1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
30E 30E '"(3R,4R)-1-[3-amino-6-(3,4,5-trimeth' non-polymer 57 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_30E
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
30E O30 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
30E C28 C C 0.000 -0.856 -0.437 -0.801
30E O29 O OC -0.500 -0.494 -1.044 -1.833
30E C27 C CH1 0.000 -2.323 -0.233 -0.522
30E H27 H H 0.000 -2.539 0.843 -0.461
30E C03 C CH1 0.000 -3.150 -0.859 -1.647
30E H03 H H 0.000 -2.922 -0.352 -2.595
30E C02 C CH2 0.000 -2.808 -2.345 -1.768
30E H021 H H 0.000 -3.113 -2.863 -0.856
30E H022 H H 0.000 -1.730 -2.460 -1.906
30E C01 C CH3 0.000 -3.544 -2.943 -2.968
30E H013 H H 0.000 -3.310 -3.974 -3.053
30E H012 H H 0.000 -4.591 -2.832 -2.836
30E H011 H H 0.000 -3.249 -2.442 -3.854
30E C26 C CH2 0.000 -2.690 -0.904 0.805
30E H261 H H 0.000 -2.133 -0.434 1.618
30E H262 H H 0.000 -2.438 -1.966 0.759
30E C25 C CH2 0.000 -4.191 -0.745 1.053
30E H251 H H 0.000 -4.439 0.317 1.114
30E H252 H H 0.000 -4.458 -1.234 1.992
30E N05 N NT 0.000 -4.939 -1.361 -0.051
30E C04 C CH2 0.000 -4.639 -0.702 -1.329
30E H042 H H 0.000 -4.887 0.359 -1.256
30E H041 H H 0.000 -5.232 -1.160 -2.122
30E C06 C CR6 0.000 -6.307 -1.351 0.206
30E C23 C CR6 0.000 -7.011 -2.559 0.307
30E N24 N NH2 0.000 -6.345 -3.771 0.150
30E H242 H H 0.000 -6.859 -4.648 0.132
30E H241 H H 0.000 -5.333 -3.797 0.050
30E N22 N NRD6 0.000 -8.313 -2.546 0.556
30E C21 C CR16 0.000 -8.949 -1.397 0.700
30E H21 H H 0.000 -10.014 -1.390 0.899
30E C08 C CR6 0.000 -8.256 -0.197 0.596
30E N07 N NRD6 0.000 -6.946 -0.202 0.350
30E C09 C CR6 0.000 -8.973 1.091 0.758
30E C20 C CR16 0.000 -8.300 2.295 0.557
30E H20 H H 0.000 -7.252 2.291 0.287
30E C17 C CR6 0.000 -8.974 3.495 0.703
30E O18 O O2 0.000 -8.319 4.671 0.503
30E C19 C CH3 0.000 -6.940 4.590 0.136
30E H193 H H 0.000 -6.846 4.053 -0.772
30E H192 H H 0.000 -6.550 5.567 0.009
30E H191 H H 0.000 -6.400 4.091 0.898
30E C14 C CR6 0.000 -10.318 3.501 1.061
30E O15 O O2 0.000 -10.977 4.682 1.210
30E C16 C CH3 0.000 -10.962 5.273 2.512
30E H163 H H 0.000 -9.962 5.467 2.801
30E H162 H H 0.000 -11.506 6.182 2.493
30E H161 H H 0.000 -11.408 4.610 3.207
30E C11 C CR6 0.000 -10.989 2.300 1.268
30E C10 C CR16 0.000 -10.320 1.098 1.118
30E H10 H H 0.000 -10.843 0.164 1.280
30E O12 O O2 0.000 -12.303 2.308 1.619
30E C13 C CH3 0.000 -12.929 1.039 1.816
30E H133 H H 0.000 -12.878 0.476 0.920
30E H132 H H 0.000 -12.431 0.515 2.591
30E H131 H H 0.000 -13.944 1.183 2.084
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
30E O30 n/a C28 START
30E C28 O30 C27 .
30E O29 C28 . .
30E C27 C28 C26 .
30E H27 C27 . .
30E C03 C27 C02 .
30E H03 C03 . .
30E C02 C03 C01 .
30E H021 C02 . .
30E H022 C02 . .
30E C01 C02 H011 .
30E H013 C01 . .
30E H012 C01 . .
30E H011 C01 . .
30E C26 C27 C25 .
30E H261 C26 . .
30E H262 C26 . .
30E C25 C26 N05 .
30E H251 C25 . .
30E H252 C25 . .
30E N05 C25 C06 .
30E C04 N05 H041 .
30E H042 C04 . .
30E H041 C04 . .
30E C06 N05 C23 .
30E C23 C06 N22 .
30E N24 C23 H241 .
30E H242 N24 . .
30E H241 N24 . .
30E N22 C23 C21 .
30E C21 N22 C08 .
30E H21 C21 . .
30E C08 C21 C09 .
30E N07 C08 . .
30E C09 C08 C20 .
30E C20 C09 C17 .
30E H20 C20 . .
30E C17 C20 C14 .
30E O18 C17 C19 .
30E C19 O18 H191 .
30E H193 C19 . .
30E H192 C19 . .
30E H191 C19 . .
30E C14 C17 C11 .
30E O15 C14 C16 .
30E C16 O15 H161 .
30E H163 C16 . .
30E H162 C16 . .
30E H161 C16 . .
30E C11 C14 O12 .
30E C10 C11 H10 .
30E H10 C10 . .
30E O12 C11 C13 .
30E C13 O12 H131 .
30E H133 C13 . .
30E H132 C13 . .
30E H131 C13 . END
30E C03 C04 . ADD
30E C06 N07 . ADD
30E C09 C10 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
30E C01 C02 single 1.513 0.020
30E C02 C03 single 1.524 0.020
30E C03 C04 single 1.524 0.020
30E C03 C27 single 1.524 0.020
30E C04 N05 single 1.469 0.020
30E C06 N05 single 1.405 0.020
30E N05 C25 single 1.469 0.020
30E C06 N07 double 1.350 0.020
30E C23 C06 single 1.487 0.020
30E N07 C08 single 1.350 0.020
30E C09 C08 single 1.487 0.020
30E C08 C21 double 1.390 0.020
30E C09 C10 single 1.390 0.020
30E C20 C09 double 1.390 0.020
30E C10 C11 double 1.390 0.020
30E O12 C11 single 1.370 0.020
30E C11 C14 single 1.487 0.020
30E C13 O12 single 1.426 0.020
30E O15 C14 single 1.370 0.020
30E C14 C17 double 1.487 0.020
30E C16 O15 single 1.426 0.020
30E O18 C17 single 1.370 0.020
30E C17 C20 single 1.390 0.020
30E C19 O18 single 1.426 0.020
30E C21 N22 single 1.337 0.020
30E N22 C23 double 1.350 0.020
30E N24 C23 single 1.355 0.020
30E C25 C26 single 1.524 0.020
30E C26 C27 single 1.524 0.020
30E C27 C28 single 1.500 0.020
30E O29 C28 deloc 1.250 0.020
30E C28 O30 deloc 1.250 0.020
30E H011 C01 single 1.059 0.020
30E H012 C01 single 1.059 0.020
30E H013 C01 single 1.059 0.020
30E H021 C02 single 1.092 0.020
30E H022 C02 single 1.092 0.020
30E H03 C03 single 1.099 0.020
30E H041 C04 single 1.092 0.020
30E H042 C04 single 1.092 0.020
30E H27 C27 single 1.099 0.020
30E H251 C25 single 1.092 0.020
30E H252 C25 single 1.092 0.020
30E H21 C21 single 1.083 0.020
30E H10 C10 single 1.083 0.020
30E H20 C20 single 1.083 0.020
30E H131 C13 single 1.059 0.020
30E H132 C13 single 1.059 0.020
30E H133 C13 single 1.059 0.020
30E H161 C16 single 1.059 0.020
30E H162 C16 single 1.059 0.020
30E H163 C16 single 1.059 0.020
30E H191 C19 single 1.059 0.020
30E H192 C19 single 1.059 0.020
30E H193 C19 single 1.059 0.020
30E H241 N24 single 1.010 0.020
30E H242 N24 single 1.010 0.020
30E H261 C26 single 1.092 0.020
30E H262 C26 single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
30E O30 C28 O29 123.000 3.000
30E O30 C28 C27 118.500 3.000
30E O29 C28 C27 118.500 3.000
30E C28 C27 H27 108.810 3.000
30E C28 C27 C03 109.470 3.000
30E C28 C27 C26 109.470 3.000
30E H27 C27 C03 108.340 3.000
30E H27 C27 C26 108.340 3.000
30E C03 C27 C26 111.000 3.000
30E C27 C03 H03 108.340 3.000
30E C27 C03 C02 111.000 3.000
30E C27 C03 C04 111.000 3.000
30E H03 C03 C02 108.340 3.000
30E H03 C03 C04 108.340 3.000
30E C02 C03 C04 109.470 3.000
30E C03 C02 H021 109.470 3.000
30E C03 C02 H022 109.470 3.000
30E C03 C02 C01 111.000 3.000
30E H021 C02 H022 107.900 3.000
30E H021 C02 C01 109.470 3.000
30E H022 C02 C01 109.470 3.000
30E C02 C01 H013 109.470 3.000
30E C02 C01 H012 109.470 3.000
30E C02 C01 H011 109.470 3.000
30E H013 C01 H012 109.470 3.000
30E H013 C01 H011 109.470 3.000
30E H012 C01 H011 109.470 3.000
30E C27 C26 H261 109.470 3.000
30E C27 C26 H262 109.470 3.000
30E C27 C26 C25 111.000 3.000
30E H261 C26 H262 107.900 3.000
30E H261 C26 C25 109.470 3.000
30E H262 C26 C25 109.470 3.000
30E C26 C25 H251 109.470 3.000
30E C26 C25 H252 109.470 3.000
30E C26 C25 N05 109.470 3.000
30E H251 C25 H252 107.900 3.000
30E H251 C25 N05 109.470 3.000
30E H252 C25 N05 109.470 3.000
30E C25 N05 C04 109.470 3.000
30E C25 N05 C06 109.500 3.000
30E C04 N05 C06 109.500 3.000
30E N05 C04 H042 109.470 3.000
30E N05 C04 H041 109.470 3.000
30E N05 C04 C03 109.500 3.000
30E H042 C04 H041 107.900 3.000
30E H042 C04 C03 109.470 3.000
30E H041 C04 C03 109.470 3.000
30E N05 C06 C23 120.000 3.000
30E N05 C06 N07 120.000 3.000
30E C23 C06 N07 120.000 3.000
30E C06 C23 N24 120.000 3.000
30E C06 C23 N22 120.000 3.000
30E N24 C23 N22 120.000 3.000
30E C23 N24 H242 120.000 3.000
30E C23 N24 H241 120.000 3.000
30E H242 N24 H241 120.000 3.000
30E C23 N22 C21 120.000 3.000
30E N22 C21 H21 120.000 3.000
30E N22 C21 C08 120.000 3.000
30E H21 C21 C08 120.000 3.000
30E C21 C08 N07 120.000 3.000
30E C21 C08 C09 120.000 3.000
30E N07 C08 C09 120.000 3.000
30E C08 N07 C06 120.000 3.000
30E C08 C09 C20 120.000 3.000
30E C08 C09 C10 120.000 3.000
30E C20 C09 C10 120.000 3.000
30E C09 C20 H20 120.000 3.000
30E C09 C20 C17 120.000 3.000
30E H20 C20 C17 120.000 3.000
30E C20 C17 O18 120.000 3.000
30E C20 C17 C14 120.000 3.000
30E O18 C17 C14 120.000 3.000
30E C17 O18 C19 120.000 3.000
30E O18 C19 H193 109.470 3.000
30E O18 C19 H192 109.470 3.000
30E O18 C19 H191 109.470 3.000
30E H193 C19 H192 109.470 3.000
30E H193 C19 H191 109.470 3.000
30E H192 C19 H191 109.470 3.000
30E C17 C14 O15 120.000 3.000
30E C17 C14 C11 120.000 3.000
30E O15 C14 C11 120.000 3.000
30E C14 O15 C16 120.000 3.000
30E O15 C16 H163 109.470 3.000
30E O15 C16 H162 109.470 3.000
30E O15 C16 H161 109.470 3.000
30E H163 C16 H162 109.470 3.000
30E H163 C16 H161 109.470 3.000
30E H162 C16 H161 109.470 3.000
30E C14 C11 C10 120.000 3.000
30E C14 C11 O12 120.000 3.000
30E C10 C11 O12 120.000 3.000
30E C11 C10 H10 120.000 3.000
30E C11 C10 C09 120.000 3.000
30E H10 C10 C09 120.000 3.000
30E C11 O12 C13 120.000 3.000
30E O12 C13 H133 109.470 3.000
30E O12 C13 H132 109.470 3.000
30E O12 C13 H131 109.470 3.000
30E H133 C13 H132 109.470 3.000
30E H133 C13 H131 109.470 3.000
30E H132 C13 H131 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
30E var_1 O30 C28 C27 C26 -60.268 20.000 3
30E var_2 C28 C27 C03 C02 60.000 20.000 3
30E var_3 C27 C03 C04 N05 -60.000 20.000 3
30E var_4 C27 C03 C02 C01 -175.216 20.000 3
30E var_5 C03 C02 C01 H011 60.038 20.000 3
30E var_6 C28 C27 C26 C25 180.000 20.000 3
30E var_7 C27 C26 C25 N05 60.000 20.000 3
30E var_8 C26 C25 N05 C06 180.000 20.000 1
30E var_9 C25 N05 C04 C03 60.000 20.000 1
30E var_10 C25 N05 C06 C23 -118.315 20.000 1
30E CONST_1 N05 C06 N07 C08 180.000 0.000 0
30E CONST_2 N05 C06 C23 N22 180.000 0.000 0
30E CONST_3 C06 C23 N24 H241 5.947 0.000 0
30E CONST_4 C06 C23 N22 C21 0.000 0.000 0
30E CONST_5 C23 N22 C21 C08 0.000 0.000 0
30E CONST_6 N22 C21 C08 C09 180.000 0.000 0
30E CONST_7 C21 C08 N07 C06 0.000 0.000 0
30E CONST_8 C21 C08 C09 C20 180.000 0.000 0
30E CONST_9 C08 C09 C10 C11 180.000 0.000 0
30E CONST_10 C08 C09 C20 C17 180.000 0.000 0
30E CONST_11 C09 C20 C17 C14 0.000 0.000 0
30E var_11 C20 C17 O18 C19 0.361 20.000 1
30E var_12 C17 O18 C19 H191 -60.073 20.000 1
30E CONST_12 C20 C17 C14 C11 0.000 0.000 0
30E var_13 C17 C14 O15 C16 -89.949 20.000 1
30E var_14 C14 O15 C16 H161 -60.037 20.000 1
30E CONST_13 C17 C14 C11 O12 180.000 0.000 0
30E CONST_14 C14 C11 C10 C09 0.000 0.000 0
30E var_15 C14 C11 O12 C13 -179.984 20.000 1
30E var_16 C11 O12 C13 H131 179.979 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
30E chir_01 C03 C02 C04 C27 negativ
30E chir_02 N05 C04 C06 C25 positiv
30E chir_03 C27 C03 C26 C28 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
30E plan-1 C06 0.020
30E plan-1 N05 0.020
30E plan-1 N07 0.020
30E plan-1 C23 0.020
30E plan-1 C08 0.020
30E plan-1 C21 0.020
30E plan-1 N22 0.020
30E plan-1 C09 0.020
30E plan-1 H21 0.020
30E plan-1 N24 0.020
30E plan-1 H242 0.020
30E plan-1 H241 0.020
30E plan-2 C09 0.020
30E plan-2 C08 0.020
30E plan-2 C10 0.020
30E plan-2 C20 0.020
30E plan-2 C11 0.020
30E plan-2 C14 0.020
30E plan-2 C17 0.020
30E plan-2 H10 0.020
30E plan-2 O12 0.020
30E plan-2 O15 0.020
30E plan-2 O18 0.020
30E plan-2 H20 0.020
30E plan-3 N24 0.020
30E plan-3 C23 0.020
30E plan-3 H241 0.020
30E plan-3 H242 0.020
30E plan-4 C28 0.020
30E plan-4 C27 0.020
30E plan-4 O29 0.020
30E plan-4 O30 0.020
# ------------------------------------------------------
|