1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
AZ2 AZ2 '"(2S)-2-ETHOXY-3-[4-(2-{4-[(METHYLSU' non-polymer 51 28 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_AZ2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
AZ2 O52 O OS 0.000 0.000 0.000 0.000
AZ2 S46 S ST 0.000 0.140 0.737 1.206
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AZ2 C47 C CH3 0.000 0.543 2.475 0.886
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AZ2 H471 H H 0.000 1.539 2.576 0.509
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AZ2 C40 C CR6 0.000 -2.106 0.699 0.648
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AZ2 H111 H H 0.000 -12.270 -4.898 -2.868
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
AZ2 O52 n/a S46 START
AZ2 S46 O52 O45 .
AZ2 O51 S46 . .
AZ2 C47 S46 H471 .
AZ2 H473 C47 . .
AZ2 H472 C47 . .
AZ2 H471 C47 . .
AZ2 O45 S46 C40 .
AZ2 C40 O45 C41 .
AZ2 C38 C40 C36 .
AZ2 H381 C38 . .
AZ2 C36 C38 H361 .
AZ2 H361 C36 . .
AZ2 C41 C40 C43 .
AZ2 H411 C41 . .
AZ2 C43 C41 C35 .
AZ2 H431 C43 . .
AZ2 C35 C43 C32 .
AZ2 C32 C35 C29 .
AZ2 H321 C32 . .
AZ2 H322 C32 . .
AZ2 C29 C32 O28 .
AZ2 H291 C29 . .
AZ2 H292 C29 . .
AZ2 O28 C29 C23 .
AZ2 C23 O28 C24 .
AZ2 C21 C23 C19 .
AZ2 H211 C21 . .
AZ2 C19 C21 H191 .
AZ2 H191 C19 . .
AZ2 C24 C23 C26 .
AZ2 H241 C24 . .
AZ2 C26 C24 C1 .
AZ2 H261 C26 . .
AZ2 C1 C26 C2 .
AZ2 C2 C1 C5 .
AZ2 H21 C2 . .
AZ2 H22 C2 . .
AZ2 C5 C2 O7 .
AZ2 H51 C5 . .
AZ2 C15 C5 O16 .
AZ2 O18 C15 . .
AZ2 O16 C15 . .
AZ2 O7 C5 C8 .
AZ2 C8 O7 C11 .
AZ2 H81 C8 . .
AZ2 H82 C8 . .
AZ2 C11 C8 H111 .
AZ2 H113 C11 . .
AZ2 H112 C11 . .
AZ2 H111 C11 . END
AZ2 C1 C19 . ADD
AZ2 C35 C36 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
AZ2 C2 C1 single 1.511 0.020
AZ2 C1 C19 double 1.390 0.020
AZ2 C1 C26 single 1.390 0.020
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AZ2 H22 C2 single 1.092 0.020
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AZ2 O16 C15 deloc 1.250 0.020
AZ2 O18 C15 deloc 1.250 0.020
AZ2 C19 C21 single 1.390 0.020
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AZ2 H381 C38 single 1.083 0.020
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AZ2 H473 C47 single 1.059 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
AZ2 O52 S46 O51 109.500 3.000
AZ2 O52 S46 C47 109.500 3.000
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AZ2 C47 S46 O45 109.500 3.000
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AZ2 S46 C47 H471 109.500 3.000
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AZ2 H473 C47 H471 109.470 3.000
AZ2 H472 C47 H471 109.470 3.000
AZ2 S46 O45 C40 120.000 3.000
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AZ2 C8 C11 H111 109.470 3.000
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AZ2 H113 C11 H111 109.470 3.000
AZ2 H112 C11 H111 109.470 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
AZ2 var_1 O52 S46 C47 H471 -70.376 20.000 1
AZ2 var_2 O52 S46 O45 C40 -26.250 20.000 1
AZ2 var_3 S46 O45 C40 C41 -89.948 20.000 1
AZ2 CONST_1 O45 C40 C38 C36 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_2 C40 C38 C36 C35 0.000 0.000 0
AZ2 CONST_3 O45 C40 C41 C43 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_4 C40 C41 C43 C35 0.000 0.000 0
AZ2 CONST_5 C41 C43 C35 C32 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_6 C43 C35 C36 C38 0.000 0.000 0
AZ2 var_4 C43 C35 C32 C29 -90.266 20.000 2
AZ2 var_5 C35 C32 C29 O28 179.989 20.000 3
AZ2 var_6 C32 C29 O28 C23 179.992 20.000 1
AZ2 var_7 C29 O28 C23 C24 0.049 20.000 1
AZ2 CONST_7 O28 C23 C21 C19 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_8 C23 C21 C19 C1 0.000 0.000 0
AZ2 CONST_9 O28 C23 C24 C26 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_10 C23 C24 C26 C1 0.000 0.000 0
AZ2 CONST_11 C24 C26 C1 C2 180.000 0.000 0
AZ2 CONST_12 C26 C1 C19 C21 0.000 0.000 0
AZ2 var_8 C26 C1 C2 C5 -90.265 20.000 2
AZ2 var_9 C1 C2 C5 O7 -60.072 20.000 3
AZ2 var_10 C2 C5 C15 O16 -60.045 20.000 3
AZ2 var_11 C2 C5 O7 C8 150.014 20.000 1
AZ2 var_12 C5 O7 C8 C11 -179.969 20.000 1
AZ2 var_13 O7 C8 C11 H111 -179.972 20.000 3
loop_
_chem_comp_chir.comp_id
_chem_comp_chir.id
_chem_comp_chir.atom_id_centre
_chem_comp_chir.atom_id_1
_chem_comp_chir.atom_id_2
_chem_comp_chir.atom_id_3
_chem_comp_chir.volume_sign
AZ2 chir_01 C5 C2 O7 C15 positiv
AZ2 chir_02 S46 O45 C47 O51 negativ
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
AZ2 plan-1 C1 0.020
AZ2 plan-1 C2 0.020
AZ2 plan-1 C19 0.020
AZ2 plan-1 C26 0.020
AZ2 plan-1 C21 0.020
AZ2 plan-1 C23 0.020
AZ2 plan-1 C24 0.020
AZ2 plan-1 H191 0.020
AZ2 plan-1 H211 0.020
AZ2 plan-1 O28 0.020
AZ2 plan-1 H241 0.020
AZ2 plan-1 H261 0.020
AZ2 plan-2 C15 0.020
AZ2 plan-2 C5 0.020
AZ2 plan-2 O16 0.020
AZ2 plan-2 O18 0.020
AZ2 plan-3 C35 0.020
AZ2 plan-3 C32 0.020
AZ2 plan-3 C36 0.020
AZ2 plan-3 C43 0.020
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AZ2 plan-3 H381 0.020
AZ2 plan-3 O45 0.020
AZ2 plan-3 H411 0.020
AZ2 plan-3 H431 0.020
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