1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AIT AIT '(2S,3R)-3-(4-HYDROXYPHENYL)-2-(4-{[(' non-polymer 62 33 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AIT
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
AIT O16 O OH1 0.000 0.000 0.000 0.000
AIT H16 H H 0.000 0.757 -0.153 0.582
AIT C15 C CR6 0.000 -1.078 0.357 0.746
AIT C14 C CR16 0.000 -1.317 1.694 1.026
AIT H14 H H 0.000 -0.644 2.455 0.651
AIT C13 C CR16 0.000 -2.414 2.055 1.785
AIT H13 H H 0.000 -2.602 3.099 2.003
AIT C17 C CR16 0.000 -1.941 -0.616 1.230
AIT H17 H H 0.000 -1.759 -1.660 1.009
AIT C18 C CR16 0.000 -3.033 -0.251 1.993
AIT H18 H H 0.000 -3.702 -1.011 2.378
AIT C12 C CR6 0.000 -3.272 1.083 2.265
AIT C1 C CH1 0.000 -4.468 1.479 3.094
AIT H1 H H 0.000 -4.836 0.613 3.662
AIT S11 S S2 0.000 -4.022 2.826 4.229
AIT C10 C CR6 0.000 -4.019 4.170 3.083
AIT C9 C CR16 0.000 -3.508 5.391 3.518
AIT H9 H H 0.000 -3.095 5.475 4.516
AIT C7 C CR6 0.000 -3.521 6.497 2.687
AIT O8 O OH1 0.000 -3.022 7.685 3.120
AIT HO8 H H 0.000 -3.727 8.195 3.542
AIT C6 C CR16 0.000 -4.050 6.382 1.410
AIT H6 H H 0.000 -4.075 7.244 0.755
AIT C5 C CR16 0.000 -4.543 5.173 0.974
AIT H5 H H 0.000 -4.952 5.095 -0.026
AIT C4 C CR6 0.000 -4.525 4.043 1.799
AIT O3 O O2 0.000 -5.010 2.912 1.243
AIT C2 C CH1 0.000 -5.581 2.024 2.182
AIT H2 H H 0.000 -6.325 2.558 2.789
AIT C19 C CR6 0.000 -6.246 0.882 1.458
AIT C24 C CR16 0.000 -5.645 0.329 0.342
AIT H24 H H 0.000 -4.700 0.721 -0.014
AIT C23 C CR16 0.000 -6.250 -0.722 -0.319
AIT H23 H H 0.000 -5.775 -1.161 -1.188
AIT C22 C CR6 0.000 -7.467 -1.215 0.129
AIT C21 C CR16 0.000 -8.067 -0.657 1.249
AIT H21 H H 0.000 -9.016 -1.043 1.603
AIT C20 C CR16 0.000 -7.456 0.389 1.911
AIT H20 H H 0.000 -7.925 0.823 2.785
AIT O25 O O2 0.000 -8.066 -2.245 -0.524
AIT C26 C CH2 0.000 -7.216 -2.592 -1.618
AIT H261 H H 0.000 -6.237 -2.891 -1.236
AIT H262 H H 0.000 -7.100 -1.729 -2.277
AIT C27 C CH1 0.000 -7.836 -3.752 -2.398
AIT H27 H H 0.000 -7.140 -4.078 -3.184
AIT C28 C CH3 0.000 -8.112 -4.918 -1.446
AIT H283 H H 0.000 -8.493 -5.741 -1.995
AIT H282 H H 0.000 -7.213 -5.203 -0.964
AIT H281 H H 0.000 -8.822 -4.621 -0.719
AIT N29 N NT 0.000 -9.095 -3.311 -3.012
AIT C33 C CH2 0.000 -9.646 -4.477 -3.736
AIT H331 H H 0.000 -10.463 -4.946 -3.185
AIT H332 H H 0.000 -8.876 -5.221 -3.948
AIT C32 C CH2 0.000 -10.185 -3.895 -5.068
AIT H321 H H 0.000 -11.166 -3.427 -4.967
AIT H322 H H 0.000 -10.215 -4.628 -5.877
AIT C31 C CH2 0.000 -9.123 -2.811 -5.389
AIT H311 H H 0.000 -9.524 -2.000 -6.000
AIT H312 H H 0.000 -8.235 -3.224 -5.872
AIT C30 C CH2 0.000 -8.747 -2.269 -3.994
AIT H302 H H 0.000 -9.307 -1.358 -3.774
AIT H301 H H 0.000 -7.677 -2.059 -3.940
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AIT O16 n/a C15 START
AIT H16 O16 . .
AIT C15 O16 C17 .
AIT C14 C15 C13 .
AIT H14 C14 . .
AIT C13 C14 H13 .
AIT H13 C13 . .
AIT C17 C15 C18 .
AIT H17 C17 . .
AIT C18 C17 C12 .
AIT H18 C18 . .
AIT C12 C18 C1 .
AIT C1 C12 C2 .
AIT H1 C1 . .
AIT S11 C1 C10 .
AIT C10 S11 C4 .
AIT C9 C10 C7 .
AIT H9 C9 . .
AIT C7 C9 C6 .
AIT O8 C7 HO8 .
AIT HO8 O8 . .
AIT C6 C7 C5 .
AIT H6 C6 . .
AIT C5 C6 H5 .
AIT H5 C5 . .
AIT C4 C10 O3 .
AIT O3 C4 . .
AIT C2 C1 C19 .
AIT H2 C2 . .
AIT C19 C2 C24 .
AIT C24 C19 C23 .
AIT H24 C24 . .
AIT C23 C24 C22 .
AIT H23 C23 . .
AIT C22 C23 O25 .
AIT C21 C22 C20 .
AIT H21 C21 . .
AIT C20 C21 H20 .
AIT H20 C20 . .
AIT O25 C22 C26 .
AIT C26 O25 C27 .
AIT H261 C26 . .
AIT H262 C26 . .
AIT C27 C26 N29 .
AIT H27 C27 . .
AIT C28 C27 H281 .
AIT H283 C28 . .
AIT H282 C28 . .
AIT H281 C28 . .
AIT N29 C27 C33 .
AIT C33 N29 C32 .
AIT H331 C33 . .
AIT H332 C33 . .
AIT C32 C33 C31 .
AIT H321 C32 . .
AIT H322 C32 . .
AIT C31 C32 C30 .
AIT H311 C31 . .
AIT H312 C31 . .
AIT C30 C31 H301 .
AIT H302 C30 . .
AIT H301 C30 . END
AIT C2 O3 . ADD
AIT C4 C5 . ADD
AIT C12 C13 . ADD
AIT C19 C20 . ADD
AIT N29 C30 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AIT C2 C1 single 1.524 0.020
AIT S11 C1 single 1.765 0.020
AIT C1 C12 single 1.480 0.020
AIT H1 C1 single 1.099 0.020
AIT C2 O3 single 1.426 0.020
AIT C19 C2 single 1.480 0.020
AIT H2 C2 single 1.099 0.020
AIT O3 C4 single 1.370 0.020
AIT C4 C5 double 1.390 0.020
AIT C4 C10 single 1.487 0.020
AIT C5 C6 single 1.390 0.020
AIT H5 C5 single 1.083 0.020
AIT C6 C7 double 1.390 0.020
AIT H6 C6 single 1.083 0.020
AIT O8 C7 single 1.362 0.020
AIT C7 C9 single 1.390 0.020
AIT HO8 O8 single 0.967 0.020
AIT C9 C10 double 1.390 0.020
AIT H9 C9 single 1.083 0.020
AIT C10 S11 single 1.695 0.020
AIT C12 C13 double 1.390 0.020
AIT C12 C18 single 1.390 0.020
AIT C13 C14 single 1.390 0.020
AIT H13 C13 single 1.083 0.020
AIT C14 C15 double 1.390 0.020
AIT H14 C14 single 1.083 0.020
AIT C15 O16 single 1.362 0.020
AIT C17 C15 single 1.390 0.020
AIT H16 O16 single 0.967 0.020
AIT C18 C17 double 1.390 0.020
AIT H17 C17 single 1.083 0.020
AIT H18 C18 single 1.083 0.020
AIT C19 C20 double 1.390 0.020
AIT C24 C19 single 1.390 0.020
AIT C20 C21 single 1.390 0.020
AIT H20 C20 single 1.083 0.020
AIT C21 C22 double 1.390 0.020
AIT H21 C21 single 1.083 0.020
AIT C22 C23 single 1.390 0.020
AIT O25 C22 single 1.370 0.020
AIT C23 C24 double 1.390 0.020
AIT H23 C23 single 1.083 0.020
AIT H24 C24 single 1.083 0.020
AIT C26 O25 single 1.426 0.020
AIT C27 C26 single 1.524 0.020
AIT H261 C26 single 1.092 0.020
AIT H262 C26 single 1.092 0.020
AIT C28 C27 single 1.524 0.020
AIT N29 C27 single 1.469 0.020
AIT H27 C27 single 1.099 0.020
AIT H281 C28 single 1.059 0.020
AIT H282 C28 single 1.059 0.020
AIT H283 C28 single 1.059 0.020
AIT N29 C30 single 1.469 0.020
AIT C33 N29 single 1.469 0.020
AIT C30 C31 single 1.524 0.020
AIT H301 C30 single 1.092 0.020
AIT H302 C30 single 1.092 0.020
AIT C31 C32 single 1.524 0.020
AIT H311 C31 single 1.092 0.020
AIT H312 C31 single 1.092 0.020
AIT C32 C33 single 1.524 0.020
AIT H321 C32 single 1.092 0.020
AIT H322 C32 single 1.092 0.020
AIT H331 C33 single 1.092 0.020
AIT H332 C33 single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AIT H16 O16 C15 109.470 3.000
AIT O16 C15 C14 120.000 3.000
AIT O16 C15 C17 120.000 3.000
AIT C14 C15 C17 120.000 3.000
AIT C15 C14 H14 120.000 3.000
AIT C15 C14 C13 120.000 3.000
AIT H14 C14 C13 120.000 3.000
AIT C14 C13 H13 120.000 3.000
AIT C14 C13 C12 120.000 3.000
AIT H13 C13 C12 120.000 3.000
AIT C15 C17 H17 120.000 3.000
AIT C15 C17 C18 120.000 3.000
AIT H17 C17 C18 120.000 3.000
AIT C17 C18 H18 120.000 3.000
AIT C17 C18 C12 120.000 3.000
AIT H18 C18 C12 120.000 3.000
AIT C18 C12 C1 120.000 3.000
AIT C18 C12 C13 120.000 3.000
AIT C1 C12 C13 120.000 3.000
AIT C12 C1 H1 109.470 3.000
AIT C12 C1 S11 109.500 3.000
AIT C12 C1 C2 109.470 3.000
AIT H1 C1 S11 109.500 3.000
AIT H1 C1 C2 108.340 3.000
AIT S11 C1 C2 109.500 3.000
AIT C1 S11 C10 99.159 3.000
AIT S11 C10 C9 120.000 3.000
AIT S11 C10 C4 120.000 3.000
AIT C9 C10 C4 120.000 3.000
AIT C10 C9 H9 120.000 3.000
AIT C10 C9 C7 120.000 3.000
AIT H9 C9 C7 120.000 3.000
AIT C9 C7 O8 120.000 3.000
AIT C9 C7 C6 120.000 3.000
AIT O8 C7 C6 120.000 3.000
AIT C7 O8 HO8 109.470 3.000
AIT C7 C6 H6 120.000 3.000
AIT C7 C6 C5 120.000 3.000
AIT H6 C6 C5 120.000 3.000
AIT C6 C5 H5 120.000 3.000
AIT C6 C5 C4 120.000 3.000
AIT H5 C5 C4 120.000 3.000
AIT C10 C4 O3 120.000 3.000
AIT C10 C4 C5 120.000 3.000
AIT O3 C4 C5 120.000 3.000
AIT C4 O3 C2 120.000 3.000
AIT C1 C2 H2 108.340 3.000
AIT C1 C2 C19 109.470 3.000
AIT C1 C2 O3 109.470 3.000
AIT H2 C2 C19 109.470 3.000
AIT H2 C2 O3 109.470 3.000
AIT C19 C2 O3 109.470 3.000
AIT C2 C19 C24 120.000 3.000
AIT C2 C19 C20 120.000 3.000
AIT C24 C19 C20 120.000 3.000
AIT C19 C24 H24 120.000 3.000
AIT C19 C24 C23 120.000 3.000
AIT H24 C24 C23 120.000 3.000
AIT C24 C23 H23 120.000 3.000
AIT C24 C23 C22 120.000 3.000
AIT H23 C23 C22 120.000 3.000
AIT C23 C22 C21 120.000 3.000
AIT C23 C22 O25 120.000 3.000
AIT C21 C22 O25 120.000 3.000
AIT C22 C21 H21 120.000 3.000
AIT C22 C21 C20 120.000 3.000
AIT H21 C21 C20 120.000 3.000
AIT C21 C20 H20 120.000 3.000
AIT C21 C20 C19 120.000 3.000
AIT H20 C20 C19 120.000 3.000
AIT C22 O25 C26 120.000 3.000
AIT O25 C26 H261 109.470 3.000
AIT O25 C26 H262 109.470 3.000
AIT O25 C26 C27 109.470 3.000
AIT H261 C26 H262 107.900 3.000
AIT H261 C26 C27 109.470 3.000
AIT H262 C26 C27 109.470 3.000
AIT C26 C27 H27 108.340 3.000
AIT C26 C27 C28 111.000 3.000
AIT C26 C27 N29 109.500 3.000
AIT H27 C27 C28 108.340 3.000
AIT H27 C27 N29 109.500 3.000
AIT C28 C27 N29 109.500 3.000
AIT C27 C28 H283 109.470 3.000
AIT C27 C28 H282 109.470 3.000
AIT C27 C28 H281 109.470 3.000
AIT H283 C28 H282 109.470 3.000
AIT H283 C28 H281 109.470 3.000
AIT H282 C28 H281 109.470 3.000
AIT C27 N29 C33 109.470 3.000
AIT C27 N29 C30 109.470 3.000
AIT C33 N29 C30 109.470 3.000
AIT N29 C33 H331 109.470 3.000
AIT N29 C33 H332 109.470 3.000
AIT N29 C33 C32 109.470 3.000
AIT H331 C33 H332 107.900 3.000
AIT H331 C33 C32 109.470 3.000
AIT H332 C33 C32 109.470 3.000
AIT C33 C32 H321 109.470 3.000
AIT C33 C32 H322 109.470 3.000
AIT C33 C32 C31 111.000 3.000
AIT H321 C32 H322 107.900 3.000
AIT H321 C32 C31 109.470 3.000
AIT H322 C32 C31 109.470 3.000
AIT C32 C31 H311 109.470 3.000
AIT C32 C31 H312 109.470 3.000
AIT C32 C31 C30 111.000 3.000
AIT H311 C31 H312 107.900 3.000
AIT H311 C31 C30 109.470 3.000
AIT H312 C31 C30 109.470 3.000
AIT C31 C30 H302 109.470 3.000
AIT C31 C30 H301 109.470 3.000
AIT C31 C30 N29 109.470 3.000
AIT H302 C30 H301 107.900 3.000
AIT H302 C30 N29 109.470 3.000
AIT H301 C30 N29 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AIT var_1 H16 O16 C15 C17 -89.976 20.000 1
AIT CONST_1 O16 C15 C14 C13 180.000 0.000 0
AIT CONST_2 C15 C14 C13 C12 0.000 0.000 0
AIT CONST_3 O16 C15 C17 C18 180.000 0.000 0
AIT CONST_4 C15 C17 C18 C12 0.000 0.000 0
AIT CONST_5 C17 C18 C12 C1 180.000 0.000 0
AIT CONST_6 C18 C12 C13 C14 0.000 0.000 0
AIT var_2 C18 C12 C1 C2 -102.771 20.000 1
AIT var_3 C12 C1 S11 C10 90.000 20.000 1
AIT var_4 C1 S11 C10 C4 0.000 20.000 1
AIT CONST_7 S11 C10 C9 C7 180.000 0.000 0
AIT CONST_8 C10 C9 C7 C6 0.000 0.000 0
AIT var_5 C9 C7 O8 HO8 -89.947 20.000 1
AIT CONST_9 C9 C7 C6 C5 0.000 0.000 0
AIT CONST_10 C7 C6 C5 C4 0.000 0.000 0
AIT CONST_11 S11 C10 C4 O3 0.000 0.000 0
AIT CONST_12 C10 C4 C5 C6 0.000 0.000 0
AIT var_6 C10 C4 O3 C2 30.000 20.000 1
AIT var_7 C12 C1 C2 C19 90.000 20.000 3
AIT var_8 C1 C2 O3 C4 -60.000 20.000 1
AIT var_9 C1 C2 C19 C24 -79.766 20.000 1
AIT CONST_13 C2 C19 C20 C21 180.000 0.000 0
AIT CONST_14 C2 C19 C24 C23 180.000 0.000 0
AIT CONST_15 C19 C24 C23 C22 0.000 0.000 0
AIT CONST_16 C24 C23 C22 O25 180.000 0.000 0
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AIT CONST_18 C22 C21 C20 C19 0.000 0.000 0
AIT var_10 C23 C22 O25 C26 -0.251 20.000 1
AIT var_11 C22 O25 C26 C27 179.968 20.000 1
AIT var_12 O25 C26 C27 N29 65.045 20.000 3
AIT var_13 C26 C27 C28 H281 63.014 20.000 3
AIT var_14 C26 C27 N29 C33 -179.504 20.000 1
AIT var_15 C27 N29 C30 C31 120.000 20.000 1
AIT var_16 C27 N29 C33 C32 -150.000 20.000 1
AIT var_17 N29 C33 C32 C31 30.000 20.000 3
AIT var_18 C33 C32 C31 C30 -30.000 20.000 3
AIT var_19 C32 C31 C30 N29 30.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AIT chir_01 C1 C2 S11 C12 positiv
AIT chir_02 C2 C1 O3 C19 negativ
AIT chir_03 C27 C26 C28 N29 negativ
AIT chir_04 N29 C27 C30 C33 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AIT plan-1 C4 0.020
AIT plan-1 O3 0.020
AIT plan-1 C5 0.020
AIT plan-1 C10 0.020
AIT plan-1 C6 0.020
AIT plan-1 C7 0.020
AIT plan-1 C9 0.020
AIT plan-1 H5 0.020
AIT plan-1 H6 0.020
AIT plan-1 O8 0.020
AIT plan-1 H9 0.020
AIT plan-1 S11 0.020
AIT plan-2 C12 0.020
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AIT plan-2 H13 0.020
AIT plan-2 H14 0.020
AIT plan-2 O16 0.020
AIT plan-2 H17 0.020
AIT plan-2 H18 0.020
AIT plan-3 C19 0.020
AIT plan-3 C2 0.020
AIT plan-3 C20 0.020
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AIT plan-3 C21 0.020
AIT plan-3 C22 0.020
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AIT plan-3 H20 0.020
AIT plan-3 H21 0.020
AIT plan-3 O25 0.020
AIT plan-3 H23 0.020
AIT plan-3 H24 0.020
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