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285
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
7GP 7GP 'ETHYL-N-(BETA-D-GLUCOPYRANOSYL)OXAMA' non-polymer 36 19 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_7GP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
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7GP C8 C C 0.000 -0.595 0.552 -0.952
7GP O9 O O2 -0.500 0.059 1.157 -1.831
7GP C9 C CH2 0.000 1.557 1.264 -1.812
7GP H91 H H 0.000 1.965 0.251 -1.829
7GP H92 H H 0.000 1.846 1.756 -0.881
7GP C10 C CH3 0.000 2.104 2.056 -3.001
7GP H103 H H 0.000 3.162 2.103 -2.943
7GP H102 H H 0.000 1.824 1.580 -3.907
7GP H101 H H 0.000 1.709 3.040 -2.987
7GP C7 C C 0.000 -2.085 0.490 -1.040
7GP O7 O O 0.000 -2.661 1.025 -1.964
7GP N1 N NH1 0.000 -2.789 -0.163 -0.093
7GP HN1 H H 0.000 -2.309 -0.609 0.675
7GP C1 C CH1 0.000 -4.249 -0.224 -0.179
7GP H1 H H 0.000 -4.559 -0.108 -1.227
7GP O5 O O2 0.000 -4.815 0.826 0.602
7GP C5 C CH1 0.000 -6.219 0.845 0.350
7GP H5 H H 0.000 -6.395 0.890 -0.734
7GP C6 C CH2 0.000 -6.840 2.073 1.017
7GP H61 H H 0.000 -6.589 2.076 2.080
7GP H62 H H 0.000 -7.926 2.040 0.901
7GP O6 O OH1 0.000 -6.330 3.258 0.402
7GP HO6 H H 0.000 -6.723 4.034 0.824
7GP C4 C CH1 0.000 -6.864 -0.422 0.917
7GP H4 H H 0.000 -6.669 -0.481 1.997
7GP O4 O OH1 0.000 -8.274 -0.386 0.687
7GP HO4 H H 0.000 -8.679 -1.186 1.046
7GP C3 C CH1 0.000 -6.259 -1.646 0.220
7GP H3 H H 0.000 -6.542 -1.643 -0.842
7GP O3 O OH1 0.000 -6.742 -2.839 0.842
7GP HO3 H H 0.000 -6.359 -3.610 0.401
7GP C2 C CH1 0.000 -4.733 -1.578 0.347
7GP H2 H H 0.000 -4.446 -1.686 1.403
7GP O2 O OH1 0.000 -4.142 -2.628 -0.421
7GP HO2 H H 0.000 -3.179 -2.583 -0.339
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
7GP O8 n/a C8 START
7GP C8 O8 C7 .
7GP O9 C8 C9 .
7GP C9 O9 C10 .
7GP H91 C9 . .
7GP H92 C9 . .
7GP C10 C9 H101 .
7GP H103 C10 . .
7GP H102 C10 . .
7GP H101 C10 . .
7GP C7 C8 N1 .
7GP O7 C7 . .
7GP N1 C7 C1 .
7GP HN1 N1 . .
7GP C1 N1 O5 .
7GP H1 C1 . .
7GP O5 C1 C5 .
7GP C5 O5 C4 .
7GP H5 C5 . .
7GP C6 C5 O6 .
7GP H61 C6 . .
7GP H62 C6 . .
7GP O6 C6 HO6 .
7GP HO6 O6 . .
7GP C4 C5 C3 .
7GP H4 C4 . .
7GP O4 C4 HO4 .
7GP HO4 O4 . .
7GP C3 C4 C2 .
7GP H3 C3 . .
7GP O3 C3 HO3 .
7GP HO3 O3 . .
7GP C2 C3 O2 .
7GP H2 C2 . .
7GP O2 C2 HO2 .
7GP HO2 O2 . END
7GP C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
7GP C1 C2 single 1.524 0.020
7GP O5 C1 single 1.426 0.020
7GP C1 N1 single 1.450 0.020
7GP H1 C1 single 1.099 0.020
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7GP C2 C3 single 1.524 0.020
7GP H2 C2 single 1.099 0.020
7GP HO2 O2 single 0.967 0.020
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7GP C3 C4 single 1.524 0.020
7GP H3 C3 single 1.099 0.020
7GP HO3 O3 single 0.967 0.020
7GP O4 C4 single 1.432 0.020
7GP C4 C5 single 1.524 0.020
7GP H4 C4 single 1.099 0.020
7GP HO4 O4 single 0.967 0.020
7GP C5 O5 single 1.426 0.020
7GP C6 C5 single 1.524 0.020
7GP H5 C5 single 1.099 0.020
7GP O6 C6 single 1.432 0.020
7GP H61 C6 single 1.092 0.020
7GP H62 C6 single 1.092 0.020
7GP HO6 O6 single 0.967 0.020
7GP N1 C7 single 1.330 0.020
7GP HN1 N1 single 1.010 0.020
7GP O7 C7 double 1.220 0.020
7GP C7 C8 single 1.460 0.020
7GP C8 O8 deloc 1.220 0.020
7GP O9 C8 deloc 1.454 0.020
7GP C9 O9 single 1.426 0.020
7GP C10 C9 single 1.513 0.020
7GP H91 C9 single 1.092 0.020
7GP H92 C9 single 1.092 0.020
7GP H101 C10 single 1.059 0.020
7GP H102 C10 single 1.059 0.020
7GP H103 C10 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
7GP O8 C8 O9 119.000 3.000
7GP O8 C8 C7 120.500 3.000
7GP O9 C8 C7 120.000 3.000
7GP C8 O9 C9 120.000 3.000
7GP O9 C9 H91 109.470 3.000
7GP O9 C9 H92 109.470 3.000
7GP O9 C9 C10 109.470 3.000
7GP H91 C9 H92 107.900 3.000
7GP H91 C9 C10 109.470 3.000
7GP H92 C9 C10 109.470 3.000
7GP C9 C10 H103 109.470 3.000
7GP C9 C10 H102 109.470 3.000
7GP C9 C10 H101 109.470 3.000
7GP H103 C10 H102 109.470 3.000
7GP H103 C10 H101 109.470 3.000
7GP H102 C10 H101 109.470 3.000
7GP C8 C7 O7 120.500 3.000
7GP C8 C7 N1 120.000 3.000
7GP O7 C7 N1 123.000 3.000
7GP C7 N1 HN1 120.000 3.000
7GP C7 N1 C1 121.500 3.000
7GP HN1 N1 C1 118.500 3.000
7GP N1 C1 H1 108.550 3.000
7GP N1 C1 O5 109.500 3.000
7GP N1 C1 C2 110.000 3.000
7GP H1 C1 O5 109.470 3.000
7GP H1 C1 C2 108.340 3.000
7GP O5 C1 C2 109.470 3.000
7GP C1 O5 C5 111.800 3.000
7GP O5 C5 H5 109.470 3.000
7GP O5 C5 C6 109.470 3.000
7GP O5 C5 C4 109.470 3.000
7GP H5 C5 C6 108.340 3.000
7GP H5 C5 C4 108.340 3.000
7GP C6 C5 C4 111.000 3.000
7GP C5 C6 H61 109.470 3.000
7GP C5 C6 H62 109.470 3.000
7GP C5 C6 O6 109.470 3.000
7GP H61 C6 H62 107.900 3.000
7GP H61 C6 O6 109.470 3.000
7GP H62 C6 O6 109.470 3.000
7GP C6 O6 HO6 109.470 3.000
7GP C5 C4 H4 108.340 3.000
7GP C5 C4 O4 109.470 3.000
7GP C5 C4 C3 111.000 3.000
7GP H4 C4 O4 109.470 3.000
7GP H4 C4 C3 108.340 3.000
7GP O4 C4 C3 109.470 3.000
7GP C4 O4 HO4 109.470 3.000
7GP C4 C3 H3 108.340 3.000
7GP C4 C3 O3 109.470 3.000
7GP C4 C3 C2 111.000 3.000
7GP H3 C3 O3 109.470 3.000
7GP H3 C3 C2 108.340 3.000
7GP O3 C3 C2 109.470 3.000
7GP C3 O3 HO3 109.470 3.000
7GP C3 C2 H2 108.340 3.000
7GP C3 C2 O2 109.470 3.000
7GP C3 C2 C1 111.000 3.000
7GP H2 C2 O2 109.470 3.000
7GP H2 C2 C1 108.340 3.000
7GP O2 C2 C1 109.470 3.000
7GP C2 O2 HO2 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
7GP var_1 O8 C8 O9 C9 0.053 20.000 1
7GP var_2 C8 O9 C9 C10 179.980 20.000 1
7GP var_3 O9 C9 C10 H101 60.004 20.000 3
7GP var_4 O8 C8 C7 N1 -0.077 20.000 1
7GP CONST_1 C8 C7 N1 C1 180.000 0.000 0
7GP var_5 C7 N1 C1 O5 -94.825 20.000 3
7GP var_6 N1 C1 C2 C3 180.000 20.000 3
7GP var_7 N1 C1 O5 C5 180.000 20.000 1
7GP var_8 C1 O5 C5 C4 60.000 20.000 1
7GP var_9 O5 C5 C6 O6 65.013 20.000 3
7GP var_10 C5 C6 O6 HO6 179.994 20.000 1
7GP var_11 O5 C5 C4 C3 -60.000 20.000 3
7GP var_12 C5 C4 O4 HO4 -179.967 20.000 1
7GP var_13 C5 C4 C3 C2 60.000 20.000 3
7GP var_14 C4 C3 O3 HO3 -179.988 20.000 1
7GP var_15 C4 C3 C2 O2 180.000 20.000 3
7GP var_16 C3 C2 O2 HO2 -179.986 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
7GP chir_01 C1 C2 O5 N1 negativ
7GP chir_02 C2 C1 O2 C3 positiv
7GP chir_03 C3 C2 O3 C4 negativ
7GP chir_04 C4 C3 O4 C5 positiv
7GP chir_05 C5 C4 O5 C6 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
7GP plan-1 N1 0.020
7GP plan-1 C1 0.020
7GP plan-1 C7 0.020
7GP plan-1 HN1 0.020
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7GP plan-2 N1 0.020
7GP plan-2 O7 0.020
7GP plan-2 C8 0.020
7GP plan-2 HN1 0.020
7GP plan-3 C8 0.020
7GP plan-3 C7 0.020
7GP plan-3 O8 0.020
7GP plan-3 O9 0.020
# ------------------------------------------------------
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