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|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
7PA 7PA 'PROPANE-1,3-DIYLBIS(PHOSPHONIC ACID)' non-polymer 21 11 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_7PA
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
7PA O3 O O 0.000 0.000 0.000 0.000
7PA P1 P P 0.000 -0.662 -0.921 0.964
7PA O4 O OH1 0.000 0.155 -2.255 1.347
7PA HO4 H H 0.000 1.065 -2.189 1.668
7PA O6 O OH1 0.000 -1.064 -0.289 2.389
7PA HO6 H H 0.000 -0.399 0.172 2.919
7PA C1 C CH2 0.000 -2.234 -1.583 0.373
7PA H11 H H 0.000 -2.612 -2.257 1.145
7PA H12 H H 0.000 -2.024 -2.153 -0.535
7PA C2 C CH2 0.000 -3.277 -0.516 0.074
7PA H21 H H 0.000 -2.840 0.177 -0.648
7PA H22 H H 0.000 -3.482 0.013 1.007
7PA C3 C CH2 0.000 -4.575 -1.082 -0.486
7PA H31 H H 0.000 -4.963 -1.791 0.249
7PA H32 H H 0.000 -4.325 -1.615 -1.406
7PA P2 P P 0.000 -5.827 0.172 -0.835
7PA O1 O O 0.000 -6.238 0.955 0.363
7PA O5 O OH1 0.000 -5.157 1.009 -2.036
7PA HO5 H H 0.000 -5.613 1.780 -2.401
7PA O2 O OH1 0.000 -6.985 -0.684 -1.556
7PA HO2 H H 0.000 -7.808 -0.253 -1.825
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
7PA O3 n/a P1 START
7PA P1 O3 C1 .
7PA O4 P1 HO4 .
7PA HO4 O4 . .
7PA O6 P1 HO6 .
7PA HO6 O6 . .
7PA C1 P1 C2 .
7PA H11 C1 . .
7PA H12 C1 . .
7PA C2 C1 C3 .
7PA H21 C2 . .
7PA H22 C2 . .
7PA C3 C2 P2 .
7PA H31 C3 . .
7PA H32 C3 . .
7PA P2 C3 O2 .
7PA O1 P2 . .
7PA O5 P2 HO5 .
7PA HO5 O5 . .
7PA O2 P2 HO2 .
7PA HO2 O2 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
7PA O1 P2 double 1.480 0.020
7PA O2 P2 single 1.610 0.020
7PA HO2 O2 single 0.967 0.020
7PA C2 C1 single 1.524 0.020
7PA C1 P1 single 1.812 0.020
7PA H11 C1 single 1.092 0.020
7PA H12 C1 single 1.092 0.020
7PA C3 C2 single 1.524 0.020
7PA H21 C2 single 1.092 0.020
7PA H22 C2 single 1.092 0.020
7PA P1 O3 double 1.480 0.020
7PA O4 P1 single 1.610 0.020
7PA O6 P1 single 1.610 0.020
7PA P2 C3 single 1.812 0.020
7PA H31 C3 single 1.092 0.020
7PA H32 C3 single 1.092 0.020
7PA O5 P2 single 1.610 0.020
7PA HO4 O4 single 0.967 0.020
7PA HO5 O5 single 0.967 0.020
7PA HO6 O6 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.value_angle_esd
7PA O3 P1 O4 109.500 3.000
7PA O3 P1 O6 109.500 3.000
7PA O3 P1 C1 109.500 3.000
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7PA O4 P1 C1 109.500 3.000
7PA O6 P1 C1 109.500 3.000
7PA P1 O4 HO4 120.000 3.000
7PA P1 O6 HO6 120.000 3.000
7PA P1 C1 H11 109.500 3.000
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7PA P1 C1 C2 109.500 3.000
7PA H11 C1 H12 107.900 3.000
7PA H11 C1 C2 109.470 3.000
7PA H12 C1 C2 109.470 3.000
7PA C1 C2 H21 109.470 3.000
7PA C1 C2 H22 109.470 3.000
7PA C1 C2 C3 111.000 3.000
7PA H21 C2 H22 107.900 3.000
7PA H21 C2 C3 109.470 3.000
7PA H22 C2 C3 109.470 3.000
7PA C2 C3 H31 109.470 3.000
7PA C2 C3 H32 109.470 3.000
7PA C2 C3 P2 109.500 3.000
7PA H31 C3 H32 107.900 3.000
7PA H31 C3 P2 109.500 3.000
7PA H32 C3 P2 109.500 3.000
7PA C3 P2 O1 109.500 3.000
7PA C3 P2 O5 109.500 3.000
7PA C3 P2 O2 109.500 3.000
7PA O1 P2 O5 109.500 3.000
7PA O1 P2 O2 109.500 3.000
7PA O5 P2 O2 109.500 3.000
7PA P2 O5 HO5 120.000 3.000
7PA P2 O2 HO2 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
7PA var_1 O3 P1 O4 HO4 53.183 20.000 1
7PA var_2 O3 P1 O6 HO6 -53.092 20.000 1
7PA var_3 O3 P1 C1 C2 -59.997 20.000 1
7PA var_4 P1 C1 C2 C3 177.268 20.000 3
7PA var_5 C1 C2 C3 P2 179.594 20.000 3
7PA var_6 C2 C3 P2 O2 173.777 20.000 1
7PA var_7 C3 P2 O5 HO5 -177.680 20.000 1
7PA var_8 C3 P2 O2 HO2 177.758 20.000 1
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