1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PIB PIB '"2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4' non-polymer 64 35 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PIB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PIB O17 O O -0.500 0.000 0.000 0.000
PIB C14 C C 0.000 -0.478 0.867 -0.765
PIB C15 C CH2 0.000 0.313 1.336 -1.959
PIB H151 H H 0.000 0.489 2.411 -1.879
PIB H152 H H 0.000 -0.250 1.127 -2.872
PIB C16 C CH2 0.000 1.653 0.600 -2.005
PIB H161 H H 0.000 1.474 -0.475 -2.084
PIB H162 H H 0.000 2.213 0.808 -1.092
PIB C17 C CH3 0.000 2.455 1.076 -3.217
PIB H173 H H 0.000 1.913 0.875 -4.106
PIB H172 H H 0.000 2.630 2.119 -3.142
PIB H171 H H 0.000 3.385 0.567 -3.252
PIB O14 O O2 -0.500 -1.612 1.344 -0.538
PIB C8 C CH1 0.000 -2.455 0.928 0.629
PIB HC8 H H 0.000 -2.216 -0.115 0.879
PIB C9 C CH2 0.000 -2.124 1.806 1.837
PIB HC91 H H 0.000 -2.721 1.455 2.681
PIB HC92 H H 0.000 -2.408 2.832 1.593
PIB O15 O O2 -0.500 -0.670 1.761 2.198
PIB C10 C C 0.000 -0.184 2.405 3.154
PIB O16 O O -0.500 -0.921 3.130 3.858
PIB C11 C CH2 0.000 1.289 2.310 3.457
PIB H111 H H 0.000 1.861 2.649 2.591
PIB H112 H H 0.000 1.548 1.272 3.679
PIB C12 C CH2 0.000 1.620 3.189 4.665
PIB H121 H H 0.000 1.047 2.848 5.530
PIB H122 H H 0.000 1.359 4.225 4.442
PIB C13 C CH3 0.000 3.115 3.092 4.971
PIB H133 H H 0.000 3.371 2.086 5.188
PIB H132 H H 0.000 3.674 3.422 4.133
PIB H131 H H 0.000 3.348 3.700 5.808
PIB C7 C CH2 0.000 -3.951 1.025 0.321
PIB HC71 H H 0.000 -4.209 2.062 0.099
PIB HC72 H H 0.000 -4.522 0.686 1.188
PIB O13 O O2 0.000 -4.260 0.204 -0.805
PIB P1 P P 0.000 -5.840 0.354 -1.071
PIB O11 O OP -0.500 -6.588 -0.096 0.128
PIB O12 O OP -0.500 -6.162 1.774 -1.350
PIB O1 O O2 0.000 -6.259 -0.549 -2.336
PIB C1 C CH1 0.000 -7.666 -0.376 -2.520
PIB HC1 H H 0.000 -8.052 0.315 -1.758
PIB C6 C CH1 0.000 -7.930 0.202 -3.912
PIB HC6 H H 0.000 -7.544 -0.488 -4.674
PIB O6 O OH1 0.000 -7.272 1.464 -4.036
PIB HO6 H H 0.000 -7.440 1.829 -4.915
PIB C5 C CH1 0.000 -9.436 0.389 -4.109
PIB HC5 H H 0.000 -9.822 1.080 -3.346
PIB O5 O OH1 0.000 -9.682 0.929 -5.409
PIB HO5 H H 0.000 -10.634 1.046 -5.534
PIB C4 C CH1 0.000 -10.139 -0.963 -3.975
PIB HC4 H H 0.000 -9.753 -1.654 -4.737
PIB O4 O OH1 0.000 -11.546 -0.789 -4.160
PIB HO4 H H 0.000 -11.712 -0.423 -5.039
PIB C3 C CH1 0.000 -9.875 -1.539 -2.585
PIB HC3 H H 0.000 -10.262 -0.848 -1.823
PIB C2 C CH1 0.000 -8.370 -1.726 -2.387
PIB HC2 H H 0.000 -8.180 -2.141 -1.386
PIB O2 O OH1 0.000 -7.868 -2.625 -3.377
PIB HO2 H H 0.000 -8.313 -3.479 -3.292
PIB O3 O O2 0.000 -10.533 -2.802 -2.460
PIB P3 P P 0.000 -11.571 -2.667 -1.238
PIB O31 O OP -0.666 -12.304 -3.977 -1.052
PIB O32 O OP -0.666 -12.569 -1.571 -1.542
PIB O33 O OP -0.666 -10.818 -2.327 0.030
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PIB O17 n/a C14 START
PIB C14 O17 O14 .
PIB C15 C14 C16 .
PIB H151 C15 . .
PIB H152 C15 . .
PIB C16 C15 C17 .
PIB H161 C16 . .
PIB H162 C16 . .
PIB C17 C16 H171 .
PIB H173 C17 . .
PIB H172 C17 . .
PIB H171 C17 . .
PIB O14 C14 C8 .
PIB C8 O14 C7 .
PIB HC8 C8 . .
PIB C9 C8 O15 .
PIB HC91 C9 . .
PIB HC92 C9 . .
PIB O15 C9 C10 .
PIB C10 O15 C11 .
PIB O16 C10 . .
PIB C11 C10 C12 .
PIB H111 C11 . .
PIB H112 C11 . .
PIB C12 C11 C13 .
PIB H121 C12 . .
PIB H122 C12 . .
PIB C13 C12 H131 .
PIB H133 C13 . .
PIB H132 C13 . .
PIB H131 C13 . .
PIB C7 C8 O13 .
PIB HC71 C7 . .
PIB HC72 C7 . .
PIB O13 C7 P1 .
PIB P1 O13 O1 .
PIB O11 P1 . .
PIB O12 P1 . .
PIB O1 P1 C1 .
PIB C1 O1 C6 .
PIB HC1 C1 . .
PIB C6 C1 C5 .
PIB HC6 C6 . .
PIB O6 C6 HO6 .
PIB HO6 O6 . .
PIB C5 C6 C4 .
PIB HC5 C5 . .
PIB O5 C5 HO5 .
PIB HO5 O5 . .
PIB C4 C5 C3 .
PIB HC4 C4 . .
PIB O4 C4 HO4 .
PIB HO4 O4 . .
PIB C3 C4 O3 .
PIB HC3 C3 . .
PIB C2 C3 O2 .
PIB HC2 C2 . .
PIB O2 C2 HO2 .
PIB HO2 O2 . .
PIB O3 C3 P3 .
PIB P3 O3 O33 .
PIB O31 P3 . .
PIB O32 P3 . .
PIB O33 P3 . END
PIB C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PIB C1 C2 single 1.524 0.020
PIB C6 C1 single 1.524 0.020
PIB C1 O1 single 1.426 0.020
PIB HC1 C1 single 1.099 0.020
PIB C2 C3 single 1.524 0.020
PIB O2 C2 single 1.432 0.020
PIB HC2 C2 single 1.099 0.020
PIB C3 C4 single 1.524 0.020
PIB O3 C3 single 1.426 0.020
PIB HC3 C3 single 1.099 0.020
PIB C4 C5 single 1.524 0.020
PIB O4 C4 single 1.432 0.020
PIB HC4 C4 single 1.099 0.020
PIB C5 C6 single 1.524 0.020
PIB O5 C5 single 1.432 0.020
PIB HC5 C5 single 1.099 0.020
PIB O6 C6 single 1.432 0.020
PIB HC6 C6 single 1.099 0.020
PIB O1 P1 single 1.610 0.020
PIB HO2 O2 single 0.967 0.020
PIB P3 O3 single 1.610 0.020
PIB HO4 O4 single 0.967 0.020
PIB HO5 O5 single 0.967 0.020
PIB HO6 O6 single 0.967 0.020
PIB O11 P1 deloc 1.510 0.020
PIB O12 P1 deloc 1.510 0.020
PIB P1 O13 single 1.610 0.020
PIB O13 C7 single 1.426 0.020
PIB O31 P3 deloc 1.510 0.020
PIB O32 P3 deloc 1.510 0.020
PIB O33 P3 deloc 1.510 0.020
PIB C7 C8 single 1.524 0.020
PIB HC71 C7 single 1.092 0.020
PIB HC72 C7 single 1.092 0.020
PIB C9 C8 single 1.524 0.020
PIB C8 O14 single 1.426 0.020
PIB HC8 C8 single 1.099 0.020
PIB O15 C9 single 1.426 0.020
PIB HC91 C9 single 1.092 0.020
PIB HC92 C9 single 1.092 0.020
PIB C11 C10 single 1.510 0.020
PIB C10 O15 deloc 1.454 0.020
PIB O16 C10 deloc 1.220 0.020
PIB C12 C11 single 1.524 0.020
PIB H111 C11 single 1.092 0.020
PIB H112 C11 single 1.092 0.020
PIB C13 C12 single 1.513 0.020
PIB H121 C12 single 1.092 0.020
PIB H122 C12 single 1.092 0.020
PIB H131 C13 single 1.059 0.020
PIB H132 C13 single 1.059 0.020
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PIB C15 C14 single 1.510 0.020
PIB O14 C14 deloc 1.454 0.020
PIB C14 O17 deloc 1.220 0.020
PIB C16 C15 single 1.524 0.020
PIB H151 C15 single 1.092 0.020
PIB H152 C15 single 1.092 0.020
PIB C17 C16 single 1.513 0.020
PIB H161 C16 single 1.092 0.020
PIB H162 C16 single 1.092 0.020
PIB H171 C17 single 1.059 0.020
PIB H172 C17 single 1.059 0.020
PIB H173 C17 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PIB O17 C14 C15 120.500 3.000
PIB O17 C14 O14 119.000 3.000
PIB C15 C14 O14 120.000 3.000
PIB C14 C15 H151 109.470 3.000
PIB C14 C15 H152 109.470 3.000
PIB C14 C15 C16 109.470 3.000
PIB H151 C15 H152 107.900 3.000
PIB H151 C15 C16 109.470 3.000
PIB H152 C15 C16 109.470 3.000
PIB C15 C16 H161 109.470 3.000
PIB C15 C16 H162 109.470 3.000
PIB C15 C16 C17 111.000 3.000
PIB H161 C16 H162 107.900 3.000
PIB H161 C16 C17 109.470 3.000
PIB H162 C16 C17 109.470 3.000
PIB C16 C17 H173 109.470 3.000
PIB C16 C17 H172 109.470 3.000
PIB C16 C17 H171 109.470 3.000
PIB H173 C17 H172 109.470 3.000
PIB H173 C17 H171 109.470 3.000
PIB H172 C17 H171 109.470 3.000
PIB C14 O14 C8 111.800 3.000
PIB O14 C8 HC8 109.470 3.000
PIB O14 C8 C9 109.470 3.000
PIB O14 C8 C7 109.470 3.000
PIB HC8 C8 C9 108.340 3.000
PIB HC8 C8 C7 108.340 3.000
PIB C9 C8 C7 109.470 3.000
PIB C8 C9 HC91 109.470 3.000
PIB C8 C9 HC92 109.470 3.000
PIB C8 C9 O15 109.470 3.000
PIB HC91 C9 HC92 107.900 3.000
PIB HC91 C9 O15 109.470 3.000
PIB HC92 C9 O15 109.470 3.000
PIB C9 O15 C10 120.000 3.000
PIB O15 C10 O16 119.000 3.000
PIB O15 C10 C11 120.000 3.000
PIB O16 C10 C11 120.500 3.000
PIB C10 C11 H111 109.470 3.000
PIB C10 C11 H112 109.470 3.000
PIB C10 C11 C12 109.470 3.000
PIB H111 C11 H112 107.900 3.000
PIB H111 C11 C12 109.470 3.000
PIB H112 C11 C12 109.470 3.000
PIB C11 C12 H121 109.470 3.000
PIB C11 C12 H122 109.470 3.000
PIB C11 C12 C13 111.000 3.000
PIB H121 C12 H122 107.900 3.000
PIB H121 C12 C13 109.470 3.000
PIB H122 C12 C13 109.470 3.000
PIB C12 C13 H133 109.470 3.000
PIB C12 C13 H132 109.470 3.000
PIB C12 C13 H131 109.470 3.000
PIB H133 C13 H132 109.470 3.000
PIB H133 C13 H131 109.470 3.000
PIB H132 C13 H131 109.470 3.000
PIB C8 C7 HC71 109.470 3.000
PIB C8 C7 HC72 109.470 3.000
PIB C8 C7 O13 109.470 3.000
PIB HC71 C7 HC72 107.900 3.000
PIB HC71 C7 O13 109.470 3.000
PIB HC72 C7 O13 109.470 3.000
PIB C7 O13 P1 120.500 3.000
PIB O13 P1 O11 108.200 3.000
PIB O13 P1 O12 108.200 3.000
PIB O13 P1 O1 102.600 3.000
PIB O11 P1 O12 119.900 3.000
PIB O11 P1 O1 108.200 3.000
PIB O12 P1 O1 108.200 3.000
PIB P1 O1 C1 120.500 3.000
PIB O1 C1 HC1 109.470 3.000
PIB O1 C1 C6 109.470 3.000
PIB O1 C1 C2 109.470 3.000
PIB HC1 C1 C6 108.340 3.000
PIB HC1 C1 C2 108.340 3.000
PIB C6 C1 C2 111.000 3.000
PIB C1 C6 HC6 108.340 3.000
PIB C1 C6 O6 109.470 3.000
PIB C1 C6 C5 111.000 3.000
PIB HC6 C6 O6 109.470 3.000
PIB HC6 C6 C5 108.340 3.000
PIB O6 C6 C5 109.470 3.000
PIB C6 O6 HO6 109.470 3.000
PIB C6 C5 HC5 108.340 3.000
PIB C6 C5 O5 109.470 3.000
PIB C6 C5 C4 111.000 3.000
PIB HC5 C5 O5 109.470 3.000
PIB HC5 C5 C4 108.340 3.000
PIB O5 C5 C4 109.470 3.000
PIB C5 O5 HO5 109.470 3.000
PIB C5 C4 HC4 108.340 3.000
PIB C5 C4 O4 109.470 3.000
PIB C5 C4 C3 111.000 3.000
PIB HC4 C4 O4 109.470 3.000
PIB HC4 C4 C3 108.340 3.000
PIB O4 C4 C3 109.470 3.000
PIB C4 O4 HO4 109.470 3.000
PIB C4 C3 HC3 108.340 3.000
PIB C4 C3 C2 111.000 3.000
PIB C4 C3 O3 109.470 3.000
PIB HC3 C3 C2 108.340 3.000
PIB HC3 C3 O3 109.470 3.000
PIB C2 C3 O3 109.470 3.000
PIB C3 C2 HC2 108.340 3.000
PIB C3 C2 O2 109.470 3.000
PIB C3 C2 C1 111.000 3.000
PIB HC2 C2 O2 109.470 3.000
PIB HC2 C2 C1 108.340 3.000
PIB O2 C2 C1 109.470 3.000
PIB C2 O2 HO2 109.470 3.000
PIB C3 O3 P3 120.500 3.000
PIB O3 P3 O31 108.200 3.000
PIB O3 P3 O32 108.200 3.000
PIB O3 P3 O33 108.200 3.000
PIB O31 P3 O32 119.900 3.000
PIB O31 P3 O33 119.900 3.000
PIB O32 P3 O33 119.900 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PIB var_1 O17 C14 C15 C16 -0.014 20.000 3
PIB var_2 C14 C15 C16 C17 -179.982 20.000 3
PIB var_3 C15 C16 C17 H171 -179.980 20.000 3
PIB var_4 O17 C14 O14 C8 0.001 20.000 1
PIB var_5 C14 O14 C8 C7 -149.394 20.000 1
PIB var_6 O14 C8 C9 O15 -56.725 20.000 3
PIB var_7 C8 C9 O15 C10 -179.984 20.000 1
PIB var_8 C9 O15 C10 C11 179.980 20.000 1
PIB var_9 O15 C10 C11 C12 179.968 20.000 3
PIB var_10 C10 C11 C12 C13 -179.961 20.000 3
PIB var_11 C11 C12 C13 H131 -179.976 20.000 3
PIB var_12 O14 C8 C7 O13 58.351 20.000 3
PIB var_13 C8 C7 O13 P1 -179.980 20.000 1
PIB var_14 C7 O13 P1 O1 179.969 20.000 1
PIB var_15 O13 P1 O1 C1 179.974 20.000 1
PIB var_16 P1 O1 C1 C6 119.983 20.000 1
PIB var_17 O1 C1 C2 C3 180.000 20.000 3
PIB var_18 O1 C1 C6 C5 180.000 20.000 3
PIB var_19 C1 C6 O6 HO6 179.993 20.000 1
PIB var_20 C1 C6 C5 C4 -60.000 20.000 3
PIB var_21 C6 C5 O5 HO5 179.967 20.000 1
PIB var_22 C6 C5 C4 C3 60.000 20.000 3
PIB var_23 C5 C4 O4 HO4 59.946 20.000 1
PIB var_24 C5 C4 C3 O3 180.000 20.000 3
PIB var_25 C4 C3 C2 O2 -60.000 20.000 3
PIB var_26 C3 C2 O2 HO2 -60.043 20.000 1
PIB var_27 C4 C3 O3 P3 -120.046 20.000 1
PIB var_28 C3 O3 P3 O33 -60.011 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
PIB chir_01 C1 C2 C6 O1 positiv
PIB chir_02 C2 C1 C3 O2 negativ
PIB chir_03 C3 C2 C4 O3 negativ
PIB chir_04 C4 C3 C5 O4 positiv
PIB chir_05 C5 C4 C6 O5 negativ
PIB chir_06 C6 C1 C5 O6 negativ
PIB chir_07 C8 C7 C9 O14 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PIB plan-1 C10 0.020
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PIB plan-1 O15 0.020
PIB plan-1 O16 0.020
PIB plan-2 C14 0.020
PIB plan-2 C15 0.020
PIB plan-2 O14 0.020
PIB plan-2 O17 0.020
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