File: chromLoc.R

package info (click to toggle)
r-bioc-annotate 1.60.0%2Bdfsg-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: buster
  • size: 2,756 kB
  • sloc: makefile: 2
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### R code from vignette source 'chromLoc.Rnw'

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### code chunk number 1: buildCL
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library("annotate")
z <- buildChromLocation("hgu95av2")
z


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### code chunk number 2: showBasicMethods
###################################################
organism(z)

dataSource(z)

## The chromLocs list is extremely large.  Let's only
## look at one of the elements.
names(chromLocs(z))
chromLocs(z)[["Y"]]

get("32972_at", probesToChrom(z))

chromInfo(z)

get("32972_at", geneSymbols(z))



###################################################
### code chunk number 3: nChrom
###################################################
nChrom(z)