1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
ANI ANI '4-(trifluoromethyl)aniline ' non-polymer 17 11 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_ANI
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
ANI F3 F F 0.000 0.000 0.000 0.000
ANI C7 C CT 0.000 -1.282 -0.429 0.362
ANI F1 F F 0.000 -1.445 -0.297 1.745
ANI F2 F F 0.000 -1.444 -1.771 -0.002
ANI C4 C CR6 0.000 -2.312 0.412 -0.347
ANI C3 C CR16 0.000 -2.025 1.726 -0.671
ANI H3 H H 0.000 -1.062 2.149 -0.415
ANI C2 C CR16 0.000 -2.967 2.499 -1.322
ANI H2 H H 0.000 -2.743 3.528 -1.574
ANI C5 C CR16 0.000 -3.541 -0.132 -0.674
ANI H5 H H 0.000 -3.760 -1.163 -0.423
ANI C6 C CR16 0.000 -4.488 0.637 -1.320
ANI H6 H H 0.000 -5.453 0.213 -1.568
ANI C1 C CR6 0.000 -4.202 1.955 -1.651
ANI N N NH2 0.000 -5.157 2.735 -2.309
ANI HN2 H H 0.000 -6.065 2.348 -2.555
ANI HN1 H H 0.000 -4.960 3.703 -2.553
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
ANI F3 n/a C7 START
ANI C7 F3 C4 .
ANI F1 C7 . .
ANI F2 C7 . .
ANI C4 C7 C5 .
ANI C3 C4 C2 .
ANI H3 C3 . .
ANI C2 C3 H2 .
ANI H2 C2 . .
ANI C5 C4 C6 .
ANI H5 C5 . .
ANI C6 C5 C1 .
ANI H6 C6 . .
ANI C1 C6 N .
ANI N C1 HN1 .
ANI HN2 N . .
ANI HN1 N . END
ANI C1 C2 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
ANI N C1 single 1.355 0.020
ANI HN1 N single 1.010 0.020
ANI HN2 N single 1.010 0.020
ANI C1 C2 double 1.390 0.020
ANI C1 C6 single 1.390 0.020
ANI C2 C3 single 1.390 0.020
ANI H2 C2 single 1.083 0.020
ANI C3 C4 double 1.390 0.020
ANI H3 C3 single 1.083 0.020
ANI C5 C4 single 1.390 0.020
ANI C4 C7 single 1.500 0.020
ANI C6 C5 double 1.390 0.020
ANI H5 C5 single 1.083 0.020
ANI H6 C6 single 1.083 0.020
ANI F1 C7 single 1.320 0.020
ANI F2 C7 single 1.320 0.020
ANI C7 F3 single 1.320 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
ANI F3 C7 F1 109.470 3.000
ANI F3 C7 F2 109.470 3.000
ANI F3 C7 C4 109.470 3.000
ANI F1 C7 F2 109.470 3.000
ANI F1 C7 C4 109.470 3.000
ANI F2 C7 C4 109.470 3.000
ANI C7 C4 C3 120.000 3.000
ANI C7 C4 C5 120.000 3.000
ANI C3 C4 C5 120.000 3.000
ANI C4 C3 H3 120.000 3.000
ANI C4 C3 C2 120.000 3.000
ANI H3 C3 C2 120.000 3.000
ANI C3 C2 H2 120.000 3.000
ANI C3 C2 C1 120.000 3.000
ANI H2 C2 C1 120.000 3.000
ANI C4 C5 H5 120.000 3.000
ANI C4 C5 C6 120.000 3.000
ANI H5 C5 C6 120.000 3.000
ANI C5 C6 H6 120.000 3.000
ANI C5 C6 C1 120.000 3.000
ANI H6 C6 C1 120.000 3.000
ANI C6 C1 N 120.000 3.000
ANI C6 C1 C2 120.000 3.000
ANI N C1 C2 120.000 3.000
ANI C1 N HN2 120.000 3.000
ANI C1 N HN1 120.000 3.000
ANI HN2 N HN1 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
ANI var_1 F3 C7 C4 C5 149.939 20.000 1
ANI CONST_1 C7 C4 C3 C2 180.000 0.000 0
ANI CONST_2 C4 C3 C2 C1 0.000 0.000 0
ANI CONST_3 C7 C4 C5 C6 180.000 0.000 0
ANI CONST_4 C4 C5 C6 C1 0.000 0.000 0
ANI CONST_5 C5 C6 C1 N 180.000 0.000 0
ANI CONST_6 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
ANI CONST_7 C6 C1 N HN1 179.741 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
ANI chir_01 C7 C4 F1 F2 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
ANI plan-1 N 0.020
ANI plan-1 C1 0.020
ANI plan-1 HN1 0.020
ANI plan-1 HN2 0.020
ANI plan-2 C1 0.020
ANI plan-2 N 0.020
ANI plan-2 C2 0.020
ANI plan-2 C6 0.020
ANI plan-2 C3 0.020
ANI plan-2 C4 0.020
ANI plan-2 C5 0.020
ANI plan-2 H2 0.020
ANI plan-2 H3 0.020
ANI plan-2 C7 0.020
ANI plan-2 H5 0.020
ANI plan-2 H6 0.020
ANI plan-2 HN2 0.020
ANI plan-2 HN1 0.020
# ------------------------------------------------------
|
