1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AVF AVF '"1-{2-[3-(2-Chloro-4,5-difluoro-benz' non-polymer 47 31 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AVF
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
AVF CL8 CL CL 0.000 0.000 0.000 0.000
AVF C5 C CR6 0.000 -0.800 1.426 -0.584
AVF C6 C CR16 0.000 -0.066 2.554 -0.889
AVF H6 H H 0.000 1.009 2.550 -0.761
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AVF F9 F F 0.000 0.021 4.791 -1.661
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AVF C3 C CR16 0.000 -2.827 2.586 -1.209
AVF H3 H H 0.000 -3.903 2.599 -1.332
AVF C2 C CR6 0.000 -2.082 3.707 -1.516
AVF F22 F F 0.000 -2.697 4.822 -1.971
AVF C7 C C 0.000 -2.980 0.233 -0.410
AVF O20 O O 0.000 -2.424 -0.767 -0.001
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AVF C11 C C 0.000 -5.042 -0.852 -0.260
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AVF N12 N NH1 0.000 -6.380 -0.840 -0.411
AVF HN12 H H 0.000 -6.852 0.015 -0.668
AVF C13 C CR6 0.000 -7.118 -2.015 -0.212
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AVF H17 H H 0.000 -10.236 -3.055 0.614
AVF C16 C CR16 0.000 -8.580 -4.339 0.183
AVF H16 H H 0.000 -9.148 -5.248 0.336
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AVF F23 F F 0.000 -6.650 -5.616 -0.323
AVF C14 C CR16 0.000 -6.512 -3.253 -0.369
AVF H14 H H 0.000 -5.467 -3.313 -0.647
AVF N21 N NT 0.000 -9.081 -0.696 0.309
AVF C24 C CH2 0.000 -10.211 -0.546 -0.618
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AVF C25 C CH2 0.000 -9.504 -0.492 1.700
AVF H25 H H 0.000 -8.651 -0.642 2.365
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AVF C26 C CH2 0.000 -10.041 0.930 1.868
AVF H26 H H 0.000 -9.252 1.648 1.633
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AVF C28 C CH1 0.000 -11.225 1.140 0.919
AVF H28 H H 0.000 -12.035 0.445 1.182
AVF C27 C CH2 0.000 -10.768 0.876 -0.519
AVF H27A H H 0.000 -9.991 1.592 -0.794
AVF H27 H H 0.000 -11.617 0.983 -1.198
AVF C29 C C 0.000 -11.719 2.559 1.037
AVF O31 O OC -0.500 -11.709 3.310 0.036
AVF O30 O OC -0.500 -12.140 2.985 2.135
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AVF CL8 n/a C5 START
AVF C5 CL8 C4 .
AVF C6 C5 C1 .
AVF H6 C6 . .
AVF C1 C6 F9 .
AVF F9 C1 . .
AVF C4 C5 C7 .
AVF C3 C4 C2 .
AVF H3 C3 . .
AVF C2 C3 F22 .
AVF F22 C2 . .
AVF C7 C4 N10 .
AVF O20 C7 . .
AVF N10 C7 C11 .
AVF HN10 N10 . .
AVF C11 N10 N12 .
AVF O19 C11 . .
AVF N12 C11 C13 .
AVF HN12 N12 . .
AVF C13 N12 C18 .
AVF C18 C13 N21 .
AVF C17 C18 C16 .
AVF H17 C17 . .
AVF C16 C17 C15 .
AVF H16 C16 . .
AVF C15 C16 C14 .
AVF F23 C15 . .
AVF C14 C15 H14 .
AVF H14 C14 . .
AVF N21 C18 C25 .
AVF C24 N21 H24 .
AVF H24A C24 . .
AVF H24 C24 . .
AVF C25 N21 C26 .
AVF H25 C25 . .
AVF H25A C25 . .
AVF C26 C25 C28 .
AVF H26 C26 . .
AVF H26A C26 . .
AVF C28 C26 C29 .
AVF H28 C28 . .
AVF C27 C28 H27 .
AVF H27A C27 . .
AVF H27 C27 . .
AVF C29 C28 O30 .
AVF O31 C29 . .
AVF O30 C29 . END
AVF C1 C2 . ADD
AVF C13 C14 . ADD
AVF C24 C27 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AVF C1 C2 double 1.487 0.020
AVF C1 C6 single 1.390 0.020
AVF F9 C1 single 1.345 0.020
AVF C2 C3 single 1.390 0.020
AVF F22 C2 single 1.345 0.020
AVF C3 C4 double 1.390 0.020
AVF H3 C3 single 1.083 0.020
AVF O20 C7 double 1.220 0.020
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AVF C7 C4 single 1.500 0.020
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AVF O19 C11 double 1.220 0.020
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AVF C18 C13 double 1.487 0.020
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AVF H14 C14 single 1.083 0.020
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AVF F23 C15 single 1.345 0.020
AVF C16 C17 double 1.390 0.020
AVF H16 C16 single 1.083 0.020
AVF C24 C27 single 1.524 0.020
AVF C24 N21 single 1.469 0.020
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AVF C29 C28 single 1.500 0.020
AVF C28 C26 single 1.524 0.020
AVF H28 C28 single 1.099 0.020
AVF O31 C29 deloc 1.250 0.020
AVF O30 C29 deloc 1.250 0.020
AVF C26 C25 single 1.524 0.020
AVF H26 C26 single 1.092 0.020
AVF H26A C26 single 1.092 0.020
AVF C25 N21 single 1.469 0.020
AVF H25 C25 single 1.092 0.020
AVF H25A C25 single 1.092 0.020
AVF N21 C18 single 1.405 0.020
AVF C17 C18 single 1.390 0.020
AVF H17 C17 single 1.083 0.020
AVF HN12 N12 single 1.010 0.020
AVF HN10 N10 single 1.010 0.020
AVF C4 C5 single 1.487 0.020
AVF C6 C5 double 1.390 0.020
AVF H6 C6 single 1.083 0.020
AVF C5 CL8 single 1.795 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AVF CL8 C5 C6 120.000 3.000
AVF CL8 C5 C4 120.000 3.000
AVF C6 C5 C4 120.000 3.000
AVF C5 C6 H6 120.000 3.000
AVF C5 C6 C1 120.000 3.000
AVF H6 C6 C1 120.000 3.000
AVF C6 C1 F9 120.000 3.000
AVF C6 C1 C2 120.000 3.000
AVF F9 C1 C2 120.000 3.000
AVF C5 C4 C3 120.000 3.000
AVF C5 C4 C7 120.000 3.000
AVF C3 C4 C7 120.000 3.000
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AVF C4 C3 C2 120.000 3.000
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AVF C3 C2 F22 120.000 3.000
AVF C3 C2 C1 120.000 3.000
AVF F22 C2 C1 120.000 3.000
AVF C4 C7 O20 120.500 3.000
AVF C4 C7 N10 120.000 3.000
AVF O20 C7 N10 123.000 3.000
AVF C7 N10 HN10 120.000 3.000
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AVF N10 C11 O19 123.000 3.000
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AVF O19 C11 N12 123.000 3.000
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AVF C13 C18 C17 120.000 3.000
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AVF C17 C18 N21 120.000 3.000
AVF C18 C17 H17 120.000 3.000
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AVF N21 C25 H25 109.470 3.000
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AVF H25 C25 H25A 107.900 3.000
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AVF H25A C25 C26 109.470 3.000
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AVF H28 C28 C27 108.340 3.000
AVF H28 C28 C29 108.810 3.000
AVF C27 C28 C29 109.470 3.000
AVF C28 C27 H27A 109.470 3.000
AVF C28 C27 H27 109.470 3.000
AVF C28 C27 C24 111.000 3.000
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AVF H27 C27 C24 109.470 3.000
AVF C28 C29 O31 118.500 3.000
AVF C28 C29 O30 118.500 3.000
AVF O31 C29 O30 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AVF CONST_1 CL8 C5 C6 C1 180.000 0.000 0
AVF CONST_2 C5 C6 C1 F9 180.000 0.000 0
AVF CONST_3 C6 C1 C2 C3 0.000 0.000 0
AVF CONST_4 CL8 C5 C4 C7 0.000 0.000 0
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AVF CONST_6 C4 C3 C2 F22 180.000 0.000 0
AVF var_1 C5 C4 C7 N10 -179.979 20.000 1
AVF CONST_7 C4 C7 N10 C11 180.000 0.000 0
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AVF CONST_9 N10 C11 N12 C13 180.000 0.000 0
AVF var_2 C11 N12 C13 C18 154.958 20.000 1
AVF CONST_10 N12 C13 C14 C15 180.000 0.000 0
AVF CONST_11 N12 C13 C18 N21 0.000 0.000 0
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AVF CONST_14 C17 C16 C15 C14 0.000 0.000 0
AVF CONST_15 C16 C15 C14 C13 0.000 0.000 0
AVF var_3 C13 C18 N21 C25 -115.790 20.000 1
AVF var_4 C18 N21 C24 C27 180.000 20.000 1
AVF var_5 N21 C24 C27 C28 -60.000 20.000 3
AVF var_6 C18 N21 C25 C26 180.000 20.000 1
AVF var_7 N21 C25 C26 C28 60.000 20.000 3
AVF var_8 C25 C26 C28 C29 180.000 20.000 3
AVF var_9 C26 C28 C27 C24 60.000 20.000 3
AVF var_10 C26 C28 C29 O30 -60.341 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AVF chir_01 C28 C27 C29 C26 positiv
AVF chir_02 N21 C24 C25 C18 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AVF plan-1 C1 0.020
AVF plan-1 C2 0.020
AVF plan-1 F9 0.020
AVF plan-1 C6 0.020
AVF plan-1 C3 0.020
AVF plan-1 C4 0.020
AVF plan-1 C5 0.020
AVF plan-1 F22 0.020
AVF plan-1 H3 0.020
AVF plan-1 C7 0.020
AVF plan-1 H6 0.020
AVF plan-1 CL8 0.020
AVF plan-2 C7 0.020
AVF plan-2 N10 0.020
AVF plan-2 O20 0.020
AVF plan-2 C4 0.020
AVF plan-2 HN10 0.020
AVF plan-3 C11 0.020
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AVF plan-3 O19 0.020
AVF plan-3 N10 0.020
AVF plan-3 HN12 0.020
AVF plan-3 HN10 0.020
AVF plan-4 C13 0.020
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AVF plan-4 N12 0.020
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AVF plan-4 H17 0.020
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AVF plan-6 C13 0.020
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AVF plan-7 N10 0.020
AVF plan-7 C7 0.020
AVF plan-7 C11 0.020
AVF plan-7 HN10 0.020
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