File: PU.cif

package info (click to toggle)
refmac-dictionary 5.41-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye
  • size: 217,852 kB
file content (495 lines) | stat: -rw-r--r-- 23,424 bytes parent folder | download | duplicates (3)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PU       PU  'PUROMYCIN-N-AMINOPHOSPHONIC ACID    ' non-polymer        68  38 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PU
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 PU            O      O    O         0.000      0.000    0.000    0.000
 PU            C      C    C         0.000     -0.861   -0.148   -0.841
 PU            CA     C    CH1       0.000     -0.491   -0.614   -2.225
 PU            HA     H    H         0.000     -1.203   -0.201   -2.953
 PU            CB     C    CH2       0.000     -0.535   -2.141   -2.278
 PU            HB1    H    H         0.000     -1.543   -2.484   -2.035
 PU            HB2    H    H         0.000      0.172   -2.551   -1.553
 PU            CG     C    CR6       0.000     -0.164   -2.607   -3.663
 PU            CD2    C    CR16      0.000     -1.147   -2.775   -4.620
 PU            HD2    H    H         0.000     -2.183   -2.576   -4.373
 PU            CE2    C    CR16      0.000     -0.809   -3.197   -5.891
 PU            HE2    H    H         0.000     -1.578   -3.320   -6.643
 PU            CZ     C    CR6       0.000      0.516   -3.462   -6.204
 PU            OC     O    O2        0.000      0.851   -3.883   -7.452
 PU            CM     C    CH3       0.000     -0.364   -3.958   -8.201
 PU            HM3    H    H         0.000     -1.024   -4.645   -7.737
 PU            HM2    H    H         0.000     -0.819   -3.002   -8.235
 PU            HM1    H    H         0.000     -0.153   -4.284   -9.186
 PU            CE1    C    CR16      0.000      1.500   -3.293   -5.242
 PU            HE1    H    H         0.000      2.536   -3.495   -5.485
 PU            CD1    C    CR16      0.000      1.158   -2.865   -3.973
 PU            HD1    H    H         0.000      1.926   -2.732   -3.222
 PU            N      N    NH1       0.000      0.865   -0.152   -2.551
 PU            HN1    H    H         0.000      1.714   -0.376   -2.052
 PU            P      P    P         0.000      0.730    0.821   -3.916
 PU            OP1    O    O         0.000      2.069    1.322   -4.300
 PU            OP2    O    OH1       0.000      0.111   -0.039   -5.129
 PU            HOP2   H    H         0.000     -0.032    0.375   -5.991
 PU            OP3    O    OH1       0.000     -0.237    2.067   -3.594
 PU            HOP3   H    H         0.000     -1.153    1.911   -3.326
 PU            "N3'"  N    NH1       0.000     -2.151    0.104   -0.537
 PU            "HN'3" H    H         0.000     -2.868   -0.019   -1.237
 PU            "C3'"  C    CH1       0.000     -2.510    0.557    0.809
 PU            "H3'"  H    H         0.000     -1.681    1.121    1.259
 PU            "C4'"  C    CH1       0.000     -2.893   -0.646    1.699
 PU            "H4'"  H    H         0.000     -3.225   -1.490    1.079
 PU            "C5'"  C    CH2       0.000     -1.714   -1.063    2.579
 PU            "H5'"  H    H         0.000     -1.387   -0.211    3.177
 PU            "H5''" H    H         0.000     -0.890   -1.400    1.946
 PU            "O5'"  O    OH1       0.000     -2.117   -2.127    3.443
 PU            "HO5'" H    H         0.000     -1.371   -2.391    3.998
 PU            "C2'"  C    CH1       0.000     -3.790    1.419    0.764
 PU            "H2'"  H    H         0.000     -3.600    2.412    1.196
 PU            "O2'"  O    OH1       0.000     -4.267    1.540   -0.576
 PU            "HO2'" H    H         0.000     -5.068    2.082   -0.585
 PU            "C1'"  C    CH1       0.000     -4.800    0.637    1.633
 PU            "H1'"  H    H         0.000     -5.427   -0.009    1.003
 PU            "O4'"  O    O2        0.000     -3.984   -0.162    2.517
 PU            N9     N    NR5       0.000     -5.634    1.562    2.403
 PU            C4     C    CR56      0.000     -6.827    2.107    2.001
 PU            C5     C    CR56      0.000     -7.258    2.922    3.061
 PU            N7     N    NRD5      0.000     -6.319    2.843    4.034
 PU            C8     C    CR15      0.000     -5.365    2.044    3.650
 PU            H8     H    H         0.000     -4.487    1.800    4.234
 PU            N3     N    NRD6      0.000     -7.585    2.007    0.914
 PU            C2     C    CR16      0.000     -8.719    2.671    0.823
 PU            H2     H    H         0.000     -9.310    2.570   -0.078
 PU            N1     N    NRD6      0.000     -9.161    3.454    1.790
 PU            C6     C    CR6       0.000     -8.475    3.611    2.917
 PU            N6     N    NT        0.000     -8.947    4.433    3.925
 PU            C10    C    CH3       0.000     -9.260    3.564    5.067
 PU            H103   H    H         0.000     -9.995    2.857    4.781
 PU            H102   H    H         0.000     -8.384    3.057    5.375
 PU            H101   H    H         0.000     -9.628    4.152    5.867
 PU            C9     C    CH3       0.000    -10.223    4.988    3.453
 PU            H93    H    H         0.000    -10.062    5.539    2.563
 PU            H92    H    H         0.000    -10.902    4.198    3.261
 PU            H91    H    H         0.000    -10.626    5.627    4.195
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 PU       O      n/a    C      START
 PU       C      O      "N3'"  .
 PU       CA     C      N      .
 PU       HA     CA     .      .
 PU       CB     CA     CG     .
 PU       HB1    CB     .      .
 PU       HB2    CB     .      .
 PU       CG     CB     CD2    .
 PU       CD2    CG     CE2    .
 PU       HD2    CD2    .      .
 PU       CE2    CD2    CZ     .
 PU       HE2    CE2    .      .
 PU       CZ     CE2    CE1    .
 PU       OC     CZ     CM     .
 PU       CM     OC     HM1    .
 PU       HM3    CM     .      .
 PU       HM2    CM     .      .
 PU       HM1    CM     .      .
 PU       CE1    CZ     CD1    .
 PU       HE1    CE1    .      .
 PU       CD1    CE1    HD1    .
 PU       HD1    CD1    .      .
 PU       N      CA     P      .
 PU       HN1    N      .      .
 PU       P      N      OP3    .
 PU       OP1    P      .      .
 PU       OP2    P      HOP2   .
 PU       HOP2   OP2    .      .
 PU       OP3    P      HOP3   .
 PU       HOP3   OP3    .      .
 PU       "N3'"  C      "C3'"  .
 PU       "HN'3" "N3'"  .      .
 PU       "C3'"  "N3'"  "C2'"  .
 PU       "H3'"  "C3'"  .      .
 PU       "C4'"  "C3'"  "C5'"  .
 PU       "H4'"  "C4'"  .      .
 PU       "C5'"  "C4'"  "O5'"  .
 PU       "H5'"  "C5'"  .      .
 PU       "H5''" "C5'"  .      .
 PU       "O5'"  "C5'"  "HO5'" .
 PU       "HO5'" "O5'"  .      .
 PU       "C2'"  "C3'"  "C1'"  .
 PU       "H2'"  "C2'"  .      .
 PU       "O2'"  "C2'"  "HO2'" .
 PU       "HO2'" "O2'"  .      .
 PU       "C1'"  "C2'"  N9     .
 PU       "H1'"  "C1'"  .      .
 PU       "O4'"  "C1'"  .      .
 PU       N9     "C1'"  C4     .
 PU       C4     N9     N3     .
 PU       C5     C4     N7     .
 PU       N7     C5     C8     .
 PU       C8     N7     H8     .
 PU       H8     C8     .      .
 PU       N3     C4     C2     .
 PU       C2     N3     N1     .
 PU       H2     C2     .      .
 PU       N1     C2     C6     .
 PU       C6     N1     N6     .
 PU       N6     C6     C9     .
 PU       C10    N6     H101   .
 PU       H103   C10    .      .
 PU       H102   C10    .      .
 PU       H101   C10    .      .
 PU       C9     N6     H91    .
 PU       H93    C9     .      .
 PU       H92    C9     .      .
 PU       H91    C9     .      END
 PU       CG     CD1    .    ADD
 PU       "C4'"  "O4'"  .    ADD
 PU       N9     C8     .    ADD
 PU       C5     C6     .    ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
 PU       OP1    P         double      1.480    0.020
 PU       OP2    P         single      1.610    0.020
 PU       OP3    P         single      1.610    0.020
 PU       P      N         single      1.750    0.020
 PU       HOP2   OP2       single      0.967    0.020
 PU       HOP3   OP3       single      0.967    0.020
 PU       N      CA        single      1.450    0.020
 PU       HN1    N         single      1.010    0.020
 PU       CA     C         single      1.500    0.020
 PU       CB     CA        single      1.524    0.020
 PU       HA     CA        single      1.099    0.020
 PU       C      O         double      1.220    0.020
 PU       "N3'"  C         single      1.330    0.020
 PU       CG     CB        single      1.511    0.020
 PU       HB1    CB        single      1.092    0.020
 PU       HB2    CB        single      1.092    0.020
 PU       CG     CD1       double      1.390    0.020
 PU       CD2    CG        single      1.390    0.020
 PU       CD1    CE1       single      1.390    0.020
 PU       HD1    CD1       single      1.083    0.020
 PU       CE2    CD2       double      1.390    0.020
 PU       HD2    CD2       single      1.083    0.020
 PU       CE1    CZ        double      1.390    0.020
 PU       HE1    CE1       single      1.083    0.020
 PU       CZ     CE2       single      1.390    0.020
 PU       HE2    CE2       single      1.083    0.020
 PU       OC     CZ        single      1.370    0.020
 PU       CM     OC        single      1.426    0.020
 PU       HM1    CM        single      1.059    0.020
 PU       HM2    CM        single      1.059    0.020
 PU       HM3    CM        single      1.059    0.020
 PU       "O5'"  "C5'"     single      1.432    0.020
 PU       "HO5'" "O5'"     single      0.967    0.020
 PU       "C5'"  "C4'"     single      1.524    0.020
 PU       "H5'"  "C5'"     single      1.092    0.020
 PU       "H5''" "C5'"     single      1.092    0.020
 PU       "C4'"  "O4'"     single      1.426    0.020
 PU       "C4'"  "C3'"     single      1.524    0.020
 PU       "H4'"  "C4'"     single      1.099    0.020
 PU       "O4'"  "C1'"     single      1.426    0.020
 PU       "C3'"  "N3'"     single      1.450    0.020
 PU       "C2'"  "C3'"     single      1.524    0.020
 PU       "H3'"  "C3'"     single      1.099    0.020
 PU       "HN'3" "N3'"     single      1.010    0.020
 PU       "O2'"  "C2'"     single      1.432    0.020
 PU       "C1'"  "C2'"     single      1.524    0.020
 PU       "H2'"  "C2'"     single      1.099    0.020
 PU       "HO2'" "O2'"     single      0.967    0.020
 PU       N9     "C1'"     single      1.485    0.020
 PU       "H1'"  "C1'"     single      1.099    0.020
 PU       N9     C8        single      1.337    0.020
 PU       C4     N9        single      1.337    0.020
 PU       C8     N7        double      1.350    0.020
 PU       H8     C8        single      1.083    0.020
 PU       N7     C5        single      1.350    0.020
 PU       C5     C6        double      1.490    0.020
 PU       C5     C4        single      1.490    0.020
 PU       N6     C6        single      1.405    0.020
 PU       C6     N1        single      1.350    0.020
 PU       C9     N6        single      1.469    0.020
 PU       C10    N6        single      1.469    0.020
 PU       H91    C9        single      1.059    0.020
 PU       H92    C9        single      1.059    0.020
 PU       H93    C9        single      1.059    0.020
 PU       H101   C10       single      1.059    0.020
 PU       H102   C10       single      1.059    0.020
 PU       H103   C10       single      1.059    0.020
 PU       N1     C2        double      1.337    0.020
 PU       C2     N3        single      1.337    0.020
 PU       H2     C2        single      1.083    0.020
 PU       N3     C4        double      1.355    0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 PU       O      C      CA      120.500    3.000
 PU       O      C      "N3'"   123.000    3.000
 PU       CA     C      "N3'"   116.500    3.000
 PU       C      CA     HA      108.810    3.000
 PU       C      CA     CB      109.470    3.000
 PU       C      CA     N       111.600    3.000
 PU       HA     CA     CB      108.340    3.000
 PU       HA     CA     N       108.550    3.000
 PU       CB     CA     N       110.000    3.000
 PU       CA     CB     HB1     109.470    3.000
 PU       CA     CB     HB2     109.470    3.000
 PU       CA     CB     CG      109.470    3.000
 PU       HB1    CB     HB2     107.900    3.000
 PU       HB1    CB     CG      109.470    3.000
 PU       HB2    CB     CG      109.470    3.000
 PU       CB     CG     CD2     120.000    3.000
 PU       CB     CG     CD1     120.000    3.000
 PU       CD2    CG     CD1     120.000    3.000
 PU       CG     CD2    HD2     120.000    3.000
 PU       CG     CD2    CE2     120.000    3.000
 PU       HD2    CD2    CE2     120.000    3.000
 PU       CD2    CE2    HE2     120.000    3.000
 PU       CD2    CE2    CZ      120.000    3.000
 PU       HE2    CE2    CZ      120.000    3.000
 PU       CE2    CZ     OC      120.000    3.000
 PU       CE2    CZ     CE1     120.000    3.000
 PU       OC     CZ     CE1     120.000    3.000
 PU       CZ     OC     CM      120.000    3.000
 PU       OC     CM     HM3     109.470    3.000
 PU       OC     CM     HM2     109.470    3.000
 PU       OC     CM     HM1     109.470    3.000
 PU       HM3    CM     HM2     109.470    3.000
 PU       HM3    CM     HM1     109.470    3.000
 PU       HM2    CM     HM1     109.470    3.000
 PU       CZ     CE1    HE1     120.000    3.000
 PU       CZ     CE1    CD1     120.000    3.000
 PU       HE1    CE1    CD1     120.000    3.000
 PU       CE1    CD1    HD1     120.000    3.000
 PU       CE1    CD1    CG      120.000    3.000
 PU       HD1    CD1    CG      120.000    3.000
 PU       CA     N      HN1     118.500    3.000
 PU       CA     N      P       120.000    3.000
 PU       HN1    N      P       120.000    3.000
 PU       N      P      OP1     109.500    3.000
 PU       N      P      OP2     109.500    3.000
 PU       N      P      OP3     109.500    3.000
 PU       OP1    P      OP2     109.500    3.000
 PU       OP1    P      OP3     109.500    3.000
 PU       OP2    P      OP3     109.500    3.000
 PU       P      OP2    HOP2    120.000    3.000
 PU       P      OP3    HOP3    120.000    3.000
 PU       C      "N3'"  "HN'3"  120.000    3.000
 PU       C      "N3'"  "C3'"   121.500    3.000
 PU       "HN'3" "N3'"  "C3'"   118.500    3.000
 PU       "N3'"  "C3'"  "H3'"   108.550    3.000
 PU       "N3'"  "C3'"  "C4'"   110.000    3.000
 PU       "N3'"  "C3'"  "C2'"   110.000    3.000
 PU       "H3'"  "C3'"  "C4'"   108.340    3.000
 PU       "H3'"  "C3'"  "C2'"   108.340    3.000
 PU       "C4'"  "C3'"  "C2'"   111.000    3.000
 PU       "C3'"  "C4'"  "H4'"   108.340    3.000
 PU       "C3'"  "C4'"  "C5'"   111.000    3.000
 PU       "C3'"  "C4'"  "O4'"   109.470    3.000
 PU       "H4'"  "C4'"  "C5'"   108.340    3.000
 PU       "H4'"  "C4'"  "O4'"   109.470    3.000
 PU       "C5'"  "C4'"  "O4'"   109.470    3.000
 PU       "C4'"  "C5'"  "H5'"   109.470    3.000
 PU       "C4'"  "C5'"  "H5''"  109.470    3.000
 PU       "C4'"  "C5'"  "O5'"   109.470    3.000
 PU       "H5'"  "C5'"  "H5''"  107.900    3.000
 PU       "H5'"  "C5'"  "O5'"   109.470    3.000
 PU       "H5''" "C5'"  "O5'"   109.470    3.000
 PU       "C5'"  "O5'"  "HO5'"  109.470    3.000
 PU       "C3'"  "C2'"  "H2'"   108.340    3.000
 PU       "C3'"  "C2'"  "O2'"   109.470    3.000
 PU       "C3'"  "C2'"  "C1'"   111.000    3.000
 PU       "H2'"  "C2'"  "O2'"   109.470    3.000
 PU       "H2'"  "C2'"  "C1'"   108.340    3.000
 PU       "O2'"  "C2'"  "C1'"   109.470    3.000
 PU       "C2'"  "O2'"  "HO2'"  109.470    3.000
 PU       "C2'"  "C1'"  "H1'"   108.340    3.000
 PU       "C2'"  "C1'"  "O4'"   109.470    3.000
 PU       "C2'"  "C1'"  N9      109.470    3.000
 PU       "H1'"  "C1'"  "O4'"   109.470    3.000
 PU       "H1'"  "C1'"  N9      109.470    3.000
 PU       "O4'"  "C1'"  N9      109.470    3.000
 PU       "C1'"  "O4'"  "C4'"   111.800    3.000
 PU       "C1'"  N9     C4      126.000    3.000
 PU       "C1'"  N9     C8      126.000    3.000
 PU       C4     N9     C8      108.000    3.000
 PU       N9     C4     C5      108.000    3.000
 PU       N9     C4     N3      132.000    3.000
 PU       C5     C4     N3      120.000    3.000
 PU       C4     C5     N7      108.000    3.000
 PU       C4     C5     C6      120.000    3.000
 PU       N7     C5     C6      132.000    3.000
 PU       C5     N7     C8      108.000    3.000
 PU       N7     C8     H8      126.000    3.000
 PU       N7     C8     N9      108.000    3.000
 PU       H8     C8     N9      126.000    3.000
 PU       C4     N3     C2      120.000    3.000
 PU       N3     C2     H2      120.000    3.000
 PU       N3     C2     N1      120.000    3.000
 PU       H2     C2     N1      120.000    3.000
 PU       C2     N1     C6      120.000    3.000
 PU       N1     C6     N6      120.000    3.000
 PU       N1     C6     C5      120.000    3.000
 PU       N6     C6     C5      120.000    3.000
 PU       C6     N6     C10     109.500    3.000
 PU       C6     N6     C9      109.500    3.000
 PU       C10    N6     C9      109.470    3.000
 PU       N6     C10    H103    109.470    3.000
 PU       N6     C10    H102    109.470    3.000
 PU       N6     C10    H101    109.470    3.000
 PU       H103   C10    H102    109.470    3.000
 PU       H103   C10    H101    109.470    3.000
 PU       H102   C10    H101    109.470    3.000
 PU       N6     C9     H93     109.470    3.000
 PU       N6     C9     H92     109.470    3.000
 PU       N6     C9     H91     109.470    3.000
 PU       H93    C9     H92     109.470    3.000
 PU       H93    C9     H91     109.470    3.000
 PU       H92    C9     H91     109.470    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 PU       var_1    O      C      CA     N        -30.023   20.000   3
 PU       var_2    C      CA     CB     CG      -179.963   20.000   3
 PU       var_3    CA     CB     CG     CD2      -89.995   20.000   2
 PU       CONST_1  CB     CG     CD1    CE1      180.000    0.000   0
 PU       CONST_2  CB     CG     CD2    CE2      180.000    0.000   0
 PU       CONST_3  CG     CD2    CE2    CZ         0.000    0.000   0
 PU       CONST_4  CD2    CE2    CZ     CE1        0.000    0.000   0
 PU       var_4    CE2    CZ     OC     CM        -0.262   20.000   1
 PU       var_5    CZ     OC     CM     HM1     -179.977   20.000   1
 PU       CONST_5  CE2    CZ     CE1    CD1        0.000    0.000   0
 PU       CONST_6  CZ     CE1    CD1    CG         0.000    0.000   0
 PU       var_6    C      CA     N      P       -119.958   20.000   3
 PU       var_7    CA     N      P      OP3       59.950   20.000   1
 PU       var_8    N      P      OP2    HOP2    -179.977   20.000   1
 PU       var_9    N      P      OP3    HOP3     -59.988   20.000   1
 PU       CONST_7  O      C      "N3'"  "C3'"      0.000    0.000   0
 PU       var_10   C      "N3'"  "C3'"  "C2'"    151.913   20.000   3
 PU       var_11   "N3'"  "C3'"  "C4'"  "C5'"     90.000   20.000   3
 PU       var_12   "C3'"  "C4'"  "O4'"  "C1'"     30.000   20.000   1
 PU       var_13   "C3'"  "C4'"  "C5'"  "O5'"    176.822   20.000   3
 PU       var_14   "C4'"  "C5'"  "O5'"  "HO5'"   179.966   20.000   1
 PU       var_15   "N3'"  "C3'"  "C2'"  "C1'"    120.000   20.000   3
 PU       var_16   "C3'"  "C2'"  "O2'"  "HO2'"  -179.991   20.000   1
 PU       var_17   "C3'"  "C2'"  "C1'"  N9       150.000   20.000   3
 PU       var_18   "C2'"  "C1'"  "O4'"  "C4'"    -30.000   20.000   1
 PU       var_19   "C2'"  "C1'"  N9     C4        89.684   20.000   1
 PU       CONST_8  "C1'"  N9     C8     N7       180.000    0.000   0
 PU       CONST_9  "C1'"  N9     C4     N3         0.000    0.000   0
 PU       CONST_10 N9     C4     C5     N7         0.000    0.000   0
 PU       CONST_11 C4     C5     C6     N1         0.000    0.000   0
 PU       CONST_12 C4     C5     N7     C8         0.000    0.000   0
 PU       CONST_13 C5     N7     C8     N9         0.000    0.000   0
 PU       CONST_14 N9     C4     N3     C2       180.000    0.000   0
 PU       CONST_15 C4     N3     C2     N1         0.000    0.000   0
 PU       CONST_16 N3     C2     N1     C6         0.000    0.000   0
 PU       CONST_17 C2     N1     C6     N6       180.000    0.000   0
 PU       var_20   N1     C6     N6     C9         0.070   20.000   1
 PU       var_21   C6     N6     C10    H101    -179.946   20.000   1
 PU       var_22   C6     N6     C9     H91      179.937   20.000   1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 PU       chir_01  CA     N      C      CB        positiv
 PU       chir_02  "C4'"  "C5'"  "O4'"  "C3'"     negativ
 PU       chir_03  "C3'"  "C4'"  "N3'"  "C2'"     negativ
 PU       chir_04  "C2'"  "C3'"  "O2'"  "C1'"     negativ
 PU       chir_05  "C1'"  "O4'"  "C2'"  N9        positiv
 PU       chir_06  N6     C6     C9     C10       negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 PU       plan-1    N         0.020
 PU       plan-1    P         0.020
 PU       plan-1    CA        0.020
 PU       plan-1    HN1       0.020
 PU       plan-2    C         0.020
 PU       plan-2    CA        0.020
 PU       plan-2    O         0.020
 PU       plan-2    "N3'"     0.020
 PU       plan-2    "HN'3"    0.020
 PU       plan-3    CG        0.020
 PU       plan-3    CB        0.020
 PU       plan-3    CD1       0.020
 PU       plan-3    CD2       0.020
 PU       plan-3    CE1       0.020
 PU       plan-3    CE2       0.020
 PU       plan-3    CZ        0.020
 PU       plan-3    HD1       0.020
 PU       plan-3    HD2       0.020
 PU       plan-3    HE1       0.020
 PU       plan-3    HE2       0.020
 PU       plan-3    OC        0.020
 PU       plan-4    "N3'"     0.020
 PU       plan-4    C         0.020
 PU       plan-4    "C3'"     0.020
 PU       plan-4    "HN'3"    0.020
 PU       plan-5    N9        0.020
 PU       plan-5    "C1'"     0.020
 PU       plan-5    C8        0.020
 PU       plan-5    C4        0.020
 PU       plan-5    N7        0.020
 PU       plan-5    H8        0.020
 PU       plan-5    C5        0.020
 PU       plan-5    C6        0.020
 PU       plan-5    N1        0.020
 PU       plan-5    C2        0.020
 PU       plan-5    N3        0.020
 PU       plan-5    N6        0.020
 PU       plan-5    H2        0.020
# ------------------------------------------------------