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303
|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
3HT 3HT '5-[1-(4-methoxyphenyl)-1H-benzimidaz' non-polymer 35 23 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_3HT
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
3HT S22 S S1 0.000 0.000 0.000 0.000
3HT C21 C CR5 0.000 -1.711 0.039 -0.021
3HT O32 O O2 0.000 -2.532 -1.023 0.049
3HT C18 C CR5 0.000 -3.810 -0.590 0.006
3HT N19 N NRD5 0.000 -3.817 0.708 -0.095
3HT N20 N NR15 0.000 -2.484 1.142 -0.114
3HT HN20 H H 0.000 -2.153 2.125 -0.188
3HT C15 C CR6 0.000 -5.010 -1.453 0.058
3HT C14 C CR16 0.000 -4.869 -2.842 0.159
3HT H14 H H 0.000 -3.879 -3.280 0.199
3HT C16 C CR16 0.000 -6.279 -0.882 0.005
3HT H16 H H 0.000 -6.390 0.193 -0.073
3HT C17 C CR56 0.000 -7.399 -1.697 0.054
3HT C12 C CR56 0.000 -7.248 -3.091 0.156
3HT N11 N NRD5 0.000 -8.497 -3.623 0.183
3HT C13 C CR16 0.000 -5.966 -3.649 0.208
3HT H13 H H 0.000 -5.846 -4.722 0.288
3HT N9 N NR5 0.000 -8.760 -1.459 0.033
3HT C10 C CR15 0.000 -9.381 -2.670 0.114
3HT H10 H H 0.000 -10.454 -2.817 0.121
3HT C6 C CR6 0.000 -9.386 -0.207 -0.056
3HT C5 C CR16 0.000 -10.385 0.005 -0.997
3HT H5 H H 0.000 -10.680 -0.796 -1.663
3HT C7 C CR16 0.000 -9.008 0.820 0.798
3HT H7 H H 0.000 -8.230 0.656 1.532
3HT C8 C CR16 0.000 -9.625 2.052 0.710
3HT H8 H H 0.000 -9.334 2.852 1.380
3HT C3 C CR6 0.000 -10.618 2.265 -0.235
3HT C4 C CR16 0.000 -11.001 1.238 -1.084
3HT H4 H H 0.000 -11.783 1.402 -1.815
3HT O2 O O2 0.000 -11.225 3.479 -0.320
3HT C1 C CH3 0.000 -10.782 4.491 0.585
3HT H1B H H 0.000 -10.935 4.166 1.582
3HT H1A H H 0.000 -9.751 4.678 0.430
3HT H1 H H 0.000 -11.330 5.382 0.417
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
3HT S22 n/a C21 START
3HT C21 S22 O32 .
3HT O32 C21 C18 .
3HT C18 O32 C15 .
3HT N19 C18 N20 .
3HT N20 N19 HN20 .
3HT HN20 N20 . .
3HT C15 C18 C16 .
3HT C14 C15 H14 .
3HT H14 C14 . .
3HT C16 C15 C17 .
3HT H16 C16 . .
3HT C17 C16 N9 .
3HT C12 C17 C13 .
3HT N11 C12 . .
3HT C13 C12 H13 .
3HT H13 C13 . .
3HT N9 C17 C6 .
3HT C10 N9 H10 .
3HT H10 C10 . .
3HT C6 N9 C7 .
3HT C5 C6 H5 .
3HT H5 C5 . .
3HT C7 C6 C8 .
3HT H7 C7 . .
3HT C8 C7 C3 .
3HT H8 C8 . .
3HT C3 C8 O2 .
3HT C4 C3 H4 .
3HT H4 C4 . .
3HT O2 C3 C1 .
3HT C1 O2 H1 .
3HT H1B C1 . .
3HT H1A C1 . .
3HT H1 C1 . END
3HT C4 C5 . ADD
3HT C10 N11 . ADD
3HT C13 C14 . ADD
3HT C21 N20 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
3HT C4 C3 double 1.390 0.020
3HT C4 C5 single 1.390 0.020
3HT H4 C4 single 1.083 0.020
3HT C5 C6 double 1.390 0.020
3HT H5 C5 single 1.083 0.020
3HT C7 C6 single 1.390 0.020
3HT C6 N9 single 1.337 0.020
3HT C8 C7 double 1.390 0.020
3HT H7 C7 single 1.083 0.020
3HT C3 C8 single 1.390 0.020
3HT H8 C8 single 1.083 0.020
3HT C10 N9 single 1.337 0.020
3HT C10 N11 double 1.350 0.020
3HT H10 C10 single 1.083 0.020
3HT C13 C12 single 1.390 0.020
3HT C13 C14 double 1.390 0.020
3HT H13 C13 single 1.083 0.020
3HT C16 C15 double 1.390 0.020
3HT C15 C18 single 1.490 0.020
3HT C14 C15 single 1.390 0.020
3HT N9 C17 single 1.337 0.020
3HT C17 C16 single 1.390 0.020
3HT C12 C17 double 1.490 0.020
3HT C21 S22 double 1.645 0.020
3HT O32 C21 single 1.370 0.020
3HT C21 N20 single 1.340 0.020
3HT N20 N19 single 1.402 0.020
3HT HN20 N20 single 1.040 0.020
3HT N19 C18 double 1.350 0.020
3HT C18 O32 single 1.370 0.020
3HT H14 C14 single 1.083 0.020
3HT H16 C16 single 1.083 0.020
3HT N11 C12 single 1.350 0.020
3HT O2 C3 single 1.370 0.020
3HT C1 O2 single 1.426 0.020
3HT H1 C1 single 1.059 0.020
3HT H1A C1 single 1.059 0.020
3HT H1B C1 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
3HT S22 C21 O32 108.000 3.000
3HT S22 C21 N20 126.000 3.000
3HT O32 C21 N20 108.000 3.000
3HT C21 O32 C18 108.000 3.000
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3HT O32 C18 C15 126.000 3.000
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3HT C18 N19 N20 108.000 3.000
3HT N19 N20 HN20 108.000 3.000
3HT N19 N20 C21 108.000 3.000
3HT HN20 N20 C21 126.000 3.000
3HT C18 C15 C14 120.000 3.000
3HT C18 C15 C16 120.000 3.000
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3HT H14 C14 C13 120.000 3.000
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3HT N9 C10 N11 108.000 3.000
3HT H10 C10 N11 126.000 3.000
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3HT N9 C6 C7 132.000 3.000
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3HT H5 C5 C4 120.000 3.000
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3HT C7 C8 C3 120.000 3.000
3HT H8 C8 C3 120.000 3.000
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3HT C3 O2 C1 120.000 3.000
3HT O2 C1 H1B 109.470 3.000
3HT O2 C1 H1A 109.470 3.000
3HT O2 C1 H1 109.470 3.000
3HT H1B C1 H1A 109.470 3.000
3HT H1B C1 H1 109.470 3.000
3HT H1A C1 H1 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
3HT CONST_1 S22 C21 N20 N19 180.000 0.000 0
3HT CONST_2 S22 C21 O32 C18 180.000 0.000 0
3HT CONST_3 C21 O32 C18 C15 180.000 0.000 0
3HT CONST_4 O32 C18 N19 N20 0.000 0.000 0
3HT CONST_5 C18 N19 N20 C21 0.000 0.000 0
3HT var_1 O32 C18 C15 C16 179.970 20.000 1
3HT CONST_6 C18 C15 C14 C13 180.000 0.000 0
3HT CONST_7 C18 C15 C16 C17 180.000 0.000 0
3HT CONST_8 C15 C16 C17 N9 180.000 0.000 0
3HT CONST_9 C16 C17 C12 C13 0.000 0.000 0
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3HT CONST_11 C17 C12 C13 C14 0.000 0.000 0
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3HT CONST_15 N9 C10 N11 C12 0.000 0.000 0
3HT var_2 C17 N9 C6 C7 -50.021 20.000 1
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3HT CONST_20 C8 C3 C4 C5 0.000 0.000 0
3HT CONST_21 C3 C4 C5 C6 0.000 0.000 0
3HT var_3 C8 C3 O2 C1 0.574 20.000 1
3HT var_4 C3 O2 C1 H1 -179.972 20.000 1
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
3HT plan-1 C4 0.020
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# ------------------------------------------------------
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