package info (click to toggle)
r-bioc-rsamtools 2.22.0%2Bdfsg-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: sid, trixie
  • size: 4,488 kB
  • sloc: ansic: 4,904; cpp: 1,586; sh: 40; makefile: 2

Folder: R

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 2,683 AllClasses.R
- - rw-r--r-- 6,050 AllGenerics.R
- - rw-r--r-- 1,868 asBam.R
- - rw-r--r-- 948 countBam.R
- - rw-r--r-- 1,617 filterBam.R
- - rw-r--r-- 206 idxstatsBam.R
- - rw-r--r-- 162 indexBam.R
- - rw-r--r-- 1,069 io_bam.R
- - rw-r--r-- 1,273 mergeBam.R
- - rw-r--r-- 4,468 methods-ApplyPileupsParam.R
- - rw-r--r-- 14,179 methods-BamFile.R
- - rw-r--r-- 1,584 methods-BamFileList.R
- - rw-r--r-- 2,296 methods-BamSampler.R
- - rw-r--r-- 6,777 methods-BamViews.R
- - rw-r--r-- 8,534 methods-BcfFile.R
- - rw-r--r-- 6,234 methods-FaFile.R
- - rw-r--r-- 2,096 methods-PileupFiles.R
- - rw-r--r-- 1,744 methods-RsamtoolsFile.R
- - rw-r--r-- 3,481 methods-RsamtoolsFileList.R
- - rw-r--r-- 2,860 methods-ScanBVcfParam.R
- - rw-r--r-- 14,027 methods-ScanBamParam.R
- - rw-r--r-- 4,538 methods-TabixFile.R
- - rw-r--r-- 2,163 phred2ASCIIOffset.R
- - rw-r--r-- 8,619 pileup.R
- - rw-r--r-- 703 pkgconfig.R
- - rw-r--r-- 9,231 quickBamFlagSummary.R
- - rw-r--r-- 2,902 readPileup.R
- - rw-r--r-- 1,464 scanBam.R
- - rw-r--r-- 300 scanBamHeader.R
- - rw-r--r-- 192 scanBcf.R
- - rw-r--r-- 222 scanBcfHeader.R
- - rw-r--r-- 597 sortBam.R
- - rw-r--r-- 755 testPairedEndBam.R
- - rw-r--r-- 3,792 utilities.R
- - rw-r--r-- 1,044 zip_compression.R
- - rw-r--r-- 411 zzz.R