1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
A49 A49 'N-{1-[(1-carbamoylcyclopropyl)methyl' non-polymer 62 32 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_A49
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
A49 F22 F F 0.000 0.000 0.000 0.000
A49 C8 C CT 0.000 0.336 -1.300 -0.395
A49 F23 F F 0.000 1.722 -1.472 -0.301
A49 F21 F F 0.000 -0.070 -1.505 -1.718
A49 C7 C CT 0.000 -0.365 -2.308 0.517
A49 C9 C CH3 0.000 0.164 -3.713 0.225
A49 H9B H H 0.000 1.208 -3.743 0.403
A49 H9A H H 0.000 -0.321 -4.412 0.856
A49 H9 H H 0.000 -0.028 -3.961 -0.787
A49 O10 O OH1 0.000 -0.106 -1.977 1.882
A49 HO10 H H 0.000 -0.619 -1.194 2.126
A49 C1 C CR6 0.000 -1.850 -2.267 0.263
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A49 H2 H H 0.000 -1.963 -4.338 -0.265
A49 C3 C CR16 0.000 -3.871 -3.383 -0.370
A49 H3 H H 0.000 -4.389 -4.282 -0.682
A49 C6 C CR16 0.000 -2.543 -1.080 0.424
A49 H6 H H 0.000 -2.018 -0.185 0.732
A49 C5 C CR16 0.000 -3.902 -1.035 0.193
A49 H5 H H 0.000 -4.444 -0.106 0.319
A49 C4 C CR6 0.000 -4.578 -2.191 -0.205
A49 C11 C C 0.000 -6.035 -2.150 -0.455
A49 O13 O O 0.000 -6.532 -2.899 -1.273
A49 N12 N N 0.000 -6.812 -1.282 0.224
A49 C15 C CH1 0.000 -8.184 -1.651 0.578
A49 H15 H H 0.000 -8.811 -0.857 1.008
A49 C24 C CH2 0.000 -8.891 -2.680 -0.306
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A49 C25 C CH2 0.000 -8.423 -3.070 1.097
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A49 H25 H H 0.000 -9.039 -3.030 1.998
A49 C14 C CH1 0.000 -6.282 0.028 0.608
A49 H14 H H 0.000 -7.112 0.695 0.881
A49 C16 C CH2 0.000 -5.339 -0.130 1.804
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A49 C17 C CH2 0.000 -4.742 1.233 2.162
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A49 C20 C CH2 0.000 -5.507 0.631 -0.567
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A49 C19 C CH2 0.000 -4.906 1.973 -0.140
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A49 H19A H H 0.000 -4.342 2.399 -0.972
A49 N2 N NT 0.000 -4.010 1.767 1.006
A49 C26 C CH2 0.000 -3.309 3.010 1.355
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A49 C31 C CT 0.000 -3.230 3.914 0.125
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A49 H12 H H 0.000 -5.313 4.923 0.449
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A49 C10 C CH2 0.000 -3.218 5.426 0.359
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A49 H10 H H 0.000 -2.419 5.880 -0.232
A49 C13 C C 0.000 -2.412 3.381 -1.023
A49 O1 O O 0.000 -2.944 2.730 -1.897
A49 N1 N NH2 0.000 -1.089 3.632 -1.081
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A49 HN1 H H 0.000 -0.534 3.275 -1.850
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
A49 F22 n/a C8 START
A49 C8 F22 C7 .
A49 F23 C8 . .
A49 F21 C8 . .
A49 C7 C8 C1 .
A49 C9 C7 H9 .
A49 H9B C9 . .
A49 H9A C9 . .
A49 H9 C9 . .
A49 O10 C7 HO10 .
A49 HO10 O10 . .
A49 C1 C7 C6 .
A49 C2 C1 C3 .
A49 H2 C2 . .
A49 C3 C2 H3 .
A49 H3 C3 . .
A49 C6 C1 C5 .
A49 H6 C6 . .
A49 C5 C6 C4 .
A49 H5 C5 . .
A49 C4 C5 C11 .
A49 C11 C4 N12 .
A49 O13 C11 . .
A49 N12 C11 C14 .
A49 C15 N12 C24 .
A49 H15 C15 . .
A49 C24 C15 C25 .
A49 H24 C24 . .
A49 H24A C24 . .
A49 C25 C24 H25 .
A49 H25A C25 . .
A49 H25 C25 . .
A49 C14 N12 C20 .
A49 H14 C14 . .
A49 C16 C14 C17 .
A49 H16 C16 . .
A49 H16A C16 . .
A49 C17 C16 H17 .
A49 H17A C17 . .
A49 H17 C17 . .
A49 C20 C14 C19 .
A49 H20 C20 . .
A49 H20A C20 . .
A49 C19 C20 N2 .
A49 H19 C19 . .
A49 H19A C19 . .
A49 N2 C19 C26 .
A49 C26 N2 C31 .
A49 H26 C26 . .
A49 H26A C26 . .
A49 C31 C26 C13 .
A49 C12 C31 C10 .
A49 H12 C12 . .
A49 H12A C12 . .
A49 C10 C12 H10 .
A49 H10A C10 . .
A49 H10 C10 . .
A49 C13 C31 N1 .
A49 O1 C13 . .
A49 N1 C13 HN1 .
A49 HN1A N1 . .
A49 HN1 N1 . END
A49 C31 C10 . ADD
A49 N2 C17 . ADD
A49 C15 C25 . ADD
A49 C4 C3 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
A49 O1 C13 double 1.220 0.020
A49 N1 C13 single 1.332 0.020
A49 C13 C31 single 1.507 0.020
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A49 HN1A N1 single 1.010 0.020
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A49 C31 C10 single 1.524 0.020
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loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
A49 F22 C8 F23 109.470 3.000
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A49 H24A C24 C25 109.470 3.000
A49 C24 C25 H25A 109.470 3.000
A49 C24 C25 H25 109.470 3.000
A49 C24 C25 C15 60.000 3.000
A49 H25A C25 H25 107.900 3.000
A49 H25A C25 C15 109.470 3.000
A49 H25 C25 C15 109.470 3.000
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_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_tor.value_angle_esd
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_chem_comp_chir.id
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_chem_comp_chir.volume_sign
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A49 chir_02 N2 C26 C17 C19 negativ
A49 chir_03 C14 C16 C20 N12 negativ
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loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
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_chem_comp_plane_atom.dist_esd
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