package info (click to toggle)
r-bioc-biostrings 2.42.1-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 14,652 kB
  • ctags: 721
  • sloc: ansic: 10,262; sh: 11; makefile: 2

Folder: src

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 1,667 BAB_class.c
- - rw-r--r-- 17,995 Biostrings.h
- - rw-r--r-- 8,625 BitMatrix.c
- - rw-r--r-- 28 IRanges_stubs.c
- - rw-r--r-- 7,429 MIndex_class.c
- - rw-r--r-- 3,019 PreprocessedTB_class.c
- - rw-r--r-- 6,569 R_init_Biostrings.c
- - rw-r--r-- 535 RoSeqs_utils.c
- - rw-r--r-- 30 S4Vectors_stubs.c
- - rw-r--r-- 2,975 SparseList_utils.c
- - rw-r--r-- 1,334 XStringSetList_class.c
- - rw-r--r-- 5,338 XStringSet_class.c
- - rw-r--r-- 28,959 XStringSet_io.c
- - rw-r--r-- 5,088 XString_class.c
- - rw-r--r-- 28 XVector_stubs.c
- - rw-r--r-- 4,423 align_needwunsQS.c
- - rw-r--r-- 49,800 align_pairwiseAlignment.c
- - rw-r--r-- 11,871 align_utils.c
- - rw-r--r-- 2,855 find_palindromes.c
- - rw-r--r-- 4,762 gtestsim.c
- - rw-r--r-- 1,142 inject_code.c
- - rw-r--r-- 32,231 letter_frequency.c
- - rw-r--r-- 18,946 lowlevel_matching.c
- - rw-r--r-- 5,612 match_PWM.c
- - rw-r--r-- 7,840 match_pattern.c
- - rw-r--r-- 14,726 match_pattern_boyermoore.c
- - rw-r--r-- 3,354 match_pattern_indels.c
- - rw-r--r-- 6,716 match_pattern_shiftor.c
- - rw-r--r-- 17,602 match_pdict.c
- - rw-r--r-- 36,333 match_pdict_ACtree2.c
- - rw-r--r-- 6,456 match_pdict_Twobit.c
- - rw-r--r-- 27,194 match_pdict_utils.c
- - rw-r--r-- 10,057 match_reporting.c
- - rw-r--r-- 6,114 matchprobes.c
- - rw-r--r-- 1,974 pmatchPattern.c
- - rw-r--r-- 9,086 replaceAt.c
- - rw-r--r-- 5,238 replace_letter_at.c
- - rw-r--r-- 1,707 strutils.c
- - rw-r--r-- 5,645 translate.c
- - rw-r--r-- 3,173 unstrsplit_methods.c
- - rw-r--r-- 4,888 utils.c
- - rw-r--r-- 4,064 xscat.c