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Folder: R
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- | rw-r--r-- | 686 | RcppExports.R |
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- | rw-r--r-- | 1,641 | addPerCellQC.R |
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- | rw-r--r-- | 13,956 | aggregateAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 2,650 | aggregateAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 4,478 | calculateAverage.R |
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- | rw-r--r-- | 3,219 | calculateCPM.R |
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- | rw-r--r-- | 1,787 | calculateFPKM.R |
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- | rw-r--r-- | 3,331 | calculateTPM.R |
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- | rw-r--r-- | 6,932 | downsampleBatches.R |
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- | rw-r--r-- | 5,042 | downsampleMatrix.R |
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- | rw-r--r-- | 4,304 | fitLinearModel.R |
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- | rw-r--r-- | 4,078 | geometricSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 9,299 | isOutlier.R |
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- | rw-r--r-- | 4,776 | librarySizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 7,439 | logNormCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 7,278 | makePerCellDF.R |
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- | rw-r--r-- | 3,791 | makePerFeatureDF.R |
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- | rw-r--r-- | 5,670 | medianSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 2,155 | mockSCE.R |
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- | rw-r--r-- | 11,827 | normalizeCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 3,496 | numDetectedAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 2,742 | numDetectedAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 12,112 | perCellQCMetrics.R |
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- | rw-r--r-- | 5,695 | perFeatureQCMetrics.R |
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- | rw-r--r-- | 5,283 | quickPerCellQC.R |
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- | rw-r--r-- | 4,824 | readSparseCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 803 | scuttle-pkg.R |
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- | rw-r--r-- | 6,425 | sumCountsAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 6,500 | sumCountsAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 9,393 | summarizeAssayByGroup.R |
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- | rw-r--r-- | 1,350 | uniquifyFeatureNames.R |
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- | rw-r--r-- | 1,087 | utils_other.R |
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- | rw-r--r-- | 3,642 | utils_parallel.R |
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- | rw-r--r-- | 847 | utils_subset.R |
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- | rw-r--r-- | 1,998 | whichNonZero.R |