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global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AVR AVR '(2R)-2-amino-1-[2-(1-methylethyl)pyr' non-polymer 34 17 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AVR
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
AVR O O O 0.000 0.000 0.000 0.000
AVR C C C 0.000 -1.121 -0.463 0.070
AVR CA C CH1 0.000 -1.454 -1.476 1.135
AVR HA H H 0.000 -2.464 -1.282 1.521
AVR CB C CH3 0.000 -1.398 -2.882 0.537
AVR HBB H H 0.000 -1.633 -3.595 1.285
AVR HBA H H 0.000 -2.099 -2.959 -0.254
AVR HB H H 0.000 -0.425 -3.070 0.164
AVR N N NH2 0.000 -0.482 -1.371 2.232
AVR HNA H H 0.000 0.300 -0.730 2.162
AVR HN H H 0.000 -0.588 -1.938 3.065
AVR C3 C CR5 0.000 -2.111 -0.056 -0.852
AVR C2 C CR5 0.000 -3.074 0.955 -0.660
AVR C10 C CH1 0.000 -3.227 1.800 0.579
AVR H10 H H 0.000 -2.469 1.507 1.318
AVR C12 C CH3 0.000 -4.622 1.590 1.169
AVR H12B H H 0.000 -4.732 2.184 2.040
AVR H12A H H 0.000 -5.354 1.872 0.457
AVR H12 H H 0.000 -4.751 0.569 1.421
AVR C11 C CH3 0.000 -3.042 3.275 0.216
AVR H11B H H 0.000 -3.773 3.559 -0.496
AVR H11A H H 0.000 -3.148 3.870 1.086
AVR H11 H H 0.000 -2.076 3.420 -0.194
AVR C4 C CR56 0.000 -2.328 -0.583 -2.144
AVR C9 C CR16 0.000 -1.695 -1.592 -2.879
AVR H9 H H 0.000 -0.860 -2.136 -2.455
AVR C8 C CR16 0.000 -2.142 -1.883 -4.135
AVR H8 H H 0.000 -1.665 -2.661 -4.718
AVR C7 C CR16 0.000 -3.224 -1.167 -4.663
AVR H7 H H 0.000 -3.585 -1.392 -5.659
AVR C6 C CR16 0.000 -3.820 -0.196 -3.934
AVR H6 H H 0.000 -4.656 0.351 -4.352
AVR N5 N NR56 0.000 -3.381 0.101 -2.679
AVR N1 N NRD5 0.000 -3.812 1.040 -1.735
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AVR O n/a C START
AVR C O C3 .
AVR CA C N .
AVR HA CA . .
AVR CB CA HB .
AVR HBB CB . .
AVR HBA CB . .
AVR HB CB . .
AVR N CA HN .
AVR HNA N . .
AVR HN N . .
AVR C3 C C4 .
AVR C2 C3 C10 .
AVR C10 C2 C11 .
AVR H10 C10 . .
AVR C12 C10 H12 .
AVR H12B C12 . .
AVR H12A C12 . .
AVR H12 C12 . .
AVR C11 C10 H11 .
AVR H11B C11 . .
AVR H11A C11 . .
AVR H11 C11 . .
AVR C4 C3 C9 .
AVR C9 C4 C8 .
AVR H9 C9 . .
AVR C8 C9 C7 .
AVR H8 C8 . .
AVR C7 C8 C6 .
AVR H7 C7 . .
AVR C6 C7 N5 .
AVR H6 C6 . .
AVR N5 C6 N1 .
AVR N1 N5 . END
AVR N1 C2 . ADD
AVR C4 N5 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AVR C O double 1.220 0.020
AVR C3 C single 1.490 0.020
AVR CA C single 1.500 0.020
AVR N CA single 1.450 0.020
AVR N1 C2 double 1.350 0.020
AVR N1 N5 single 1.402 0.020
AVR C2 C3 single 1.490 0.020
AVR C10 C2 single 1.480 0.020
AVR C4 C3 double 1.490 0.020
AVR C4 N5 single 1.337 0.020
AVR C9 C4 single 1.390 0.020
AVR N5 C6 single 1.337 0.020
AVR C6 C7 double 1.390 0.020
AVR C7 C8 single 1.390 0.020
AVR C8 C9 double 1.390 0.020
AVR CB CA single 1.524 0.020
AVR C11 C10 single 1.524 0.020
AVR C12 C10 single 1.524 0.020
AVR HN N single 1.010 0.020
AVR HNA N single 1.010 0.020
AVR H6 C6 single 1.083 0.020
AVR H7 C7 single 1.083 0.020
AVR H8 C8 single 1.083 0.020
AVR H9 C9 single 1.083 0.020
AVR HA CA single 1.099 0.020
AVR HB CB single 1.059 0.020
AVR HBA CB single 1.059 0.020
AVR HBB CB single 1.059 0.020
AVR H10 C10 single 1.099 0.020
AVR H11 C11 single 1.059 0.020
AVR H11A C11 single 1.059 0.020
AVR H11B C11 single 1.059 0.020
AVR H12 C12 single 1.059 0.020
AVR H12A C12 single 1.059 0.020
AVR H12B C12 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AVR O C CA 120.500 3.000
AVR O C C3 120.500 3.000
AVR CA C C3 120.000 3.000
AVR C CA HA 108.810 3.000
AVR C CA CB 109.470 3.000
AVR C CA N 109.470 3.000
AVR HA CA CB 108.340 3.000
AVR HA CA N 109.470 3.000
AVR CB CA N 109.470 3.000
AVR CA CB HBB 109.470 3.000
AVR CA CB HBA 109.470 3.000
AVR CA CB HB 109.470 3.000
AVR HBB CB HBA 109.470 3.000
AVR HBB CB HB 109.470 3.000
AVR HBA CB HB 109.470 3.000
AVR CA N HNA 120.000 3.000
AVR CA N HN 120.000 3.000
AVR HNA N HN 120.000 3.000
AVR C C3 C2 117.000 3.000
AVR C C3 C4 108.000 3.000
AVR C2 C3 C4 108.000 3.000
AVR C3 C2 C10 126.000 3.000
AVR C3 C2 N1 108.000 3.000
AVR C10 C2 N1 126.000 3.000
AVR C2 C10 H10 109.470 3.000
AVR C2 C10 C12 109.470 3.000
AVR C2 C10 C11 109.470 3.000
AVR H10 C10 C12 108.340 3.000
AVR H10 C10 C11 108.340 3.000
AVR C12 C10 C11 111.000 3.000
AVR C10 C12 H12B 109.470 3.000
AVR C10 C12 H12A 109.470 3.000
AVR C10 C12 H12 109.470 3.000
AVR H12B C12 H12A 109.470 3.000
AVR H12B C12 H12 109.470 3.000
AVR H12A C12 H12 109.470 3.000
AVR C10 C11 H11B 109.470 3.000
AVR C10 C11 H11A 109.470 3.000
AVR C10 C11 H11 109.470 3.000
AVR H11B C11 H11A 109.470 3.000
AVR H11B C11 H11 109.470 3.000
AVR H11A C11 H11 109.470 3.000
AVR C3 C4 C9 126.000 3.000
AVR C3 C4 N5 108.000 3.000
AVR C9 C4 N5 120.000 3.000
AVR C4 C9 H9 120.000 3.000
AVR C4 C9 C8 120.000 3.000
AVR H9 C9 C8 120.000 3.000
AVR C9 C8 H8 120.000 3.000
AVR C9 C8 C7 120.000 3.000
AVR H8 C8 C7 120.000 3.000
AVR C8 C7 H7 120.000 3.000
AVR C8 C7 C6 120.000 3.000
AVR H7 C7 C6 120.000 3.000
AVR C7 C6 H6 120.000 3.000
AVR C7 C6 N5 120.000 3.000
AVR H6 C6 N5 120.000 3.000
AVR C6 N5 N1 120.000 3.000
AVR C6 N5 C4 120.000 3.000
AVR N1 N5 C4 120.000 3.000
AVR N5 N1 C2 108.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AVR var_1 O C CA N 21.061 20.000 3
AVR var_2 C CA CB HB 60.017 20.000 3
AVR var_3 C CA N HN 176.055 20.000 1
AVR var_4 O C C3 C4 84.490 20.000 1
AVR CONST_1 C C3 C2 C10 0.000 0.000 0
AVR var_5 C3 C2 C10 C11 119.951 20.000 1
AVR var_6 C2 C10 C12 H12 60.031 20.000 3
AVR var_7 C2 C10 C11 H11 -59.945 20.000 3
AVR CONST_2 C C3 C4 C9 0.000 0.000 0
AVR CONST_3 C3 C4 N5 C6 180.000 0.000 0
AVR CONST_4 C3 C4 C9 C8 180.000 0.000 0
AVR CONST_5 C4 C9 C8 C7 0.000 0.000 0
AVR CONST_6 C9 C8 C7 C6 0.000 0.000 0
AVR CONST_7 C8 C7 C6 N5 0.000 0.000 0
AVR CONST_8 C7 C6 N5 N1 180.000 0.000 0
AVR CONST_9 C6 N5 N1 C2 180.000 0.000 0
AVR CONST_10 N5 N1 C2 C3 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AVR chir_01 CA C N CB positiv
AVR chir_02 C10 C2 C11 C12 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AVR plan-1 C 0.020
AVR plan-1 O 0.020
AVR plan-1 C3 0.020
AVR plan-1 CA 0.020
AVR plan-2 N 0.020
AVR plan-2 CA 0.020
AVR plan-2 HN 0.020
AVR plan-2 HNA 0.020
AVR plan-3 N1 0.020
AVR plan-3 C2 0.020
AVR plan-3 N5 0.020
AVR plan-3 C3 0.020
AVR plan-3 C10 0.020
AVR plan-3 C 0.020
AVR plan-3 C4 0.020
AVR plan-3 C9 0.020
AVR plan-3 C6 0.020
AVR plan-3 C7 0.020
AVR plan-3 C8 0.020
AVR plan-3 H6 0.020
AVR plan-3 H7 0.020
AVR plan-3 H8 0.020
AVR plan-3 H9 0.020
# ------------------------------------------------------
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