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Folder: R
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.. (parent) | |||
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- | rw-r--r-- | 740 | DM.R |
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- | rw-r--r-- | 2,653 | RcppExports.R |
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- | rw-r--r-- | 693 | bootstrapCluster.R |
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- | rw-r--r-- | 6,696 | buildSNNGraph.R |
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- | rw-r--r-- | 4,847 | cleanSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 691 | clusterModularity.R |
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- | rw-r--r-- | 2,937 | clusterPurity.R |
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- | rw-r--r-- | 8,412 | clusterSNNGraph.R |
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- | rw-r--r-- | 4,529 | coassignProb.R |
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- | rw-r--r-- | 4,084 | combineBlocks.R |
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- | rw-r--r-- | 19,712 | combineMarkers.R |
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- | rw-r--r-- | 7,010 | combinePValues.R |
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- | rw-r--r-- | 6,183 | combineVar.R |
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- | rw-r--r-- | 2,675 | computeSpikeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 26,101 | computeSumFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 3,987 | convertTo.R |
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- | rw-r--r-- | 2,372 | correlateGenes.R |
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- | rw-r--r-- | 6,118 | correlateNull.R |
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- | rw-r--r-- | 20,635 | correlatePairs.R |
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- | rw-r--r-- | 15,617 | createClusterMST.R |
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- | rw-r--r-- | 10,853 | cyclone.R |
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- | rw-r--r-- | 4,433 | decideTestsPerLabel.R |
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- | rw-r--r-- | 2,042 | defunct.R |
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- | rw-r--r-- | 15,178 | denoisePCA.R |
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- | rw-r--r-- | 11,485 | doubletCells.R |
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- | rw-r--r-- | 11,182 | doubletCluster.R |
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- | rw-r--r-- | 7,736 | doubletRecovery.R |
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- | rw-r--r-- | 8,726 | findMarkers.R |
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- | rw-r--r-- | 6,637 | fitTrendCV2.R |
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- | rw-r--r-- | 3,979 | fitTrendPoisson.R |
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- | rw-r--r-- | 10,753 | fitTrendVar.R |
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- | rw-r--r-- | 4,756 | getClusteredPCs.R |
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- | rw-r--r-- | 1,918 | getMarkerEffects.R |
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- | rw-r--r-- | 3,555 | getTopHVGs.R |
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- | rw-r--r-- | 5,414 | getTopMarkers.R |
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- | rw-r--r-- | 8,732 | modelGeneCV2.R |
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- | rw-r--r-- | 7,494 | modelGeneCV2WithSpikes.R |
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- | rw-r--r-- | 10,311 | modelGeneVar.R |
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- | rw-r--r-- | 7,903 | modelGeneVarByPoisson.R |
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- | rw-r--r-- | 11,781 | modelGeneVarWithSpikes.R |
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- | rw-r--r-- | 7,876 | multiMarkerStats.R |
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- | rw-r--r-- | 153 | namespace.R |
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- | rw-r--r-- | 15,609 | pairwiseBinom.R |
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- | rw-r--r-- | 23,497 | pairwiseTTests.R |
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- | rw-r--r-- | 17,124 | pairwiseWilcox.R |
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- | rw-r--r-- | 16,967 | pseudoBulkDGE.R |
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- | rw-r--r-- | 7,616 | pseudoBulkSpecific.R |
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- | rw-r--r-- | 15,507 | quickCluster.R |
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- | rw-r--r-- | 3,488 | quickPseudotime.R |
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- | rw-r--r-- | 8,630 | quickSubCluster.R |
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- | rw-r--r-- | 7,075 | sandbag.R |
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- | rw-r--r-- | 4,626 | scaledColRanks.R |
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- | rw-r--r-- | 4,351 | summaryMarkerStats.R |
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- | rw-r--r-- | 8,036 | testLinearModel.R |
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- | rw-r--r-- | 8,758 | testPseudotime.R |
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- | rw-r--r-- | 7,268 | utils_markers.R |
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- | rw-r--r-- | 386 | utils_parallel.R |
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- | rw-r--r-- | 1,376 | utils_pca.R |
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- | rw-r--r-- | 855 | utils_tricube.R |
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- | rw-r--r-- | 7,536 | utils_variance.R |