File: clustal_glualign.aln

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CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


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GE0002118       GCGAACGTAGCTCAG-----TTGGTTAGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--------- 46
GE0004030       GCGCTCGTAGCTCAG-----TTGGATAGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGTCT------- 48
GE0001107       GGCTAGATAGCTCAG-----ATGGT-AGAGCAGAGGATTGAAGATCCTTGT--------- 45
GE0002463       GGCTAGATAGCTCAG-----CTGGT-AGAGCAGAGGACTGAAGATCCTTGT--------- 45
GE0005068       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005094       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005154       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005174       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005177       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005098       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AAAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005105       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AAAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0005142       GGCTCGGTAGCTCAG-----TTGGT-AAAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT--------- 45
GE0001435       GCCTAAATAGCTCAG-----TTGGT-AGAGCAACACATTCGTAACGTGTAG--------- 45
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GE0002551       GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCAGACG----CGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGTGAATAA 54
GE0000765       GCAGCTATGGCGAAATC-GGTAGACG----CGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGCTTATG- 54
GE0000766       GCAGCTATGGCGAAATC-GGTAGACG----CGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGCTTATG- 54
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GE0002316       GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTAGACA----CGCTGGATTTAGGATCC--AGTGCTTCGC- 52
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GE0000713       GCCGGTGTGGCGGAAT--GGTAGACG----CGGTAGACTCAAAATCTACTCTTAGCAAT- 53
GE0000714       GCCGGTGTGGCGGAAT--GGTAGACG----CGGTAGACTCAAAATCTACTCTTAGCAAT- 53
GE0002201       GCCGGCGTGGCGGAAT--GGTAGACG----CGGTAGACTCAAAATCTACTCTTAGCAGT- 53
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GE0001609       GGGGGTGTCGCATAGTG-GTCAATTG----CATCGGACTGTAAATCC--GGCTCCTTACG 53
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                       *                                                    

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GE0004429       ----TGCGTTGGTTCGAATCCAGCTAGCCCAGTC- 74
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GE0004982       ----GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA 77
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GE0003328       ----GTTGGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGC---- 73
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GE0004798       ----GTCGATGGTTCGAGTCCATTCAGGCCCACCA 77
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GE0002596       ----GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCG---- 74
GE0002597       ----GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCG---- 74
GE0001189       ----GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCG---- 74
GE0005822       ----GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCA 76
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GE0005453       ----GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGC---- 72
GE0005464       ----GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGC---- 72
GE0005525       ----GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGC---- 72
GE0005534       ----GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCACCA 76
GE0001532       ----GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGC---- 72
GE0000591       ----GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGC---- 73
GE0002118       ----GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGC---- 73
GE0004030       ----GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGAGCGC---- 75
GE0001107       ----GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCC---- 72
GE0002463       ----GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCC---- 72
GE0005068       ----GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA--- 73
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GE0001435       ----GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGC---- 72
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GE0000340       ----GTTGCGGGTTCGACCCCCGTCTCTCGC---- 73
GE0001951       ----GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCTCTCGC---- 73
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GE0004523       ----A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA--- 72
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GE0004711       ----CTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCC- 75
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GE0000801       ----CTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGC---- 81
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GE0000215       --A-CGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCATCCGCACCA 87
GE0002550       --CCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCATC- 86
GE0002551       --CCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCATC- 86
GE0000765       --CTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGC---- 83
GE0000766       --CTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGC---- 83
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GE0000713       --AAGGTGTTGGTTCGAGTCCGATCACCGGC---- 82
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GE0002201       --AAGGTGTTGGTTCGAGTCCAATCGCCGGC---- 82
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GE0004877       --GGAGTGTCGGTTCGACCCCGACCACCGGTA--- 82
GE0004878       --GGAGTGTCGGTTCGACCCCGACCACCGGTA--- 82
GE0001609       --GATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCC---- 82
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GE0005698       --GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA 85
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GE0005643       --GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACC- 83
GE0002686       GGGGACCGGGGGTTCAAATCCCTTCTCTTCC---- 86
GE0002687       GGGGACCGGGGGTTCAAATCCCTTCTCTTCC---- 86
GE0001233       AGGAACCAGGGGTTCGAATCCCTTCTCTT------ 84
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GE0001391       AGGGTCCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCC---- 84
GE0002730       GGGTACCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCC---- 88
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GE0001275       GGGTACCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCC---- 87
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GE0001321       C-GTACCGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCC---- 86
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GE0003147       C-GTACCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCC---- 86
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GE0003154       C-GTACCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCC---- 86
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GE0005242       C-GGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA 91
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GE0005388       C-C-CGCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGCC- 91
                           **** *  *