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d | rwxr-xr-x | 78 | btree |
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d | rwxr-xr-x | 91 | digestpp |
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d | rwxr-xr-x | 153 | metro |
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d | rwxr-xr-x | 59 | nonstd |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | sparsepp |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | spdlog |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | tsl |
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d | rwxr-xr-x | 58 | zstr |
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- | rw-r--r-- | 8,291 | BooMap.hpp |
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- | rw-r--r-- | 41,872 | BooPHF.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,175 | Const.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,801 | EnumCoder.hpp |
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- | rw-r--r-- | 4,864 | FastxParser.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,668 | FastxParserThreadUtils.hpp |
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- | rw-r--r-- | 11,924 | FrugalBooMap.hpp |
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- | rw-r--r-- | 5,372 | HitManager.hpp |
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- | rw-r--r-- | 6,200 | IndexHeader.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,580 | JFRaw.hpp |
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- | rw-r--r-- | 18,973 | Kmer.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,565 | PairAlignmentFormatter.hpp |
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- | rw-r--r-- | 6,142 | PairSequenceParser.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,175 | RapMapConfig.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,366 | RapMapFileSystem.hpp |
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- | rw-r--r-- | 2,483 | RapMapIndex.hpp |
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- | rw-r--r-- | 2,544 | RapMapSAIndex.hpp |
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- | rw-r--r-- | 50,134 | RapMapUtils.hpp |
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- | rw-r--r-- | 24,757 | SACollector.hpp |
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- | rw-r--r-- | 23,928 | SASearcher.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,474 | ScopedTimer.hpp |
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- | rw-r--r-- | 13,820 | SelectiveAlignmentUtils.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,366 | SingleAlignmentFormatter.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,757 | SparseHashSerializer.hpp |
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- | rw-r--r-- | 1,595 | SpinLock.hpp |
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- | rw-r--r-- | 973 | Type.hpp |
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- | rw-r--r-- | 2,029 | Util.hpp |
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- | rw-r--r-- | 4,458 | bar.h |
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- | rw-r--r-- | 19,395 | bit_array.h |
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- | rw-r--r-- | 9,697 | bit_macros.h |
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- | rw-r--r-- | 146,892 | concurrentqueue.h |
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- | rw-r--r-- | 12,485 | edlib.h |
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- | rw-r--r-- | 9,118 | kseq.h |
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- | rw-r--r-- | 2,842 | macros.h |
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- | rw-r--r-- | 9,928 | picosha2.h |
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- | rw-r--r-- | 1,309 | rank9b.h |
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- | rw-r--r-- | 5,868 | stringpiece.h |
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- | rw-r--r-- | 12,577 | xxhash.h |