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|
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_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AS1 AS1 'ARGININOSUCCINATE ' non-polymer 35 20 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AS1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
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AS1 OD2 O OC -0.500 0.000 0.000 0.000
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AS1 OD1 O OC -0.500 -1.897 0.484 0.929
AS1 CB C CH2 0.000 -1.728 -1.647 -0.143
AS1 HB1 H H 0.000 -1.127 -2.446 0.297
AS1 HB2 H H 0.000 -1.691 -1.722 -1.232
AS1 CA C CH1 0.000 -3.178 -1.777 0.330
AS1 HA H H 0.000 -3.225 -1.612 1.415
AS1 CG C C 0.000 -3.689 -3.158 0.009
AS1 OG1 O OC -0.500 -3.122 -4.162 0.492
AS1 OG2 O OC -0.500 -4.680 -3.299 -0.741
AS1 N1 N NH1 0.000 -4.005 -0.779 -0.352
AS1 HN1 H H 0.000 -3.719 -0.414 -1.250
AS1 C C C 0.000 -5.170 -0.339 0.229
AS1 N3 N N 0.000 -5.539 -0.810 1.387
AS1 HN3 H H 0.000 -5.005 -1.466 1.845
AS1 N2 N NH1 0.000 -5.947 0.598 -0.411
AS1 HN2 H H 0.000 -5.661 0.963 -1.308
AS1 C1 C CH2 0.000 -7.189 1.066 0.209
AS1 H11 H H 0.000 -6.964 1.523 1.174
AS1 H12 H H 0.000 -7.863 0.219 0.356
AS1 C2 C CH2 0.000 -7.856 2.098 -0.703
AS1 H21 H H 0.000 -8.080 1.639 -1.668
AS1 H22 H H 0.000 -7.181 2.943 -0.851
AS1 C3 C CH2 0.000 -9.154 2.587 -0.056
AS1 H31 H H 0.000 -8.928 3.045 0.910
AS1 H32 H H 0.000 -9.828 1.741 0.093
AS1 C4 C CH1 0.000 -9.821 3.619 -0.968
AS1 H4 H H 0.000 -9.966 3.185 -1.967
AS1 N4 N NH2 0.000 -8.965 4.809 -1.071
AS1 HN42 H H 0.000 -8.610 5.107 -1.972
AS1 HN41 H H 0.000 -8.724 5.339 -0.242
AS1 C5 C C 0.000 -11.157 4.009 -0.391
AS1 O51 O OC -0.500 -11.272 5.076 0.252
AS1 O52 O OC -0.500 -12.151 3.267 -0.555
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AS1 OD2 n/a CD START
AS1 CD OD2 CB .
AS1 OD1 CD . .
AS1 CB CD CA .
AS1 HB1 CB . .
AS1 HB2 CB . .
AS1 CA CB N1 .
AS1 HA CA . .
AS1 CG CA OG2 .
AS1 OG1 CG . .
AS1 OG2 CG . .
AS1 N1 CA C .
AS1 HN1 N1 . .
AS1 C N1 N2 .
AS1 N3 C HN3 .
AS1 HN3 N3 . .
AS1 N2 C C1 .
AS1 HN2 N2 . .
AS1 C1 N2 C2 .
AS1 H11 C1 . .
AS1 H12 C1 . .
AS1 C2 C1 C3 .
AS1 H21 C2 . .
AS1 H22 C2 . .
AS1 C3 C2 C4 .
AS1 H31 C3 . .
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AS1 H4 C4 . .
AS1 N4 C4 HN41 .
AS1 HN42 N4 . .
AS1 HN41 N4 . .
AS1 C5 C4 O52 .
AS1 O51 C5 . .
AS1 O52 C5 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AS1 O51 C5 deloc 1.250 0.020
AS1 O52 C5 deloc 1.250 0.020
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AS1 HN41 N4 single 1.010 0.020
AS1 HN42 N4 single 1.010 0.020
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AS1 C1 N2 single 1.450 0.020
AS1 H11 C1 single 1.092 0.020
AS1 H12 C1 single 1.092 0.020
AS1 N2 C single 1.330 0.020
AS1 HN2 N2 single 1.010 0.020
AS1 N3 C double 1.260 0.020
AS1 C N1 single 1.330 0.020
AS1 HN3 N3 single 0.954 0.020
AS1 N1 CA single 1.450 0.020
AS1 HN1 N1 single 1.010 0.020
AS1 CG CA single 1.500 0.020
AS1 CA CB single 1.524 0.020
AS1 HA CA single 1.099 0.020
AS1 OG2 CG deloc 1.250 0.020
AS1 OG1 CG deloc 1.250 0.020
AS1 CB CD single 1.510 0.020
AS1 HB1 CB single 1.092 0.020
AS1 HB2 CB single 1.092 0.020
AS1 OD1 CD deloc 1.250 0.020
AS1 CD OD2 deloc 1.250 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AS1 OD2 CD OD1 123.000 3.000
AS1 OD2 CD CB 118.500 3.000
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AS1 CB CA CG 109.470 3.000
AS1 CB CA N1 110.000 3.000
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AS1 HA CA N1 108.550 3.000
AS1 CG CA N1 111.600 3.000
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AS1 CA CG OG2 118.500 3.000
AS1 OG1 CG OG2 123.000 3.000
AS1 CA N1 HN1 118.500 3.000
AS1 CA N1 C 121.500 3.000
AS1 HN1 N1 C 120.000 3.000
AS1 N1 C N3 120.000 3.000
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AS1 N3 C N2 120.000 3.000
AS1 C N3 HN3 120.000 3.000
AS1 C N2 HN2 120.000 3.000
AS1 C N2 C1 121.500 3.000
AS1 HN2 N2 C1 118.500 3.000
AS1 N2 C1 H11 109.470 3.000
AS1 N2 C1 H12 109.470 3.000
AS1 N2 C1 C2 112.000 3.000
AS1 H11 C1 H12 107.900 3.000
AS1 H11 C1 C2 109.470 3.000
AS1 H12 C1 C2 109.470 3.000
AS1 C1 C2 H21 109.470 3.000
AS1 C1 C2 H22 109.470 3.000
AS1 C1 C2 C3 111.000 3.000
AS1 H21 C2 H22 107.900 3.000
AS1 H21 C2 C3 109.470 3.000
AS1 H22 C2 C3 109.470 3.000
AS1 C2 C3 H31 109.470 3.000
AS1 C2 C3 H32 109.470 3.000
AS1 C2 C3 C4 111.000 3.000
AS1 H31 C3 H32 107.900 3.000
AS1 H31 C3 C4 109.470 3.000
AS1 H32 C3 C4 109.470 3.000
AS1 C3 C4 H4 108.340 3.000
AS1 C3 C4 N4 109.470 3.000
AS1 C3 C4 C5 109.470 3.000
AS1 H4 C4 N4 109.470 3.000
AS1 H4 C4 C5 108.810 3.000
AS1 N4 C4 C5 109.470 3.000
AS1 C4 N4 HN42 120.000 3.000
AS1 C4 N4 HN41 120.000 3.000
AS1 HN42 N4 HN41 120.000 3.000
AS1 C4 C5 O51 118.500 3.000
AS1 C4 C5 O52 118.500 3.000
AS1 O51 C5 O52 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
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_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AS1 var_1 OD2 CD CB CA -179.978 20.000 3
AS1 var_2 CD CB CA N1 64.995 20.000 3
AS1 var_3 CB CA CG OG2 -119.965 20.000 3
AS1 var_4 CB CA N1 C -154.982 20.000 3
AS1 CONST_1 CA N1 C N2 180.000 0.000 0
AS1 CONST_2 N1 C N3 HN3 0.000 0.000 0
AS1 CONST_3 N1 C N2 C1 180.000 0.000 0
AS1 var_5 C N2 C1 C2 179.995 20.000 3
AS1 var_6 N2 C1 C2 C3 -179.970 20.000 3
AS1 var_7 C1 C2 C3 C4 -179.982 20.000 3
AS1 var_8 C2 C3 C4 C5 174.986 20.000 3
AS1 var_9 C3 C4 N4 HN41 -59.943 20.000 1
AS1 var_10 C3 C4 C5 O52 -80.016 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AS1 chir_01 C4 C5 N4 C3 negativ
AS1 chir_02 CA N1 CG CB negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AS1 plan-1 C5 0.020
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AS1 plan-1 O52 0.020
AS1 plan-1 C4 0.020
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AS1 plan-2 C4 0.020
AS1 plan-2 HN41 0.020
AS1 plan-2 HN42 0.020
AS1 plan-3 N2 0.020
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AS1 plan-3 C 0.020
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AS1 plan-4 C 0.020
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AS1 plan-4 N3 0.020
AS1 plan-4 N1 0.020
AS1 plan-4 HN3 0.020
AS1 plan-4 HN2 0.020
AS1 plan-4 HN1 0.020
AS1 plan-5 N1 0.020
AS1 plan-5 C 0.020
AS1 plan-5 CA 0.020
AS1 plan-5 HN1 0.020
AS1 plan-6 CG 0.020
AS1 plan-6 CA 0.020
AS1 plan-6 OG2 0.020
AS1 plan-6 OG1 0.020
AS1 plan-7 CD 0.020
AS1 plan-7 CB 0.020
AS1 plan-7 OD1 0.020
AS1 plan-7 OD2 0.020
# ------------------------------------------------------
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