package info (click to toggle)
rapmap 0.4.0%2Bdfsg-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch
  • size: 1,428 kB
  • ctags: 3,173
  • sloc: cpp: 16,065; ansic: 3,471; sh: 153; python: 82; makefile: 8

Folder: include

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 62 btree
- - rw-r--r-- 8,291 BooMap.hpp
- - rw-r--r-- 33,660 BooPHF.hpp
- - rw-r--r-- 1,175 Const.hpp
- - rw-r--r-- 1,801 EnumCoder.hpp
- - rw-r--r-- 4,394 FastxParser.hpp
- - rw-r--r-- 11,895 FrugalBooMap.hpp
- - rw-r--r-- 4,948 HitManager.hpp
- - rw-r--r-- 3,982 IndexHeader.hpp
- - rw-r--r-- 1,580 JFRaw.hpp
- - rw-r--r-- 1,565 PairAlignmentFormatter.hpp
- - rw-r--r-- 6,142 PairSequenceParser.hpp
- - rw-r--r-- 1,175 RapMapConfig.hpp
- - rw-r--r-- 1,366 RapMapFileSystem.hpp
- - rw-r--r-- 2,483 RapMapIndex.hpp
- - rw-r--r-- 2,309 RapMapSAIndex.hpp
- - rw-r--r-- 34,391 RapMapUtils.hpp
- - rw-r--r-- 27,570 SACollector.hpp
- - rw-r--r-- 23,910 SASearcher.hpp
- - rw-r--r-- 1,474 ScopedTimer.hpp
- - rw-r--r-- 1,366 SingleAlignmentFormatter.hpp
- - rw-r--r-- 1,753 SparseHashSerializer.hpp
- - rw-r--r-- 1,595 SpinLock.hpp
- - rw-r--r-- 973 Type.hpp
- - rw-r--r-- 2,029 Util.hpp
- - rw-r--r-- 4,458 bar.h
- - rw-r--r-- 19,395 bit_array.h
- - rw-r--r-- 9,697 bit_macros.h
- - rw-r--r-- 146,032 concurrentqueue.h
- - rw-r--r-- 8,795 kseq.h
- - rw-r--r-- 2,842 macros.h
- - rw-r--r-- 1,253 rank9b.h
- - rw-r--r-- 210,047 sparsepp.h
- - rw-r--r-- 5,868 stringpiece.h
- - rw-r--r-- 7,520 xxhash.h