1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
2EA 2EA '(1S)-2-(1H-INDOL-3-YL)-1-{[(5-ISOQUI' non-polymer 52 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_2EA
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
2EA N4 N NH2 0.000 0.000 0.000 0.000
2EA HN41 H H 0.000 -0.122 0.647 0.770
2EA HN42 H H 0.000 0.928 -0.152 -0.379
2EA C23 C CH1 0.000 -1.157 -0.711 -0.562
2EA H23 H H 0.000 -1.269 -0.447 -1.623
2EA C25 C CH2 0.000 -0.938 -2.220 -0.433
2EA H251 H H 0.000 -0.901 -2.493 0.624
2EA H252 H H 0.000 0.004 -2.494 -0.912
2EA C17 C CH1 0.000 -2.093 -2.962 -1.113
2EA H17 H H 0.000 -3.054 -2.684 -0.657
2EA C16 C CR15 0.000 -2.106 -2.682 -2.601
2EA H16 H H 0.000 -2.237 -1.714 -3.068
2EA N2 N NRD5 0.000 -1.935 -3.800 -3.211
2EA C12 C CR56 0.000 -1.796 -4.874 -2.376
2EA C11 C CR16 0.000 -1.596 -6.232 -2.642
2EA H11 H H 0.000 -1.529 -6.579 -3.666
2EA C13 C CR56 0.000 -1.882 -4.456 -1.041
2EA C14 C CR16 0.000 -1.768 -5.357 -0.015
2EA H14 H H 0.000 -1.833 -5.018 1.012
2EA C15 C CR16 0.000 -1.570 -6.699 -0.290
2EA H15 H H 0.000 -1.483 -7.411 0.521
2EA C10 C CR16 0.000 -1.485 -7.130 -1.602
2EA H10 H H 0.000 -1.329 -8.181 -1.813
2EA C24 C CH2 0.000 -2.421 -0.311 0.199
2EA H241 H H 0.000 -2.275 -0.493 1.266
2EA H242 H H 0.000 -3.264 -0.906 -0.158
2EA O1 O O2 0.000 -2.689 1.076 -0.017
2EA C22 C CR6 0.000 -3.817 1.371 0.681
2EA C18 C CR16 0.000 -4.466 0.390 1.416
2EA H18 H H 0.000 -4.067 -0.617 1.432
2EA C21 C CR16 0.000 -4.332 2.662 0.671
2EA H21 H H 0.000 -3.843 3.451 0.113
2EA C20 C CR6 0.000 -5.496 2.915 1.400
2EA C19 C CR16 0.000 -6.088 1.873 2.112
2EA H19 H H 0.000 -6.989 2.058 2.683
2EA N3 N NRD6 0.000 -5.562 0.664 2.097
2EA C1 C CR6 0.000 -6.092 4.274 1.420
2EA C6 C CR16 0.000 -5.255 5.399 1.489
2EA H6 H H 0.000 -4.181 5.264 1.526
2EA C5 C CR16 0.000 -5.773 6.655 1.509
2EA H5 H H 0.000 -5.114 7.513 1.563
2EA C4 C CR66 0.000 -7.164 6.839 1.460
2EA C9 C CR16 0.000 -7.745 8.116 1.478
2EA H9 H H 0.000 -7.117 8.996 1.531
2EA N1 N NRD6 0.000 -9.051 8.243 1.429
2EA C8 C CR16 0.000 -9.872 7.205 1.363
2EA H8 H H 0.000 -10.940 7.379 1.326
2EA C7 C CR16 0.000 -9.409 5.924 1.341
2EA H7 H H 0.000 -10.096 5.089 1.287
2EA C3 C CR66 0.000 -8.019 5.706 1.390
2EA C2 C CR16 0.000 -7.466 4.420 1.365
2EA H2 H H 0.000 -8.108 3.550 1.305
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
2EA N4 n/a C23 START
2EA HN41 N4 . .
2EA HN42 N4 . .
2EA C23 N4 C24 .
2EA H23 C23 . .
2EA C25 C23 C17 .
2EA H251 C25 . .
2EA H252 C25 . .
2EA C17 C25 C13 .
2EA H17 C17 . .
2EA C16 C17 N2 .
2EA H16 C16 . .
2EA N2 C16 C12 .
2EA C12 N2 C11 .
2EA C11 C12 H11 .
2EA H11 C11 . .
2EA C13 C17 C14 .
2EA C14 C13 C15 .
2EA H14 C14 . .
2EA C15 C14 C10 .
2EA H15 C15 . .
2EA C10 C15 H10 .
2EA H10 C10 . .
2EA C24 C23 O1 .
2EA H241 C24 . .
2EA H242 C24 . .
2EA O1 C24 C22 .
2EA C22 O1 C21 .
2EA C18 C22 H18 .
2EA H18 C18 . .
2EA C21 C22 C20 .
2EA H21 C21 . .
2EA C20 C21 C1 .
2EA C19 C20 N3 .
2EA H19 C19 . .
2EA N3 C19 . .
2EA C1 C20 C6 .
2EA C6 C1 C5 .
2EA H6 C6 . .
2EA C5 C6 C4 .
2EA H5 C5 . .
2EA C4 C5 C9 .
2EA C9 C4 N1 .
2EA H9 C9 . .
2EA N1 C9 C8 .
2EA C8 N1 C7 .
2EA H8 C8 . .
2EA C7 C8 C3 .
2EA H7 C7 . .
2EA C3 C7 C2 .
2EA C2 C3 H2 .
2EA H2 C2 . END
2EA C1 C2 . ADD
2EA C3 C4 . ADD
2EA C10 C11 . ADD
2EA C12 C13 . ADD
2EA C18 N3 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
2EA C1 C2 double 1.390 0.020
2EA C6 C1 single 1.390 0.020
2EA C1 C20 single 1.487 0.020
2EA C2 C3 single 1.390 0.020
2EA H2 C2 single 1.083 0.020
2EA C3 C4 double 1.490 0.020
2EA C3 C7 single 1.390 0.020
2EA C4 C5 single 1.390 0.020
2EA C9 C4 single 1.390 0.020
2EA C5 C6 double 1.390 0.020
2EA H5 C5 single 1.083 0.020
2EA H6 C6 single 1.083 0.020
2EA C7 C8 double 1.390 0.020
2EA H7 C7 single 1.083 0.020
2EA C8 N1 single 1.337 0.020
2EA H8 C8 single 1.083 0.020
2EA N1 C9 double 1.337 0.020
2EA H9 C9 single 1.083 0.020
2EA C10 C11 double 1.390 0.020
2EA C10 C15 single 1.390 0.020
2EA H10 C10 single 1.083 0.020
2EA C11 C12 single 1.390 0.020
2EA H11 C11 single 1.083 0.020
2EA C12 C13 double 1.490 0.020
2EA C12 N2 single 1.350 0.020
2EA C14 C13 single 1.390 0.020
2EA C13 C17 single 1.460 0.020
2EA C15 C14 double 1.390 0.020
2EA H14 C14 single 1.083 0.020
2EA H15 C15 single 1.083 0.020
2EA N2 C16 double 1.350 0.020
2EA C16 C17 single 1.510 0.020
2EA H16 C16 single 1.083 0.020
2EA C17 C25 single 1.524 0.020
2EA H17 C17 single 1.099 0.020
2EA C18 N3 single 1.337 0.020
2EA C18 C22 double 1.390 0.020
2EA H18 C18 single 1.083 0.020
2EA N3 C19 double 1.337 0.020
2EA C19 C20 single 1.390 0.020
2EA H19 C19 single 1.083 0.020
2EA C20 C21 double 1.390 0.020
2EA C21 C22 single 1.390 0.020
2EA H21 C21 single 1.083 0.020
2EA C22 O1 single 1.370 0.020
2EA O1 C24 single 1.426 0.020
2EA C24 C23 single 1.524 0.020
2EA H241 C24 single 1.092 0.020
2EA H242 C24 single 1.092 0.020
2EA C25 C23 single 1.524 0.020
2EA C23 N4 single 1.450 0.020
2EA H23 C23 single 1.099 0.020
2EA H251 C25 single 1.092 0.020
2EA H252 C25 single 1.092 0.020
2EA HN41 N4 single 1.010 0.020
2EA HN42 N4 single 1.010 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
2EA HN41 N4 HN42 120.000 3.000
2EA HN41 N4 C23 120.000 3.000
2EA HN42 N4 C23 120.000 3.000
2EA N4 C23 H23 109.470 3.000
2EA N4 C23 C25 109.470 3.000
2EA N4 C23 C24 109.470 3.000
2EA H23 C23 C25 108.340 3.000
2EA H23 C23 C24 108.340 3.000
2EA C25 C23 C24 109.470 3.000
2EA C23 C25 H251 109.470 3.000
2EA C23 C25 H252 109.470 3.000
2EA C23 C25 C17 111.000 3.000
2EA H251 C25 H252 107.900 3.000
2EA H251 C25 C17 109.470 3.000
2EA H252 C25 C17 109.470 3.000
2EA C25 C17 H17 108.340 3.000
2EA C25 C17 C16 109.500 3.000
2EA C25 C17 C13 109.500 3.000
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2EA H17 C17 C13 109.500 3.000
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2EA C17 C16 H16 108.000 3.000
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2EA N2 C12 C11 132.000 3.000
2EA N2 C12 C13 108.000 3.000
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2EA C12 C11 C10 120.000 3.000
2EA H11 C11 C10 120.000 3.000
2EA C17 C13 C14 120.000 3.000
2EA C17 C13 C12 120.000 3.000
2EA C14 C13 C12 120.000 3.000
2EA C13 C14 H14 120.000 3.000
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2EA C23 C24 H241 109.470 3.000
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2EA O1 C22 C18 120.000 3.000
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2EA C21 C20 C19 120.000 3.000
2EA C21 C20 C1 120.000 3.000
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2EA C6 C5 H5 120.000 3.000
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2EA H9 C9 N1 120.000 3.000
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