1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253
|
global_
_lib_name ?
_lib_version ?
_lib_update ?
# ------------------------------------------------
#
# --- LIST OF MONOMERS ---
#
data_comp_list
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.three_letter_code
_chem_comp.name
_chem_comp.group
_chem_comp.number_atoms_all
_chem_comp.number_atoms_nh
_chem_comp.desc_level
C4E C4E 'N-phenyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-' non-polymer 27 16 .
# ------------------------------------------------------
# ------------------------------------------------------
#
# --- DESCRIPTION OF MONOMERS ---
#
data_comp_C4E
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.type_energy
_chem_comp_atom.partial_charge
_chem_comp_atom.x
_chem_comp_atom.y
_chem_comp_atom.z
C4E H1 H H 0.000 0.002 -0.001 -0.001
C4E C1 C CR16 0.000 -0.910 0.567 0.132
C4E C9 C CR16 0.000 -2.140 -0.056 0.038
C4E H9 H H 0.000 -2.214 -1.116 -0.169
C4E C2 C CR16 0.000 -0.853 1.927 0.399
C4E H2 H H 0.000 0.112 2.412 0.472
C4E N3 N NRD6 0.000 -1.946 2.642 0.565
C4E C4 C CR56 0.000 -3.153 2.099 0.486
C4E N5 N NR15 0.000 -4.421 2.608 0.619
C4E HN5 H H 0.000 -4.646 3.603 0.821
C4E C6 C CR15 0.000 -5.351 1.608 0.445
C4E H6 H H 0.000 -6.425 1.739 0.500
C4E C8 C CR56 0.000 -3.285 0.722 0.217
C4E C7 C CR5 0.000 -4.725 0.443 0.196
C4E N10 N NH1 0.000 -5.334 -0.803 -0.036
C4E HN10 H H 0.000 -4.767 -1.636 -0.114
C4E C11 C CR6 0.000 -6.722 -0.890 -0.159
C4E C16 C CR16 0.000 -7.397 -2.000 0.334
C4E H16 H H 0.000 -6.847 -2.802 0.811
C4E C15 C CR16 0.000 -8.771 -2.080 0.215
C4E H15 H H 0.000 -9.299 -2.940 0.608
C4E C14 C CR16 0.000 -9.472 -1.063 -0.404
C4E H14 H H 0.000 -10.549 -1.130 -0.500
C4E C13 C CR16 0.000 -8.803 0.041 -0.902
C4E H13 H H 0.000 -9.357 0.836 -1.387
C4E C12 C CR16 0.000 -7.431 0.130 -0.781
C4E H12 H H 0.000 -6.907 0.995 -1.171
loop_
_chem_comp_tree.comp_id
_chem_comp_tree.atom_id
_chem_comp_tree.atom_back
_chem_comp_tree.atom_forward
_chem_comp_tree.connect_type
C4E H1 n/a C1 START
C4E C1 H1 C2 .
C4E C9 C1 H9 .
C4E H9 C9 . .
C4E C2 C1 N3 .
C4E H2 C2 . .
C4E N3 C2 C4 .
C4E C4 N3 C8 .
C4E N5 C4 C6 .
C4E HN5 N5 . .
C4E C6 N5 H6 .
C4E H6 C6 . .
C4E C8 C4 C7 .
C4E C7 C8 N10 .
C4E N10 C7 C11 .
C4E HN10 N10 . .
C4E C11 N10 C16 .
C4E C16 C11 C15 .
C4E H16 C16 . .
C4E C15 C16 C14 .
C4E H15 C15 . .
C4E C14 C15 C13 .
C4E H14 C14 . .
C4E C13 C14 C12 .
C4E H13 C13 . .
C4E C12 C13 H12 .
C4E H12 C12 . END
C4E C11 C12 . ADD
C4E C7 C6 . ADD
C4E C8 C9 . ADD
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.type
_chem_comp_bond.value_dist
_chem_comp_bond.value_dist_esd
C4E C11 N10 single 1.350 0.020
C4E N10 C7 single 1.350 0.020
C4E C11 C12 double 1.390 0.020
C4E C16 C11 single 1.390 0.020
C4E C12 C13 single 1.390 0.020
C4E C13 C14 double 1.390 0.020
C4E C14 C15 single 1.390 0.020
C4E C15 C16 double 1.390 0.020
C4E C7 C6 double 1.387 0.020
C4E C7 C8 single 1.490 0.020
C4E C6 N5 single 1.350 0.020
C4E C8 C9 double 1.390 0.020
C4E C8 C4 single 1.490 0.020
C4E C9 C1 single 1.390 0.020
C4E N5 C4 single 1.340 0.020
C4E C4 N3 double 1.355 0.020
C4E N3 C2 single 1.337 0.020
C4E C2 C1 double 1.390 0.020
C4E HN10 N10 single 1.010 0.020
C4E H12 C12 single 1.083 0.020
C4E H13 C13 single 1.083 0.020
C4E H14 C14 single 1.083 0.020
C4E H15 C15 single 1.083 0.020
C4E H16 C16 single 1.083 0.020
C4E H6 C6 single 1.083 0.020
C4E H9 C9 single 1.083 0.020
C4E HN5 N5 single 1.040 0.020
C4E H2 C2 single 1.083 0.020
C4E C1 H1 single 1.083 0.020
loop_
_chem_comp_angle.comp_id
_chem_comp_angle.atom_id_1
_chem_comp_angle.atom_id_2
_chem_comp_angle.atom_id_3
_chem_comp_angle.value_angle
_chem_comp_angle.value_angle_esd
C4E H1 C1 C9 120.000 3.000
C4E H1 C1 C2 120.000 3.000
C4E C9 C1 C2 120.000 3.000
C4E C1 C9 H9 120.000 3.000
C4E C1 C9 C8 120.000 3.000
C4E H9 C9 C8 120.000 3.000
C4E C1 C2 H2 120.000 3.000
C4E C1 C2 N3 120.000 3.000
C4E H2 C2 N3 120.000 3.000
C4E C2 N3 C4 120.000 3.000
C4E N3 C4 N5 132.000 3.000
C4E N3 C4 C8 120.000 3.000
C4E N5 C4 C8 108.000 3.000
C4E C4 N5 HN5 126.000 3.000
C4E C4 N5 C6 108.000 3.000
C4E HN5 N5 C6 126.000 3.000
C4E N5 C6 H6 126.000 3.000
C4E N5 C6 C7 108.000 3.000
C4E H6 C6 C7 126.000 3.000
C4E C4 C8 C7 108.000 3.000
C4E C4 C8 C9 120.000 3.000
C4E C7 C8 C9 126.000 3.000
C4E C8 C7 N10 108.000 3.000
C4E C8 C7 C6 108.000 3.000
C4E N10 C7 C6 126.000 3.000
C4E C7 N10 HN10 120.000 3.000
C4E C7 N10 C11 120.000 3.000
C4E HN10 N10 C11 120.000 3.000
C4E N10 C11 C16 120.000 3.000
C4E N10 C11 C12 120.000 3.000
C4E C16 C11 C12 120.000 3.000
C4E C11 C16 H16 120.000 3.000
C4E C11 C16 C15 120.000 3.000
C4E H16 C16 C15 120.000 3.000
C4E C16 C15 H15 120.000 3.000
C4E C16 C15 C14 120.000 3.000
C4E H15 C15 C14 120.000 3.000
C4E C15 C14 H14 120.000 3.000
C4E C15 C14 C13 120.000 3.000
C4E H14 C14 C13 120.000 3.000
C4E C14 C13 H13 120.000 3.000
C4E C14 C13 C12 120.000 3.000
C4E H13 C13 C12 120.000 3.000
C4E C13 C12 H12 120.000 3.000
C4E C13 C12 C11 120.000 3.000
C4E H12 C12 C11 120.000 3.000
loop_
_chem_comp_tor.comp_id
_chem_comp_tor.id
_chem_comp_tor.atom_id_1
_chem_comp_tor.atom_id_2
_chem_comp_tor.atom_id_3
_chem_comp_tor.atom_id_4
_chem_comp_tor.value_angle
_chem_comp_tor.value_angle_esd
_chem_comp_tor.period
C4E CONST_1 H1 C1 C9 C8 180.000 0.000 0
C4E CONST_2 H1 C1 C2 N3 180.000 0.000 0
C4E CONST_3 C1 C2 N3 C4 0.000 0.000 0
C4E CONST_4 C2 N3 C4 C8 0.000 0.000 0
C4E CONST_5 N3 C4 N5 C6 180.000 0.000 0
C4E CONST_6 C4 N5 C6 C7 0.000 0.000 0
C4E CONST_7 N3 C4 C8 C7 180.000 0.000 0
C4E CONST_8 C4 C8 C9 C1 0.000 0.000 0
C4E CONST_9 C4 C8 C7 N10 180.000 0.000 0
C4E CONST_10 C8 C7 C6 N5 0.000 0.000 0
C4E var_1 C8 C7 N10 C11 -173.553 20.000 1
C4E var_2 C7 N10 C11 C16 -144.364 20.000 1
C4E CONST_11 N10 C11 C12 C13 180.000 0.000 0
C4E CONST_12 N10 C11 C16 C15 180.000 0.000 0
C4E CONST_13 C11 C16 C15 C14 0.000 0.000 0
C4E CONST_14 C16 C15 C14 C13 0.000 0.000 0
C4E CONST_15 C15 C14 C13 C12 0.000 0.000 0
C4E CONST_16 C14 C13 C12 C11 0.000 0.000 0
loop_
_chem_comp_plane_atom.comp_id
_chem_comp_plane_atom.plane_id
_chem_comp_plane_atom.atom_id
_chem_comp_plane_atom.dist_esd
C4E plan-1 N10 0.020
C4E plan-1 C11 0.020
C4E plan-1 C7 0.020
C4E plan-1 HN10 0.020
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C4E plan-2 C13 0.020
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C4E plan-2 HN10 0.020
C4E plan-3 C7 0.020
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C4E plan-3 C9 0.020
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C4E plan-3 N3 0.020
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C4E plan-3 H9 0.020
C4E plan-3 HN5 0.020
C4E plan-3 H2 0.020
C4E plan-3 H1 0.020
C4E plan-3 HN10 0.020
# ------------------------------------------------------
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