File: 9GP.cif

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global_
_lib_name         ?
_lib_version      ?
_lib_update       ?
# ------------------------------------------------
#
# ---   LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
9GP      9GP 'N-(hydroxyacetyl)-beta-D-glucopyrano' non-polymer        31  16 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_9GP
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
 9GP           O7     O    O         0.000      0.000    0.000    0.000
 9GP           C7     C    C         0.000     -0.298    0.473   -1.077
 9GP           C9     C    CH2       0.000      0.773    0.747   -2.101
 9GP           H9     H    H         0.000      0.781    1.811   -2.344
 9GP           H9A    H    H         0.000      0.567    0.170   -3.005
 9GP           O9     O    OH1       0.000      2.046    0.368   -1.573
 9GP           HO9    H    H         0.000      2.732    0.544   -2.231
 9GP           N1     N    NH1       0.000     -1.585    0.755   -1.356
 9GP           HN1    H    H         0.000     -1.833    1.149   -2.253
 9GP           C1     C    CH1       0.000     -2.626    0.489   -0.360
 9GP           H1     H    H         0.000     -2.182    0.500    0.645
 9GP           C2     C    CH1       0.000     -3.709    1.567   -0.453
 9GP           H2     H    H         0.000     -4.125    1.584   -1.470
 9GP           O2     O    OH1       0.000     -3.141    2.842   -0.148
 9GP           HO2    H    H         0.000     -2.435    3.038   -0.778
 9GP           O5     O    O2        0.000     -3.209   -0.792   -0.609
 9GP           C5     C    CH1       0.000     -4.223   -1.164    0.326
 9GP           H5     H    H         0.000     -3.801   -1.174    1.340
 9GP           C6     C    CH2       0.000     -4.751   -2.558   -0.022
 9GP           H6     H    H         0.000     -5.089   -2.569   -1.060
 9GP           H6A    H    H         0.000     -5.588   -2.803    0.635
 9GP           O6     O    OH1       0.000     -3.709   -3.519    0.152
 9GP           HO6    H    H         0.000     -4.043   -4.399   -0.068
 9GP           C4     C    CH1       0.000     -5.371   -0.152    0.259
 9GP           H4     H    H         0.000     -5.820   -0.171   -0.743
 9GP           O4     O    OH1       0.000     -6.360   -0.489    1.234
 9GP           HO4    H    H         0.000     -7.081    0.153    1.195
 9GP           C3     C    CH1       0.000     -4.823    1.248    0.550
 9GP           H3     H    H         0.000     -4.419    1.281    1.572
 9GP           O3     O    OH1       0.000     -5.873    2.209    0.419
 9GP           HO3    H    H         0.000     -5.524    3.093    0.595
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
 9GP      O7     n/a    C7     START
 9GP      C7     O7     N1     .
 9GP      C9     C7     O9     .
 9GP      H9     C9     .      .
 9GP      H9A    C9     .      .
 9GP      O9     C9     HO9    .
 9GP      HO9    O9     .      .
 9GP      N1     C7     C1     .
 9GP      HN1    N1     .      .
 9GP      C1     N1     O5     .
 9GP      H1     C1     .      .
 9GP      C2     C1     O2     .
 9GP      H2     C2     .      .
 9GP      O2     C2     HO2    .
 9GP      HO2    O2     .      .
 9GP      O5     C1     C5     .
 9GP      C5     O5     C4     .
 9GP      H5     C5     .      .
 9GP      C6     C5     O6     .
 9GP      H6     C6     .      .
 9GP      H6A    C6     .      .
 9GP      O6     C6     HO6    .
 9GP      HO6    O6     .      .
 9GP      C4     C5     C3     .
 9GP      H4     C4     .      .
 9GP      O4     C4     HO4    .
 9GP      HO4    O4     .      .
 9GP      C3     C4     O3     .
 9GP      H3     C3     .      .
 9GP      O3     C3     HO3    .
 9GP      HO3    O3     .      END
 9GP      C2     C3     .    ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
 9GP      O2     C2        single      1.432    0.020
 9GP      HO2    O2        single      0.967    0.020
 9GP      C2     C3        single      1.524    0.020
 9GP      C2     C1        single      1.524    0.020
 9GP      H2     C2        single      1.099    0.020
 9GP      O3     C3        single      1.432    0.020
 9GP      C3     C4        single      1.524    0.020
 9GP      H3     C3        single      1.099    0.020
 9GP      HO3    O3        single      0.967    0.020
 9GP      O4     C4        single      1.432    0.020
 9GP      C4     C5        single      1.524    0.020
 9GP      H4     C4        single      1.099    0.020
 9GP      HO4    O4        single      0.967    0.020
 9GP      C6     C5        single      1.524    0.020
 9GP      C5     O5        single      1.426    0.020
 9GP      H5     C5        single      1.099    0.020
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 9GP      C1     N1        single      1.450    0.020
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 9GP      N1     C7        single      1.330    0.020
 9GP      HN1    N1        single      1.010    0.020
 9GP      C7     O7        double      1.220    0.020
 9GP      C9     C7        single      1.510    0.020
 9GP      O9     C9        single      1.432    0.020
 9GP      H9     C9        single      1.092    0.020
 9GP      H9A    C9        single      1.092    0.020
 9GP      HO9    O9        single      0.967    0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
 9GP      O7     C7     C9      120.500    3.000
 9GP      O7     C7     N1      123.000    3.000
 9GP      C9     C7     N1      116.500    3.000
 9GP      C7     C9     H9      109.470    3.000
 9GP      C7     C9     H9A     109.470    3.000
 9GP      C7     C9     O9      109.500    3.000
 9GP      H9     C9     H9A     107.900    3.000
 9GP      H9     C9     O9      109.470    3.000
 9GP      H9A    C9     O9      109.470    3.000
 9GP      C9     O9     HO9     109.470    3.000
 9GP      C7     N1     HN1     120.000    3.000
 9GP      C7     N1     C1      121.500    3.000
 9GP      HN1    N1     C1      118.500    3.000
 9GP      N1     C1     H1      108.550    3.000
 9GP      N1     C1     C2      110.000    3.000
 9GP      N1     C1     O5      109.500    3.000
 9GP      H1     C1     C2      108.340    3.000
 9GP      H1     C1     O5      109.470    3.000
 9GP      C2     C1     O5      109.470    3.000
 9GP      C1     C2     H2      108.340    3.000
 9GP      C1     C2     O2      109.470    3.000
 9GP      C1     C2     C3      111.000    3.000
 9GP      H2     C2     O2      109.470    3.000
 9GP      H2     C2     C3      108.340    3.000
 9GP      O2     C2     C3      109.470    3.000
 9GP      C2     O2     HO2     109.470    3.000
 9GP      C1     O5     C5      111.800    3.000
 9GP      O5     C5     H5      109.470    3.000
 9GP      O5     C5     C6      109.470    3.000
 9GP      O5     C5     C4      109.470    3.000
 9GP      H5     C5     C6      108.340    3.000
 9GP      H5     C5     C4      108.340    3.000
 9GP      C6     C5     C4      111.000    3.000
 9GP      C5     C6     H6      109.470    3.000
 9GP      C5     C6     H6A     109.470    3.000
 9GP      C5     C6     O6      109.470    3.000
 9GP      H6     C6     H6A     107.900    3.000
 9GP      H6     C6     O6      109.470    3.000
 9GP      H6A    C6     O6      109.470    3.000
 9GP      C6     O6     HO6     109.470    3.000
 9GP      C5     C4     H4      108.340    3.000
 9GP      C5     C4     O4      109.470    3.000
 9GP      C5     C4     C3      111.000    3.000
 9GP      H4     C4     O4      109.470    3.000
 9GP      H4     C4     C3      108.340    3.000
 9GP      O4     C4     C3      109.470    3.000
 9GP      C4     O4     HO4     109.470    3.000
 9GP      C4     C3     H3      108.340    3.000
 9GP      C4     C3     O3      109.470    3.000
 9GP      C4     C3     C2      111.000    3.000
 9GP      H3     C3     O3      109.470    3.000
 9GP      H3     C3     C2      108.340    3.000
 9GP      O3     C3     C2      109.470    3.000
 9GP      C3     O3     HO3     109.470    3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
 9GP      var_1    O7     C7     C9     O9        -0.041   20.000   3
 9GP      var_2    C7     C9     O9     HO9     -179.997   20.000   1
 9GP      CONST_1  O7     C7     N1     C1         0.000    0.000   0
 9GP      var_3    C7     N1     C1     O5       -95.050   20.000   3
 9GP      var_4    N1     C1     C2     O2       -60.000   20.000   3
 9GP      var_5    C1     C2     C3     C4       -60.000   20.000   3
 9GP      var_6    C1     C2     O2     HO2       59.941   20.000   1
 9GP      var_7    N1     C1     O5     C5       180.000   20.000   1
 9GP      var_8    C1     O5     C5     C4        60.000   20.000   1
 9GP      var_9    O5     C5     C6     O6        65.082   20.000   3
 9GP      var_10   C5     C6     O6     HO6     -180.000   20.000   1
 9GP      var_11   O5     C5     C4     C3       -60.000   20.000   3
 9GP      var_12   C5     C4     O4     HO4      179.667   20.000   1
 9GP      var_13   C5     C4     C3     O3       180.000   20.000   3
 9GP      var_14   C4     C3     O3     HO3     -179.513   20.000   1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
 9GP      chir_01  C2     O2     C3     C1        positiv
 9GP      chir_02  C3     C2     O3     C4        negativ
 9GP      chir_03  C4     C3     O4     C5        positiv
 9GP      chir_04  C5     C4     C6     O5        negativ
 9GP      chir_05  C1     C2     O5     N1        negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
 9GP      plan-1    N1        0.020
 9GP      plan-1    C1        0.020
 9GP      plan-1    C7        0.020
 9GP      plan-1    HN1       0.020
 9GP      plan-2    C7        0.020
 9GP      plan-2    N1        0.020
 9GP      plan-2    O7        0.020
 9GP      plan-2    C9        0.020
 9GP      plan-2    HN1       0.020
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