1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
A58 A58 '"4-(6-{[(4-METHYLCYCLOHEXYL)AMINO]ME' non-polymer 56 30 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_A58
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
A58 O30 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
A58 C28 C C 0.000 -0.917 -0.401 -0.750
A58 O29 O OC -0.500 -0.969 -0.093 -1.961
A58 C25 C CR6 0.000 -2.023 -1.256 -0.346
A58 C24 C CR16 0.000 -2.118 -1.696 0.974
A58 H24 H H 0.000 -1.369 -1.401 1.698
A58 C23 C CR16 0.000 -3.179 -2.515 1.361
A58 H23 H H 0.000 -3.254 -2.857 2.386
A58 C26 C CR16 0.000 -2.988 -1.636 -1.279
A58 H26 H H 0.000 -2.914 -1.295 -2.304
A58 C27 C CR16 0.000 -4.048 -2.456 -0.893
A58 H27 H H 0.000 -4.797 -2.752 -1.617
A58 C22 C CR6 0.000 -4.141 -2.893 0.427
A58 C19 C CR5 0.000 -5.235 -3.738 0.827
A58 C17 C CR55 0.000 -6.524 -3.763 0.294
A58 C16 C CH2 0.000 -7.379 -3.118 -0.742
A58 H161 H H 0.000 -7.062 -3.282 -1.774
A58 H162 H H 0.000 -7.573 -2.054 -0.588
A58 C12 C CR56 0.000 -8.663 -3.922 -0.463
A58 C11 C CR16 0.000 -9.877 -3.799 -1.115
A58 H11 H H 0.000 -10.012 -3.081 -1.914
A58 N20 N NRD5 0.000 -5.086 -4.636 1.819
A58 N21 N NR15 0.000 -6.303 -5.233 1.910
A58 H21 H H 0.000 -6.535 -5.986 2.589
A58 C18 C CR55 0.000 -7.170 -4.729 1.013
A58 C13 C CR56 0.000 -8.514 -4.875 0.584
A58 C14 C CR16 0.000 -9.539 -5.698 0.993
A58 H14 H H 0.000 -9.404 -6.415 1.793
A58 C15 C CR16 0.000 -10.760 -5.566 0.329
A58 H15 H H 0.000 -11.595 -6.193 0.616
A58 C10 C CR6 0.000 -10.920 -4.630 -0.707
A58 C9 C CH2 0.000 -12.252 -4.521 -1.391
A58 H91 H H 0.000 -12.724 -5.506 -1.375
A58 H92 H H 0.000 -12.079 -4.219 -2.426
A58 N8 N NH1 0.000 -13.121 -3.555 -0.741
A58 HN8 H H 0.000 -12.870 -3.012 0.073
A58 C2 C CH1 0.000 -14.392 -3.477 -1.421
A58 H2 H H 0.000 -14.846 -4.478 -1.411
A58 C7 C CH2 0.000 -14.202 -3.058 -2.880
A58 H71 H H 0.000 -13.592 -3.815 -3.379
A58 H72 H H 0.000 -13.677 -2.101 -2.897
A58 C6 C CH2 0.000 -15.539 -2.920 -3.605
A58 H61 H H 0.000 -16.000 -3.908 -3.666
A58 H62 H H 0.000 -15.346 -2.547 -4.614
A58 C5 C CH1 0.000 -16.483 -1.957 -2.874
A58 H5 H H 0.000 -16.027 -0.957 -2.884
A58 C1 C CH3 0.000 -17.830 -1.874 -3.589
A58 H13 H H 0.000 -18.375 -1.044 -3.221
A58 H12 H H 0.000 -17.671 -1.757 -4.630
A58 H11A H H 0.000 -18.379 -2.762 -3.414
A58 C4 C CH2 0.000 -16.672 -2.382 -1.412
A58 H41 H H 0.000 -17.197 -3.340 -1.398
A58 H42 H H 0.000 -17.282 -1.627 -0.911
A58 C3 C CH2 0.000 -15.335 -2.522 -0.687
A58 H32 H H 0.000 -15.527 -2.900 0.320
A58 H31 H H 0.000 -14.875 -1.533 -0.621
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
A58 O30 n/a C28 START
A58 C28 O30 C25 .
A58 O29 C28 . .
A58 C25 C28 C26 .
A58 C24 C25 C23 .
A58 H24 C24 . .
A58 C23 C24 H23 .
A58 H23 C23 . .
A58 C26 C25 C27 .
A58 H26 C26 . .
A58 C27 C26 C22 .
A58 H27 C27 . .
A58 C22 C27 C19 .
A58 C19 C22 N20 .
A58 C17 C19 C16 .
A58 C16 C17 C12 .
A58 H161 C16 . .
A58 H162 C16 . .
A58 C12 C16 C11 .
A58 C11 C12 H11 .
A58 H11 C11 . .
A58 N20 C19 N21 .
A58 N21 N20 C18 .
A58 H21 N21 . .
A58 C18 N21 C13 .
A58 C13 C18 C14 .
A58 C14 C13 C15 .
A58 H14 C14 . .
A58 C15 C14 C10 .
A58 H15 C15 . .
A58 C10 C15 C9 .
A58 C9 C10 N8 .
A58 H91 C9 . .
A58 H92 C9 . .
A58 N8 C9 C2 .
A58 HN8 N8 . .
A58 C2 N8 C7 .
A58 H2 C2 . .
A58 C7 C2 C6 .
A58 H71 C7 . .
A58 H72 C7 . .
A58 C6 C7 C5 .
A58 H61 C6 . .
A58 H62 C6 . .
A58 C5 C6 C4 .
A58 H5 C5 . .
A58 C1 C5 H11A .
A58 H13 C1 . .
A58 H12 C1 . .
A58 H11A C1 . .
A58 C4 C5 C3 .
A58 H41 C4 . .
A58 H42 C4 . .
A58 C3 C4 H31 .
A58 H32 C3 . .
A58 H31 C3 . END
A58 C2 C3 . ADD
A58 C10 C11 . ADD
A58 C12 C13 . ADD
A58 C17 C18 . ADD
A58 C22 C23 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
A58 C1 C5 single 1.524 0.020
A58 H11A C1 single 1.059 0.020
A58 H12 C1 single 1.059 0.020
A58 H13 C1 single 1.059 0.020
A58 C7 C2 single 1.524 0.020
A58 C2 C3 single 1.524 0.020
A58 C2 N8 single 1.450 0.020
A58 H2 C2 single 1.099 0.020
A58 C3 C4 single 1.524 0.020
A58 H31 C3 single 1.092 0.020
A58 H32 C3 single 1.092 0.020
A58 C4 C5 single 1.524 0.020
A58 H41 C4 single 1.092 0.020
A58 H42 C4 single 1.092 0.020
A58 C5 C6 single 1.524 0.020
A58 H5 C5 single 1.099 0.020
A58 C6 C7 single 1.524 0.020
A58 H61 C6 single 1.092 0.020
A58 H62 C6 single 1.092 0.020
A58 H71 C7 single 1.092 0.020
A58 H72 C7 single 1.092 0.020
A58 N8 C9 single 1.450 0.020
A58 HN8 N8 single 1.010 0.020
A58 C9 C10 single 1.511 0.020
A58 H91 C9 single 1.092 0.020
A58 H92 C9 single 1.092 0.020
A58 C10 C15 single 1.390 0.020
A58 C10 C11 double 1.390 0.020
A58 C11 C12 single 1.390 0.020
A58 H11 C11 single 1.083 0.020
A58 C12 C13 double 1.490 0.020
A58 C12 C16 single 1.457 0.020
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A58 H14 C14 single 1.083 0.020
A58 H15 C15 single 1.083 0.020
A58 C16 C17 single 1.457 0.020
A58 H161 C16 single 1.092 0.020
A58 H162 C16 single 1.092 0.020
A58 C17 C19 single 1.490 0.020
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A58 C18 N21 single 1.395 0.020
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A58 C19 C22 single 1.490 0.020
A58 N21 N20 single 1.402 0.020
A58 H21 N21 single 1.040 0.020
A58 C22 C27 single 1.390 0.020
A58 C22 C23 double 1.390 0.020
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A58 H23 C23 single 1.083 0.020
A58 C24 C25 double 1.390 0.020
A58 H24 C24 single 1.083 0.020
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A58 C25 C28 single 1.500 0.020
A58 C27 C26 double 1.390 0.020
A58 H26 C26 single 1.083 0.020
A58 H27 C27 single 1.083 0.020
A58 O29 C28 deloc 1.250 0.020
A58 C28 O30 deloc 1.250 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
A58 O30 C28 O29 123.000 3.000
A58 O30 C28 C25 120.000 3.000
A58 O29 C28 C25 120.000 3.000
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A58 C28 C25 C26 120.000 3.000
A58 C24 C25 C26 120.000 3.000
A58 C25 C24 H24 120.000 3.000
A58 C25 C24 C23 120.000 3.000
A58 H24 C24 C23 120.000 3.000
A58 C24 C23 H23 120.000 3.000
A58 C24 C23 C22 120.000 3.000
A58 H23 C23 C22 120.000 3.000
A58 C25 C26 H26 120.000 3.000
A58 C25 C26 C27 120.000 3.000
A58 H26 C26 C27 120.000 3.000
A58 C26 C27 H27 120.000 3.000
A58 C26 C27 C22 120.000 3.000
A58 H27 C27 C22 120.000 3.000
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A58 C22 C19 C17 108.000 3.000
A58 C22 C19 N20 126.000 3.000
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A58 C19 C17 C18 108.000 3.000
A58 C16 C17 C18 108.000 3.000
A58 C17 C16 H161 109.500 3.000
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A58 H161 C16 H162 107.900 3.000
A58 H161 C16 C12 109.500 3.000
A58 H162 C16 C12 109.500 3.000
A58 C16 C12 C11 120.000 3.000
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A58 H11 C11 C10 120.000 3.000
A58 C19 N20 N21 108.000 3.000
A58 N20 N21 H21 108.000 3.000
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A58 C13 C14 C15 120.000 3.000
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A58 C14 C15 H15 120.000 3.000
A58 C14 C15 C10 120.000 3.000
A58 H15 C15 C10 120.000 3.000
A58 C15 C10 C9 120.000 3.000
A58 C15 C10 C11 120.000 3.000
A58 C9 C10 C11 120.000 3.000
A58 C10 C9 H91 109.470 3.000
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A58 C10 C9 N8 109.500 3.000
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A58 H91 C9 N8 109.470 3.000
A58 H92 C9 N8 109.470 3.000
A58 C9 N8 HN8 118.500 3.000
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A58 HN8 N8 C2 118.500 3.000
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_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_chir.id
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