 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
9 |
blast6_custom_minimal
|
 |
- |
rw-r--r-- |
53 |
blast6_custom_mixed_nans
|
 |
- |
rw-r--r-- |
113 |
blast6_custom_multi_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
31 |
blast6_custom_single_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
143 |
blast6_default_multi_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47 |
blast6_default_single_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
141 |
blast6_invalid_column_types
|
 |
- |
rw-r--r-- |
36 |
blast6_invalid_number_of_columns
|
 |
- |
rw-r--r-- |
95 |
blast6_invalid_type_in_column
|
 |
- |
rw-r--r-- |
93 |
blast7_custom_minimal
|
 |
- |
rw-r--r-- |
396 |
blast7_custom_mixed_nans
|
 |
- |
rw-r--r-- |
410 |
blast7_custom_multi_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
377 |
blast7_custom_single_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
424 |
blast7_default_multi_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
324 |
blast7_default_single_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
415 |
blast7_invalid_differing_fields
|
 |
- |
rw-r--r-- |
57 |
blast7_invalid_for_sniffer
|
 |
- |
rw-r--r-- |
53 |
blast7_invalid_for_sniffer_2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
144 |
blast7_invalid_gibberish
|
 |
- |
rw-r--r-- |
408 |
blast7_invalid_no_data
|
 |
- |
rw-r--r-- |
410 |
blast7_invalid_too_many_columns
|
 |
- |
rw-r--r-- |
179 |
blast7_invalid_unrecognized_field
|
 |
- |
rw-r--r-- |
0 |
empty
|
 |
- |
rw-r--r-- |
608 |
error_diff_ids.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
669 |
error_double_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
669 |
error_double_seq.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
609 |
error_long_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
482 |
error_no_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
608 |
error_qual_del.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
608 |
error_qual_escape.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
610 |
error_qual_null.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
609 |
error_qual_space.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
609 |
error_qual_tab.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
608 |
error_qual_unit_sep.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
608 |
error_qual_vtab.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
607 |
error_short_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
628 |
error_spaces.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
629 |
error_tabs.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
548 |
error_trunc_at_plus.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
582 |
error_trunc_at_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
522 |
error_trunc_at_seq.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
562 |
error_trunc_in_plus.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
607 |
error_trunc_in_qual.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
535 |
error_trunc_in_seq.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
513 |
error_trunc_in_title.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
174 |
fasta_10_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
63 |
fasta_3_seqs_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
66 |
fasta_3_seqs_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
150 |
fasta_5_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
205 |
fasta_5_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
151 |
fasta_6_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
217 |
fasta_6_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
157 |
fasta_blank_lines_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
152 |
fasta_blanks_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
75 |
fasta_description_newline_replacement_empty_str
|
 |
- |
rw-r--r-- |
109 |
fasta_description_newline_replacement_multi_char
|
 |
- |
rw-r--r-- |
87 |
fasta_description_newline_replacement_none
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
fasta_id_whitespace_replacement_empty_str
|
 |
- |
rw-r--r-- |
53 |
fasta_id_whitespace_replacement_multi_char
|
 |
- |
rw-r--r-- |
29 |
fasta_id_whitespace_replacement_none
|
 |
- |
rw-r--r-- |
186 |
fasta_invalid_after_10_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
52 |
fasta_invalid_blank_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
64 |
fasta_invalid_blank_line_within_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
46 |
fasta_invalid_blank_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40 |
fasta_invalid_legacy_format
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16 |
fasta_invalid_missing_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
46 |
fasta_invalid_missing_seq_data_first
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47 |
fasta_invalid_missing_seq_data_last
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45 |
fasta_invalid_missing_seq_data_middle
|
 |
- |
rw-r--r-- |
63 |
fasta_invalid_whitespace_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
fasta_invalid_whitespace_only_line_within_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
57 |
fasta_invalid_whitespace_only_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32 |
fasta_max_width_1
|
 |
- |
rw-r--r-- |
150 |
fasta_max_width_5
|
 |
- |
rw-r--r-- |
51 |
fasta_mixed_qual_scores
|
 |
- |
rw-r--r-- |
145 |
fasta_multi_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
114 |
fasta_multi_seq_roundtrip
|
 |
- |
rw-r--r-- |
80 |
fasta_prot_seqs_odd_labels
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18 |
fasta_single_bio_seq_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
fasta_single_bio_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18 |
fasta_single_dna_seq_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
fasta_single_dna_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
fasta_single_prot_seq_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19 |
fasta_single_prot_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18 |
fasta_single_rna_seq_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
fasta_single_rna_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23 |
fasta_single_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
72 |
fasta_tabular_msa_different_type
|
 |
- |
rw-r--r-- |
277 |
fasta_ws_lines_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
233 |
fasta_ws_lines_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
92 |
fastq_5_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
147 |
fastq_5_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
90 |
fastq_blank_lines
|
 |
- |
rw-r--r-- |
88 |
fastq_invalid_blank_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
88 |
fastq_invalid_blank_after_plus
|
 |
- |
rw-r--r-- |
88 |
fastq_invalid_blank_after_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
fastq_invalid_blank_in_seq_at_symbol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
fastq_invalid_blank_within_qual
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
fastq_invalid_blank_within_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23 |
fastq_invalid_missing_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
103 |
fastq_invalid_missing_seq_data
|
 |
- |
rw-r--r-- |
99 |
fastq_invalid_ws_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
99 |
fastq_invalid_ws_line_after_plus
|
 |
- |
rw-r--r-- |
99 |
fastq_invalid_ws_line_after_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
fastq_invalid_ws_line_within_qual
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
fastq_invalid_ws_line_within_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
95 |
fastq_multi_blank_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
94 |
fastq_multi_blank_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
93 |
fastq_multi_blank_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
87 |
fastq_multi_seq_sanger
|
 |
- |
rw-r--r-- |
331 |
fastq_multi_whitespace_stripping
|
 |
- |
rw-r--r-- |
159 |
fastq_multi_ws_lines_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
183 |
fastq_multi_ws_lines_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
159 |
fastq_multi_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
33 |
fastq_single_seq_illumina1.3
|
 |
- |
rw-r--r-- |
118 |
fastq_single_seq_illumina1.8
|
 |
- |
rw-r--r-- |
123 |
fastq_whitespace_only_lines
|
 |
- |
rw-r--r-- |
885 |
fastq_wrapping_as_illumina_no_description
|
 |
- |
rw-r--r-- |
885 |
fastq_wrapping_as_sanger_no_description
|
 |
- |
rw-r--r-- |
898 |
fastq_wrapping_original_sanger_no_description
|
 |
- |
rw-r--r-- |
94 |
fastq_writer_illumina1.3_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
94 |
fastq_writer_sanger_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
94 |
fastq_writer_sanger_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
85 |
genbank_5_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86 |
genbank_6_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
71 |
genbank_missing_locus_name
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,598 |
genbank_multi_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,139 |
genbank_single_record
|
 |
- |
rw-r--r-- |
90 |
genbank_single_record_lower
|
 |
- |
rw-r--r-- |
90 |
genbank_single_record_upper
|
 |
- |
rw-r--r-- |
82 |
genbank_w_beginning_whitespace
|
 |
- |
rw-r--r-- |
426 |
illumina_full_range_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
426 |
illumina_full_range_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
426 |
illumina_full_range_original_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
505 |
legacy9_and_blast7_default
|
 |
- |
rw-r--r-- |
404 |
legacy9_invalid_differing_fields
|
 |
- |
rw-r--r-- |
262 |
legacy9_invalid_too_many_columns
|
 |
- |
rw-r--r-- |
296 |
legacy9_mixed_nans
|
 |
- |
rw-r--r-- |
345 |
legacy9_multi_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
251 |
legacy9_single_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,388 |
longreads_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,388 |
longreads_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,466 |
longreads_original_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
767 |
misc_dna_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
767 |
misc_dna_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
767 |
misc_dna_original_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
774 |
misc_rna_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
774 |
misc_rna_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
774 |
misc_rna_original_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
351 |
ordination_L%26L_CA_data_scores
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,584 |
ordination_PCoA_sample_data_3_scores
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,569 |
ordination_error1
|
 |
- |
rw-r--r-- |
306 |
ordination_error10
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,578 |
ordination_error11
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,569 |
ordination_error12
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,569 |
ordination_error13
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,584 |
ordination_error14
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,543 |
ordination_error15
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,579 |
ordination_error16
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,531 |
ordination_error17
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,570 |
ordination_error18
|
 |
- |
rw-r--r-- |
304 |
ordination_error19
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,555 |
ordination_error2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
306 |
ordination_error20
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10 |
ordination_error21
|
 |
- |
rw-r--r-- |
18 |
ordination_error22
|
 |
- |
rw-r--r-- |
42 |
ordination_error23
|
 |
- |
rw-r--r-- |
75 |
ordination_error24
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,567 |
ordination_error3
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,569 |
ordination_error4
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,569 |
ordination_error5
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,558 |
ordination_error6
|
 |
- |
rw-r--r-- |
65 |
ordination_error7
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,570 |
ordination_error8
|
 |
- |
rw-r--r-- |
304 |
ordination_error9
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,396 |
ordination_example2_scores
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,579 |
ordination_example3_scores
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,293 |
ordination_exp_Ordination_CCA_site
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,291 |
ordination_exp_Ordination_CCA_site_constraints
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,065 |
ordination_exp_Ordination_CCA_species
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,062 |
ordination_exp_Ordination_PCoA_site
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,786 |
ordination_exp_Ordination_RDA_site
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,787 |
ordination_exp_Ordination_RDA_site_constraints
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,070 |
ordination_exp_Ordination_RDA_species
|
 |
- |
rw-r--r-- |
80 |
phylip_dna_3_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
phylip_invalid_empty_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
phylip_invalid_empty_line_before_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
phylip_invalid_empty_line_between_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
80 |
phylip_invalid_header_too_long
|
 |
- |
rw-r--r-- |
68 |
phylip_invalid_header_too_short
|
 |
- |
rw-r--r-- |
64 |
phylip_invalid_no_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
71 |
phylip_invalid_seq_too_long
|
 |
- |
rw-r--r-- |
67 |
phylip_invalid_seq_too_short
|
 |
- |
rw-r--r-- |
37 |
phylip_invalid_too_few_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
phylip_invalid_too_many_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15 |
phylip_invalid_zero_seq_len
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4 |
phylip_invalid_zero_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
42 |
phylip_single_seq_long
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16 |
phylip_single_seq_short
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
phylip_two_chunks
|
 |
- |
rw-r--r-- |
106 |
phylip_variable_length_ids
|
 |
- |
rw-r--r-- |
81 |
phylip_varied_whitespace_in_seqs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
106 |
phylip_whitespace_in_header_1
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86 |
phylip_whitespace_in_header_2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
102 |
phylip_whitespace_in_header_3
|
 |
- |
rw-r--r-- |
217 |
qseq_invalid_filter
|
 |
- |
rw-r--r-- |
217 |
qseq_invalid_lane
|
 |
- |
rw-r--r-- |
217 |
qseq_invalid_read
|
 |
- |
rw-r--r-- |
216 |
qseq_invalid_tile
|
 |
- |
rw-r--r-- |
234 |
qseq_invalid_x
|
 |
- |
rw-r--r-- |
251 |
qseq_invalid_y
|
 |
- |
rw-r--r-- |
226 |
qseq_multi_seq_illumina1.3
|
 |
- |
rw-r--r-- |
217 |
qseq_single_seq_sanger
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
qual_2_seqs_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
qual_3_seqs_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
qual_3_seqs_defaults_desc_mismatch
|
 |
- |
rw-r--r-- |
124 |
qual_3_seqs_defaults_extra
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
qual_3_seqs_defaults_id_mismatch
|
 |
- |
rw-r--r-- |
97 |
qual_3_seqs_defaults_length_mismatch
|
 |
- |
rw-r--r-- |
105 |
qual_3_seqs_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
218 |
qual_5_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
273 |
qual_5_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
219 |
qual_6_blanks_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
285 |
qual_6_ws_lines_start_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
223 |
qual_blank_lines_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
220 |
qual_blanks_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
104 |
qual_description_newline_replacement_empty_str
|
 |
- |
rw-r--r-- |
138 |
qual_description_newline_replacement_multi_char
|
 |
- |
rw-r--r-- |
116 |
qual_description_newline_replacement_none
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22 |
qual_id_whitespace_replacement_empty_str
|
 |
- |
rw-r--r-- |
58 |
qual_id_whitespace_replacement_multi_char
|
 |
- |
rw-r--r-- |
34 |
qual_id_whitespace_replacement_none
|
 |
- |
rw-r--r-- |
101 |
qual_invalid_blank_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
102 |
qual_invalid_blank_line_within_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
84 |
qual_invalid_blank_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47 |
qual_invalid_legacy_format
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19 |
qual_invalid_missing_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
92 |
qual_invalid_missing_qual_scores_first
|
 |
- |
rw-r--r-- |
85 |
qual_invalid_missing_qual_scores_last
|
 |
- |
rw-r--r-- |
83 |
qual_invalid_missing_qual_scores_middle
|
 |
- |
rw-r--r-- |
102 |
qual_invalid_qual_scores_float
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
qual_invalid_qual_scores_negative
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
qual_invalid_qual_scores_over_255
|
 |
- |
rw-r--r-- |
101 |
qual_invalid_qual_scores_string
|
 |
- |
rw-r--r-- |
113 |
qual_invalid_whitespace_line_in_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
95 |
qual_invalid_whitespace_only_sequence
|
 |
- |
rw-r--r-- |
112 |
qual_invalid_ws_line_after_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40 |
qual_max_width_1
|
 |
- |
rw-r--r-- |
213 |
qual_max_width_5
|
 |
- |
rw-r--r-- |
213 |
qual_multi_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
166 |
qual_multi_seq_roundtrip
|
 |
- |
rw-r--r-- |
131 |
qual_prot_seqs_odd_labels
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
qual_single_bio_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
qual_single_dna_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23 |
qual_single_nuc_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22 |
qual_single_prot_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
qual_single_rna_seq_non_defaults
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40 |
qual_single_seq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
85 |
qual_tabular_msa_different_type
|
 |
- |
rw-r--r-- |
333 |
qual_ws_lines_between_records
|
 |
- |
rw-r--r-- |
309 |
qual_ws_lines_end_of_file
|
 |
- |
rw-r--r-- |
550 |
sanger_full_range_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
550 |
sanger_full_range_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
550 |
sanger_full_range_original_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
450 |
solexa_full_range_original_solexa.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
404 |
stockholm_all_data_types
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47 |
stockholm_blank_lines
|
 |
- |
rw-r--r-- |
82 |
stockholm_data_only
|
 |
- |
rw-r--r-- |
142 |
stockholm_different_padding
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
stockholm_differing_gc_data_length
|
 |
- |
rw-r--r-- |
62 |
stockholm_differing_gr_data_length
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
stockholm_differing_seq_lengths
|
 |
- |
rw-r--r-- |
180 |
stockholm_duplicate_gc
|
 |
- |
rw-r--r-- |
195 |
stockholm_duplicate_gr
|
 |
- |
rw-r--r-- |
159 |
stockholm_duplicate_sequence_names
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73 |
stockholm_duplicate_tree_ids
|
 |
- |
rw-r--r-- |
652 |
stockholm_extensive
|
 |
- |
rw-r--r-- |
660 |
stockholm_extensive_mixed
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45 |
stockholm_invalid_data_type
|
 |
- |
rw-r--r-- |
183 |
stockholm_invalid_nonexistent_gr
|
 |
- |
rw-r--r-- |
110 |
stockholm_invalid_nonexistent_gs
|
 |
- |
rw-r--r-- |
24 |
stockholm_malformed_data_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
61 |
stockholm_malformed_gc_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27 |
stockholm_malformed_gf_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
54 |
stockholm_malformed_gr_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43 |
stockholm_malformed_gs_line
|
 |
- |
rw-r--r-- |
70 |
stockholm_metadata_only
|
 |
- |
rw-r--r-- |
48 |
stockholm_minimal
|
 |
- |
rw-r--r-- |
121 |
stockholm_missing_footer
|
 |
- |
rw-r--r-- |
108 |
stockholm_missing_header
|
 |
- |
rw-r--r-- |
66 |
stockholm_missing_reference_items
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45 |
stockholm_missing_rn_tag
|
 |
- |
rw-r--r-- |
45 |
stockholm_multi_line_tree_no_id
|
 |
- |
rw-r--r-- |
59 |
stockholm_multi_line_tree_with_id
|
 |
- |
rw-r--r-- |
486 |
stockholm_multiple_msa
|
 |
- |
rw-r--r-- |
99 |
stockholm_multiple_multi_line_trees
|
 |
- |
rw-r--r-- |
319 |
stockholm_multiple_references
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
stockholm_multiple_trees
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19 |
stockholm_no_data
|
 |
- |
rw-r--r-- |
110 |
stockholm_nonstring_labels
|
 |
- |
rw-r--r-- |
243 |
stockholm_rna
|
 |
- |
rw-r--r-- |
156 |
stockholm_runon_gf_no_whitespace
|
 |
- |
rw-r--r-- |
157 |
stockholm_runon_gf_with_whitespace
|
 |
- |
rw-r--r-- |
87 |
stockholm_runon_gs_no_whitespace
|
 |
- |
rw-r--r-- |
88 |
stockholm_runon_gs_with_whitespace
|
 |
- |
rw-r--r-- |
150 |
stockholm_runon_references
|
 |
- |
rw-r--r-- |
150 |
stockholm_runon_references_mixed
|
 |
- |
rw-r--r-- |
119 |
stockholm_single_reference
|
 |
- |
rw-r--r-- |
46 |
stockholm_single_tree_with_id
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32 |
stockholm_single_tree_without_id
|
 |
- |
rw-r--r-- |
246 |
stockholm_two_of_each_metadata
|
 |
- |
rw-r--r-- |
74 |
stockholm_whitespace_only_lines
|
 |
- |
rw-r--r-- |
160 |
tsv_10_fields
|
 |
- |
rw-r--r-- |
133 |
tsv_8_fields
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47 |
whitespace_only
|
 |
- |
rw-r--r-- |
963 |
wrapping_as_illumina.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
963 |
wrapping_as_sanger.fastq
|
 |
- |
rw-r--r-- |
975 |
wrapping_original_sanger.fastq
|