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376
|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AO2 AO2 'N'-(2S,3R)-3-AMINO-4-CYCLOHEXYL-2-HY' non-polymer 49 22 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AO2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
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AO2 HN91 H H 0.000 -3.498 0.891 -2.260
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AO2 H21A H H 0.000 -8.122 0.189 -0.494
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AO2 O13 n/a C12 START
AO2 C12 O13 C10 .
AO2 N14 C12 N15 .
AO2 H14 N14 . .
AO2 N15 N14 C16 .
AO2 H15 N15 . .
AO2 C16 N15 C21 .
AO2 C21 C16 C20 .
AO2 H21 C21 . .
AO2 C20 C21 C19 .
AO2 H20 C20 . .
AO2 C19 C20 C18 .
AO2 C22 C19 H221 .
AO2 H223 C22 . .
AO2 H222 C22 . .
AO2 H221 C22 . .
AO2 C18 C19 C17 .
AO2 H18 C18 . .
AO2 C17 C18 H17 .
AO2 H17 C17 . .
AO2 C10 C12 C8 .
AO2 H10 C10 . .
AO2 O11 C10 H11 .
AO2 H11 O11 . .
AO2 C8 C10 C7 .
AO2 H8 C8 . .
AO2 N9 C8 HN91 .
AO2 HN92 N9 . .
AO2 HN91 N9 . .
AO2 C7 C8 C6 .
AO2 H71 C7 . .
AO2 H72 C7 . .
AO2 C6 C7 C5 .
AO2 H6 C6 . .
AO2 C1 C6 H11A .
AO2 H12 C1 . .
AO2 H11A C1 . .
AO2 C5 C6 C4 .
AO2 H51 C5 . .
AO2 H52 C5 . .
AO2 C4 C5 C3 .
AO2 H41 C4 . .
AO2 H42 C4 . .
AO2 C3 C4 C2 .
AO2 H31 C3 . .
AO2 H32 C3 . .
AO2 C2 C3 H21A .
AO2 H22 C2 . .
AO2 H21A C2 . END
AO2 C1 C2 . ADD
AO2 C16 C17 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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AO2 H32 C3 single 1.092 0.020
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AO2 HN92 N9 single 1.010 0.020
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AO2 H15 N15 single 1.010 0.020
AO2 C16 C17 single 1.390 0.020
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AO2 H18 C18 single 1.083 0.020
AO2 C19 C20 double 1.390 0.020
AO2 C22 C19 single 1.506 0.020
AO2 C20 C21 single 1.390 0.020
AO2 H20 C20 single 1.083 0.020
AO2 H21 C21 single 1.083 0.020
AO2 H221 C22 single 1.059 0.020
AO2 H222 C22 single 1.059 0.020
AO2 H223 C22 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
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AO2 C4 C3 H31 109.470 3.000
AO2 C4 C3 H32 109.470 3.000
AO2 C4 C3 C2 111.000 3.000
AO2 H31 C3 H32 107.900 3.000
AO2 H31 C3 C2 109.470 3.000
AO2 H32 C3 C2 109.470 3.000
AO2 C3 C2 H22 109.470 3.000
AO2 C3 C2 H21A 109.470 3.000
AO2 C3 C2 C1 111.000 3.000
AO2 H22 C2 H21A 107.900 3.000
AO2 H22 C2 C1 109.470 3.000
AO2 H21A C2 C1 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AO2 CONST_1 O13 C12 N14 N15 0.000 0.000 0
AO2 var_1 C12 N14 N15 C16 179.972 20.000 1
AO2 var_2 N14 N15 C16 C21 179.948 20.000 1
AO2 CONST_2 N15 C16 C17 C18 180.000 0.000 0
AO2 CONST_3 N15 C16 C21 C20 180.000 0.000 0
AO2 CONST_4 C16 C21 C20 C19 0.000 0.000 0
AO2 CONST_5 C21 C20 C19 C18 0.000 0.000 0
AO2 var_3 C20 C19 C22 H221 89.985 20.000 1
AO2 CONST_6 C20 C19 C18 C17 0.000 0.000 0
AO2 CONST_7 C19 C18 C17 C16 0.000 0.000 0
AO2 var_4 O13 C12 C10 C8 114.979 20.000 3
AO2 var_5 C12 C10 O11 H11 60.073 20.000 1
AO2 var_6 C12 C10 C8 C7 -175.027 20.000 3
AO2 var_7 C10 C8 N9 HN91 -179.652 20.000 1
AO2 var_8 C10 C8 C7 C6 -174.602 20.000 3
AO2 var_9 C8 C7 C6 C5 -174.786 20.000 3
AO2 var_10 C7 C6 C1 C2 180.000 20.000 3
AO2 var_11 C6 C1 C2 C3 -60.000 20.000 3
AO2 var_12 C7 C6 C5 C4 180.000 20.000 3
AO2 var_13 C6 C5 C4 C3 60.000 20.000 3
AO2 var_14 C5 C4 C3 C2 -60.000 20.000 3
AO2 var_15 C4 C3 C2 C1 60.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AO2 chir_01 C6 C1 C5 C7 negativ
AO2 chir_02 C8 C7 N9 C10 negativ
AO2 chir_03 C10 C8 O11 C12 positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AO2 plan-1 N9 0.020
AO2 plan-1 C8 0.020
AO2 plan-1 HN91 0.020
AO2 plan-1 HN92 0.020
AO2 plan-2 C12 0.020
AO2 plan-2 C10 0.020
AO2 plan-2 O13 0.020
AO2 plan-2 N14 0.020
AO2 plan-2 H14 0.020
AO2 plan-3 N14 0.020
AO2 plan-3 C12 0.020
AO2 plan-3 N15 0.020
AO2 plan-3 H14 0.020
AO2 plan-3 H15 0.020
AO2 plan-4 N15 0.020
AO2 plan-4 N14 0.020
AO2 plan-4 C16 0.020
AO2 plan-4 H15 0.020
AO2 plan-4 H14 0.020
AO2 plan-5 C16 0.020
AO2 plan-5 N15 0.020
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AO2 plan-5 H20 0.020
AO2 plan-5 H21 0.020
AO2 plan-5 H15 0.020
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