1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
3N3 3N3 '(2S)-1-[(benzyloxy)carbonyl]-2,3-dih' non-polymer 36 22 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_3N3
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
3N3 O22 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
3N3 C21 C C 0.000 -1.094 -0.509 -0.140
3N3 O23 O O2 0.000 -2.203 0.176 0.200
3N3 C24 C CH2 0.000 -2.014 1.516 0.727
3N3 H24 H H 0.000 -1.505 2.131 -0.018
3N3 H24A H H 0.000 -1.408 1.468 1.634
3N3 C27 C CR6 0.000 -3.356 2.123 1.049
3N3 C36 C CR16 0.000 -3.905 1.956 2.307
3N3 H36 H H 0.000 -3.373 1.387 3.059
3N3 C34 C CR16 0.000 -5.134 2.516 2.604
3N3 H34 H H 0.000 -5.562 2.391 3.591
3N3 C32 C CR16 0.000 -5.817 3.234 1.641
3N3 H32 H H 0.000 -6.781 3.670 1.873
3N3 C30 C CR16 0.000 -5.270 3.397 0.381
3N3 H30 H H 0.000 -5.805 3.960 -0.373
3N3 C28 C CR16 0.000 -4.040 2.841 0.085
3N3 H28 H H 0.000 -3.611 2.967 -0.901
3N3 N1 N N 0.000 -1.200 -1.758 -0.634
3N3 C8 C CR6 0.000 -2.403 -2.441 -0.837
3N3 C9 C CR16 0.000 -3.712 -2.020 -0.595
3N3 H9 H H 0.000 -3.895 -1.031 -0.193
3N3 C11 C CR16 0.000 -4.772 -2.857 -0.866
3N3 H11 H H 0.000 -5.785 -2.524 -0.676
3N3 C13 C CR16 0.000 -4.548 -4.121 -1.381
3N3 H13 H H 0.000 -5.384 -4.776 -1.595
3N3 C15 C CR16 0.000 -3.255 -4.546 -1.621
3N3 H15 H H 0.000 -3.078 -5.536 -2.022
3N3 C7 C CR6 0.000 -2.189 -3.710 -1.352
3N3 C4 C CH2 0.000 -0.700 -3.916 -1.518
3N3 H4 H H 0.000 -0.429 -4.088 -2.562
3N3 H4A H H 0.000 -0.335 -4.744 -0.907
3N3 C2 C CH1 0.000 -0.070 -2.602 -1.033
3N3 H2 H H 0.000 0.589 -2.789 -0.173
3N3 C17 C C 0.000 0.702 -1.948 -2.150
3N3 O18 O OC -0.500 0.172 -1.041 -2.829
3N3 O19 O OC -0.500 1.872 -2.313 -2.399
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
3N3 O22 n/a C21 START
3N3 C21 O22 N1 .
3N3 O23 C21 C24 .
3N3 C24 O23 C27 .
3N3 H24 C24 . .
3N3 H24A C24 . .
3N3 C27 C24 C36 .
3N3 C36 C27 C34 .
3N3 H36 C36 . .
3N3 C34 C36 C32 .
3N3 H34 C34 . .
3N3 C32 C34 C30 .
3N3 H32 C32 . .
3N3 C30 C32 C28 .
3N3 H30 C30 . .
3N3 C28 C30 H28 .
3N3 H28 C28 . .
3N3 N1 C21 C8 .
3N3 C8 N1 C9 .
3N3 C9 C8 C11 .
3N3 H9 C9 . .
3N3 C11 C9 C13 .
3N3 H11 C11 . .
3N3 C13 C11 C15 .
3N3 H13 C13 . .
3N3 C15 C13 C7 .
3N3 H15 C15 . .
3N3 C7 C15 C4 .
3N3 C4 C7 C2 .
3N3 H4 C4 . .
3N3 H4A C4 . .
3N3 C2 C4 C17 .
3N3 H2 C2 . .
3N3 C17 C2 O19 .
3N3 O18 C17 . .
3N3 O19 C17 . END
3N3 N1 C2 . ADD
3N3 C7 C8 . ADD
3N3 C27 C28 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
3N3 N1 C2 single 1.455 0.020
3N3 N1 C21 single 1.330 0.020
3N3 C8 N1 single 1.400 0.020
3N3 C17 C2 single 1.500 0.020
3N3 C2 C4 single 1.524 0.020
3N3 H2 C2 single 1.099 0.020
3N3 C4 C7 single 1.511 0.020
3N3 H4 C4 single 1.092 0.020
3N3 H4A C4 single 1.092 0.020
3N3 C7 C8 double 1.487 0.020
3N3 C7 C15 single 1.390 0.020
3N3 C9 C8 single 1.390 0.020
3N3 C11 C9 double 1.390 0.020
3N3 H9 C9 single 1.083 0.020
3N3 C13 C11 single 1.390 0.020
3N3 H11 C11 single 1.083 0.020
3N3 C15 C13 double 1.390 0.020
3N3 H13 C13 single 1.083 0.020
3N3 H15 C15 single 1.083 0.020
3N3 O18 C17 deloc 1.250 0.020
3N3 O19 C17 deloc 1.250 0.020
3N3 C21 O22 double 1.220 0.020
3N3 O23 C21 single 1.454 0.020
3N3 C24 O23 single 1.426 0.020
3N3 C27 C24 single 1.511 0.020
3N3 H24 C24 single 1.092 0.020
3N3 H24A C24 single 1.092 0.020
3N3 C27 C28 double 1.390 0.020
3N3 C36 C27 single 1.390 0.020
3N3 C28 C30 single 1.390 0.020
3N3 H28 C28 single 1.083 0.020
3N3 C30 C32 double 1.390 0.020
3N3 H30 C30 single 1.083 0.020
3N3 C32 C34 single 1.390 0.020
3N3 H32 C32 single 1.083 0.020
3N3 C34 C36 double 1.390 0.020
3N3 H34 C34 single 1.083 0.020
3N3 H36 C36 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
3N3 O22 C21 O23 119.000 3.000
3N3 O22 C21 N1 123.000 3.000
3N3 O23 C21 N1 120.000 3.000
3N3 C21 O23 C24 120.000 3.000
3N3 O23 C24 H24 109.470 3.000
3N3 O23 C24 H24A 109.470 3.000
3N3 O23 C24 C27 109.470 3.000
3N3 H24 C24 H24A 107.900 3.000
3N3 H24 C24 C27 109.470 3.000
3N3 H24A C24 C27 109.470 3.000
3N3 C24 C27 C36 120.000 3.000
3N3 C24 C27 C28 120.000 3.000
3N3 C36 C27 C28 120.000 3.000
3N3 C27 C36 H36 120.000 3.000
3N3 C27 C36 C34 120.000 3.000
3N3 H36 C36 C34 120.000 3.000
3N3 C36 C34 H34 120.000 3.000
3N3 C36 C34 C32 120.000 3.000
3N3 H34 C34 C32 120.000 3.000
3N3 C34 C32 H32 120.000 3.000
3N3 C34 C32 C30 120.000 3.000
3N3 H32 C32 C30 120.000 3.000
3N3 C32 C30 H30 120.000 3.000
3N3 C32 C30 C28 120.000 3.000
3N3 H30 C30 C28 120.000 3.000
3N3 C30 C28 H28 120.000 3.000
3N3 C30 C28 C27 120.000 3.000
3N3 H28 C28 C27 120.000 3.000
3N3 C21 N1 C8 120.000 3.000
3N3 C21 N1 C2 121.000 3.000
3N3 C8 N1 C2 120.000 3.000
3N3 N1 C8 C9 120.000 3.000
3N3 N1 C8 C7 120.000 3.000
3N3 C9 C8 C7 120.000 3.000
3N3 C8 C9 H9 120.000 3.000
3N3 C8 C9 C11 120.000 3.000
3N3 H9 C9 C11 120.000 3.000
3N3 C9 C11 H11 120.000 3.000
3N3 C9 C11 C13 120.000 3.000
3N3 H11 C11 C13 120.000 3.000
3N3 C11 C13 H13 120.000 3.000
3N3 C11 C13 C15 120.000 3.000
3N3 H13 C13 C15 120.000 3.000
3N3 C13 C15 H15 120.000 3.000
3N3 C13 C15 C7 120.000 3.000
3N3 H15 C15 C7 120.000 3.000
3N3 C15 C7 C4 120.000 3.000
3N3 C15 C7 C8 120.000 3.000
3N3 C4 C7 C8 120.000 3.000
3N3 C7 C4 H4 109.470 3.000
3N3 C7 C4 H4A 109.470 3.000
3N3 C7 C4 C2 109.470 3.000
3N3 H4 C4 H4A 107.900 3.000
3N3 H4 C4 C2 109.470 3.000
3N3 H4A C4 C2 109.470 3.000
3N3 C4 C2 H2 108.340 3.000
3N3 C4 C2 C17 109.470 3.000
3N3 C4 C2 N1 105.000 3.000
3N3 H2 C2 C17 108.810 3.000
3N3 H2 C2 N1 109.470 3.000
3N3 C17 C2 N1 111.600 3.000
3N3 C2 C17 O18 118.500 3.000
3N3 C2 C17 O19 118.500 3.000
3N3 O18 C17 O19 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
3N3 var_1 O22 C21 O23 C24 -0.025 20.000 1
3N3 var_2 C21 O23 C24 C27 -179.975 20.000 1
3N3 var_3 O23 C24 C27 C36 90.024 20.000 2
3N3 CONST_1 C24 C27 C28 C30 180.000 0.000 0
3N3 CONST_2 C24 C27 C36 C34 180.000 0.000 0
3N3 CONST_3 C27 C36 C34 C32 0.000 0.000 0
3N3 CONST_4 C36 C34 C32 C30 0.000 0.000 0
3N3 CONST_5 C34 C32 C30 C28 0.000 0.000 0
3N3 CONST_6 C32 C30 C28 C27 0.000 0.000 0
3N3 CONST_7 O22 C21 N1 C8 180.000 0.000 0
3N3 var_4 C21 N1 C2 C4 180.000 20.000 3
3N3 var_5 C21 N1 C8 C9 0.000 20.000 1
3N3 CONST_8 N1 C8 C9 C11 180.000 0.000 0
3N3 CONST_9 C8 C9 C11 C13 0.000 0.000 0
3N3 CONST_10 C9 C11 C13 C15 0.000 0.000 0
3N3 CONST_11 C11 C13 C15 C7 0.000 0.000 0
3N3 CONST_12 C13 C15 C7 C4 180.000 0.000 0
3N3 CONST_13 C15 C7 C8 N1 180.000 0.000 0
3N3 var_6 C15 C7 C4 C2 180.000 20.000 2
3N3 var_7 C7 C4 C2 C17 -120.000 20.000 3
3N3 var_8 C4 C2 C17 O19 -82.788 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
3N3 chir_01 C2 N1 C4 C17 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
3N3 plan-1 N1 0.020
3N3 plan-1 C2 0.020
3N3 plan-1 C8 0.020
3N3 plan-1 C21 0.020
3N3 plan-2 C7 0.020
3N3 plan-2 C4 0.020
3N3 plan-2 C8 0.020
3N3 plan-2 C15 0.020
3N3 plan-2 C9 0.020
3N3 plan-2 C11 0.020
3N3 plan-2 C13 0.020
3N3 plan-2 N1 0.020
3N3 plan-2 H9 0.020
3N3 plan-2 H11 0.020
3N3 plan-2 H13 0.020
3N3 plan-2 H15 0.020
3N3 plan-3 C17 0.020
3N3 plan-3 C2 0.020
3N3 plan-3 O18 0.020
3N3 plan-3 O19 0.020
3N3 plan-4 C21 0.020
3N3 plan-4 N1 0.020
3N3 plan-4 O22 0.020
3N3 plan-4 O23 0.020
3N3 plan-5 C27 0.020
3N3 plan-5 C24 0.020
3N3 plan-5 C28 0.020
3N3 plan-5 C36 0.020
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3N3 plan-5 H28 0.020
3N3 plan-5 H30 0.020
3N3 plan-5 H32 0.020
3N3 plan-5 H34 0.020
3N3 plan-5 H36 0.020
# ------------------------------------------------------
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