1:63
chr3 53000453 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
chr3 53000463 . A G 54 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=19 PL:GT:GQ 87,30,0:1/1:99
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chr3 81554381 . G T 17.6 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
chr3 87614647 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr3 93900455 . A T 11.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=13 PL:GT:GQ 44,15,0:1/1:75
chr3 96174457 . A G 4.11 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
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chr3 96587998 . A C 7.08 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,6,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,18,0:1/1:90
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chr3 99789741 . C G 99 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=47 PL:GT:GQ 210,51,0:1/1:99
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chr3 104997217 . G A 33.1 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,16,0;MQ=34;PV4=1,3e-10,0.17,0.36 PL:GT:GQ 66,19,0:1/1:76
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chr3 121238963 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr3 126248567 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr3 129733836 . A G 6.2 . DP=4;AF1=0.5003;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.02,0.31,1 PL:GT:GQ 35,0,28:0/1:30
chr3 131372785 . C T 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=34 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
chr3 132290987 . C T 22 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=45 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr3 136054421 . C T 73 . DP=82;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,78,0;MQ=28 PL:GT:GQ 106,235,0:1/1:99
chr3 141075246 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
chr3 141075262 . T G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=41 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr3 141430649 . G T 81.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,4;MQ=41;PV4=1,0.34,1,0.25 PL:GT:GQ 113,6,0:1/1:49
chr3 143617747 . G T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr3 163576128 . C T 5.6 . DP=4;AF1=0.7302;CI95=0.5,1;DP4=2,0,2,0;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 33,0,2:0/1:3
chr3 163839828 . A G 4.45 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=26 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
chr3 175839340 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr3 190193258 . G T 3.98 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
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chr3 190970350 . A G 61 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=37 PL:GT:GQ 94,30,0:1/1:99
chr3 198686408 . G A 36.6 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,16;MQ=25;PV4=1,1,0.026,1 PL:GT:GQ 69,11,0:1/1:66
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chr3 199780181 . G T 77 . DP=45;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,35,0,10;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 107,0,114:0/1:99
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chr4 82653801 . A G 4.11 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
chr4 87130164 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr4 87130176 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=26 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr4 91459729 . C A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr4 96130778 . G C 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,19;MQ=45 PL:GT:GQ 211,57,0:1/1:99
chr4 100709417 . A G 45.1 . DP=16;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,4,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,0,17:0/1:20
chr4 107276770 . C T 70 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 100,0,97:0/1:98
chr4 115327550 . G C 42 . DP=67;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,66;MQ=35;PV4=1,3.2e-24,0.13,1 PL:GT:GQ 75,162,0:1/1:99
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chr4 192175690 . A G 76.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,4;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,0:1/1:10
chr4 192673268 . G A 14.2 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=22 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
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chr4 195460104 . C G 23.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=19 PL:GT:GQ 56,24,0:1/1:96
chr4 198277830 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr5 170098 . A G 13 . DP=12;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr5 395814 . T C 4.77 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=36;PV4=1,1,0.48,1 PL:GT:GQ 33,0,33:0/1:33
chr5 414024 . T A 10.4 . DP=17;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=20 PL:GT:GQ 42,9,0:1/1:63
chr5 496767 . T C 13.9 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr5 805676 . C G 45 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=32 PL:GT:GQ 78,51,0:1/1:99
chr5 1252896 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr5 1418370 . G A 3.65 . DP=8;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=4,0,4,0;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
chr5 1494911 . G C 62 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=46 PL:GT:GQ 95,24,0:1/1:96
chr5 1494932 . C T 6.98 . DP=8;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=46;PV4=1,0.1,0.077,1 PL:GT:GQ 36,0,31:0/1:33
chr5 1506037 . T C 24.1 . DP=24;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=11,0,13,0;MQ=16;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 55,5,0:1/1:46
chr5 1509406 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr5 1733649 . A G 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,25;MQ=47 PL:GT:GQ 212,75,0:1/1:99
chr5 1747304 . A G 12.3 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 45,36,0:1/1:99
chr5 1747308 . C A 44 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=19 PL:GT:GQ 77,36,0:1/1:99
chr5 3519783 . C T 21.1 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 54,24,0:1/1:96
chr5 4101593 . A G 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
chr5 7204332 . T A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=24 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
chr5 11510398 . A C 34 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=51;PV4=1,1,0,1 PL:GT:GQ 64,0,31:0/1:34
chr5 15406720 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr5 25152417 . C A 10.9 . DP=28;AF1=0.5718;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,6;MQ=25;PV4=1,1,0.21,1 PL:GT:GQ 40,0,6:0/1:8
chr5 39072637 . A G 35.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=50 PL:GT:GQ 68,15,0:1/1:75
chr5 46022699 . G A 44 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=35 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
chr5 55664181 . C G 10.4 . DP=8;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=3,0,5,0;MQ=18;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 40,3,0:1/1:41
chr5 56253386 . T C 50.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=36 PL:GT:GQ 83,21,0:1/1:84
chr5 56253447 . C T 42.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=45 PL:GT:GQ 75,12,0:1/1:72
chr5 71950166 . G T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr5 72703090 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr5 73570280 . G T 5.45 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,41,0;MQ=15 PL:GT:GQ 37,123,0:1/1:99
chr5 73701762 . G T 40.8 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=43 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
chr5 76956867 . T C 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
chr5 79097961 . C G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr5 87026167 . T C 22 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr5 97680525 . T C 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
chr5 100674737 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr5 105389966 . T C 3.52 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=15 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
chr5 109998341 . A C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
chr5 120629105 . C T 6.79 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
chr5 128383954 . C T 23 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,5,0,5;MQ=48;PV4=1,3.3e-07,1,1 PL:GT:GQ 53,0,98:0/1:56
chr5 133925142 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr5 135375404 . T C 11.8 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=31;PV4=1,0.03,1,1 PL:GT:GQ 42,4,0:1/1:45
chr5 136498281 . T G 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr5 136717285 . A G 82.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 115,12,0:1/1:72
chr5 136910734 . G A 62 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,13;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 95,31,0:1/1:99
chr5 141208149 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr5 148056348 . C A 37.1 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=38;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,1,0:1/1:23
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chr5 159967229 . G C 22.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 55,12,0:1/1:72
chr5 174024541 . T G 29.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 59,2,0:1/1:37
chr5 175525290 . A G 3.27 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=20 PL:GT:GQ 33,12,0:1/1:72
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chr6_cox_hap1 687497 . A G 33 . DP=6;AF1=0.9999;CI95=0.5,1;DP4=2,0,4,0;MQ=35;PV4=1,0.0016,1,1 PL:GT:GQ 63,3,0:1/1:41
chr6_qbl_hap2 120066 . T C 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 139,27,0:1/1:99
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chr6 52696512 . C T 70 . DP=76;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,34,0,42;MQ=18;PV4=1,0.11,1,1 PL:GT:GQ 100,0,51:0/1:54
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chr6 53897484 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr6 57038290 . C T 10.2 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 41,6,0:1/1:49
chr6 62925087 . G C 35 . DP=5;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,4,0;MQ=36;PV4=1,1,0.2,1 PL:GT:GQ 65,0,25:0/1:28
chr6 62925094 . T C 25.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=36 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
chr6 70834405 . G A 72.1 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=29 PL:GT:GQ 105,21,0:1/1:84
chr6 71026058 . C T 48.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=42 PL:GT:GQ 81,18,0:1/1:90
chr6 74420752 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
chr6 77498624 . T C 16.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 48,6,0:1/1:49
chr6 80416836 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr6 113611590 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=46 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
chr6 119308431 . T C 38.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 71,12,0:1/1:72
chr6 151758592 . T C 3.07 . DP=17;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,8,0,9;MQ=13;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 29,1,0:1/1:23
chr6 151759358 . A G 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=12,0,15,0;MQ=44;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 171,0,128:0/1:99
chr6 154741755 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=50 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr6 161061053 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=52 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr6 161474189 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr6 164304657 . C T 10.4 . DP=63;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,29,0,19;MQ=22;PV4=1,7.7e-11,1,0.049 PL:GT:GQ 40,0,37:0/1:38
chr6 164703105 . T C 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=40 PL:GT:GQ 165,30,0:1/1:99
chr6 167518328 . A G 78 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,14,0;MQ=33;PV4=1,0.026,0.43,0.056 PL:GT:GQ 108,0,149:0/1:99
chr6 169906323 . G A 41.8 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr6 171893912 . G A 69.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=33 PL:GT:GQ 102,15,0:1/1:75
chr6 173631604 . A G 6.98 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=37;PV4=1,0.069,1,1 PL:GT:GQ 36,0,34:0/1:35
chr7 835856 . C T 27.5 . DP=13;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=4,0,6,0;MQ=23;PV4=1,0.46,1,1 PL:GT:GQ 57,2,0:1/1:37
chr7 1046005 . C T 11.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=36 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr7 1564339 . C T 71 . DP=66;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=36,0,24,0;MQ=29;PV4=1,1,0.35,1 PL:GT:GQ 101,0,134:0/1:99
chr7 1806266 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr7 1936013 . G T 7.77 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,9,0:1/1:63
chr7 2319532 . C A 4.11 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=14 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
chr7 2682121 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr7 3248116 . T C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
chr7 3624766 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=41 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr7 5291140 . G C 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=37 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr7 5314457 . C A 3.56 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=18 PL:GT:GQ 34,24,0:1/1:95
chr7 5595072 . T A 79 . DP=13;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,5,0;MQ=31;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 109,0,57:0/1:60
chr7 5646060 . G C 7.79 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=10 PL:GT:GQ 40,30,0:1/1:99
chr7 6056816 . C G 7.08 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=23;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 35,1,0:1/1:23
chr7 6412641 . C T 40 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=33 PL:GT:GQ 73,33,0:1/1:99
chr7 6766874 . A G 34.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=43 PL:GT:GQ 67,15,0:1/1:75
chr7 8482729 . C T 5.08 . DP=16;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=22;PV4=1,1,1,0.19 PL:GT:GQ 32,0,1:1/1:5
chr7 9238362 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr7 9687781 . G A 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,12;MQ=48;PV4=1,6.5e-38,1,1 PL:GT:GQ 63,0,170:0/1:66
chr7 9752803 . A T 14.2 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=18 PL:GT:GQ 47,27,0:1/1:99
chr7 10240910 . T C 45.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 78,12,0:1/1:72
chr7 11046187 . C T 86.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=47 PL:GT:GQ 119,12,0:1/1:72
chr7 11548207 . C G 14.6 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=6,1,0,5;MQ=18;PV4=0.015,1,1,1 PL:GT:GQ 46,7,0:1/1:57
chr7 11580317 . C T 42 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,10;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 75,23,0:1/1:92
chr7 11585384 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=46 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr7 13498356 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr7 13500887 . G A 15.1 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=22 PL:GT:GQ 48,30,0:1/1:99
chr7 13827079 . C T 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr7 14403976 . T G 59 . DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 92,24,0:1/1:96
chr7 14756588 . A G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,5.3e-18,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
chr7 14756619 . T G 44 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,10,0;MQ=44;PV4=1,6.4e-10,1,1 PL:GT:GQ 74,0,70:0/1:72
chr7 36734598 . A C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
chr7 36734599 . A T 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
chr7 36734603 . G C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=40 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr7 40634921 . A C 55 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=39 PL:GT:GQ 88,39,0:1/1:99
chr7 48271285 . A T 73 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=25 PL:GT:GQ 106,30,0:1/1:99
chr7 56264700 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr7 62326003 . C A 26.1 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 59,18,0:1/1:90
chr7 109468934 . T G 5.13 . DP=10;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,0.031,1,1 PL:GT:GQ 33,2,0:1/1:37
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chr7 157331292 . G T 43.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=34 PL:GT:GQ 76,21,0:1/1:84
chr7 157382957 . T C 33.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
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chr8 16781011 . A G 55.5 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=34 PL:GT:GQ 88,12,0:1/1:72
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chr8 31685466 . C T 34 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=10,0,5,0;MQ=28;PV4=1,0.072,1,0.36 PL:GT:GQ 64,0,50:0/1:53
chr8 37378739 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
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chr8 62764995 . T G 20 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=32 PL:GT:GQ 52,9,0:1/1:63
chr8 63157426 . C G 41.6 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,7,0,15;MQ=19;PV4=1,1,1,0.25 PL:GT:GQ 74,11,0:1/1:66
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chr8 109966441 . T C 27.3 . DP=9;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=38 PL:GT:GQ 60,15,0:1/1:75
chr8 118811716 . G T 99 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=50 PL:GT:GQ 155,18,0:1/1:90
chr8 119440254 . A T 58.5 . DP=5;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=34;PV4=1,1,1,0.14 PL:GT:GQ 87,0,1:1/1:5
chr8 121236024 . G A 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
chr8 125489079 . C T 13 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr8 128502549 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr8 128502551 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr8 130951113 . G A 4.61 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=19 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
chr8 135307123 . G A 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr8 138814155 . C T 57.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=46 PL:GT:GQ 90,18,0:1/1:90
chr8 140566111 . A G 18.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=15 PL:GT:GQ 51,36,0:1/1:99
chr8 141586480 . T G 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
chr8 143376712 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr8 150662729 . T C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr8 150741294 . A G 25.1 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=34 PL:GT:GQ 58,18,0:1/1:90
chr8 150975618 . A G 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr8 151580103 . T C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=20 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr8 151634410 . G T 48 . DP=17;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,5;MQ=39;PV4=1,0.072,1,1 PL:GT:GQ 78,0,125:0/1:81
chr8 151709267 . G A 91.1 . DP=8;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=40;PV4=1,1,0.28,0.37 PL:GT:GQ 121,0,16:0/1:19
chr8 152636420 . G A 8.75 . DP=3;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=30;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 37,1,0:1/1:23
chr8 152706967 . G A 3.01 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=16 PL:GT:GQ 33,30,0:1/1:99
chr8 152786522 . T C 80.1 . DP=16;AF1=0.5102;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,12;MQ=31;PV4=1,0.25,1,1 PL:GT:GQ 110,0,14:0/1:17
chr8 152863132 . T G 5.44 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=30 PL:GT:GQ 36,9,0:1/1:63
chr9 23235268 . C T 12 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 43,6,0:1/1:49
chr9 26391176 . T C 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
chr9 26868232 . C G 63 . DP=20;AF1=0.5025;CI95=0.5,0.5;DP4=7,0,13,0;MQ=22;PV4=1,0.2,1,0.44 PL:GT:GQ 93,0,20:0/1:23
chr9 34223668 . C T 22 . DP=16;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,7;MQ=27;PV4=1,0.14,0.34,1 PL:GT:GQ 52,0,79:0/1:55
chr9 39696645 . G A 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr9 40654130 . T G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr9 41145321 . T G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
chr9 42273483 . G A 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr9 55633192 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr9 58705807 . T C 70 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=24 PL:GT:GQ 103,30,0:1/1:99
chr9 61697149 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr9 63152790 . A C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr9 63703913 . C G 90.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=38 PL:GT:GQ 123,21,0:1/1:84
chr9 65116068 . T C 70 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=49 PL:GT:GQ 103,39,0:1/1:99
chr9 71266598 . C A 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
chr9 73188677 . G T 52 . DP=294;AF1=1;CI95=1,1;DP4=44,0,245,0;MQ=33;PV4=1,0.28,0.0092,1 PL:GT:GQ 85,147,0:1/1:99
chr9 78854179 . G T 22 . DP=97;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=21,0,12,0;MQ=44;PV4=1,0.02,0.032,0.0033 PL:GT:GQ 52,0,158:0/1:55
chr9 82964679 . A C 13.2 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,9,0:1/1:63
chr9 84124545 . G T 57 . DP=11;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,3,0;MQ=49;PV4=1,1,0.024,1 PL:GT:GQ 87,0,59:0/1:62
chr9 86552862 . C T 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=26 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
chr9 87548941 . A G 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr9 89021101 . G A 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
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chr9 92462035 . C A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
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chr10 5986542 . T C 83 . DP=93;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 116,30,0:1/1:99
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chr10 10881734 . A G 9.52 . DP=9;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,5,0;MQ=42;PV4=1,0.0026,0.14,1 PL:GT:GQ 39,0,91:0/1:42
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chr10 44455192 . C T 4.41 . DP=6;AF1=0.8276;CI95=0.5,1;DP4=0,3,0,3;MQ=21;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 31,0,1:1/1:5
chr10 48387336 . A G 13 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr10 51561705 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr10 51561712 . C G 39.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 71,6,0:1/1:49
chr10 55617954 . G A 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
chr10 55718281 . T A 3.41 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=32 PL:GT:GQ 32,6,0:1/1:49
chr10 55888771 . T C 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
chr10 56025569 . C G 34.1 . DP=3;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=39;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 64,0,16:0/1:19
chr10 57384943 . G T 84 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=16,0,13,0;MQ=26;PV4=1,0.015,1,1 PL:GT:GQ 114,0,110:0/1:99
chr10 59873077 . T G 49 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=42 PL:GT:GQ 82,24,0:1/1:96
chr10 61329572 . C T 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
chr10 63790636 . T G 32.1 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=1,0,10,0;MQ=28;PV4=1,0.14,1,1 PL:GT:GQ 65,22,0:1/1:88
chr10 64466048 . C G 18.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=28 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
chr10 65053440 . G T 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=39 PL:GT:GQ 153,30,0:1/1:99
chr10 65407358 . C G 84.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 117,15,0:1/1:75
chr10 65605291 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr10 66104447 . T C 99 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,21;MQ=34;PV4=1,1,0.15,1 PL:GT:GQ 136,0,162:0/1:99
chr10 82160859 . G C 99 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,13;MQ=36 PL:GT:GQ 153,39,0:1/1:99
chr10 82198579 . C T 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr10 87086290 . A G 4.13 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=17 PL:GT:GQ 35,27,0:1/1:99
chr10 89550621 . T G 74 . DP=47;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,45;MQ=45 PL:GT:GQ 107,135,0:1/1:99
chr10 92325046 . G A 42.3 . DP=18;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=45 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
chr10 94488050 . A G 5.46 . DP=4;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=43;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
chr10 95024815 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr10 95466306 . G A 53 . DP=7;AF1=0.6671;CI95=0.5,1;DP4=0,4,0,3;MQ=33;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 82,0,3:0/1:5
chr10 100256777 . T G 3.83 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=23 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
chr10 101510485 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr10 101530760 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr10 101879744 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=44 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr10 102147276 . G C 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=33 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr10 102642248 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr10 107666616 . T C 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=43 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr10 108319945 . C G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=29 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr10 109734371 . G A 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
chr10 112870604 . C T 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=36 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
chr10 115304673 . T C 11.3 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr10 119380588 . G A 14.2 . DP=4;AF1=0.502;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=43;PV4=1,0.18,0.32,1 PL:GT:GQ 44,0,21:0/1:24
chr10 123063756 . C T 14.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=23 PL:GT:GQ 46,9,0:1/1:63
chr10 128424770 . T G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr10 131229204 . T C 44 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=40 PL:GT:GQ 76,9,0:1/1:63
chr10 132420570 . G C 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
chr10 132528066 . C T 99 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,19,0;MQ=42 PL:GT:GQ 213,57,0:1/1:99
chr10 132644619 . G A 19.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=23 PL:GT:GQ 52,15,0:1/1:75
chr10 132707581 . G C 9.11 . DP=51;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=25;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
chr10 133026892 . T C 55.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=44 PL:GT:GQ 88,18,0:1/1:90
chr11 768033 . T C 33.5 . DP=4;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
chr11 768042 . T C 33.5 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,2;MQ=32;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,1:1/1:5
chr11 874568 . G C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
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chr11 1556298 . G A 11.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=33 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
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chr11 4385618 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr11 4424365 . T A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr11 5295586 . C T 3.01 . DP=52;AF1=0.4997;CI95=0.5,0.5;DP4=33,0,10,0;MQ=29;PV4=1,0.0045,0.3,0.17 PL:GT:GQ 30,0,131:0/1:33
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chr11 9373125 . T C 19.8 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 51,6,0:1/1:49
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chr11 10266192 . A C 14.3 . DP=22;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=27 PL:GT:GQ 47,18,0:1/1:90
chr11 10303263 . T C 8.64 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=18 PL:GT:GQ 41,51,0:1/1:99
chr11 10420170 . T C 35 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,15;MQ=28;PV4=1,0.12,1,0.4 PL:GT:GQ 68,36,0:1/1:99
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chr11 11315826 . T G 6.29 . DP=27;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 38,18,0:1/1:90
chr11 11603859 . A C 22 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,6;MQ=34;PV4=1,9.5e-13,0.22,1 PL:GT:GQ 52,0,115:0/1:55
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chr11 11822758 . G A 15.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,3;MQ=38;PV4=1,0.18,1,1 PL:GT:GQ 45,0,88:0/1:48
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chr11 14380517 . C G 16.1 . DP=10;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=5,0,5,0;MQ=48;PV4=1,2.1e-05,0.13,1 PL:GT:GQ 46,0,113:0/1:49
chr11 14419212 . A G 91.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 124,18,0:1/1:90
chr11 14846792 . A G 55 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=19 PL:GT:GQ 88,33,0:1/1:99
chr11 15494556 . C T 99 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=22,0,14,0;MQ=34;PV4=1,0.0071,1,1 PL:GT:GQ 146,0,159:0/1:99
chr11 16262879 . A C 16.1 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=43;PV4=1,0.061,0.24,0.33 PL:GT:GQ 46,0,28:0/1:31
chr11 21514947 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=41 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
chr11 22532576 . C G 28 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,17;MQ=17 PL:GT:GQ 61,51,0:1/1:99
chr11 23529238 . G T 4.29 . DP=13;AF1=0.5334;CI95=0.5,1;DP4=1,0,3,0;MQ=37;PV4=1,1,0.34,0.21 PL:GT:GQ 32,0,9:0/1:12
chr11 24249554 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr11 24853167 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=51 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr11 33353903 . T C 24.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=36 PL:GT:GQ 57,15,0:1/1:75
chr11 35126569 . T C 24.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,12,0:1/1:72
chr11 35132248 . C T 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
chr11 35155482 . T C 68 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=46 PL:GT:GQ 101,66,0:1/1:99
chr11 52494088 . T C 99 . DP=9;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,9;MQ=37 PL:GT:GQ 140,27,0:1/1:99
chr11 57899943 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr11 62261460 . G T 19.1 . DP=15;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,7,0,5;MQ=27;PV4=1,1.1e-06,1,1 PL:GT:GQ 49,0,58:0/1:51
chr11 67456049 . C T 39.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=19 PL:GT:GQ 72,18,0:1/1:90
chr11 68509708 . C G 3.65 . DP=9;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,5,0,4;MQ=17;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
chr11 70115115 . T A 99 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=49 PL:GT:GQ 140,15,0:1/1:75
chr11 72643951 . T C 70 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=39 PL:GT:GQ 103,66,0:1/1:99
chr11 72647930 . G A 36 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=41;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 66,0,28:0/1:31
chr11 73330148 . C T 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr11 81720893 . A G 5.83 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=19 PL:GT:GQ 37,12,0:1/1:72
chr11 83813797 . A G 23.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=43 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
chr11 85949488 . C A 54 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=37 PL:GT:GQ 87,42,0:1/1:99
chr11 87634829 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=51 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr11 90913093 . A T 35.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 67,6,0:1/1:49
chr11 93793348 . G A 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=31 PL:GT:GQ 139,24,0:1/1:96
chr11 100802294 . T C 16.6 . DP=21;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=35 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
chr11 107455449 . C T 8.44 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=26 PL:GT:GQ 39,6,0:1/1:49
chr11 111344355 . A G 69.5 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=43 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
chr11 111611115 . C T 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr11 113050466 . G C 6.02 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=30 PL:GT:GQ 36,6,0:1/1:49
chr11 114332544 . T C 3.54 . DP=17;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,5;MQ=37;PV4=1,0.32,0.13,1 PL:GT:GQ 31,0,37:0/1:33
chr11 114332549 . G A 3.54 . DP=17;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,9,0,8;MQ=36;PV4=1,3.1e-10,0.088,1 PL:GT:GQ 31,0,127:0/1:34
chr11 114843578 . G C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr11 115580279 . A G 99 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=48 PL:GT:GQ 190,45,0:1/1:99
chr11 116434328 . G A 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
chr11 125914161 . A G 20.8 . DP=7;AF1=0.95;CI95=0.5,1;DP4=3,0,4,0;MQ=38;PV4=1,0.074,1,1 PL:GT:GQ 49,0,0:1/1:10
chr11 125917089 . C T 12.3 . DP=41;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,28,0,12;MQ=44;PV4=1,4.7e-25,1,1 PL:GT:GQ 42,0,167:0/1:45
chr11 127194100 . A G 60 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=49 PL:GT:GQ 93,24,0:1/1:96
chr12 70856 . G A 27.5 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 60,12,0:1/1:72
chr12 153693 . T C 52.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=38 PL:GT:GQ 85,15,0:1/1:75
chr12 924547 . C G 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=50 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
chr12 1555916 . G A 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
chr12 1919860 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr12 2283756 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=34 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr12 2805983 . G C 12.7 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=35 PL:GT:GQ 45,12,0:1/1:72
chr12 6088203 . T C 72.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=37 PL:GT:GQ 105,15,0:1/1:75
chr12 7099460 . G C 10.8 . DP=6;AF1=0.8277;CI95=0.5,1;DP4=3,0,3,0;MQ=26;PV4=1,0.027,1,1 PL:GT:GQ 39,0,1:1/1:5
chr12 7099464 . G A 13.3 . DP=6;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=2,0,3,0;MQ=28;PV4=1,0.16,1,1 PL:GT:GQ 42,1,0:1/1:23
chr12 7198516 . T G 4.61 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 34,6,0:1/1:49
chr12 23331895 . C T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr12 28209020 . T G 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
chr12 30074073 . C T 32.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 64,6,0:1/1:49
chr12 30563452 . T C 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
chr12 30563453 . A G 25 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=46 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
chr12 30563464 . C A 78.8 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,5;MQ=34;PV4=1,0.29,1,1 PL:GT:GQ 110,6,0:1/1:49
chr12 31505085 . G A 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr12 34041336 . G A 5.46 . DP=5;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=36;PV4=1,1,0.48,0.21 PL:GT:GQ 34,0,34:0/1:34
chr12 49003648 . C G 42 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=39 PL:GT:GQ 75,24,0:1/1:96
chr12 51280690 . G A 69 . DP=98;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,18,0;MQ=45;PV4=1,1,0.051,1 PL:GT:GQ 99,0,84:0/1:87
chr12 69206633 . T C 17.1 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=17 PL:GT:GQ 50,33,0:1/1:99
chr12 80417253 . T C 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=48 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
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chr13 21536703 . A G 9.31 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
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chr13 53084193 . C T 9.11 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=0,1,0,2;MQ=29;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 38,2,0:1/1:37
chr13 57763228 . C T 45 . DP=555;AF1=1;CI95=1,1;DP4=2,0,21,0;MQ=23;PV4=1,0.00021,1,0.3 PL:GT:GQ 78,45,0:1/1:99
chr13 73857921 . G C 31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 63,9,0:1/1:63
chr13 76718001 . G A 59 . DP=4;AF1=0.5004;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,3,0;MQ=45;PV4=1,1,0.12,1 PL:GT:GQ 89,0,28:0/1:31
chr13 100912695 . A T 23 . DP=22;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,16,0,6;MQ=31;PV4=1,0.029,1,0.35 PL:GT:GQ 53,0,103:0/1:56
chr13 101332001 . G C 21 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,23,0;MQ=21 PL:GT:GQ 54,69,0:1/1:99
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chr13 114775162 . A G 80 . DP=17;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,17,0;MQ=21 PL:GT:GQ 113,51,0:1/1:99
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chr13 116068676 . C T 3.83 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=27 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
chr13 116455918 . A G 33 . DP=29;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,15,0;MQ=42;PV4=1,1.8e-20,0.3,1 PL:GT:GQ 63,0,146:0/1:66
chr13 116765012 . G A 30.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 62,6,0:1/1:49
chr13 116779773 . C T 17.1 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=27,0,11,0;MQ=24;PV4=1,4.5e-35,1,1 PL:GT:GQ 47,0,106:0/1:50
chr13 116779791 . C T 57 . DP=38;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,0,14,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 87,0,103:0/1:90
chr14 20159250 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=39 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr14 23510676 . T C 52 . DP=22;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,0;MQ=32 PL:GT:GQ 85,66,0:1/1:99
chr14 24735256 . G A 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr14 29525577 . G A 21 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,9,0;MQ=16 PL:GT:GQ 54,27,0:1/1:99
chr14 36186389 . C T 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
chr14 36186394 . A G 6.79 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
chr14 37440609 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr14 40432807 . A G 18.6 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
chr14 59466268 . T C 15.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
chr14 61368162 . G T 7.18 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=17 PL:GT:GQ 39,15,0:1/1:75
chr14 65152922 . G A 92 . DP=33;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,18,0,15;MQ=36;PV4=1,0.059,0.35,1 PL:GT:GQ 122,0,144:0/1:99
chr14 69749148 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=25 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr14 74877658 . C T 45 . DP=48;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,1,0,12;MQ=36;PV4=1,0.02,1,0.39 PL:GT:GQ 78,28,0:1/1:99
chr14 75546678 . C T 19.2 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=17 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
chr14 76439185 . T C 67.1 . DP=7;AF1=0.505;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,6;MQ=33;PV4=1,1,0.056,0.29 PL:GT:GQ 97,0,17:0/1:20
chr14 77313295 . T A 99 . DP=12;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,10;MQ=48 PL:GT:GQ 191,30,0:1/1:99
chr14 77673422 . G A 11.5 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=24 PL:GT:GQ 44,18,0:1/1:90
chr14 78646125 . T C 99 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=40 PL:GT:GQ 153,24,0:1/1:96
chr14 91702449 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr14 91769842 . G A 63 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 95,9,0:1/1:63
chr14 91775899 . C G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr14 91775924 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr14 93482918 . A C 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
chr14 93665819 . C T 75 . DP=7;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,4;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 105,0,31:0/1:34
chr14 95422276 . A G 55.1 . DP=7;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=45 PL:GT:GQ 88,21,0:1/1:84
chr14 95731986 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
chr14 96045464 . A G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=33 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr14 97172020 . C T 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=51 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
chr14 100515480 . A G 6.98 . DP=3;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=45;PV4=1,0.14,0.085,0.33 PL:GT:GQ 36,0,30:0/1:32
chr14 100770214 . A T 8.69 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=16 PL:GT:GQ 41,21,0:1/1:84
chr14 101258303 . G A 82 . DP=15;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,15,0;MQ=26 PL:GT:GQ 115,45,0:1/1:99
chr14 101701492 . C G 66 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,10,0;MQ=49 PL:GT:GQ 99,30,0:1/1:99
chr14 102113772 . T C 3.98 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=30 PL:GT:GQ 33,6,0:1/1:49
chr14 102751431 . A C 36.5 . DP=3;AF1=0.9998;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=35;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 66,2,0:1/1:37
chr14 103708033 . A G 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,12;MQ=27 PL:GT:GQ 141,36,0:1/1:99
chr14 104744582 . G A 3.52 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 33,9,0:1/1:63
chr14 105989100 . C T 3.14 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 33,15,0:1/1:75
chr14 105989162 . C T 3.65 . DP=12;AF1=0.7301;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,6;MQ=15;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,2:0/1:3
chr14 106234810 . G A 25.3 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=39 PL:GT:GQ 58,15,0:1/1:75
chr14 106995572 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr14 107283057 . T C 5.5 . DP=8;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,7,0;MQ=20 PL:GT:GQ 37,21,0:1/1:84
chr14 107285319 . T C 33 . DP=36;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,35;MQ=22 PL:GT:GQ 66,105,0:1/1:99
chr14 107640449 . A G 11.8 . DP=7;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 44,12,0:1/1:72
chr15 20082092 . T G 18.3 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=24 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
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chr15 23233324 . C A 47 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,14,0;MQ=31 PL:GT:GQ 80,42,0:1/1:99
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chr15 89836258 . T C 99 . DP=10;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=39 PL:GT:GQ 141,24,0:1/1:96
chr15 89837706 . G A 4.13 . DP=8;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,4,0,4;MQ=30;PV4=1,1,0.25,1 PL:GT:GQ 32,0,59:0/1:35
chr15 89857648 . T C 99 . DP=27;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,8,0;MQ=40;PV4=1,1,0.3,1 PL:GT:GQ 133,0,130:0/1:99
chr15 89864228 . A C 32 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=2,0,2,0;MQ=42;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 62,0,31:0/1:34
chr15 91261235 . G A 7.8 . DP=4;AF1=0.5002;CI95=0.5,0.5;DP4=1,0,2,0;MQ=44;PV4=1,1,0.32,1 PL:GT:GQ 37,0,30:0/1:32
chr16 256990 . A C 10.4 . DP=16;AF1=0.5008;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,3,0;MQ=23;PV4=1,0.34,1,1 PL:GT:GQ 40,0,25:0/1:28
chr16 260794 . T C 3.01 . DP=19;AF1=0.4999;CI95=0.5,0.5;DP4=13,0,2,0;MQ=24;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 30,0,32:0/1:31
chr16 419905 . A G 7.9 . DP=5;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,3;MQ=22;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 36,1,0:1/1:23
chr16 824086 . T C 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=48 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr16 1085063 . C T 52 . DP=12;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,6,0;MQ=42;PV4=1,1,0.014,1 PL:GT:GQ 82,0,128:0/1:85
chr16 1221305 . T C 54 . DP=7;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,3;MQ=40;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 84,0,60:0/1:63
chr16 1411728 . A G 32.3 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=35 PL:GT:GQ 65,15,0:1/1:75
chr16 1443197 . C G 64 . DP=26;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,25,0;MQ=36 PL:GT:GQ 97,75,0:1/1:99
chr16 1478746 . A T 32 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,8,0;MQ=28 PL:GT:GQ 65,24,0:1/1:96
chr16 1514438 . A C 45 . DP=49;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,48,0;MQ=26 PL:GT:GQ 78,144,0:1/1:99
chr16 1601989 . T C 99 . DP=13;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,13,0;MQ=29 PL:GT:GQ 133,39,0:1/1:99
chr16 2043883 . C T 30 . DP=33;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,33;MQ=14 PL:GT:GQ 63,99,0:1/1:99
chr16 2137470 . A C 39 . DP=38;AF1=0.5016;CI95=0.5,0.5;DP4=4,0,6,0;MQ=34;PV4=1,0.02,1,1 PL:GT:GQ 69,0,22:0/1:25
chr16 2537260 . A G 99 . DP=11;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,11,0;MQ=40 PL:GT:GQ 177,33,0:1/1:99
chr16 2564737 . T C 99 . DP=25;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,22;MQ=41 PL:GT:GQ 199,66,0:1/1:99
chr16 2612605 . A T 62.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=28 PL:GT:GQ 95,15,0:1/1:75
chr16 2704518 . G A 41 . DP=48;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,17,0,12;MQ=48;PV4=1,1.9e-23,0.24,0.034 PL:GT:GQ 71,0,175:0/1:74
chr16 3274307 . G T 68 . DP=39;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,30,0,8;MQ=37;PV4=1,1,1,1 PL:GT:GQ 98,0,138:0/1:99
chr16 5467292 . G C 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
chr16 10079145 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr16 11483702 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr16 12038227 . A T 23 . DP=47;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,22,0,23;MQ=32;PV4=1,4.4e-66,0.47,0.028 PL:GT:GQ 53,0,135:0/1:56
chr16 21336880 . G C 55 . DP=35;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,12,0,19;MQ=47;PV4=1,5.6e-21,1,1 PL:GT:GQ 85,0,121:0/1:88
chr16 21980241 . C T 16.1 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=29 PL:GT:GQ 48,9,0:1/1:63
chr16 23275383 . C G 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr16 27546495 . G T 25 . DP=35;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=43 PL:GT:GQ 57,9,0:1/1:63
chr16 27700399 . A T 17.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=17 PL:GT:GQ 50,12,0:1/1:72
chr16 28021935 . A G 18.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=23 PL:GT:GQ 51,15,0:1/1:75
chr16 29070016 . G T 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr16 29478618 . C T 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=42 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr16 29718140 . C T 46.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=31 PL:GT:GQ 79,15,0:1/1:75
chr16 30700759 . T C 17.1 . DP=14;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=14 PL:GT:GQ 50,42,0:1/1:99
chr16 35139103 . A G 46.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=37 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
chr16 35473348 . G A 3.83 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 34,12,0:1/1:72
chr16 36213667 . A G 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr16 36705528 . G A 14.4 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,15,0:1/1:75
chr16 43831353 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=42 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
chr16 44715166 . A C 25 . DP=18;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,8;MQ=32 PL:GT:GQ 58,24,0:1/1:96
chr16 44957661 . T C 7.03 . DP=23;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,7;MQ=18 PL:GT:GQ 39,21,0:1/1:84
chr16 44958698 . C T 42.3 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=49 PL:GT:GQ 75,15,0:1/1:75
chr16 44959163 . T C 33.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=48 PL:GT:GQ 66,12,0:1/1:72
chr16 45167959 . C T 4.45 . DP=16;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=24 PL:GT:GQ 35,12,0:1/1:72
chr16 50254956 . C T 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=36 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr16 52383122 . A C 46.5 . DP=19;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=42 PL:GT:GQ 79,12,0:1/1:72
chr16 55978159 . C T 10.7 . DP=20;AF1=0.5336;CI95=0.5,1;DP4=2,0,5,0;MQ=35;PV4=1,0.038,1,0.059 PL:GT:GQ 40,0,9:0/1:12
chr16 61358878 . T A 15.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=32 PL:GT:GQ 47,6,0:1/1:49
chr16 61392487 . G A 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr16 61621603 . G T 6.59 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=22 PL:GT:GQ 38,12,0:1/1:72
chr16 69120890 . G C 51.3 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=42 PL:GT:GQ 84,15,0:1/1:75
chr16 70778219 . A G 21.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=39 PL:GT:GQ 53,6,0:1/1:49
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chr16 72079251 . A G 11.3 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=41 PL:GT:GQ 43,9,0:1/1:63
chr16 72093003 . G C 9.31 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr16 72672428 . A G 68 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=49 PL:GT:GQ 100,9,0:1/1:63
chr16 72864515 . A G 13.9 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=35 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr16 72890560 . G A 47.1 . DP=10;AF1=0.5064;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,7;MQ=49;PV4=1,0.0019,0.0033,1 PL:GT:GQ 77,0,16:0/1:19
chr16 73048929 . A G 6.29 . DP=4;AF1=0.9966;CI95=0.5,1;DP4=1,0,2,0;MQ=27;PV4=1,1,1,0.33 PL:GT:GQ 34,1,0:1/1:23
chr16 73177179 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr16 73191468 . C T 69.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=40 PL:GT:GQ 102,12,0:1/1:72
chr16 73367439 . A C 7.41 . DP=36;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,2,0,13;MQ=26;PV4=1,1,0.027,1 PL:GT:GQ 37,4,0:1/1:45
chr16 74259316 . C T 89.5 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=49 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
chr16 75271450 . C G 6.99 . DP=15;AF1=0.5015;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,3;MQ=44;PV4=1,0.065,0.31,1 PL:GT:GQ 36,0,22:0/1:25
chr16 76199870 . G A 26 . DP=14;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=8,0,6,0;MQ=47;PV4=1,1.2e-06,0.32,1 PL:GT:GQ 56,0,141:0/1:59
chr16 77723692 . A G 89.5 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=50 PL:GT:GQ 122,12,0:1/1:72
chr17 165875 . G A 40.8 . DP=11;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=42 PL:GT:GQ 72,6,0:1/1:49
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chr17 1618253 . C T 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=39 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr17 2815309 . T G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
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chr17 3734367 . C A 23.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=36 PL:GT:GQ 56,12,0:1/1:72
chr17 5634764 . T C 13 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=35 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr17 6408090 . C G 3.54 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=3,0,2,0;MQ=40;PV4=1,1,0.36,1 PL:GT:GQ 31,0,66:0/1:34
chr17 7089723 . A G 9.31 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=47 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr17 8731503 . G C 11.1 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 42,6,0:1/1:49
chr17 9282935 . T C,G 24.5 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=40 PL:GT:GQ 57,12,61,0,3,61:1/1:72
chr17 17284831 . T C 29 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,3;MQ=25 PL:GT:GQ 61,9,0:1/1:63
chr17 18439515 . G A 4.11 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=25 PL:GT:GQ 34,9,0:1/1:63
chr17 18602146 . C T 4.76 . DP=20;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,11;MQ=16 PL:GT:GQ 36,33,0:1/1:99
chr17 19427888 . C T 57 . DP=104;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=45,0,29,0;MQ=39;PV4=1,2.2e-12,1,1 PL:GT:GQ 87,0,131:0/1:90
chr17 19604159 . T C 9.31 . DP=5;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=45 PL:GT:GQ 40,6,0:1/1:49
chr17 19610366 . C T 13 . DP=13;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=48 PL:GT:GQ 44,6,0:1/1:49
chr17 20484706 . C G 51 . DP=35;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=0,11,0,21;MQ=21;PV4=1,0.39,0.49,1 PL:GT:GQ 81,0,36:0/1:39
chr17 20555720 . A G 26.3 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,5;MQ=28 PL:GT:GQ 59,15,0:1/1:75
chr17 24328984 . A C 15.4 . DP=34;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,5,0;MQ=25 PL:GT:GQ 48,15,0:1/1:75
chr17 26237090 . G A 41.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=44 PL:GT:GQ 73,6,0:1/1:49
chr17 28394766 . C A 13.9 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=31 PL:GT:GQ 45,6,0:1/1:49
chr17 31218277 . A G 3.62 . DP=38;AF1=0.5161;CI95=0.5,0.5;DP4=0,1,0,2;MQ=38;PV4=1,0.26,1,1 PL:GT:GQ 31,0,12:0/1:15
chr17 31254021 . C T 15.1 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 47,9,0:1/1:63
chr17 32516798 . G A 37.8 . DP=2;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=49 PL:GT:GQ 69,6,0:1/1:49
chr17 32600253 . A G 16.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 49,12,0:1/1:72
chr17 34255214 . G C 19.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=21 PL:GT:GQ 52,18,0:1/1:90
chr17 34365900 . T C 93.1 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,6,0;MQ=38 PL:GT:GQ 126,18,0:1/1:90
chr17 35380386 . A T 6.79 . DP=44;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,2;MQ=46 PL:GT:GQ 37,6,0:1/1:49
chr17 41993344 . C T 64 . DP=41;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,41;MQ=16 PL:GT:GQ 97,123,0:1/1:99
chr17 42128201 . A G 4.13 . DP=5;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,2,0,2;MQ=52;PV4=1,0.0041,1,1 PL:GT:GQ 32,0,62:0/1:35
chr17 42984490 . C A 56 . DP=33;AF1=0.5001;CI95=0.5,0.5;DP4=6,0,12,0;MQ=42;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 86,0,34:0/1:37
chr17 43419457 . G A 99 . DP=16;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,14;MQ=45 PL:GT:GQ 185,42,0:1/1:99
chr17 43421225 . A G 65.1 . DP=31;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,6,0,17;MQ=43;PV4=1,0.004,1,1 PL:GT:GQ 98,18,0:1/1:90
chr17 45206897 . G A 22 . DP=3;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=47 PL:GT:GQ 54,9,0:1/1:63
chr17 45381302 . T C 18.6 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,4;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
chr17 45530812 . C A 3.54 . DP=6;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=0,3,0,2;MQ=40;PV4=1,1,0.37,1 PL:GT:GQ 31,0,58:0/1:34
chr17 50242633 . G A 44 . DP=42;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=0,25,0,13;MQ=32;PV4=1,0.084,0.14,1 PL:GT:GQ 74,0,154:0/1:77
chr17 51275317 . G A 14.9 . DP=10;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,2,0;MQ=31 PL:GT:GQ 46,6,0:1/1:49
chr17 52325530 . C T 29 . DP=19;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,0,18;MQ=24 PL:GT:GQ 62,54,0:1/1:99
chr17 52411748 . T G 18.6 . DP=4;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,4,0;MQ=25 PL:GT:GQ 51,12,0:1/1:72
chr17 53190746 . C G 62.1 . DP=20;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=40 PL:GT:GQ 95,18,0:1/1:90
chr17 58289916 . T C 18.2 . DP=8;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,0,6;MQ=22 PL:GT:GQ 51,18,0:1/1:90
chr17 59796875 . C T 42 . DP=6;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=0,0,3,0;MQ=35 PL:GT:GQ 74,9,0:1/1:63
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