package info (click to toggle)
r-bioc-biostrings 2.42.1-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 14,652 kB
  • ctags: 721
  • sloc: ansic: 10,262; sh: 11; makefile: 2

Folder: R

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 1,344 00datacache.R
- - rw-r--r-- 1,235 AMINO_ACID_CODE.R
- - rw-r--r-- 6,913 AlignedXStringSet-class.R
- - rw-r--r-- 7,851 GENETIC_CODE.R
- - rw-r--r-- 1,045 IUPAC_CODE_MAP.R
- - rw-r--r-- 691 InDel-class.R
- - rw-r--r-- 9,249 MIndex-class.R
- - rw-r--r-- 11,023 MaskedXString-class.R
- - rw-r--r-- 28,952 MultipleAlignment.R
- - rw-r--r-- 19,684 PDict-class.R
- - rw-r--r-- 15,884 PairwiseAlignments-class.R
- - rw-r--r-- 15,742 PairwiseAlignments-io.R
- - rw-r--r-- 10,370 PairwiseAlignmentsSingleSubject-class.R
- - rw-r--r-- 4,865 QualityScaledXStringSet.R
- - rw-r--r-- 2,264 SparseList-class.R
- - rw-r--r-- 11,417 XString-class.R
- - rw-r--r-- 7,126 XStringCodec-class.R
- - rw-r--r-- 2,034 XStringPartialMatches-class.R
- - rw-r--r-- 9,617 XStringQuality-class.R
- - rw-r--r-- 16,937 XStringSet-class.R
- - rw-r--r-- 2,876 XStringSet-comparison.R
- - rw-r--r-- 15,897 XStringSet-io.R
- - rw-r--r-- 5,151 XStringSetList-class.R
- - rw-r--r-- 15,720 XStringViews-class.R
- - rw-r--r-- 14,879 align-utils.R
- - rw-r--r-- 1,495 chartr.R
- - rw-r--r-- 7,230 dinucleotideFrequencyTest.R
- - rw-r--r-- 7,779 findPalindromes.R
- - rw-r--r-- 301 getSeq.R
- - rw-r--r-- 1,363 injectHardMask.R
- - rw-r--r-- 2,258 letter.R
- - rw-r--r-- 35,186 letterFrequency.R
- - rw-r--r-- 18,140 lowlevel-matching.R
- - rw-r--r-- 2,715 maskMotif.R
- - rw-r--r-- 5,993 match-utils.R
- - rw-r--r-- 4,887 matchLRPatterns.R
- - rw-r--r-- 36,361 matchPDict.R
- - rw-r--r-- 14,086 matchPWM.R
- - rw-r--r-- 1,761 matchPattern.BOC.R
- - rw-r--r-- 5,338 matchPattern.BOC2.R
- - rw-r--r-- 18,440 matchPattern.R
- - rw-r--r-- 4,796 matchProbePair.R
- - rw-r--r-- 266 matchprobes.R
- - rw-r--r-- 427 misc.R
- - rw-r--r-- 6,478 needwunsQS.R
- - rw-r--r-- 5,276 padAndClip.R
- - rw-r--r-- 27,138 pairwiseAlignment.R
- - rw-r--r-- 9,564 pmatchPattern.R
- - rw-r--r-- 18,199 replaceAt.R
- - rw-r--r-- 3,575 replaceLetterAt.R
- - rw-r--r-- 3,272 reverseComplement.R
- - rw-r--r-- 4,825 seqtype.R
- - rw-r--r-- 13,551 stringDist.R
- - rw-r--r-- 1,070 toComplex.R
- - rw-r--r-- 7,671 translate.R
- - rw-r--r-- 7,694 trimLRPatterns.R
- - rw-r--r-- 519 unstrsplit-methods.R
- - rw-r--r-- 930 utils.R
- - rw-r--r-- 2,471 xscat.R
- - rw-r--r-- 432 zzz.R