1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AI2 AI2 '3A-METHYL-5,6-DIHYDRO-FURO[2,3-D][1,' non-polymer 23 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AI2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
AI2 O13 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
AI2 H13 H H 0.000 0.055 -0.101 -0.960
AI2 C8 C CT 0.000 -1.302 -0.389 0.445
AI2 O1 O O2 0.000 -2.360 0.445 -0.067
AI2 C7 C CH1 0.000 -1.630 -1.865 0.130
AI2 H7 H H 0.000 -2.675 -1.972 -0.195
AI2 O12 O OH1 0.000 -0.737 -2.392 -0.853
AI2 H12 H H 0.000 -0.906 -3.338 -0.966
AI2 C6 C CH2 0.000 -1.408 -2.550 1.501
AI2 H62 H H 0.000 -0.353 -2.751 1.699
AI2 H61 H H 0.000 -1.978 -3.476 1.600
AI2 O5 O O2 0.000 -1.900 -1.577 2.446
AI2 C4 C CT 0.000 -1.480 -0.283 1.984
AI2 C11 C CH3 0.000 -0.213 0.202 2.689
AI2 H113 H H 0.000 0.571 -0.491 2.525
AI2 H112 H H 0.000 0.067 1.148 2.303
AI2 H111 H H 0.000 -0.396 0.287 3.729
AI2 O3 O O2 0.000 -2.584 0.636 2.135
AI2 B2 B B -1.000 -2.616 1.349 0.945
AI2 O10 O OH1 0.000 -3.849 1.913 0.767
AI2 H10 H H 0.000 -4.127 2.549 1.404
AI2 O9 O OH1 0.000 -1.653 2.317 0.963
AI2 H9 H H 0.000 -1.731 2.989 1.618
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AI2 O13 n/a C8 START
AI2 H13 O13 . .
AI2 C8 O13 C4 .
AI2 O1 C8 . .
AI2 C7 C8 C6 .
AI2 H7 C7 . .
AI2 O12 C7 H12 .
AI2 H12 O12 . .
AI2 C6 C7 O5 .
AI2 H62 C6 . .
AI2 H61 C6 . .
AI2 O5 C6 . .
AI2 C4 C8 O3 .
AI2 C11 C4 H111 .
AI2 H113 C11 . .
AI2 H112 C11 . .
AI2 H111 C11 . .
AI2 O3 C4 B2 .
AI2 B2 O3 O9 .
AI2 O10 B2 H10 .
AI2 H10 O10 . .
AI2 O9 B2 H9 .
AI2 H9 O9 . END
AI2 O1 B2 . ADD
AI2 C4 O5 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AI2 O1 B2 single 1.434 0.020
AI2 O1 C8 single 1.426 0.020
AI2 O9 B2 single 1.535 0.020
AI2 O10 B2 single 1.535 0.020
AI2 B2 O3 single 1.434 0.020
AI2 H9 O9 single 0.967 0.020
AI2 H10 O10 single 0.967 0.020
AI2 O3 C4 single 1.426 0.020
AI2 C11 C4 single 1.524 0.020
AI2 C4 O5 single 1.426 0.020
AI2 C4 C8 single 1.524 0.020
AI2 H111 C11 single 1.059 0.020
AI2 H112 C11 single 1.059 0.020
AI2 H113 C11 single 1.059 0.020
AI2 O5 C6 single 1.426 0.020
AI2 C6 C7 single 1.524 0.020
AI2 H61 C6 single 1.092 0.020
AI2 H62 C6 single 1.092 0.020
AI2 O12 C7 single 1.432 0.020
AI2 C7 C8 single 1.524 0.020
AI2 H7 C7 single 1.099 0.020
AI2 H12 O12 single 0.967 0.020
AI2 C8 O13 single 1.432 0.020
AI2 H13 O13 single 0.967 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AI2 H13 O13 C8 109.470 3.000
AI2 O13 C8 O1 109.470 3.000
AI2 O13 C8 C7 109.470 3.000
AI2 O13 C8 C4 109.470 3.000
AI2 O1 C8 C7 109.470 3.000
AI2 O1 C8 C4 109.470 3.000
AI2 C7 C8 C4 111.000 3.000
AI2 C8 O1 B2 120.000 3.000
AI2 C8 C7 H7 108.340 3.000
AI2 C8 C7 O12 109.470 3.000
AI2 C8 C7 C6 111.000 3.000
AI2 H7 C7 O12 109.470 3.000
AI2 H7 C7 C6 108.340 3.000
AI2 O12 C7 C6 109.470 3.000
AI2 C7 O12 H12 109.470 3.000
AI2 C7 C6 H62 109.470 3.000
AI2 C7 C6 H61 109.470 3.000
AI2 C7 C6 O5 109.470 3.000
AI2 H62 C6 H61 107.900 3.000
AI2 H62 C6 O5 109.470 3.000
AI2 H61 C6 O5 109.470 3.000
AI2 C6 O5 C4 111.800 3.000
AI2 C8 C4 C11 111.000 3.000
AI2 C8 C4 O3 109.470 3.000
AI2 C8 C4 O5 109.470 3.000
AI2 C11 C4 O3 109.470 3.000
AI2 C11 C4 O5 109.470 3.000
AI2 O3 C4 O5 109.500 3.000
AI2 C4 C11 H113 109.470 3.000
AI2 C4 C11 H112 109.470 3.000
AI2 C4 C11 H111 109.470 3.000
AI2 H113 C11 H112 109.470 3.000
AI2 H113 C11 H111 109.470 3.000
AI2 H112 C11 H111 109.470 3.000
AI2 C4 O3 B2 120.000 3.000
AI2 O3 B2 O10 120.000 3.000
AI2 O3 B2 O9 120.000 3.000
AI2 O3 B2 O1 120.000 3.000
AI2 O10 B2 O9 120.000 3.000
AI2 O10 B2 O1 120.000 3.000
AI2 O9 B2 O1 120.000 3.000
AI2 B2 O10 H10 120.000 3.000
AI2 B2 O9 H9 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AI2 var_1 H13 O13 C8 C4 179.041 20.000 1
AI2 var_2 O13 C8 O1 B2 -90.000 20.000 1
AI2 var_3 C8 O1 B2 O3 -30.000 20.000 1
AI2 var_4 O13 C8 C7 C6 90.000 20.000 1
AI2 var_5 C8 C7 O12 H12 174.334 20.000 1
AI2 var_6 C8 C7 C6 O5 30.000 20.000 3
AI2 var_7 C7 C6 O5 C4 -30.000 20.000 1
AI2 var_8 O13 C8 C4 O3 120.000 20.000 1
AI2 var_9 C8 C4 O5 C6 30.000 20.000 1
AI2 var_10 C8 C4 C11 H111 178.194 20.000 1
AI2 var_11 C8 C4 O3 B2 -30.000 20.000 1
AI2 var_12 C4 O3 B2 O9 -90.000 20.000 1
AI2 var_13 O3 B2 O10 H10 62.615 20.000 1
AI2 var_14 O3 B2 O9 H9 -62.911 20.000 1
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AI2 chir_01 B2 O1 O9 O10 negativ
AI2 chir_02 C4 O3 C11 O5 negativ
AI2 chir_03 C7 C6 O12 C8 positiv
AI2 chir_04 C8 O1 C4 C7 negativ
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