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214
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AZ1 AZ1 'AZELAIC ACID ' non-polymer 27 13 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AZ1
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
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AZ1 H82 H H 0.000 -2.454 0.891 -0.729
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AZ1 H62 H H 0.000 -4.938 0.891 -0.473
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AZ1 H42 H H 0.000 -7.424 0.891 -0.217
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AZ1 H32 H H 0.000 -8.446 -0.891 2.045
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AZ1 H22 H H 0.000 -9.908 0.891 0.039
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AZ1 O1 O OC -0.500 -12.165 0.000 1.255
AZ1 O2 O OC -0.500 -10.738 0.000 2.885
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AZ1 O4 n/a C9 START
AZ1 C9 O4 C8 .
AZ1 O3 C9 . .
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AZ1 H81 C8 . .
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AZ1 H71 C7 . .
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AZ1 C6 C7 C5 .
AZ1 H61 C6 . .
AZ1 H62 C6 . .
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AZ1 H51 C5 . .
AZ1 H52 C5 . .
AZ1 C4 C5 C3 .
AZ1 H41 C4 . .
AZ1 H42 C4 . .
AZ1 C3 C4 C2 .
AZ1 H31 C3 . .
AZ1 H32 C3 . .
AZ1 C2 C3 C1 .
AZ1 H21 C2 . .
AZ1 H22 C2 . .
AZ1 C1 C2 O2 .
AZ1 O1 C1 . .
AZ1 O2 C1 . END
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
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AZ1 O3 C9 deloc 1.250 0.020
AZ1 C9 O4 deloc 1.250 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
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_chem_comp_angle.atom_id_3
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_chem_comp_angle.value_angle_esd
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AZ1 H71 C7 C6 109.470 3.000
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AZ1 H61 C6 C5 109.470 3.000
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AZ1 H51 C5 C4 109.470 3.000
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AZ1 C5 C4 H41 109.470 3.000
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AZ1 H41 C4 H42 107.900 3.000
AZ1 H41 C4 C3 109.470 3.000
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AZ1 C4 C3 C2 111.000 3.000
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AZ1 H31 C3 C2 109.470 3.000
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AZ1 H21 C2 C1 109.470 3.000
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AZ1 O1 C1 O2 123.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
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_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
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AZ1 var_8 C3 C2 C1 O2 0.000 20.000 3
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AZ1 plan-1 C1 0.020
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# ------------------------------------------------------
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