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Folder: R
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- | rw-r--r-- | 1,155 | RcppExports.R |
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- | rw-r--r-- | 3,009 | addPerCellQCMetrics.R |
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- | rw-r--r-- | 12,804 | aggregateAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 2,650 | aggregateAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 4,486 | calculateAverage.R |
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- | rw-r--r-- | 3,227 | calculateCPM.R |
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- | rw-r--r-- | 1,787 | calculateFPKM.R |
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- | rw-r--r-- | 3,331 | calculateTPM.R |
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- | rw-r--r-- | 4,936 | cleanSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 2,640 | computeSpikeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 6,149 | correctGroupSummary.R |
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- | rw-r--r-- | 6,940 | downsampleBatches.R |
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- | rw-r--r-- | 5,042 | downsampleMatrix.R |
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- | rw-r--r-- | 4,304 | fitLinearModel.R |
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- | rw-r--r-- | 4,253 | geometricSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 10,219 | isOutlier.R |
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- | rw-r--r-- | 4,784 | librarySizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 7,152 | logNormCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 7,993 | makePerCellDF.R |
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- | rw-r--r-- | 3,791 | makePerFeatureDF.R |
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- | rw-r--r-- | 5,716 | medianSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 2,197 | mockSCE.R |
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- | rw-r--r-- | 15,305 | normalizeCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 3,531 | numDetectedAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 2,764 | numDetectedAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 3,641 | perCellQCFilters.R |
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- | rw-r--r-- | 12,843 | perCellQCMetrics.R |
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- | rw-r--r-- | 5,612 | perFeatureQCMetrics.R |
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- | rw-r--r-- | 27,231 | pooledSizeFactors.R |
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- | rw-r--r-- | 3,813 | quickPerCellQC.R |
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- | rw-r--r-- | 4,766 | readSparseCounts.R |
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- | rw-r--r-- | 803 | scuttle-pkg.R |
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- | rw-r--r-- | 6,425 | sumCountsAcrossCells.R |
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- | rw-r--r-- | 6,500 | sumCountsAcrossFeatures.R |
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- | rw-r--r-- | 10,868 | summarizeAssayByGroup.R |
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- | rw-r--r-- | 1,197 | uniquifyDataFrameByGroup.R |
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- | rw-r--r-- | 1,350 | uniquifyFeatureNames.R |
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- | rw-r--r-- | 1,087 | utils_other.R |
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- | rw-r--r-- | 3,659 | utils_parallel.R |
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- | rw-r--r-- | 921 | utils_subset.R |
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- | rw-r--r-- | 71 | whichNonZero.R |