1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
PZ2 PZ2 '3-[2-bromo-4-(1H-pyrazolo[3,4-c]pyri' non-polymer 41 27 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_PZ2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
PZ2 BR26 BR BR 0.000 0.000 0.000 0.000
PZ2 C11 C CR6 0.000 -1.800 -0.010 0.582
PZ2 C12 C CR16 0.000 -2.525 1.166 0.608
PZ2 H12 H H 0.000 -2.063 2.094 0.294
PZ2 C13 C CR6 0.000 -3.840 1.159 1.034
PZ2 C14 C CR16 0.000 -4.433 -0.024 1.437
PZ2 H14 H H 0.000 -5.464 -0.028 1.770
PZ2 C15 C CR16 0.000 -3.712 -1.202 1.414
PZ2 H15 H H 0.000 -4.176 -2.128 1.730
PZ2 C10 C CR6 0.000 -2.392 -1.199 0.986
PZ2 O25 O O2 0.000 -1.682 -2.357 0.958
PZ2 C20 C CR6 0.000 -2.309 -3.499 1.347
PZ2 C19 C CR16 0.000 -2.985 -4.270 0.414
PZ2 H19 H H 0.000 -3.015 -3.964 -0.624
PZ2 C18 C CR6 0.000 -3.627 -5.440 0.819
PZ2 C23 C CSP 0.000 -4.328 -6.242 -0.139
PZ2 N24 N NS 0.000 -4.885 -6.878 -0.898
PZ2 C17 C CR16 0.000 -3.582 -5.828 2.159
PZ2 H17 H H 0.000 -4.078 -6.737 2.477
PZ2 C21 C CR16 0.000 -2.271 -3.892 2.677
PZ2 H21 H H 0.000 -1.741 -3.288 3.403
PZ2 C16 C CR6 0.000 -2.907 -5.054 3.079
PZ2 C22 C CH3 0.000 -2.866 -5.470 4.526
PZ2 H22B H H 0.000 -2.797 -4.609 5.139
PZ2 H22A H H 0.000 -3.748 -6.005 4.765
PZ2 H22 H H 0.000 -2.022 -6.089 4.692
PZ2 C27 C CH2 0.000 -4.629 2.442 1.060
PZ2 H27 H H 0.000 -3.954 3.280 1.242
PZ2 H27A H H 0.000 -5.372 2.395 1.859
PZ2 C7 C CR5 0.000 -5.324 2.633 -0.263
PZ2 C1 C CR56 0.000 -6.655 2.157 -0.612
PZ2 N9 N NRD5 0.000 -4.841 3.253 -1.303
PZ2 N8 N NR15 0.000 -5.769 3.235 -2.348
PZ2 HN8 H H 0.000 -5.629 3.663 -3.286
PZ2 C6 C CR56 0.000 -6.892 2.567 -1.942
PZ2 N5 N NRD6 0.000 -8.050 2.265 -2.513
PZ2 N4 N NRD6 0.000 -8.958 1.608 -1.885
PZ2 C3 C CR16 0.000 -8.817 1.187 -0.639
PZ2 H3 H H 0.000 -9.618 0.637 -0.162
PZ2 C2 C CR16 0.000 -7.660 1.443 0.052
PZ2 H2 H H 0.000 -7.529 1.105 1.072
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
PZ2 BR26 n/a C11 START
PZ2 C11 BR26 C12 .
PZ2 C12 C11 C13 .
PZ2 H12 C12 . .
PZ2 C13 C12 C27 .
PZ2 C14 C13 C15 .
PZ2 H14 C14 . .
PZ2 C15 C14 C10 .
PZ2 H15 C15 . .
PZ2 C10 C15 O25 .
PZ2 O25 C10 C20 .
PZ2 C20 O25 C21 .
PZ2 C19 C20 C18 .
PZ2 H19 C19 . .
PZ2 C18 C19 C17 .
PZ2 C23 C18 N24 .
PZ2 N24 C23 . .
PZ2 C17 C18 H17 .
PZ2 H17 C17 . .
PZ2 C21 C20 C16 .
PZ2 H21 C21 . .
PZ2 C16 C21 C22 .
PZ2 C22 C16 H22 .
PZ2 H22B C22 . .
PZ2 H22A C22 . .
PZ2 H22 C22 . .
PZ2 C27 C13 C7 .
PZ2 H27 C27 . .
PZ2 H27A C27 . .
PZ2 C7 C27 N9 .
PZ2 C1 C7 . .
PZ2 N9 C7 N8 .
PZ2 N8 N9 C6 .
PZ2 HN8 N8 . .
PZ2 C6 N8 N5 .
PZ2 N5 C6 N4 .
PZ2 N4 N5 C3 .
PZ2 C3 N4 C2 .
PZ2 H3 C3 . .
PZ2 C2 C3 H2 .
PZ2 H2 C2 . END
PZ2 C1 C2 . ADD
PZ2 C1 C6 . ADD
PZ2 C10 C11 . ADD
PZ2 C16 C17 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
PZ2 C1 C2 double 1.390 0.020
PZ2 C1 C6 single 1.490 0.020
PZ2 C1 C7 single 1.490 0.020
PZ2 C2 C3 single 1.390 0.020
PZ2 C3 N4 double 1.337 0.020
PZ2 N4 N5 single 1.400 0.020
PZ2 N5 C6 double 1.355 0.020
PZ2 C6 N8 single 1.340 0.020
PZ2 N9 C7 double 1.350 0.020
PZ2 C7 C27 single 1.510 0.020
PZ2 N8 N9 single 1.402 0.020
PZ2 C10 C11 double 1.487 0.020
PZ2 C10 C15 single 1.390 0.020
PZ2 O25 C10 single 1.370 0.020
PZ2 C12 C11 single 1.390 0.020
PZ2 C11 BR26 single 1.890 0.020
PZ2 C13 C12 double 1.390 0.020
PZ2 C14 C13 single 1.390 0.020
PZ2 C27 C13 single 1.511 0.020
PZ2 C15 C14 double 1.390 0.020
PZ2 C16 C17 double 1.390 0.020
PZ2 C16 C21 single 1.390 0.020
PZ2 C22 C16 single 1.506 0.020
PZ2 C17 C18 single 1.390 0.020
PZ2 C18 C19 double 1.390 0.020
PZ2 C23 C18 single 1.285 0.020
PZ2 C19 C20 single 1.390 0.020
PZ2 C21 C20 double 1.390 0.020
PZ2 C20 O25 single 1.370 0.020
PZ2 N24 C23 triple 1.158 0.020
PZ2 H2 C2 single 1.083 0.020
PZ2 H3 C3 single 1.083 0.020
PZ2 HN8 N8 single 1.040 0.020
PZ2 H12 C12 single 1.083 0.020
PZ2 H14 C14 single 1.083 0.020
PZ2 H15 C15 single 1.083 0.020
PZ2 H17 C17 single 1.083 0.020
PZ2 H19 C19 single 1.083 0.020
PZ2 H21 C21 single 1.083 0.020
PZ2 H22 C22 single 1.059 0.020
PZ2 H22A C22 single 1.059 0.020
PZ2 H22B C22 single 1.059 0.020
PZ2 H27 C27 single 1.092 0.020
PZ2 H27A C27 single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
PZ2 BR26 C11 C12 120.000 3.000
PZ2 BR26 C11 C10 120.000 3.000
PZ2 C12 C11 C10 120.000 3.000
PZ2 C11 C12 H12 120.000 3.000
PZ2 C11 C12 C13 120.000 3.000
PZ2 H12 C12 C13 120.000 3.000
PZ2 C12 C13 C14 120.000 3.000
PZ2 C12 C13 C27 120.000 3.000
PZ2 C14 C13 C27 120.000 3.000
PZ2 C13 C14 H14 120.000 3.000
PZ2 C13 C14 C15 120.000 3.000
PZ2 H14 C14 C15 120.000 3.000
PZ2 C14 C15 H15 120.000 3.000
PZ2 C14 C15 C10 120.000 3.000
PZ2 H15 C15 C10 120.000 3.000
PZ2 C15 C10 O25 120.000 3.000
PZ2 C15 C10 C11 120.000 3.000
PZ2 O25 C10 C11 120.000 3.000
PZ2 C10 O25 C20 120.000 3.000
PZ2 O25 C20 C19 120.000 3.000
PZ2 O25 C20 C21 120.000 3.000
PZ2 C19 C20 C21 120.000 3.000
PZ2 C20 C19 H19 120.000 3.000
PZ2 C20 C19 C18 120.000 3.000
PZ2 H19 C19 C18 120.000 3.000
PZ2 C19 C18 C23 120.000 3.000
PZ2 C19 C18 C17 120.000 3.000
PZ2 C23 C18 C17 120.000 3.000
PZ2 C18 C23 N24 180.000 3.000
PZ2 C18 C17 H17 120.000 3.000
PZ2 C18 C17 C16 120.000 3.000
PZ2 H17 C17 C16 120.000 3.000
PZ2 C20 C21 H21 120.000 3.000
PZ2 C20 C21 C16 120.000 3.000
PZ2 H21 C21 C16 120.000 3.000
PZ2 C21 C16 C22 120.000 3.000
PZ2 C21 C16 C17 120.000 3.000
PZ2 C22 C16 C17 120.000 3.000
PZ2 C16 C22 H22B 109.470 3.000
PZ2 C16 C22 H22A 109.470 3.000
PZ2 C16 C22 H22 109.470 3.000
PZ2 H22B C22 H22A 109.470 3.000
PZ2 H22B C22 H22 109.470 3.000
PZ2 H22A C22 H22 109.470 3.000
PZ2 C13 C27 H27 109.470 3.000
PZ2 C13 C27 H27A 109.470 3.000
PZ2 C13 C27 C7 109.500 3.000
PZ2 H27 C27 H27A 107.900 3.000
PZ2 H27 C27 C7 109.470 3.000
PZ2 H27A C27 C7 109.470 3.000
PZ2 C27 C7 C1 126.000 3.000
PZ2 C27 C7 N9 126.000 3.000
PZ2 C1 C7 N9 108.000 3.000
PZ2 C7 C1 C2 126.000 3.000
PZ2 C7 C1 C6 108.000 3.000
PZ2 C2 C1 C6 120.000 3.000
PZ2 C7 N9 N8 108.000 3.000
PZ2 N9 N8 HN8 108.000 3.000
PZ2 N9 N8 C6 108.000 3.000
PZ2 HN8 N8 C6 126.000 3.000
PZ2 N8 C6 N5 132.000 3.000
PZ2 N8 C6 C1 108.000 3.000
PZ2 N5 C6 C1 120.000 3.000
PZ2 C6 N5 N4 120.000 3.000
PZ2 N5 N4 C3 120.000 3.000
PZ2 N4 C3 H3 120.000 3.000
PZ2 N4 C3 C2 120.000 3.000
PZ2 H3 C3 C2 120.000 3.000
PZ2 C3 C2 H2 120.000 3.000
PZ2 C3 C2 C1 120.000 3.000
PZ2 H2 C2 C1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
PZ2 CONST_1 BR26 C11 C12 C13 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_2 C11 C12 C13 C27 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_3 C12 C13 C14 C15 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_4 C13 C14 C15 C10 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_5 C14 C15 C10 O25 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_6 C15 C10 C11 BR26 180.000 0.000 0
PZ2 var_1 C15 C10 O25 C20 0.546 20.000 1
PZ2 var_2 C10 O25 C20 C21 -90.144 20.000 1
PZ2 CONST_7 O25 C20 C19 C18 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_8 C20 C19 C18 C17 0.000 0.000 0
PZ2 var_3 C19 C18 C23 N24 -162.968 20.000 1
PZ2 CONST_9 C19 C18 C17 C16 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_10 O25 C20 C21 C16 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_11 C20 C21 C16 C22 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_12 C21 C16 C17 C18 0.000 0.000 0
PZ2 var_4 C21 C16 C22 H22 -90.279 20.000 1
PZ2 var_5 C12 C13 C27 C7 89.995 20.000 2
PZ2 var_6 C13 C27 C7 N9 -90.003 20.000 2
PZ2 CONST_13 C27 C7 C1 C2 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_14 C7 C1 C2 C3 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_15 C7 C1 C6 N8 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_16 C27 C7 N9 N8 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_17 C7 N9 N8 C6 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_18 N9 N8 C6 N5 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_19 N8 C6 N5 N4 180.000 0.000 0
PZ2 CONST_20 C6 N5 N4 C3 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_21 N5 N4 C3 C2 0.000 0.000 0
PZ2 CONST_22 N4 C3 C2 C1 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
PZ2 plan-1 C1 0.020
PZ2 plan-1 C2 0.020
PZ2 plan-1 C6 0.020
PZ2 plan-1 C7 0.020
PZ2 plan-1 N8 0.020
PZ2 plan-1 N9 0.020
PZ2 plan-1 C3 0.020
PZ2 plan-1 H2 0.020
PZ2 plan-1 N4 0.020
PZ2 plan-1 N5 0.020
PZ2 plan-1 H3 0.020
PZ2 plan-1 C27 0.020
PZ2 plan-1 HN8 0.020
PZ2 plan-2 C10 0.020
PZ2 plan-2 C11 0.020
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PZ2 plan-3 C19 0.020
PZ2 plan-3 C20 0.020
PZ2 plan-3 H17 0.020
PZ2 plan-3 C23 0.020
PZ2 plan-3 H19 0.020
PZ2 plan-3 O25 0.020
PZ2 plan-3 H21 0.020
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