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##INFO=<ID=AF, Number=1, Type=Float, Description="Dindel estimated population allele frequency">
##INFO=<ID=CA, Number=1, Type=String, Description="Pilot 1 callability mask">
##INFO=<ID=HP, Number=1, Type=Integer, Description="Reference homopolymer tract length">
##INFO=<ID=NS, Number=1, Type=Integer, Description="Number of samples with data">
##INFO=<ID=DB, Number=0, Type=Flag, Description="dbSNP membership build 129 - type match and indel sequence length match within 25 bp">
##INFO=<ID=NR, Number=1, Type=Integer, Description="Number of reads covering non-ref variant on reverse strand">
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1 1000153 . TCACAC TC 100 PASS AF=0.115095;HP=1;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=615
1 1000906 . CAG CG 48 PASS AF=0.0772696;HP=1;NF=2;NR=9;NS=51;CA=0;DP=281
1 1000950 rs60561655;-/G CGG CG 100 PASS AF=0.447771;HP=5;DB;NF=10;NR=20;NS=50;CA=M;DP=291
1 1010786 rs36095298;-/G,mills,venter AC AGC 100 PASS AF=0.774334;HP=1;DB;NF=21;NR=27;NS=51;CA=0;DP=306
1 1026158 . TG TGGGGGG 100 PASS AF=0.115637;HP=1;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=591
1 1028860 mills,venter ACTCC AC 10 PASS AF=0.0107751;HP=1;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
1 1040517 . CA CAA 100 PASS AF=0.0577672;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=426
1 1043690 rs5772037;-/G,venter TG TGG 100 PASS AF=0.065857;HP=3;DB;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=427
1 1049375 . TA TACACACCTGAGCACACACACCTGTGCA 100 PASS AF=0.0808078;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=643
1 1055459 venter ACC AC 100 PASS AF=0.936429;HP=2;NF=13;NR=24;NS=51;CA=M;DP=342
1 1056251 rs34287831;-/A,venter CT CTT 100 PASS AF=0.725164;HP=1;DB;NF=31;NR=20;NS=52;CA=0;DP=375
1 1057459 rs55853944;-/AG,venter CAGG CG 100 PASS AF=0.525146;HP=1;DB;NF=16;NR=18;NS=51;CA=0;DP=331
1 1057537 rs35574593;-/CC,watson TG TGGG 100 PASS AF=0.591248;HP=1;DB;NF=30;NR=12;NS=50;CA=0;DP=341
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1 1073880 . AC ACC 13 PASS AF=0.0555821;HP=2;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=457
1 1087270 mills,venter,watson CCCCAC CC 100 PASS AF=0.990156;HP=4;NF=32;NR=27;NS=50;CA=0;DP=339
1 1088683 rs5772039;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.957928;HP=9;DB;NF=31;NR=26;NS=49;CA=0;DP=336
1 1093553 . TC TCAC 100 PASS AF=0.962343;HP=5;NF=44;NR=17;NS=51;CA=0;DP=324
1 1111698 rs57346441;-/TG,watson CA CTGA 100 PASS AF=0.0986662;HP=1;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=528
1 1117471 . GT GTT 48 PASS AF=0.04843;HP=6;NF=20;NR=8;NS=52;CA=0;DP=510
1 1118641 . CT CTTAT 38 PASS AF=0.0574453;HP=1;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=424
1 1119225 rs60117456;-/C AC ACC 50 PASS AF=0.0255886;HP=4;DB;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=522
1 1121774 . GCTGTTCAGACCTG GG 100 PASS AF=0.0749767;HP=1;NF=6;NR=6;NS=51;CA=0;DP=508
1 1123178 . AACA AA 14 PASS AF=0.0195065;HP=3;NF=2;NR=3;NS=49;CA=0;DP=329
1 1134362 . GGAG GG 100 PASS AF=0.142028;HP=2;NF=12;NR=17;NS=51;CA=0;DP=407
1 1140087 . TCA TA 19 PASS AF=0.0635822;HP=1;NF=2;NR=5;NS=51;CA=0;DP=446
1 1141951 . CTG CG 100 PASS AF=0.100135;HP=1;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=463
1 1148304 rs34808371;-/GT,venter GCAC GC 100 PASS AF=0.0786699;HP=1;DB;NF=11;NR=18;NS=52;CA=0;DP=687
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1 1149524 . GTTTTAT GT 100 PASS AF=0.0475567;HP=4;NF=19;NR=14;NS=50;CA=0;DP=395
1 1150963 . CGCCACAGACACGGGCCACACACTCCACATG CG 100 PASS AF=0.111384;HP=1;NF=46;NR=28;NS=50;CA=0;DP=510
1 1151863 . GT GCT 100 PASS AF=0.126132;HP=1;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=416
1 1153674 rs3831195;-/ACAG GG GGACAG 18 PASS AF=0.0388728;HP=2;DB;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=418
1 1154612 . GT GCT 100 PASS AF=0.0630518;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=531
1 1155143 . GCAC GC 100 PASS AF=0.0991605;HP=1;NF=25;NR=23;NS=52;CA=0;DP=540
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1 1156953 rs57672822;-/ACCCCGGGA CCCCCGGGAAC CC 59 PASS AF=0.0847102;HP=5;DB;NF=5;NR=8;NS=50;CA=0;DP=312
1 1164370 . AA AACATGCATCCA 100 PASS AF=0.0550752;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=481
1 1166826 . AC ACC 11 PASS AF=0.0735648;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=379
1 1167781 rs3835300;-/T CTG CG 100 PASS AF=0.0719128;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=50;CA=0;DP=360
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1 1184391 . GC GCAC 16 PASS AF=0.0187867;HP=1;NF=2;NR=6;NS=51;CA=M;DP=521
1 1204971 . TGG TG 100 PASS AF=0.0564084;HP=6;NF=11;NR=6;NS=50;CA=0;DP=419
1 1207801 rs35647244;-/GT,watson CC CCAC 100 PASS AF=0.034013;HP=2;DB;NF=9;NR=4;NS=52;CA=0;DP=624
1 1213486 . GTCT GT 100 PASS AF=0.504039;HP=1;NF=9;NR=5;NS=50;CA=M;DP=372
1 1217527 rs3831920;-/CTCA,watson TTGAGT TT 100 PASS AF=0.098042;HP=2;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=444
1 1224625 . AGG AG 40 PASS AF=0.0395551;HP=5;NF=4;NR=4;NS=51;CA=0;DP=406
1 1228918 rs35156558;-/GGA,venter CC CCCTC 100 PASS AF=0.999996;HP=5;DB;NF=24;NR=30;NS=49;CA=0;DP=268
1 1232491 . CTACCTGACCTTC CC 13 PASS AF=0.0510512;HP=1;NF=5;NR=5;NS=52;CA=0;DP=510
1 1236119 . CGGCTCTGGGTCACAGGTG CG 17 PASS AF=0.0581287;HP=2;NF=6;NR=8;NS=49;CA=M;DP=277
1 1245266 rs5772041;-/G,venter TGG TG 100 PASS AF=0.928175;HP=4;DB;NF=39;NR=39;NS=52;CA=0;DP=431
1 1286232 venter,watson GACA GA 100 PASS AF=0.878082;HP=1;NF=31;NR=15;NS=50;CA=0;DP=249
1 1292184 watson TG TGTGTGCAG 100 PASS AF=0.92351;HP=1;NF=36;NR=17;NS=51;CA=0;DP=633
1 1475307 rs35008066;-/G,venter GCC GC 59 PASS AF=0.0854422;HP=2;DB;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=372
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1 1482738 rs34962853;-/AT,watson CATA CA 100 PASS AF=0.1747;HP=1;DB;NF=28;NR=14;NS=51;CA=0;DP=441
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1 1512041 . CAAAAGTAAA CA 33 PASS AF=0.0333379;HP=4;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=440
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1 1521139 . GA GAGACA 100 PASS AF=0.667375;HP=1;NF=10;NR=7;NS=52;CA=M;DP=537
1 1521387 . GAGACA GA 100 PASS AF=0.361313;HP=1;NF=13;NR=34;NS=52;CA=M;DP=598
1 1521833 . GACA GA 100 PASS AF=0.193306;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=737
1 1522371 . CC CCCTCAGCTGGACTC 100 PASS AF=0.480499;HP=3;NF=11;NR=12;NS=51;CA=0;DP=535
1 1530305 . AG AGG 15 PASS AF=0.0737746;HP=3;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=569
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1 1575329 . GCAAC GC 12 PASS AF=0.0174116;HP=1;NF=27;NR=21;NS=52;CA=0;DP=554
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1 1577203 venter,watson AA AAAACA 100 PASS AF=0.979791;HP=4;NF=59;NR=37;NS=52;CA=0;DP=498
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1 1638199 . GA GATGTTAA 100 PASS AF=0.962724;HP=1;NF=22;NR=22;NS=52;CA=0;DP=480
1 1638366 venter AT ATT 100 PASS AF=0.471703;HP=4;NF=50;NR=16;NS=52;CA=0;DP=738
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1 1656307 rs35516110;-/GTTT,venter GT GGTTTT 100 PASS AF=0.686901;HP=6;DB;NF=22;NR=20;NS=51;CA=0;DP=293
1 1674207 venter CC CCCTC 100 PASS AF=0.303909;HP=3;NF=26;GC;NR=29;NS=52;CA=0;DP=534
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1 1679986 rs35357728;-/TG,mills,venter,watson AA AACA 100 PASS AF=0.956895;HP=4;DB;NF=60;NR=58;NS=52;CA=0;DP=520
1 1684058 . AAATGA AA 100 PASS AF=0.508762;HP=4;NF=48;NR=55;NS=52;CA=0;DP=471
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1 1715347 . TG TGGGGGG 24 PASS AF=0.0415083;HP=1;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=519
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1 1761838 . GCAC GC 17 PASS AF=0.0186129;HP=1;NF=23;NR=23;NS=52;CA=0;DP=566
1 1767123 . TACACACACACACACACACACACACACACACA TA 100 PASS AF=0.205885;HP=1;NF=32;NR=32;NS=52;CA=0;DP=560
1 1767308 . AG ATG 12 PASS AF=0.363076;HP=2;NF=25;NR=12;NS=52;CA=0;DP=611
1 1768358 . ACA AA 11 NoQCALL AF=0.0311546;HP=1;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=502
1 1768592 . AC ACAACAAAATCCCTTTTTC 100 PASS AF=0.0974177;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=597
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1 1771291 . TG TGG 100 PASS AF=0.18937;HP=2;NF=5;NR=15;NS=52;CA=0;DP=590
1 1778545 . TA TAAA 100 PASS AF=0.155668;HP=3;NF=5;NR=12;NS=52;CA=0;DP=621
1 1778604 rs34483468;-/AGCC,venter GG GGGCTG 100 PASS AF=0.135521;HP=4;DB;NF=22;NR=28;NS=52;CA=0;DP=629
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1 1797136 rs59528461;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.94689;HP=10;DB;NF=58;NR=57;NS=52;CA=0;DP=531
1 1797791 rs35226472;-/CT,venter CG CGAG 100 PASS AF=0.383219;HP=1;DB;NF=64;NR=38;NS=52;CA=0;DP=673
1 1802225 rs34339560;-/A,mills,venter CAA CA 100 PASS AF=0.973419;HP=2;DB;NF=64;NR=71;NS=52;CA=0;DP=635
1 1802305 . GGAG GG 100 PASS AF=0.273326;HP=2;NF=41;NR=34;NS=52;CA=0;DP=695
1 1806743 . TTAGAT TT 100 PASS AF=0.179706;HP=2;NF=9;NR=6;NS=52;CA=0;DP=377
1 1809681 . AG AGG 21 PASS AF=0.133833;HP=2;NF=7;NR=3;NS=52;CA=0;DP=482
1 1810283 . AC ACC 30 PASS AF=0.0430128;HP=2;NF=4;NR=11;NS=52;CA=0;DP=523
1 1810555 . CTTAAT CT 100 PASS AF=0.0498379;HP=2;NF=9;NR=7;NS=52;CA=0;DP=521
1 1812953 rs34135959;-/TCTC CA CAGAGA 100 PASS AF=0.311555;HP=1;DB;NF=6;NR=8;NS=42;CA=0;DP=242
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1 1819947 rs60517384;-/AAGTTGGATATACACACAT CACACACATAAGTTGGATATA CA 100 PASS AF=0.0935091;HP=1;DB;NF=59;NR=69;NS=52;CA=0;DP=854
1 1825723 venter AA AAAATAAATAAATA 100 PASS AF=0.348026;HP=4;NF=9;NR=10;NS=52;CA=0;DP=373
1 1835530 . GTGAGAGTTGTTG GG 100 PASS AF=0.15298;HP=1;NF=12;NR=1;NS=51;CA=0;DP=528
1 1838692 rs5772055;-/AC,mills AA AACA 100 PASS AF=0.0441449;HP=3;DB;NF=2;NR=3;NS=51;CA=0;DP=360
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1 1850674 . AGG AG 100 PASS AF=0.474687;HP=3;NF=7;NR=1;NS=49;CA=0;DP=271
1 1855740 watson GT GTGTAT 100 PASS AF=0.646893;HP=1;NF=42;NR=28;NS=51;CA=0;DP=653
1 1856762 . CACAGG CG 14 PASS AF=0.0324715;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=M;DP=379
1 1857166 . TACA TA 100 PASS AF=0.0531955;HP=1;NF=39;NR=29;NS=52;CA=0;DP=634
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1 1859353 rs35385292;-/TC,venter ACTC AC 100 PASS AF=0.493919;HP=1;DB;NF=26;NR=38;NS=52;CA=M;DP=641
1 1859424 rs34242289;-/CA,venter TCAG TG 100 PASS AF=0.3962;HP=1;DB;NF=40;NR=32;NS=52;CA=M;DP=695
1 1859520 . TCAC TC 100 PASS AF=0.234548;HP=1;NF=26;NR=23;NS=52;CA=0;DP=729
1 1859631 rs35205487;-/GA,venter AC ACTC 100 PASS AF=0.347295;HP=1;DB;NF=15;NR=28;NS=52;CA=0;DP=710
1 1859792 rs34050188;-/AT,watson CG CATG 100 PASS AF=0.715253;HP=1;DB;NF=35;NR=44;NS=52;CA=0;DP=590
1 1864576 . CG CGG 13 PASS AF=0.0158703;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=556
1 1867274 rs34832935;-/C TGG TG 100 PASS AF=0.304336;HP=8;DB;NF=38;NR=23;NS=51;CA=0;DP=538
1 1869711 rs56005703;-/ATAT,watson AA AATATA 100 PASS AF=0.652198;HP=3;DB;NF=16;NR=16;NS=51;CA=0;DP=349
1 1870233 . TC TCCCTCCCTTCTTTCCTTCCCTTTCCCTCC 100 PASS AF=0.408049;HP=2;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=814
1 1870305 . CC CCTTTCCCTCCCTTACTCCTTCCTTCCTTC 100 PASS AF=0.121733;HP=4;NF=1;NR=5;NS=52;CA=0;DP=680
1 1870363 . CT CTT 100 PASS AF=0.11398;HP=2;NF=4;NR=6;NS=52;CA=0;DP=680
1 1870863 rs35875775;-/C,venter TT TGT 100 PASS AF=0.744276;HP=2;DB;NF=43;NR=22;NS=52;CA=0;DP=455
1 1873164 . GT GTT 100 PASS AF=0.387355;HP=3;NF=20;NR=18;NS=52;CA=0;DP=523
1 1873889 rs58267869;-/AAGA AA AAAAGA 100 PASS AF=0.252999;HP=5;DB;NF=57;NR=31;NS=52;CA=0;DP=536
1 1874122 rs35595511;-/T TAA TA 100 PASS AF=0.338059;HP=9;DB;NF=38;NR=38;NS=51;CA=0;DP=519
1 1876064 watson AG AGAGTG 100 PASS AF=0.0829624;HP=1;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=465
1 1876204 . AC ACAGC 100 PASS AF=0.256855;HP=1;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=483
1 1876616 . GC GCTGGTGCGCGTC 100 PASS AF=0.0656988;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=420
1 1876971 rs3838975;-/G GCC GC 21 PASS AF=0.201137;HP=2;DB;NF=15;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
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1 2255198 . TGCTGGAAAGAACAG TG 100 PASS AF=0.115149;HP=1;NF=9;NR=12;NS=51;CA=0;DP=470
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1 2272049 . AGGGGTGGCACGG AG 100 PASS AF=0.0657391;HP=4;NF=20;NR=19;NS=52;CA=0;DP=465
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1 2282631 rs59328016;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.230902;HP=1;DB;NF=1;NR=6;NS=52;CA=M;DP=310
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1 2284162 . CA CAA 12 PASS AF=0.0508845;HP=10;NF=7;NR=7;NS=52;CA=0;DP=406
1 2285124 . TAAAAA TA 100 PASS AF=0.226133;HP=8;NF=14;NR=5;NS=52;CA=0;DP=315
1 2288255 rs56670882;-/TACATAGAAAAA,venter,watson CAAAATACATAGAA CA 100 PASS AF=0.154865;HP=4;DB;NF=46;NR=50;NS=51;CA=0;DP=466
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1 2305015 rs35699260;-/T,venter CAG CG 100 PASS AF=0.283002;HP=1;DB;NF=14;NR=17;NS=51;CA=0;DP=451
1 2310430 . AA AAAGA 100 PASS AF=0.382413;HP=6;NF=20;NR=11;NS=52;CA=0;DP=408
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1 2322519 . TCCT TT 100 PASS AF=0.200476;HP=2;NF=2;NR=10;NS=50;CA=0;DP=413
1 2322562 . TCCACCCTCC TC 100 PASS AF=0.3747;HP=2;NF=8;NR=15;NS=51;CA=0;DP=325
1 2322680 . CT CTT 100 PASS AF=0.284453;HP=1;NF=26;NR=24;NS=52;CA=M;DP=388
1 2323804 venter TC TCC 100 PASS AF=0.865363;HP=3;NF=38;NR=47;NS=50;CA=0;DP=438
1 2325452 . CG CGG 39 PASS AF=0.0242463;HP=3;NF=5;NR=8;NS=51;CA=0;DP=547
1 2332518 . GA GAA 100 PASS AF=0.0862532;HP=1;NF=5;NR=13;NS=51;CA=0;DP=414
1 2337697 rs55744642;-/CGACA,venter,watson GG GGGACAG 100 PASS AF=0.867582;HP=3;DB;NF=16;NR=23;NS=51;CA=0;DP=383
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1 2358758 . CAA CA 26 PASS AF=0.0241071;HP=3;NF=1;NR=3;NS=51;CA=0;DP=486
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1 2688911 rs34425096;-/TC,venter TTCT TT 100 PASS AF=0.26327;HP=5;DB;NF=17;NR=12;NS=52;CA=0;DP=451
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1 2765863 . AG AGG 100 PASS AF=0.999885;HP=1;NF=14;NR=36;NS=49;CA=0;DP=364
1 2765952 . AG AGG 100 PASS AF=0.0789769;HP=1;NF=29;NR=29;NS=51;CA=B;DP=851
1 2779479 . TTTTCTTCTCTTTCT TT 100 PASS AF=0.712577;HP=4;NF=29;NR=22;NS=50;CA=0;DP=322
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1 2822270 rs59677991;-/GC GGCG GG 18 NoQCALL AF=0.0194725;HP=2;DB;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=806
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1 2827616 . CAAGC CC 52 PASS AF=0.132317;HP=2;NF=8;NR=4;NS=51;CA=0;DP=300
1 2828576 . CG CTG 100 PASS AF=0.168378;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=325
1 2829365 rs35758696;-/A TAA TA 100 PASS AF=0.216995;HP=6;DB;NF=20;NR=20;NS=51;CA=0;DP=531
1 2833106 . TG TGTTGGG 100 PASS AF=0.237115;HP=1;NF=11;NR=4;NS=52;CA=0;DP=336
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1 2859183 rs34869376;-/CT ACTC AC 100 PASS AF=0.228335;HP=1;DB;NF=11;NR=14;NS=52;CA=0;DP=446
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1 2871504 . TA TACTAA 100 PASS AF=0.128765;HP=1;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=676
1 2871601 rs60410855;-/TCCA CC CCCATC 100 PASS AF=0.11635;HP=3;DB;NF=19;NR=14;NS=52;CA=0;DP=682
1 2874709 . GT GTT 100 PASS AF=0.138394;HP=9;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=534
1 2876814 rs5772089;-/A,mills,venter GG GAG 100 PASS AF=0.999994;HP=10;DB;NF=39;NR=42;NS=50;CA=0;DP=343
1 2877421 rs35085736;-/C,venter GC GCC 100 PASS AF=0.582204;HP=6;DB;NF=29;NR=37;NS=50;CA=0;DP=426
1 2881114 . GG GTG 100 PASS AF=0.586283;HP=5;NF=16;NR=5;NS=47;CA=M;DP=256
1 2883970 . GG GCG 16 PASS AF=0.516075;HP=4;NF=6;NR=2;NS=51;CA=M;DP=332
1 2885504 . TCC TC 29 PASS AF=0.140908;HP=9;NF=12;NR=8;NS=51;CA=0;DP=353
1 2886983 . AG AGG 50 PASS AF=0.0436199;HP=3;NF=7;NR=2;NS=50;CA=0;DP=401
1 2887864 rs57379840;-/T,venter CG CTG 100 PASS AF=0.770236;HP=2;DB;NF=41;NR=25;NS=51;CA=0;DP=375
1 2892284 . CAT CT 100 PASS AF=0.0885935;HP=1;NF=23;NR=17;NS=52;CA=0;DP=685
1 2892433 venter AT ATCCATCCTCCATCCT 100 PASS AF=0.814532;HP=1;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=620
1 2892472 . CCCATC CC 100 PASS AF=0.181828;HP=3;NF=50;NR=61;NS=52;CA=0;DP=633
1 2899352 . CTA CA 100 PASS AF=0.0433393;HP=1;NF=5;NR=2;NS=51;CA=0;DP=512
1 2902379 . TAGA TA 40 PASS AF=0.0165292;HP=1;NF=3;NR=2;NS=51;CA=0;DP=476
1 2903930 rs36097640;-/A TAA TA 12 PASS AF=0.0522384;HP=8;DB;NF=13;NR=15;NS=51;CA=0;DP=535
1 2907194 rs35693840;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.136995;HP=5;DB;NF=14;NR=8;NS=52;CA=0;DP=516
1 2916313 . AC ACC 40 PASS AF=0.0606632;HP=1;NF=1;NR=13;NS=52;CA=0;DP=529
1 2923107 . GA GGGGGGAA 35 PASS AF=0.311458;HP=1;NF=1;NR=2;NS=50;CA=0;DP=285
1 2923994 . AAGGA AA 100 PASS AF=0.136914;HP=3;NF=4;NR=16;NS=52;CA=0;DP=475
1 2926544 rs58065168;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.231871;HP=7;DB;NF=23;NR=13;NS=51;CA=0;DP=445
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1 2932462 . GT GTGAT 56 PASS AF=0.766604;HP=1;NF=33;NR=13;NS=52;CA=M;DP=790
1 2932531 . GT GTGGTGAT 56 PASS AF=0.365205;HP=1;NF=19;NR=4;NS=52;CA=M;DP=738
1 2938240 rs57953122;-/AAGCC AC ACCAAGC 100 PASS AF=0.229942;HP=2;DB;NF=5;NR=7;NS=52;CA=0;DP=387
1 2939820 rs35035410;-/C,venter GCC GC 100 PASS AF=0.270114;HP=6;DB;NF=15;NR=21;NS=52;CA=0;DP=477
1 2940602 . GA GAA 100 PASS AF=0.245189;HP=10;NF=31;NR=30;NS=52;CA=0;DP=516
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1 2943041 rs34450334;-/G,mills CGG CG 100 PASS AF=0.212427;HP=8;DB;NF=13;NR=12;NS=52;CA=0;DP=523
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1 2950056 . TC TCAAACAAAC 100 PASS AF=0.133966;HP=1;NF=9;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
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1 2982005 . GT GGGTT 100 PASS AF=0.189932;HP=5;NF=6;NR=5;NS=52;CA=0;DP=460
1 2984462 rs34471979;-/C,venter TCC TC 100 PASS AF=0.423837;HP=2;DB;NF=20;NR=27;NS=51;CA=0;DP=459
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1 2987353 . AGTG AG 39 PASS AF=0.0534166;HP=1;NF=13;NR=12;NS=51;CA=0;DP=341
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1 3131742 . GT GGGGGGGGGTT 27 PASS AF=0.243052;HP=3;NF=2;NR=1;NS=49;CA=0;DP=394
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1 3335208 . CGG CG 100 PASS AF=0.0438559;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=448
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1 3356271 . TTCCT TT 15 PASS AF=0.00990969;HP=3;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=537
1 3356391 rs4018597;-/TA TT TTAT 100 PASS AF=0.0517593;HP=2;DB;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
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1 3393157 . AAAAAATA AA 100 PASS AF=0.0549314;HP=6;NF=23;NR=18;NS=51;CA=0;DP=468
1 3393524 . GGTGTG GG 23 PASS AF=0.017751;HP=2;NF=1;NR=19;NS=49;CA=0;DP=266
1 3409800 . AAGA AA 100 PASS AF=0.0431791;HP=3;NF=1;NR=8;NS=51;CA=0;DP=643
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1 3411485 rs60864742;-/ACACCGGTAGCAAGGCA,mills ACACCGGTAGCAAGGCACC AC 100 PASS AF=0.0858716;HP=1;DB;NF=8;NR=17;NS=52;CA=0;DP=523
1 3417374 . GCACACGCCCCCACCC GC 20 PASS AF=0.0294079;HP=1;NF=4;NR=3;NS=50;CA=0;DP=447
1 3429498 rs56204236;-/G CG CGG 100 PASS AF=0.596026;HP=10;DB;NF=6;NR=7;NS=51;CA=0;DP=322
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1 3543853 . TC TCC 100 PASS AF=0.156605;HP=6;NF=12;NR=13;NS=52;CA=0;DP=527
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1 3556883 . CA CATA 14 PASS AF=0.0221011;HP=1;NF=9;NR=13;NS=50;CA=0;DP=436
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1 3566253 rs57149403;-/GTCCAGC AC ACGTCCAGC 100 PASS AF=0.0476733;HP=1;DB;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=363
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1 3574939 . CG CGTGTGTG 23 PASS AF=0.401022;HP=1;NF=46;NR=32;NS=52;CA=0;DP=481
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1 3603570 . GCGGGGCCCACCTCGCACCCGCGGCCCACGTCGCACCC GC 100 PASS AF=0.0758905;HP=1;NF=8;NR=12;NS=51;CA=0;DP=414
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1 3635416 rs3034587;-/CTCTCT,mills,venter AA AAGAGAGA 100 PASS AF=0.707697;HP=3;DB;NF=37;NR=27;NS=52;CA=0;DP=538
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1 3665995 . TTTGAAACT TT 33 PASS AF=0.00986571;HP=4;NF=1;NR=3;NS=52;CA=0;DP=507
1 3668078 . AGG AG 100 PASS AF=0.341281;HP=8;NF=21;NR=29;NS=52;CA=0;DP=467
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1 3710853 rs35447451;-/G,venter AG AGG 100 PASS AF=0.272856;HP=4;DB;NF=25;NR=31;NS=52;CA=0;DP=507
1 3711553 rs36007194;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.093968;HP=10;DB;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=515
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1 3759325 . CG CGGCCAAGGAG 100 PASS AF=0.391954;HP=2;NF=19;NR=18;NS=52;CA=0;DP=465
1 3759824 . CG CGGG 22 PASS AF=0.0355289;HP=5;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=591
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1 3786092 . TACTCA TA 100 PASS AF=0.0330531;HP=1;NF=1;NR=6;NS=52;CA=0;DP=497
1 3788460 rs35600694;-/ATA,watson CA CAATA 100 PASS AF=0.42686;HP=1;DB;NF=20;NR=17;NS=51;CA=0;DP=533
1 3788666 rs34172576;-/T,venter GT GTT 100 PASS AF=0.481873;HP=1;DB;NF=26;NR=12;NS=52;CA=0;DP=409
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1 3806447 rs35704040;-/C,mills GCC GC 100 PASS AF=0.0700176;HP=6;DB;NF=4;NR=8;NS=52;CA=0;DP=350
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1 3818483 . AC ACC 29 PASS AF=0.0676027;HP=3;NF=1;NR=7;NS=50;CA=0;DP=412
1 3820456 . TGG TG 12 PASS AF=0.0215117;HP=4;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=417
1 3824944 . GCTC GC 100 PASS AF=0.174164;HP=1;NF=9;NR=17;NS=50;CA=0;DP=277
1 3825911 . CG CGGGGGG 100 PASS AF=0.29134;HP=2;NF=24;NR=12;NS=52;CA=0;DP=514
1 3827024 . TTCCCT TT 16 PASS AF=0.0318298;HP=2;NF=34;NR=70;NS=51;CA=M;DP=394
1 3827604 . TG TGG 40 PASS AF=0.0159039;HP=1;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=571
1 3833062 watson TC TCCACC 100 PASS AF=0.312659;HP=2;NF=17;NR=16;NS=52;CA=0;DP=463
1 3833266 venter,watson AT ATCAGT 100 PASS AF=0.497122;HP=1;NF=10;NR=19;NS=51;CA=0;DP=412
1 3833395 . CTATCTT CT 24 PASS AF=0.0218407;HP=1;NF=7;NR=3;NS=50;CA=0;DP=400
1 3833485 . GTCTAT GT 100 PASS AF=0.417779;HP=1;NF=11;NR=12;NS=50;CA=0;DP=323
1 3833578 watson TTATCT TT 100 PASS AF=0.329625;HP=2;NF=27;NR=26;NS=51;CA=0;DP=388
1 3833880 watson CA CATCTA 100 PASS AF=0.347946;HP=1;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=458
1 3906706 . TGG TG 100 PASS AF=0.149111;HP=3;NF=11;NR=9;NS=52;CA=0;DP=498
1 3907565 rs34088401;-/C,mills TCC TC 100 PASS AF=0.191109;HP=6;DB;NF=11;NR=14;NS=51;CA=0;DP=478
1 3909253 . AC ACC 100 PASS AF=0.0974891;HP=2;NF=10;NR=9;NS=52;CA=0;DP=591
1 3909917 rs35302885;-/T,venter CTT CT 100 PASS AF=0.766256;HP=7;DB;NF=45;NR=61;NS=52;CA=0;DP=605
1 3916501 rs55698528;-/A,venter GA GAA 100 PASS AF=0.624637;HP=1;DB;NF=37;NR=28;NS=52;CA=0;DP=488
1 3920626 rs59758170;-/TAAATAAATA AATAAATAAATA AA 100 PASS AF=0.276985;HP=3;DB;NF=6;NR=6;NS=50;CA=M;DP=308
1 3923069 . TCG TG 100 PASS AF=0.224119;HP=1;NF=23;NR=7;NS=52;CA=0;DP=488
1 3925431 rs34400281;-/T,venter CTT CT 100 PASS AF=0.372459;HP=2;DB;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=500
1 3933527 . ATTCCCCACAGTGTCTATGGGGACTCTAGCACGGTCAGGGACCCT AT 100 PASS AF=0.0367516;HP=2;NF=29;NR=33;NS=51;CA=0;DP=622
1 3934862 venter GCAC GC 100 PASS AF=0.565308;HP=1;NF=47;NR=42;NS=51;CA=0;DP=648
1 3935044 . TCAC TC 40 PASS AF=0.0156518;HP=1;NF=25;NR=8;NS=52;CA=0;DP=717
1 3937578 rs56700097;-/A,venter TG TAG 100 PASS AF=0.540707;HP=1;DB;NF=40;NR=17;NS=52;CA=0;DP=392
1 3938627 rs58820377;-/ATAG TTAGAT TT 100 PASS AF=0.0846429;HP=2;DB;NF=10;NR=11;NS=52;CA=0;DP=489
1 3945777 . CAGA CA 100 PASS AF=0.442957;HP=1;NF=49;NR=35;NS=52;CA=M;DP=511
1 3967107 venter GAGAA GA 100 PASS AF=0.226936;HP=1;NF=10;NR=15;NS=52;CA=0;DP=543
1 3971955 rs56102422;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.275646;HP=10;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=477
1 3973109 rs56883229;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.374332;HP=8;DB;NF=7;NR=38;NS=52;CA=0;DP=398
1 3974590 . ATT AT 100 PASS AF=0.373956;HP=8;NF=19;NR=19;NS=51;CA=0;DP=352
1 3976220 . TTCCAGCTGTTGGACTGGCAAACAGT TT 100 PASS AF=0.155908;HP=3;NF=51;NR=67;NS=52;CA=0;DP=702
1 3983232 . GC GCC 100 PASS AF=0.153929;HP=3;NF=2;NR=12;NS=51;CA=0;DP=479
1 3989673 rs34117538;-/T CTT CT 100 PASS AF=0.138005;HP=7;DB;NF=10;NR=16;NS=52;CA=0;DP=480
1 3991472 . GT GTT 41 PASS AF=0.0921994;HP=10;NF=23;NR=19;NS=52;CA=0;DP=490
1 3995340 . GAATA GA 100 PASS AF=0.126804;HP=2;NF=18;NR=25;NS=51;CA=0;DP=456
1 3995701 rs35842317;-/A GA GAA 100 PASS AF=0.287765;HP=3;DB;NF=16;NR=28;NS=52;CA=0;DP=515
1 3998289 rs34690250;-/C AT ATT 31 PASS AF=0.0505667;HP=1;DB;NF=5;NR=6;NS=50;CA=0;DP=373
1 3998556 rs35439065;-/C,venter AC ACC 100 PASS AF=0.152989;HP=1;DB;NF=17;NR=4;NS=52;CA=0;DP=565
1 4003805 . CCCTTC CC 100 PASS AF=0.497734;HP=3;NF=13;NR=9;NS=52;CA=M;DP=357
1 4004467 . TA TAA 100 PASS AF=0.178845;HP=10;NF=39;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
1 4005161 . AAGA AA 10 PASS AF=0.109604;HP=8;NF=5;NR=3;NS=52;CA=0;DP=418
1 4009724 . GGAGAGGGAGAAG GG 100 PASS AF=0.0443217;HP=4;NF=7;NR=9;NS=51;CA=0;DP=347
1 4010638 rs59300943;-/T CT CTT 100 PASS AF=0.238748;HP=5;DB;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=424
1 4018608 . GGGAG GG 14 PASS AF=0.0210215;HP=3;NF=11;NR=22;NS=52;CA=0;DP=439
1 4020045 rs60135555;-/AAA,venter TA TAAAA 55 PASS AF=0.669408;HP=9;DB;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=315
1 4021381 . CTGGGAAC CC 26 PASS AF=0.0682584;HP=1;NF=1;NR=7;NS=52;CA=0;DP=500
1 4022270 . TG TCG 59 PASS AF=0.0269606;HP=6;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=522
1 4022431 rs58149124;-/CC,watson TC TCCC 100 PASS AF=0.833755;HP=1;DB;NF=29;NR=41;NS=52;CA=0;DP=574
1 4024133 rs56013829;-/GTCA,venter ACAGTC AC 100 PASS AF=0.444062;HP=1;DB;NF=29;NR=25;NS=52;CA=0;DP=599
1 4024168 rs56372495;-/AC,venter TCAC TC 100 PASS AF=0.370935;HP=1;DB;NF=14;NR=39;NS=52;CA=0;DP=645
1 4024408 rs55816119;-/TT,watson TC TCAC 100 PASS AF=0.479654;HP=1;DB;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=726
1 4024524 . ACTC AC 100 PASS AF=0.220192;HP=1;NF=11;NR=5;NS=52;CA=0;DP=721
1 4024673 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.173855;HP=2;NF=11;NR=13;NS=52;CA=0;DP=887
1 4024704 . TCAG TG 100 PASS AF=0.0291681;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=750
1 4024735 venter TC TCAC 100 PASS AF=0.247468;HP=1;NF=19;NR=5;NS=52;CA=0;DP=775
1 4024928 . CTCAGT CT 100 PASS AF=0.0974879;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=919
1 4025065 . TCAC TC 100 PASS AF=0.273013;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=714
1 4025127 . ACTC AC 100 PASS AF=0.380734;HP=1;NF=17;NR=20;NS=52;CA=M;DP=574
1 4025165 . TC TCACTCAC 100 PASS AF=0.0820414;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=M;DP=574
1 4025232 watson TC TCAC 100 PASS AF=0.631924;HP=1;NF=15;NR=11;NS=52;CA=M;DP=459
1 4025339 . TTCACT TT 53 PASS AF=0.159738;HP=2;NF=17;NR=14;NS=51;CA=0;DP=609
1 4025399 . CA CATA 100 PASS AF=0.0862676;HP=1;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=506
1 4025472 . CA CATTTA 39 PASS AF=0.0270865;HP=1;NF=2;NR=1;NS=52;CA=0;DP=538
1 4025543 venter,watson TC TCAC 100 PASS AF=0.26036;HP=1;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=482
1 4025589 . AC ACTC 53 PASS AF=0.0696821;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=575
1 4025678 watson TACTCA TA 100 PASS AF=0.299176;HP=1;NF=14;NR=7;NS=52;CA=0;DP=549
1 4025718 . CATT CT 100 PASS AF=0.0815807;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=570
1 4025810 watson TC TCAC 100 PASS AF=0.240222;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=442
1 4025920 . ACTCACACTC AC 15 PASS AF=0.0440807;HP=1;NF=5;NR=6;NS=52;CA=0;DP=439
1 4025988 . ATCACT AT 100 PASS AF=0.115745;HP=1;NF=7;NR=3;NS=52;CA=M;DP=409
1 4026021 . ATTCGC AC 19 PASS AF=0.0230633;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=408
1 4026091 . ACAGTC AC 100 PASS AF=0.239672;HP=1;NF=10;NR=12;NS=52;CA=0;DP=418
1 4026188 . GTCACTCGTT GT 100 PASS AF=0.0942528;HP=1;NF=17;NR=15;NS=51;CA=M;DP=704
1 4026243 . AC ACTCACTC 100 PASS AF=0.0701669;HP=1;NF=8;NR=2;NS=52;CA=0;DP=852
1 4026341 . AC ACTC 100 PASS AF=0.180464;HP=1;NF=7;NR=12;NS=52;CA=0;DP=797
1 4026433 . AC ACTCACAGTC 100 PASS AF=0.0755971;HP=1;NF=10;NR=4;NS=52;CA=0;DP=727
1 4026489 . CCACTC CC 100 PASS AF=0.152175;HP=2;NF=20;NR=14;NS=52;CA=0;DP=896
1 4026521 . AT ACT 18 PASS AF=0.0348752;HP=1;NF=8;NR=8;NS=52;CA=0;DP=896
1 4026676 . ACACTC AC 100 PASS AF=0.345964;HP=1;NF=25;NR=27;NS=52;CA=0;DP=805
1 4026745 . ACTC AC 100 PASS AF=0.277096;HP=1;NF=6;NR=11;NS=52;CA=0;DP=625
1 4026831 . AC ACTC 100 PASS AF=0.158736;HP=1;NF=13;NR=9;NS=52;CA=0;DP=585
1 4026904 . TACTCA TA 59 PASS AF=0.094457;HP=1;NF=7;NR=4;NS=52;CA=0;DP=594
1 4026996 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.0816069;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=668
1 4027100 watson GT GTCACT 100 PASS AF=0.51624;HP=1;NF=22;NR=20;NS=52;CA=0;DP=958
1 4027153 . AC ACTCACACTC 100 PASS AF=0.221157;HP=1;NF=11;NR=7;NS=52;CA=0;DP=694
1 4027249 . ACACTCGCTCAGTC AC 100 PASS AF=0.191741;HP=1;NF=20;NR=16;NS=52;CA=0;DP=528
1 4027301 . TCAC TC 100 PASS AF=0.21653;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=511
1 4027378 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.23813;HP=2;NF=19;NR=16;NS=52;CA=0;DP=565
1 4027440 . TT TTCACT 100 PASS AF=0.351897;HP=2;NF=28;NR=13;NS=52;CA=0;DP=736
1 4031776 venter,watson GC GCTGCTCC 100 PASS AF=0.57914;HP=1;NF=17;NR=13;NS=52;CA=0;DP=475
1 4046995 rs60127181;-/ATG,watson GC GGATC 100 PASS AF=0.863384;HP=1;DB;NF=37;NR=32;NS=51;CA=0;DP=427
1 4053051 . AC AACC 10 PASS AF=0.0731381;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=453
1 4056743 rs57501900;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.863012;HP=6;DB;NF=63;NR=45;NS=52;CA=0;DP=485
1 4078234 venter,watson CTGCCTGTGTGAGCAAGAT CT 100 PASS AF=0.308447;HP=1;NF=26;NR=18;NS=52;CA=0;DP=484
1 4080449 rs35774756;-/T GTT GT 100 PASS AF=0.285891;HP=2;DB;NF=20;NR=24;NS=51;CA=0;DP=526
1 4082493 rs35701497;-/G CGG CG 100 PASS AF=0.277913;HP=4;DB;NF=14;NR=16;NS=52;CA=0;DP=416
1 4086137 . CA CTA 100 PASS AF=0.0260425;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=569
1 4088196 . TTCT TT 100 PASS AF=0.0658972;HP=3;NF=67;NR=77;NS=51;CA=B;DP=647
1 4091673 rs56198003;-/TTA GTTAT GT 100 PASS AF=0.0274099;HP=2;DB;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=489
1 4093407 rs35442233;-/G,venter TGG TG 100 PASS AF=0.056726;HP=4;DB;NF=4;NR=5;NS=51;CA=0;DP=432
1 4097902 rs5772141;-/ATT,mills,venter,watson CA CATTA 100 PASS AF=0.999995;HP=1;DB;NF=38;NR=34;NS=52;CA=0;DP=432
1 4106716 . AC ACACACACACACGC 100 PASS AF=0.316911;HP=1;NF=1;NR=1;NS=52;CA=0;DP=601
1 4114274 rs60603556;-/CAT,watson AATCA AA 100 PASS AF=0.135224;HP=3;DB;NF=17;NR=9;NS=51;CA=0;DP=587
1 4114592 rs56285575;-/ACA,venter AAACA AA 100 PASS AF=0.254759;HP=3;DB;NF=21;NR=18;NS=52;CA=0;DP=554
1 4114812 . TTAT TT 33 PASS AF=0.14738;HP=3;NF=5;NR=4;NS=52;CA=0;DP=411
1 4114996 . AA AATTATTA 11 PASS AF=0.228122;HP=2;NF=26;NR=29;NS=49;CA=0;DP=276
1 4120825 . GAA GA 43 PASS AF=0.147904;HP=2;NF=11;NR=17;NS=51;CA=0;DP=328
1 4121802 . ATGT AT 11 PASS AF=0.0113836;HP=1;NF=24;NR=16;NS=52;CA=0;DP=570
1 4131826 . ATTGTTT AT 100 PASS AF=0.999996;HP=2;NF=38;NR=35;NS=52;CA=0;DP=456
1 4134659 rs35271731;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.417516;HP=5;DB;NF=21;NR=19;NS=52;CA=0;DP=429
1 4139315 rs35859581;-/T,venter GT GTT 100 PASS AF=0.371694;HP=2;DB;NF=12;NR=16;NS=52;CA=0;DP=444
1 4144542 . CAA CA 100 PASS AF=0.0915309;HP=2;NF=7;NR=8;NS=52;CA=M;DP=461
1 4149378 rs35644791;-/CCT,venter,watson AC ACCTC 100 PASS AF=0.955034;HP=2;DB;NF=35;NR=24;NS=52;CA=0;DP=461
1 4150078 . ATC AC 100 PASS AF=0.0248618;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=489
1 4158176 rs61115653;-/A CA CAA 100 PASS AF=0.109858;HP=9;DB;NF=9;NR=8;NS=52;CA=0;DP=480
1 4158371 rs35550030;-/G AGA AA 100 PASS AF=0.282272;HP=1;DB;NF=22;NR=13;NS=52;CA=0;DP=508
1 4160853 . AG AGTG 100 PASS AF=0.883963;HP=1;NF=52;NR=40;NS=52;CA=0;DP=475
1 4163479 rs35439066;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.421487;HP=7;DB;NF=35;NR=40;NS=52;CA=0;DP=580
1 4165518 rs5772143;-/A,mills CAT CT 100 PASS AF=0.0997002;HP=1;DB;NF=8;NR=9;NS=52;CA=0;DP=569
1 4168412 . TG TGG 100 PASS AF=0.0597927;HP=5;NF=7;NR=5;NS=50;CA=0;DP=411
1 4174019 . CCTTTC CC 100 PASS AF=0.223832;HP=2;NF=5;NR=11;NS=51;CA=M;DP=369
1 4176371 rs5772145;-/GGGCT,mills,venter,watson GG GGGGCTG 100 PASS AF=0.965127;HP=4;DB;NF=37;NR=39;NS=51;CA=0;DP=577
1 4180359 rs35134459;-/T,venter CG CTG 100 PASS AF=0.994644;HP=2;DB;NF=70;NR=40;NS=52;CA=0;DP=510
1 4198168 . GCCATTTACATCCCACC GC 100 PASS AF=0.0947023;HP=2;NF=47;NR=53;NS=52;CA=0;DP=625
1 4203370 . TCAC TC 22 PASS AF=0.151126;HP=1;NF=40;NR=22;NS=51;CA=0;DP=481
1 4224147 . ATGT AT 100 PASS AF=0.459042;HP=1;NF=45;NR=57;NS=52;CA=0;DP=508
1 4236168 venter,watson GT GTCCTGTT 100 PASS AF=0.465028;HP=1;NF=21;NR=21;NS=51;CA=0;DP=473
1 4238553 . TAG TG 100 PASS AF=0.0884036;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=313
1 4243904 . TG TGGGGG 28 PASS AF=0.177328;HP=1;NF=6;NR=9;NS=52;CA=0;DP=598
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1 4291813 . CGC CC 41 PASS AF=0.05598;HP=1;NF=1;NR=9;NS=52;CA=0;DP=504
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1 4310305 venter GA GAA 39 PASS AF=0.078696;HP=9;NF=15;NR=5;NS=52;CA=0;DP=455
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1 4313453 . GG GTG 23 PASS AF=0.026167;HP=2;NF=2;NR=5;NS=52;CA=0;DP=614
1 4315016 rs34078493;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.459017;HP=1;DB;NF=25;NR=37;NS=52;CA=0;DP=493
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1 4317119 rs35907112;-/AG AAGA AA 100 PASS AF=0.210583;HP=3;DB;NF=19;NR=13;NS=52;CA=0;DP=652
1 4319781 rs34098980;-/AAAAA,mills,venter CC CAAAAAC 100 PASS AF=0.451406;HP=2;DB;NF=9;NR=1;NS=52;CA=0;DP=605
1 4323411 . GT GTT 41 PASS AF=0.0448346;HP=6;NF=4;NR=5;NS=52;CA=0;DP=498
1 4326343 . CG CGGGGGGGGGGG 100 PASS AF=0.212625;HP=2;NF=5;NR=11;NS=52;CA=0;DP=475
1 4329138 . GTGAT GT 47 PASS AF=0.0168095;HP=1;NF=35;NR=37;NS=52;CA=0;DP=675
1 4329500 venter ATGGTGATGGT AT 100 PASS AF=0.0491;HP=1;NF=35;NR=49;NS=52;CA=0;DP=718
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1 4333090 . CCCATC CC 100 PASS AF=0.896174;HP=3;NF=52;NR=56;NS=52;CA=0;DP=564
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1 4362123 rs57250327;-/AAATT TA TAATTAA 100 PASS AF=0.202867;HP=2;DB;NF=23;NR=24;NS=52;CA=0;DP=404
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1 4373092 . CATTTA CA 100 PASS AF=0.155807;HP=1;NF=19;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
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1 4376164 rs57973702;-/TG,venter CG CGTG 100 PASS AF=0.555727;HP=1;DB;NF=33;NR=60;NS=52;CA=0;DP=552
1 4382255 . GT GTT 100 PASS AF=0.134524;HP=8;NF=12;NR=14;NS=52;CA=0;DP=445
1 4382929 . CG CGCCGTGCCCTGCTCAG 100 PASS AF=0.293977;HP=1;NF=3;NR=1;NS=52;CA=0;DP=423
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1 4387089 rs35106948;-/GA,venter,watson TGAG TG 100 PASS AF=0.76407;HP=1;DB;NF=42;NR=48;NS=52;CA=0;DP=730
1 4398343 rs56075652;-/AGCTAG,mills,venter,watson GGAGCTAG GG 100 PASS AF=0.850798;HP=2;DB;NF=51;NR=52;NS=52;CA=0;DP=535
1 4403445 . ATC AC 100 PASS AF=0.0257077;HP=1;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=579
1 4413424 . GGAAG GG 100 PASS AF=0.0911622;HP=2;NF=13;NR=11;NS=52;CA=0;DP=539
1 4415363 rs35655214;-/A,mills,venter CAA CA 100 PASS AF=0.279808;HP=10;DB;NF=16;NR=13;NS=52;CA=0;DP=623
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1 4429935 . ACC AC 100 PASS AF=0.121066;HP=2;NF=8;NR=7;NS=52;CA=0;DP=509
1 4432975 rs35185885;-/TTAT,venter TT TTTTAT 100 PASS AF=0.370788;HP=4;DB;NF=7;NR=50;NS=51;CA=0;DP=329
1 4433724 . AC ACC 100 PASS AF=0.191535;HP=2;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=609
1 4434361 . GA GATGATATTGAAA 100 PASS AF=0.175787;HP=1;NF=8;NR=5;NS=52;CA=0;DP=496
1 4439328 rs55695069;-/TGTG,watson TGTGAG TG 100 PASS AF=0.115075;HP=1;DB;NF=13;NR=10;NS=51;CA=0;DP=510
1 4444447 . GC GCC 100 PASS AF=0.126735;HP=1;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=442
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1 4456823 . TT TTTTCTCTCT 100 PASS AF=0.281015;HP=3;NF=18;NR=7;NS=52;CA=0;DP=566
1 4460399 . CAGA CA 17 PASS AF=0.0162627;HP=1;NF=4;NR=1;NS=52;CA=0;DP=437
1 4461064 . TG TGGG 100 PASS AF=0.136493;HP=8;NF=11;NR=12;NS=52;CA=0;DP=516
1 4461120 . GAGTCA GA 100 PASS AF=0.106497;HP=1;NF=4;NR=10;NS=52;CA=0;DP=513
1 4462914 rs35786528;-/T,venter GTT GT 100 PASS AF=0.636288;HP=9;DB;NF=46;NR=44;NS=52;CA=0;DP=457
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1 4465553 rs33984734;-/C,mills,venter GCC GC 100 PASS AF=0.832437;HP=3;DB;NF=43;NR=36;NS=52;CA=0;DP=507
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1 4466414 rs34356738;-/T,venter AT ATT 100 PASS AF=0.0343632;HP=4;DB;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=523
1 4468803 . CT CTTTTCTTTTCTTT 100 PASS AF=0.185641;HP=2;NF=2;NR=1;NS=51;CA=0;DP=271
1 4469024 . TT TTGTGT 26 PASS AF=0.65093;HP=2;NF=51;NR=54;NS=51;CA=0;DP=465
1 4470162 rs34280110;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.19103;HP=3;DB;NF=13;NR=16;NS=52;CA=0;DP=581
1 4472390 rs35540877;-/AAG TAAGA TA 100 PASS AF=0.0513799;HP=2;DB;NF=4;NR=3;NS=52;CA=0;DP=531
1 4481812 rs34806922;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.0356083;HP=3;DB;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=576
1 4482705 . CA CATCTA 100 PASS AF=0.203301;HP=1;NF=34;NR=52;NS=50;CA=M;DP=382
1 4482808 . CTA CA 16 PASS AF=0.0550307;HP=1;NF=1;NR=1;NS=51;CA=M;DP=356
1 4482848 rs5772166;-/TCTCTCTC,mills ATCTCTCTCT AT 100 PASS AF=0.561639;HP=1;DB;NF=52;NR=17;NS=51;CA=M;DP=311
1 4484471 rs3059158;-/CT,mills,watson AG ACTG 100 PASS AF=0.497825;HP=1;DB;NF=31;NR=34;NS=52;CA=0;DP=538
1 4486660 rs34976033;-/CCCT,mills,venter,watson GCTCCC GC 100 PASS AF=0.593551;HP=1;DB;NF=42;NR=55;NS=52;CA=0;DP=566
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1 4504724 venter,watson TAGACA TA 100 PASS AF=0.381777;HP=1;NF=34;NR=33;NS=52;CA=0;DP=728
1 4504861 venter TACAGAGAGAGACAGAGAGA TA 100 PASS AF=0.208225;HP=1;NF=42;NR=31;NS=52;CA=0;DP=820
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1 4513234 rs5772168;-/ATCA,venter,watson TA TATCAA 100 PASS AF=0.761132;HP=1;DB;NF=45;NR=38;NS=52;CA=0;DP=478
1 4513552 rs34248962;-/G,venter CTC CC 100 PASS AF=0.397344;HP=1;DB;NF=19;NR=21;NS=52;CA=0;DP=502
1 4518079 . CTTTATGTCAAC CC 31 PASS AF=0.0537494;HP=3;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=567
1 4519870 . CATAA CA 100 PASS AF=0.156873;HP=1;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=518
1 4520552 venter,watson ATATT AT 100 PASS AF=0.0454741;HP=1;NF=13;NR=21;NS=52;CA=0;DP=523
1 4524683 rs60936673;-/A,venter GAC GC 100 PASS AF=0.0433734;HP=1;DB;NF=5;NR=1;NS=51;CA=0;DP=407
1 4531795 . CG CGAGCAGATAG 100 PASS AF=0.0529244;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=598
1 4533811 rs61232512;-/TCCCTCCTGGACAGCCAGG,watson TCCTCCTGGACAGCCAGGTCC TC 100 PASS AF=0.455665;HP=2;DB;NF=9;NR=12;NS=52;CA=0;DP=455
1 4535415 rs34971058;-/C,mills,venter GC GCC 100 PASS AF=0.872856;HP=1;DB;NF=71;NR=50;NS=52;CA=0;DP=585
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1 4541031 . TT TTTTCT 100 PASS AF=0.0665496;HP=6;NF=18;NR=24;NS=51;CA=0;DP=371
1 4541492 rs5772170;-/G,mills,venter TG TGG 100 PASS AF=0.912727;HP=3;DB;NF=57;NR=39;NS=52;CA=0;DP=454
1 4542962 . CC CCTCTCTCTCTC 100 PASS AF=0.767807;HP=2;NF=57;NR=35;NS=52;CA=0;DP=481
1 4544333 rs3059964;-/CT,venter ACTC AC 100 PASS AF=0.941425;HP=1;DB;NF=54;NR=73;NS=52;CA=0;DP=591
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1 4552887 . GT GTCT 100 PASS AF=0.155774;HP=1;NF=6;NR=7;NS=52;CA=0;DP=507
1 4556585 rs3833958;-/GGGCT,venter GA GAGCCCA 100 PASS AF=0.248571;HP=1;DB;NF=9;NR=9;NS=52;CA=0;DP=416
1 4558195 rs58248788;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.949748;HP=4;DB;NF=38;NR=18;NS=51;CA=0;DP=446
1 4558625 . AGA AA 100 PASS AF=0.105248;HP=1;NF=12;NR=4;NS=52;CA=0;DP=526
1 4570630 . GT GGGTTT 14 PASS AF=0.0570941;HP=1;NF=4;NR=2;NS=52;CA=0;DP=480
1 4574298 . GC GAC 41 PASS AF=0.0333335;HP=2;NF=1;NR=4;NS=52;CA=0;DP=497
1 4574507 . TT TTCCTCTAATGCT 100 PASS AF=0.406213;HP=2;NF=13;NR=8;NS=52;CA=0;DP=437
1 4577694 rs33988719;-/G,mills,venter TG TGG 100 PASS AF=0.999997;HP=1;DB;NF=52;NR=28;NS=52;CA=0;DP=381
1 4578235 . TAT TT 26 PASS AF=0.292482;HP=1;NF=8;NR=14;NS=51;CA=0;DP=330
1 4580634 . ATAAAATA AA 100 PASS AF=0.328083;HP=1;NF=11;NR=4;NS=51;CA=M;DP=372
1 4581760 . CTT CT 100 PASS AF=0.0551414;HP=2;NF=4;NR=7;NS=52;CA=0;DP=578
1 4583153 rs35427335;-/CA,venter,watson GCAC GC 100 PASS AF=0.0310016;HP=1;DB;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=483
1 4586257 rs34899280;-/T GTC GC 100 PASS AF=0.311452;HP=1;DB;NF=16;NR=8;NS=51;CA=0;DP=441
1 4589959 venter,watson GG GGGCCTG 100 PASS AF=0.0494854;HP=3;NF=3;NR=4;NS=52;CA=0;DP=469
1 4590830 rs34057361;-/GCAAAGC,mills,venter,watson TGCAAAGCG TG 100 PASS AF=0.739178;HP=1;DB;NF=42;NR=52;NS=50;CA=0;DP=465
1 4595540 rs56784481;-/T TCT TT 53 PASS AF=0.154234;HP=1;DB;NF=7;NR=21;NS=52;CA=0;DP=439
1 4596270 . AC ACGCTGAGGCTGCAGCACCCCTCGTGGAGC 100 PASS AF=0.171201;HP=1;NF=6;NR=1;NS=52;CA=0;DP=498
1 4600396 rs36042545;-/AT,venter CATA CA 100 PASS AF=0.185579;HP=1;DB;NF=24;NR=23;NS=52;CA=0;DP=357
1 4603645 rs60786353;-/C,venter AC ACC 100 PASS AF=0.999998;HP=1;DB;NF=76;NR=57;NS=52;CA=0;DP=571
1 4607282 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.287968;HP=1;NF=38;NR=26;NS=52;CA=0;DP=810
1 4607435 . GTGAT GT 100 PASS AF=0.347474;HP=1;NF=39;NR=53;NS=52;CA=0;DP=674
1 4611309 . CGTGTG CG 100 PASS AF=0.311775;HP=1;NF=38;NR=31;NS=52;CA=0;DP=486
1 4621966 rs35610947;-/GT TTGT TT 100 PASS AF=0.252136;HP=3;DB;NF=41;NR=42;NS=52;CA=0;DP=612
1 4623256 rs59174221;-/CTCCAGAAAGCAC GGAAAGCACCTCCAG GG 100 PASS AF=0.248792;HP=2;DB;NF=24;NR=28;NS=52;CA=0;DP=458
1 4623618 rs60584333;-/GTGTCGGGAGCAGAGACTG,venter GC GCTGGTGTCGGGAGCAGAGAC 100 PASS AF=0.624955;HP=1;DB;NF=8;NR=16;NS=51;CA=0;DP=518
1 4628242 rs56871532;-/TG,venter,watson CTGT CT 100 PASS AF=0.630417;HP=1;DB;NF=46;NR=41;NS=52;CA=0;DP=605
1 4631325 watson GAGGACATA GA 100 PASS AF=0.0694082;HP=1;NF=14;NR=10;NS=51;CA=0;DP=388
1 4633949 . TCC TC 100 PASS AF=0.223776;HP=7;NF=13;NR=4;NS=51;CA=0;DP=492
1 4637510 . TAAA TA 18 PASS AF=0.0428857;HP=9;NF=13;NR=6;NS=52;CA=0;DP=456
1 4639728 . GGTGTGTGTGTGTGTG GG 56 PASS AF=0.223403;HP=3;NF=39;NR=66;NS=51;CA=0;DP=466
1 4645583 rs59275910;-/G,venter AG AGG 100 PASS AF=0.999998;HP=1;DB;NF=41;NR=59;NS=51;CA=0;DP=416
1 4649824 . CTT CT 100 PASS AF=0.0615007;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=371
1 4653490 . GAG GG 19 PASS AF=0.016501;HP=1;NF=1;NR=2;NS=52;CA=0;DP=448
1 4654099 rs3086606;-/GTCTGCA,mills CC CCAGTCTGC 100 PASS AF=0.299705;HP=2;DB;NF=11;NR=10;NS=52;CA=0;DP=440
1 4655877 rs58828516;-/G TG TGG 100 PASS AF=0.083803;HP=6;DB;NF=13;NR=14;NS=52;CA=0;DP=553
1 4656096 rs34592768;-/G,mills TGG TG 100 PASS AF=0.0586852;HP=2;DB;NF=6;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
1 4656943 . GGTGTG GG 53 PASS AF=0.0156574;HP=2;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=804
1 4668803 . CTT CT 39 PASS AF=0.0748695;HP=8;NF=8;NR=6;NS=52;CA=0;DP=401
1 4670089 rs34058244;-/AC,venter GA GACA 100 PASS AF=0.471432;HP=1;DB;NF=47;NR=39;NS=52;CA=0;DP=789
1 4670383 rs35737766;-/TCAC,watson ACACTC AC 100 PASS AF=0.331554;HP=1;DB;NF=20;NR=35;NS=52;CA=0;DP=609
1 4676654 . AGATG AG 10 PASS AF=0.011049;HP=1;NF=15;NR=18;NS=52;CA=0;DP=617
1 4684590 . TCCTGCACCTGCTGTGCCCCTGGCTCCCAGCACC TC 100 PASS AF=0.0368566;HP=2;NF=13;NR=7;NS=52;CA=0;DP=543
1 4689505 . TC TCTGTCCTCTCTCCTAGCTCTGGTGCCCTGAGATGC 100 PASS AF=0.355136;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=597
1 4693342 rs3835539;-/TTCA CC CCATTC 100 PASS AF=0.307703;HP=2;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=594
1 4695582 venter TGTGAGG TG 100 PASS AF=0.630317;HP=1;NF=17;NR=29;NS=52;CA=0;DP=408
1 4700273 . GCCT GT 51 PASS AF=0.154012;HP=2;NF=3;NR=3;NS=52;CA=0;DP=402
1 4700727 rs34897087;-/A,venter CG CGG 13 PASS AF=0.0702045;HP=8;DB;NF=22;NR=6;NS=51;CA=M;DP=305
1 4702014 rs34592315;-/AA,venter TAAA TA 100 PASS AF=0.183045;HP=3;DB;NF=9;NR=20;NS=52;CA=0;DP=551
1 4702135 . GCC GC 100 PASS AF=0.132917;HP=5;NF=18;NR=10;NS=52;CA=0;DP=561
1 4702842 rs3835540;-/GAC TGACG TG 100 PASS AF=0.333162;HP=1;DB;NF=25;NR=19;NS=52;CA=0;DP=517
1 4703849 rs35422518;-/TCTCCAGGC,mills,venter,watson AGCTCTCCAGG AG 100 PASS AF=0.461699;HP=1;DB;NF=52;NR=39;NS=52;CA=0;DP=558
1 4704242 . ATT AT 100 PASS AF=0.124811;HP=6;NF=16;NR=12;NS=52;CA=0;DP=518
1 4704545 . GCACAC GC 43 PASS AF=0.374122;HP=1;NF=68;NR=46;NS=52;CA=0;DP=586
1 4709952 rs55677440;-/GT TT TTGT 100 PASS AF=0.111566;HP=3;DB;NF=37;NR=55;NS=52;CA=0;DP=757
1 4712998 rs35177072;-/CTC,mills,venter,watson TCTCC TC 100 PASS AF=0.409205;HP=1;DB;NF=23;NR=30;NS=52;CA=0;DP=527
1 4714785 rs3835541;-/A,venter CAA CA 100 PASS AF=0.207747;HP=2;DB;NF=12;NR=9;NS=52;CA=0;DP=525
1 4715739 . GT GTT 100 PASS AF=0.0593871;HP=1;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=486
1 4717874 rs33969697;-/C,mills,venter TCA TA 100 PASS AF=0.644689;HP=1;DB;NF=37;NR=47;NS=52;CA=0;DP=521
1 4720164 rs5772181;-/GA,mills,venter,watson TG TGAG 100 PASS AF=0.660601;HP=1;DB;NF=60;NR=61;NS=52;CA=0;DP=723
1 4725394 venter AG AGAGAGACATGAGTGAAGAAGG 100 PASS AF=0.486541;HP=1;NF=34;NR=40;NS=52;CA=0;DP=600
1 4726136 rs35816653;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.325542;HP=7;DB;NF=25;NR=33;NS=52;CA=0;DP=561
1 4728249 rs35594902;-/TGTT CT CTGTTT 100 PASS AF=0.236832;HP=1;DB;NF=16;NR=16;NS=52;CA=0;DP=595
1 4730619 rs56688128;-/AAGGC,venter,watson ACAAGGC AC 100 PASS AF=0.197783;HP=1;DB;NF=14;NR=10;NS=52;CA=0;DP=450
1 4738491 . ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT AT 100 PASS AF=0.109332;HP=1;NF=34;NR=36;NS=52;CA=0;DP=556
1 4743143 rs34960969;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.443382;HP=2;DB;NF=27;NR=29;NS=51;CA=0;DP=521
1 4750482 . AC ACC 44 PASS AF=0.0773717;HP=1;NF=1;NR=10;NS=52;CA=0;DP=532
1 4751808 . CC CTC 100 PASS AF=0.287743;HP=6;NF=22;NR=19;NS=52;CA=0;DP=549
1 4753639 rs56735073;-/G AG AGG 100 PASS AF=0.354197;HP=6;DB;NF=26;NR=25;NS=52;CA=0;DP=499
1 4756338 . TGG TG 100 PASS AF=0.145276;HP=6;NF=12;NR=22;NS=52;CA=0;DP=505
1 4756654 . CTGT CT 100 PASS AF=0.0253358;HP=1;NF=2;NR=3;NS=52;CA=0;DP=502
1 4768227 rs34482713;-/A,venter CAC CC 100 PASS AF=0.624286;HP=1;DB;NF=16;NR=29;NS=52;CA=0;DP=382
1 4769408 rs3030792;-/CA,venter TC TCAC 100 PASS AF=0.564397;HP=1;DB;NF=37;NR=45;NS=51;CA=0;DP=550
1 4771107 rs59952959;-/TTATCGGTGGTTT ATTATCGGTGGTTTC AC 100 PASS AF=0.43732;HP=2;DB;NF=24;NR=26;NS=52;CA=0;DP=437
1 4771150 . AGGCAGAGGATTTAGGGGGCAGTGAAACTA AA 100 PASS AF=0.365014;HP=2;NF=25;NR=17;NS=51;CA=0;DP=446
1 4773228 . AACA AA 100 PASS AF=0.358433;HP=4;NF=49;NR=37;NS=51;CA=0;DP=403
1 4779293 rs35799766;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.620558;HP=4;DB;NF=40;NR=44;NS=52;CA=0;DP=539
1 4783405 . TACGTATATACATATACA TA 100 PASS AF=0.346752;HP=1;NF=20;NR=40;NS=52;CA=0;DP=331
1 4784171 . TA TAAGA 100 PASS AF=0.058761;HP=2;NF=4;NR=4;NS=52;CA=0;DP=522
1 4787548 rs35350740;-/CA,mills AACA AA 100 PASS AF=0.294238;HP=3;DB;NF=43;NR=40;NS=52;CA=0;DP=565
1 4790642 rs5772184;-/T,venter ATT AT 100 PASS AF=0.360239;HP=10;DB;NF=23;NR=25;NS=52;CA=0;DP=544
1 4794867 . AATA AA 59 PASS AF=0.0541594;HP=2;NF=6;NR=24;NS=52;CA=0;DP=316
1 4794934 . CT CTCTCTTT 21 PASS AF=0.322809;HP=1;NF=7;NR=9;NS=50;CA=M;DP=241
1 4800829 rs35005833;-/C,venter TC TCC 100 PASS AF=0.404199;HP=5;DB;NF=48;NR=15;NS=52;CA=0;DP=479
1 4806476 . GC GCC 100 PASS AF=0.0973173;HP=6;NF=8;NR=8;NS=52;CA=M;DP=398
1 4808450 rs34573971;-/A,venter GAA GA 100 PASS AF=0.332411;HP=9;DB;NF=26;NR=22;NS=52;CA=0;DP=474
1 4809140 rs60726929;-/TCCA,venter,watson TC TCATCC 100 PASS AF=0.348085;HP=1;DB;NF=49;NR=32;NS=52;CA=0;DP=579
1 4810276 rs3030822;-/TAGT,watson ATAGTT AT 100 PASS AF=0.242205;HP=1;DB;NF=27;NR=13;NS=52;CA=0;DP=582
1 4831434 . TA TACCACACACACA 100 PASS AF=0.49717;HP=1;NF=18;NR=17;NS=52;CA=0;DP=675
1 4831567 rs34042090;-/CA CCAC CC 100 PASS AF=0.535527;HP=4;DB;NF=52;NR=45;NS=52;CA=0;DP=738
1 4833596 rs35226825;-/T AT ATT 100 PASS AF=0.237481;HP=5;DB;NF=19;NR=19;NS=52;CA=0;DP=498
1 4839967 . TCCTGCCAGCCGGGGGC TC 100 PASS AF=0.0394386;HP=2;NF=5;NR=2;NS=52;CA=0;DP=565
1 4840948 rs59349393;-/AAACCACATCCCTTGAACT GACTAAACCACATCCCTTGAA GA 100 PASS AF=0.144437;HP=1;DB;NF=16;NR=17;NS=52;CA=0;DP=578
1 4846284 rs36118323;-/T,venter CT CTT 100 PASS AF=0.130437;HP=7;DB;NF=12;NR=15;NS=52;CA=0;DP=415
1 4855247 venter GA GACACA 100 PASS AF=0.301971;HP=1;NF=19;NR=3;NS=52;CA=0;DP=635
1 4864897 venter AT ATT 100 PASS AF=0.215684;HP=6;NF=17;NR=20;NS=52;CA=0;DP=450
1 4865373 rs34273857;-/A,venter CA CAA 100 PASS AF=0.169967;HP=6;DB;NF=17;NR=15;NS=52;CA=0;DP=533
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