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376
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378
|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
3F1 3F1 'N-{[4-(benzyloxy)phenyl](methyl)-lam' non-polymer 48 27 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_3F1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
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3F1 H7 H H 0.000 -2.553 5.267 -0.580
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3F1 H15 H H 0.000 -7.056 -3.577 0.882
3F1 C14 C CR16 0.000 -5.116 -2.677 0.855
3F1 H14 H H 0.000 -4.611 -3.577 1.183
3F1 O20 O O2 0.000 -8.482 -1.522 0.099
3F1 C21 C CH2 0.000 -9.080 -0.299 -0.335
3F1 H21 H H 0.000 -8.663 -0.014 -1.303
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3F1 C22 C CR6 0.000 -10.570 -0.487 -0.464
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3F1 H25 H H 0.000 -10.468 -1.095 -2.514
3F1 C26 C CR16 0.000 -12.480 -1.075 -1.782
3F1 H26 H H 0.000 -12.906 -1.402 -2.723
3F1 C27 C CR16 0.000 -13.303 -0.831 -0.699
3F1 H27 H H 0.000 -14.374 -0.970 -0.790
3F1 C24 C CR16 0.000 -12.760 -0.408 0.500
3F1 H24 H H 0.000 -13.406 -0.211 1.347
3F1 C23 C CR16 0.000 -11.394 -0.236 0.618
3F1 H23 H H 0.000 -10.969 0.095 1.557
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
3F1 O16 n/a S10 START
3F1 S10 O16 N11 .
3F1 O5 S10 . .
3F1 C9 S10 C8 .
3F1 C4 C9 C3 .
3F1 H4 C4 . .
3F1 C3 C4 H3 .
3F1 H3 C3 . .
3F1 C8 C9 C7 .
3F1 H8 C8 . .
3F1 C7 C8 C2 .
3F1 H7 C7 . .
3F1 C2 C7 C1 .
3F1 C1 C2 H1 .
3F1 H1B C1 . .
3F1 H1A C1 . .
3F1 H1 C1 . .
3F1 N11 S10 S12 .
3F1 S12 N11 C13 .
3F1 C6 S12 H6 .
3F1 H6B C6 . .
3F1 H6A C6 . .
3F1 H6 C6 . .
3F1 C13 S12 C17 .
3F1 C17 C13 C18 .
3F1 H17 C17 . .
3F1 C18 C17 C19 .
3F1 H18 C18 . .
3F1 C19 C18 O20 .
3F1 C15 C19 C14 .
3F1 H15 C15 . .
3F1 C14 C15 H14 .
3F1 H14 C14 . .
3F1 O20 C19 C21 .
3F1 C21 O20 C22 .
3F1 H21 C21 . .
3F1 H21A C21 . .
3F1 C22 C21 C25 .
3F1 C25 C22 C26 .
3F1 H25 C25 . .
3F1 C26 C25 C27 .
3F1 H26 C26 . .
3F1 C27 C26 C24 .
3F1 H27 C27 . .
3F1 C24 C27 C23 .
3F1 H24 C24 . .
3F1 C23 C24 H23 .
3F1 H23 C23 . END
3F1 C2 C3 . ADD
3F1 C13 C14 . ADD
3F1 C22 C23 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
3F1 C1 C2 single 1.506 0.020
3F1 C2 C3 double 1.390 0.020
3F1 C2 C7 single 1.390 0.020
3F1 C3 C4 single 1.390 0.020
3F1 C4 C9 double 1.390 0.020
3F1 O5 S10 double 1.436 0.020
3F1 C6 S12 single 1.707 0.020
3F1 C7 C8 double 1.390 0.020
3F1 C8 C9 single 1.390 0.020
3F1 C9 S10 single 1.595 0.020
3F1 N11 S10 single 1.520 0.020
3F1 S10 O16 double 1.436 0.020
3F1 S12 N11 double 1.565 0.020
3F1 C13 S12 single 1.640 0.020
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3F1 C15 C19 double 1.390 0.020
3F1 C18 C17 double 1.390 0.020
3F1 C19 C18 single 1.390 0.020
3F1 O20 C19 single 1.370 0.020
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3F1 C24 C27 double 1.390 0.020
3F1 C26 C25 double 1.390 0.020
3F1 C27 C26 single 1.390 0.020
3F1 H1 C1 single 1.059 0.020
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3F1 H6A C6 single 1.059 0.020
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3F1 H7 C7 single 1.083 0.020
3F1 H8 C8 single 1.083 0.020
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3F1 H15 C15 single 1.083 0.020
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3F1 H18 C18 single 1.083 0.020
3F1 H21 C21 single 1.092 0.020
3F1 H21A C21 single 1.092 0.020
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3F1 H25 C25 single 1.083 0.020
3F1 H26 C26 single 1.083 0.020
3F1 H27 C27 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
3F1 O16 S10 O5 109.500 3.000
3F1 O16 S10 C9 109.500 3.000
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3F1 O5 S10 N11 109.500 3.000
3F1 C9 S10 N11 109.500 3.000
3F1 S10 C9 C4 120.000 3.000
3F1 S10 C9 C8 120.000 3.000
3F1 C4 C9 C8 120.000 3.000
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3F1 C2 C1 H1 109.470 3.000
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3F1 H1B C1 H1 109.470 3.000
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3F1 S12 C6 H6 109.500 3.000
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3F1 C21 C22 C23 120.000 3.000
3F1 C25 C22 C23 120.000 3.000
3F1 C22 C25 H25 120.000 3.000
3F1 C22 C25 C26 120.000 3.000
3F1 H25 C25 C26 120.000 3.000
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3F1 C24 C23 H23 120.000 3.000
3F1 C24 C23 C22 120.000 3.000
3F1 H23 C23 C22 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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3F1 CONST_4 C9 C8 C7 C2 0.000 0.000 0
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3F1 CONST_6 C7 C2 C3 C4 0.000 0.000 0
3F1 var_2 C7 C2 C1 H1 -90.267 20.000 1
3F1 var_3 O16 S10 N11 S12 -66.392 20.000 1
3F1 var_4 S10 N11 S12 C13 -120.011 20.000 1
3F1 var_5 N11 S12 C6 H6 60.036 20.000 1
3F1 var_6 N11 S12 C13 C17 16.530 20.000 1
3F1 CONST_7 S12 C13 C14 C15 180.000 0.000 0
3F1 CONST_8 S12 C13 C17 C18 180.000 0.000 0
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3F1 var_7 C18 C19 O20 C21 0.207 20.000 1
3F1 var_8 C19 O20 C21 C22 179.981 20.000 1
3F1 var_9 O20 C21 C22 C25 -90.271 20.000 2
3F1 CONST_13 C21 C22 C23 C24 180.000 0.000 0
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3F1 CONST_18 C27 C24 C23 C22 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
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_chem_comp_chir.volume_sign
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3F1 chir_02 S12 C6 N11 C13 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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3F1 plan-1 C9 0.020
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3F1 plan-1 H4 0.020
3F1 plan-1 H7 0.020
3F1 plan-1 H8 0.020
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3F1 plan-4 H27 0.020
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