File: annotate.R

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r-bioc-annotate 1.84.0%2Bdfsg-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid, trixie
  • size: 3,624 kB
  • sloc: makefile: 2
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### R code from vignette source 'annotate.Rnw'

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### code chunk number 1: loadlibs
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library("annotate")
library("hgu95av2.db")
ls("package:hgu95av2.db")


###################################################
### code chunk number 2: qc
###################################################
hgu95av2()


###################################################
### code chunk number 3: locusid
###################################################
hgu95av2ENTREZID


###################################################
### code chunk number 4: getting
###################################################

get("1000_at", env=hgu95av2ENTREZID)
hgu95av2ENTREZID[["1000_at"]]
hgu95av2ENTREZID$"1000_at"



###################################################
### code chunk number 5: tolist
###################################################
LLs = as.list(hgu95av2ENTREZID)
length(LLs)
names(LLs)[1:10]



###################################################
### code chunk number 6: annotate.Rnw:216-217
###################################################
sessionInfo()