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_lib_version ?
_lib_update ?
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# --- LIST OF MONOMERS ---
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_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AVV AVV '"[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-2-fluoro-' non-polymer 56 36 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
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#
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_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
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AVV "O5'N" O O2 0.000 -1.107 1.013 2.033
AVV "C5'N" C CH2 0.000 -0.157 2.022 2.381
AVV HC5B H H 0.000 0.318 2.403 1.474
AVV HC5C H H 0.000 0.605 1.595 3.037
AVV "C4'N" C CH1 0.000 -0.871 3.167 3.103
AVV HC4A H H 0.000 -1.708 3.531 2.491
AVV "C3'N" C CH1 0.000 0.121 4.315 3.371
AVV HC3A H H 0.000 1.130 4.038 3.033
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AVV "C2'N" C CH1 0.000 0.094 4.489 4.909
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AVV "O2'N" O OH1 0.000 0.109 5.873 5.267
AVV HO2A H H 0.000 0.000 5.959 6.224
AVV "O4'N" O O2 0.000 -1.357 2.716 4.378
AVV "C1'N" C CH2 0.000 -1.259 3.834 5.286
AVV HC1B H H 0.000 -1.234 3.520 6.332
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AVV PA P P 0.000 -2.362 -2.411 -0.066
AVV O1A O OP -0.500 -1.928 -3.679 0.568
AVV O2A O OP -0.500 -1.635 -2.225 -1.346
AVV "O5'A" O O2 0.000 -3.945 -2.466 -0.352
AVV "C5'A" C CH2 0.000 -4.538 -3.385 -1.273
AVV "HC5'" H H 0.000 -4.320 -4.407 -0.957
AVV HC5A H H 0.000 -4.125 -3.217 -2.270
AVV "C4'A" C CH1 0.000 -6.052 -3.170 -1.303
AVV "HC4'" H H 0.000 -6.465 -3.208 -0.285
AVV "C3'A" C CH1 0.000 -6.728 -4.233 -2.197
AVV "HC3'" H H 0.000 -6.016 -4.624 -2.937
AVV "O3'A" O OH1 0.000 -7.257 -5.295 -1.399
AVV "HO3'" H H 0.000 -7.729 -5.919 -1.967
AVV "C2'A" C CH1 0.000 -7.870 -3.463 -2.898
AVV "HC2'" H H 0.000 -7.728 -3.470 -3.987
AVV "O2'A" O OH1 0.000 -9.138 -4.026 -2.555
AVV "HO2'" H H 0.000 -9.197 -4.924 -2.908
AVV "O4'A" O O2 0.000 -6.371 -1.907 -1.927
AVV "C1'A" C CH1 0.000 -7.748 -2.026 -2.346
AVV "HC1'" H H 0.000 -8.422 -1.887 -1.489
AVV N9A N NR5 0.000 -8.049 -1.049 -3.395
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AVV N3A N NRD6 0.000 -10.521 -0.746 -3.252
AVV C2A C CR6 0.000 -11.542 -0.102 -3.781
AVV F1A F F 0.000 -12.780 -0.324 -3.285
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AVV N7A N NRD5 0.000 -7.758 0.353 -5.042
AVV C5A C CR56 0.000 -9.087 0.345 -4.772
AVV C6A C CR6 0.000 -10.207 1.008 -5.303
AVV N1A N NRD6 0.000 -11.401 0.754 -4.779
AVV N6A N NH2 0.000 -10.068 1.905 -6.348
AVV HANA H H 0.000 -10.879 2.382 -6.729
AVV HAN6 H H 0.000 -9.153 2.095 -6.745
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AVV O2N n/a PN START
AVV PN O2N O3 .
AVV O1N PN . .
AVV "O5'N" PN "C5'N" .
AVV "C5'N" "O5'N" "C4'N" .
AVV HC5B "C5'N" . .
AVV HC5C "C5'N" . .
AVV "C4'N" "C5'N" "O4'N" .
AVV HC4A "C4'N" . .
AVV "C3'N" "C4'N" "C2'N" .
AVV HC3A "C3'N" . .
AVV "O3'N" "C3'N" HO3A .
AVV HO3A "O3'N" . .
AVV "C2'N" "C3'N" "O2'N" .
AVV HC2A "C2'N" . .
AVV "O2'N" "C2'N" HO2A .
AVV HO2A "O2'N" . .
AVV "O4'N" "C4'N" "C1'N" .
AVV "C1'N" "O4'N" HC1A .
AVV HC1B "C1'N" . .
AVV HC1A "C1'N" . .
AVV O3 PN PA .
AVV PA O3 "O5'A" .
AVV O1A PA . .
AVV O2A PA . .
AVV "O5'A" PA "C5'A" .
AVV "C5'A" "O5'A" "C4'A" .
AVV "HC5'" "C5'A" . .
AVV HC5A "C5'A" . .
AVV "C4'A" "C5'A" "O4'A" .
AVV "HC4'" "C4'A" . .
AVV "C3'A" "C4'A" "C2'A" .
AVV "HC3'" "C3'A" . .
AVV "O3'A" "C3'A" "HO3'" .
AVV "HO3'" "O3'A" . .
AVV "C2'A" "C3'A" "O2'A" .
AVV "HC2'" "C2'A" . .
AVV "O2'A" "C2'A" "HO2'" .
AVV "HO2'" "O2'A" . .
AVV "O4'A" "C4'A" "C1'A" .
AVV "C1'A" "O4'A" N9A .
AVV "HC1'" "C1'A" . .
AVV N9A "C1'A" C8A .
AVV C4A N9A N3A .
AVV N3A C4A C2A .
AVV C2A N3A F1A .
AVV F1A C2A . .
AVV C8A N9A N7A .
AVV HC8 C8A . .
AVV N7A C8A C5A .
AVV C5A N7A C6A .
AVV C6A C5A N6A .
AVV N1A C6A . .
AVV N6A C6A HAN6 .
AVV HANA N6A . .
AVV HAN6 N6A . END
AVV N1A C2A . ADD
AVV C4A C5A . ADD
AVV "C1'A" "C2'A" . ADD
AVV "C1'N" "C2'N" . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AVV O2A PA deloc 1.510 0.020
AVV PA O3 single 1.610 0.020
AVV "O5'A" PA single 1.610 0.020
AVV O1A PA deloc 1.510 0.020
AVV PN O2N deloc 1.510 0.020
AVV O1N PN deloc 1.510 0.020
AVV O3 PN single 1.610 0.020
AVV "O5'N" PN single 1.610 0.020
AVV F1A C2A single 1.345 0.020
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AVV HC5A "C5'A" single 1.092 0.020
AVV "C5'N" "O5'N" single 1.426 0.020
AVV HC5B "C5'N" single 1.092 0.020
AVV HC5C "C5'N" single 1.092 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AVV O2N PN O1N 119.900 3.000
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AVV O1N PN O3 108.200 3.000
AVV "O5'N" PN O3 102.600 3.000
AVV PN "O5'N" "C5'N" 120.500 3.000
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AVV "C5'N" "C4'N" HC4A 108.340 3.000
AVV "C5'N" "C4'N" "C3'N" 111.000 3.000
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AVV "C4'N" "C3'N" "C2'N" 111.000 3.000
AVV HC3A "C3'N" "O3'N" 109.470 3.000
AVV HC3A "C3'N" "C2'N" 108.340 3.000
AVV "O3'N" "C3'N" "C2'N" 109.470 3.000
AVV "C3'N" "O3'N" HO3A 109.470 3.000
AVV "C3'N" "C2'N" HC2A 108.340 3.000
AVV "C3'N" "C2'N" "O2'N" 109.470 3.000
AVV "C3'N" "C2'N" "C1'N" 111.000 3.000
AVV HC2A "C2'N" "O2'N" 109.470 3.000
AVV HC2A "C2'N" "C1'N" 108.340 3.000
AVV "O2'N" "C2'N" "C1'N" 109.470 3.000
AVV "C2'N" "O2'N" HO2A 109.470 3.000
AVV "C4'N" "O4'N" "C1'N" 111.800 3.000
AVV "O4'N" "C1'N" HC1B 109.470 3.000
AVV "O4'N" "C1'N" HC1A 109.470 3.000
AVV "O4'N" "C1'N" "C2'N" 109.470 3.000
AVV HC1B "C1'N" HC1A 107.900 3.000
AVV HC1B "C1'N" "C2'N" 109.470 3.000
AVV HC1A "C1'N" "C2'N" 109.470 3.000
AVV PN O3 PA 120.500 3.000
AVV O3 PA O1A 108.200 3.000
AVV O3 PA O2A 108.200 3.000
AVV O3 PA "O5'A" 102.600 3.000
AVV O1A PA O2A 119.900 3.000
AVV O1A PA "O5'A" 108.200 3.000
AVV O2A PA "O5'A" 108.200 3.000
AVV PA "O5'A" "C5'A" 120.500 3.000
AVV "O5'A" "C5'A" "HC5'" 109.470 3.000
AVV "O5'A" "C5'A" HC5A 109.470 3.000
AVV "O5'A" "C5'A" "C4'A" 109.470 3.000
AVV "HC5'" "C5'A" HC5A 107.900 3.000
AVV "HC5'" "C5'A" "C4'A" 109.470 3.000
AVV HC5A "C5'A" "C4'A" 109.470 3.000
AVV "C5'A" "C4'A" "HC4'" 108.340 3.000
AVV "C5'A" "C4'A" "C3'A" 111.000 3.000
AVV "C5'A" "C4'A" "O4'A" 109.470 3.000
AVV "HC4'" "C4'A" "C3'A" 108.340 3.000
AVV "HC4'" "C4'A" "O4'A" 109.470 3.000
AVV "C3'A" "C4'A" "O4'A" 109.470 3.000
AVV "C4'A" "C3'A" "HC3'" 108.340 3.000
AVV "C4'A" "C3'A" "O3'A" 109.470 3.000
AVV "C4'A" "C3'A" "C2'A" 111.000 3.000
AVV "HC3'" "C3'A" "O3'A" 109.470 3.000
AVV "HC3'" "C3'A" "C2'A" 108.340 3.000
AVV "O3'A" "C3'A" "C2'A" 109.470 3.000
AVV "C3'A" "O3'A" "HO3'" 109.470 3.000
AVV "C3'A" "C2'A" "HC2'" 108.340 3.000
AVV "C3'A" "C2'A" "O2'A" 109.470 3.000
AVV "C3'A" "C2'A" "C1'A" 111.000 3.000
AVV "HC2'" "C2'A" "O2'A" 109.470 3.000
AVV "HC2'" "C2'A" "C1'A" 108.340 3.000
AVV "O2'A" "C2'A" "C1'A" 109.470 3.000
AVV "C2'A" "O2'A" "HO2'" 109.470 3.000
AVV "C4'A" "O4'A" "C1'A" 111.800 3.000
AVV "O4'A" "C1'A" "HC1'" 109.470 3.000
AVV "O4'A" "C1'A" N9A 109.470 3.000
AVV "O4'A" "C1'A" "C2'A" 109.470 3.000
AVV "HC1'" "C1'A" N9A 109.470 3.000
AVV "HC1'" "C1'A" "C2'A" 108.340 3.000
AVV N9A "C1'A" "C2'A" 109.470 3.000
AVV "C1'A" N9A C4A 126.000 3.000
AVV "C1'A" N9A C8A 126.000 3.000
AVV C4A N9A C8A 108.000 3.000
AVV N9A C4A N3A 132.000 3.000
AVV N9A C4A C5A 108.000 3.000
AVV N3A C4A C5A 120.000 3.000
AVV C4A N3A C2A 120.000 3.000
AVV N3A C2A F1A 120.000 3.000
AVV N3A C2A N1A 120.000 3.000
AVV F1A C2A N1A 120.000 3.000
AVV N9A C8A HC8 126.000 3.000
AVV N9A C8A N7A 108.000 3.000
AVV HC8 C8A N7A 126.000 3.000
AVV C8A N7A C5A 108.000 3.000
AVV N7A C5A C6A 132.000 3.000
AVV N7A C5A C4A 108.000 3.000
AVV C6A C5A C4A 120.000 3.000
AVV C5A C6A N1A 120.000 3.000
AVV C5A C6A N6A 120.000 3.000
AVV N1A C6A N6A 120.000 3.000
AVV C6A N1A C2A 120.000 3.000
AVV C6A N6A HANA 120.000 3.000
AVV C6A N6A HAN6 120.000 3.000
AVV HANA N6A HAN6 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AVV var_1 O2N PN "O5'N" "C5'N" -54.989 20.000 1
AVV var_2 PN "O5'N" "C5'N" "C4'N" 179.985 20.000 1
AVV var_3 "O5'N" "C5'N" "C4'N" "O4'N" 67.129 20.000 3
AVV var_4 "C5'N" "C4'N" "C3'N" "C2'N" -120.000 20.000 3
AVV var_5 "C4'N" "C3'N" "O3'N" HO3A 176.248 20.000 1
AVV var_6 "C4'N" "C3'N" "C2'N" "O2'N" -150.000 20.000 3
AVV var_7 "C3'N" "C2'N" "O2'N" HO2A 174.180 20.000 1
AVV var_8 "C5'N" "C4'N" "O4'N" "C1'N" 150.000 20.000 1
AVV var_9 "C4'N" "O4'N" "C1'N" "C2'N" -30.000 20.000 1
AVV var_10 "O4'N" "C1'N" "C2'N" "C3'N" 30.000 20.000 3
AVV var_11 O2N PN O3 PA 44.986 20.000 1
AVV var_12 PN O3 PA "O5'A" -159.978 20.000 1
AVV var_13 O3 PA "O5'A" "C5'A" 175.012 20.000 1
AVV var_14 PA "O5'A" "C5'A" "C4'A" -179.999 20.000 1
AVV var_15 "O5'A" "C5'A" "C4'A" "O4'A" 69.522 20.000 3
AVV var_16 "C5'A" "C4'A" "C3'A" "C2'A" -150.000 20.000 3
AVV var_17 "C4'A" "C3'A" "O3'A" "HO3'" 176.094 20.000 1
AVV var_18 "C4'A" "C3'A" "C2'A" "O2'A" -120.000 20.000 3
AVV var_19 "C3'A" "C2'A" "O2'A" "HO2'" -65.348 20.000 1
AVV var_20 "C5'A" "C4'A" "O4'A" "C1'A" 150.000 20.000 1
AVV var_21 "C4'A" "O4'A" "C1'A" N9A -150.000 20.000 1
AVV var_22 "O4'A" "C1'A" "C2'A" "C3'A" 30.000 20.000 3
AVV var_23 "O4'A" "C1'A" N9A C8A 23.539 20.000 1
AVV CONST_1 "C1'A" N9A C4A N3A 0.000 0.000 0
AVV CONST_2 N9A C4A C5A N7A 0.000 0.000 0
AVV CONST_3 N9A C4A N3A C2A 180.000 0.000 0
AVV CONST_4 C4A N3A C2A F1A 180.000 0.000 0
AVV CONST_5 "C1'A" N9A C8A N7A 180.000 0.000 0
AVV CONST_6 N9A C8A N7A C5A 0.000 0.000 0
AVV CONST_7 C8A N7A C5A C6A 180.000 0.000 0
AVV CONST_8 N7A C5A C6A N6A 0.000 0.000 0
AVV CONST_9 C5A C6A N1A C2A 0.000 0.000 0
AVV CONST_10 C6A N1A C2A N3A 0.000 0.000 0
AVV CONST_11 C5A C6A N6A HAN6 -0.026 0.000 0
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AVV chir_01 "C1'A" N9A "C2'A" "O4'A" negativ
AVV chir_02 "C2'A" "C1'A" "O2'A" "C3'A" positiv
AVV chir_03 "C2'N" "C1'N" "O2'N" "C3'N" positiv
AVV chir_04 "C3'A" "C2'A" "O3'A" "C4'A" positiv
AVV chir_05 "C3'N" "C2'N" "O3'N" "C4'N" positiv
AVV chir_06 "C4'A" "C3'A" "O4'A" "C5'A" positiv
AVV chir_07 "C4'N" "C3'N" "O4'N" "C5'N" positiv
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AVV plan-1 N1A 0.020
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AVV plan-1 N3A 0.020
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AVV plan-1 C8A 0.020
AVV plan-1 N6A 0.020
AVV plan-1 HC8 0.020
AVV plan-1 "C1'A" 0.020
AVV plan-1 HANA 0.020
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AVV plan-2 N6A 0.020
AVV plan-2 C6A 0.020
AVV plan-2 HAN6 0.020
AVV plan-2 HANA 0.020
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